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Heatmap: Cluster_30 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.32 0.31 -0.16 0.86 -1.9 -1.4 0.47 -0.03 -0.16 -0.15
0.75 0.71 -0.78 0.71 -1.89 -2.13 -0.24 -0.06 0.22 -0.02
0.91 0.76 -1.13 -0.11 -3.07 -2.5 0.47 0.17 0.28 0.03
0.5 0.47 -0.2 1.0 -2.03 -2.64 0.44 0.02 -0.23 -0.52
0.58 0.48 -0.35 0.43 -0.52 -0.56 -0.16 -0.16 -0.18 -0.1
0.66 0.59 -0.55 0.46 -0.5 -0.73 -0.34 -0.17 0.07 -0.29
0.53 0.43 -0.23 0.79 -2.03 -2.4 0.31 -0.05 -0.02 -0.0
0.28 0.26 0.08 0.48 -0.45 -0.94 0.13 0.02 -0.22 -0.14
0.57 0.22 -0.69 0.74 -0.77 -1.04 0.14 -0.13 -0.08 0.03
0.41 0.29 -0.39 0.14 -0.21 -0.48 0.03 -0.01 -0.01 -0.01
0.43 0.1 -0.15 0.18 -0.65 -0.5 0.11 -0.08 0.13 0.13
0.54 0.71 -0.45 0.67 -2.26 -2.59 0.45 -0.05 -0.09 -0.1
0.43 0.36 -0.41 0.38 -0.68 -1.09 0.44 -0.15 0.04 -0.1
0.4 0.34 -0.01 0.33 -0.5 -1.37 0.49 -0.12 -0.2 -0.19
0.7 0.93 -0.93 0.45 -2.49 -2.82 0.15 0.23 -0.36 0.26
0.38 0.34 -0.14 0.56 -1.06 -1.15 -0.01 -0.06 0.06 0.16
0.54 0.58 -0.5 0.63 -1.71 -1.86 0.35 0.04 0.01 -0.15
0.32 0.53 0.03 0.52 -0.92 -1.16 0.23 -0.15 -0.16 -0.14
0.53 0.91 -1.62 0.81 -1.1 -2.58 -0.13 0.05 0.09 -0.09
0.51 0.25 -0.38 0.76 -1.26 -1.6 0.28 0.02 0.04 -0.13
0.33 0.33 0.13 0.47 -0.85 -1.01 0.03 -0.11 -0.09 0.09
0.43 0.55 -0.19 0.61 -1.4 -1.89 0.21 -0.07 -0.04 0.09
0.49 0.62 -0.41 0.6 -2.03 -2.73 0.23 0.17 -0.23 0.32
0.58 0.69 -0.03 0.38 -1.0 -1.05 0.0 -0.1 -0.24 -0.25
0.27 0.28 -0.01 0.63 -0.76 -0.88 -0.01 -0.08 -0.03 -0.02
0.5 0.57 -0.35 0.86 -1.7 -1.88 0.26 -0.26 -0.02 -0.16
0.57 0.74 -0.02 0.7 -1.78 -1.93 0.09 -0.47 0.08 -0.26
1.0 1.0 -2.32 0.85 -4.16 -4.54 -0.26 -0.03 -0.6 0.5
0.29 0.59 -0.3 0.41 -1.42 -1.93 0.64 -0.09 0.25 -0.31
0.77 0.61 0.19 0.5 -1.71 -1.23 -0.06 -0.18 -0.56 -0.07
0.61 0.72 -1.61 0.99 -1.89 -2.2 0.52 -0.18 -0.02 -0.45
0.79 0.91 -1.05 0.51 -2.09 -2.67 0.25 -0.09 0.05 -0.11
0.26 0.11 -0.09 0.46 -0.48 -0.44 0.1 -0.11 -0.05 -0.01
0.9 0.46 -0.43 0.41 -0.47 -1.03 -0.02 -0.17 -0.45 -0.2
0.36 0.59 -0.75 0.39 -1.32 -1.79 0.58 0.18 0.2 -0.25
0.27 0.39 -0.3 0.37 -0.97 -1.11 0.26 0.1 0.29 -0.13
0.51 0.27 -1.29 0.71 -0.41 -0.57 -0.04 -0.05 -0.61 0.38
0.88 0.79 -0.71 0.71 -1.73 -2.98 -0.01 0.55 -0.6 -0.67
0.27 0.23 -0.55 0.36 -0.42 -0.86 0.34 0.12 0.1 -0.1
0.73 0.77 0.48 0.31 -1.98 -1.57 -0.39 -0.27 -0.7 0.27
0.51 0.66 -0.33 0.57 -1.21 -1.36 -0.0 0.15 -0.26 -0.06
0.5 0.67 0.1 0.39 -1.23 -1.3 0.08 -0.02 -0.11 -0.29
0.4 0.27 -0.06 0.38 -0.52 -0.93 0.09 -0.03 -0.19 0.11
0.4 0.38 0.02 0.32 -0.52 -0.84 0.02 0.05 -0.26 -0.03
0.67 0.69 -1.5 1.15 -2.01 -2.78 0.43 -0.04 -0.15 -0.71
0.47 0.81 -0.24 0.55 -1.71 -2.03 0.11 -0.2 0.28 -0.27
0.57 0.51 -0.32 0.28 -0.9 -1.62 0.25 0.01 -0.1 0.11
0.8 0.85 -1.06 0.79 -3.51 -4.15 0.12 0.32 -0.06 -0.29
0.51 0.46 -0.11 0.69 -2.21 -2.38 0.0 0.0 0.09 0.25
0.44 0.46 -1.03 0.86 -0.99 -1.58 0.29 0.03 -0.11 -0.06
0.44 0.09 -0.04 0.38 -0.17 -1.06 0.36 -0.16 -0.19 -0.18
0.36 0.52 -0.66 0.41 -1.42 -1.77 0.77 0.21 0.06 -0.4
0.68 0.41 -1.51 0.67 -0.53 -1.32 0.2 -0.2 0.2 -0.22
0.68 0.55 0.09 0.26 -1.09 -0.95 0.21 -0.25 -0.22 -0.27
0.42 0.24 -0.22 0.24 -0.81 -0.93 0.44 0.01 0.04 -0.07
0.73 0.68 -0.3 0.46 -2.76 -3.42 0.27 -0.08 0.04 0.18
0.63 0.74 -0.73 0.8 -2.4 -2.67 0.34 0.18 -0.3 -0.19
0.5 0.48 -0.98 0.53 -1.73 -2.05 0.56 0.12 0.35 -0.19
0.55 0.4 -0.33 0.25 -1.19 -1.52 0.44 0.05 0.14 -0.07
0.7 0.73 -1.38 0.83 -2.79 -3.68 0.35 0.13 0.08 -0.13
0.55 0.46 -0.09 0.41 -0.72 -1.12 0.23 -0.14 -0.22 -0.16
0.33 0.35 0.09 0.35 -0.72 -0.85 0.18 -0.02 -0.02 -0.23
0.53 0.45 -0.91 0.93 -1.67 -2.42 0.38 0.05 0.18 -0.33
0.53 0.54 -0.2 0.4 -1.04 -1.02 0.08 0.13 -0.09 -0.25
0.27 0.42 -0.35 0.57 -1.58 -1.63 0.74 0.0 0.24 -0.55
0.2 0.26 -0.1 0.11 -0.67 -1.01 0.35 0.06 -0.02 0.27
1.09 1.06 -1.18 0.65 -1.2 -1.34 -0.4 -0.17 -1.26 -0.18
0.36 0.47 -0.29 0.39 -0.91 -1.43 0.31 0.04 0.15 -0.13
0.5 0.44 -0.32 0.36 -0.72 -0.93 0.21 -0.26 -0.11 0.13
0.34 0.44 -0.13 0.55 -1.0 -1.44 0.29 -0.05 0.01 -0.09
0.44 0.27 -0.06 0.64 -1.39 -1.72 0.04 0.07 0.07 0.16
0.82 0.67 -0.97 0.9 -0.95 -1.24 -0.56 -0.26 -0.01 -0.29
0.24 0.47 -0.19 0.89 -1.09 -1.25 0.09 -0.23 -0.01 -0.16
0.59 0.51 -0.24 0.54 -0.91 -0.84 0.01 -0.12 -0.1 -0.28
0.18 0.22 0.0 0.3 -0.54 -0.55 0.11 0.04 0.01 -0.03
0.79 1.02 -0.87 0.91 -2.95 -3.46 -0.84 0.03 -0.22 0.22
0.64 0.81 -0.52 0.8 -2.04 -2.32 0.31 -0.48 -0.2 -0.03
0.66 1.26 -1.92 0.99 -3.64 -2.8 -0.26 -0.11 0.02 -0.36
0.35 0.36 -0.31 0.27 -0.59 -1.15 0.25 0.06 0.12 -0.01
0.45 0.57 -1.07 1.0 -1.17 -1.79 0.55 -0.1 -0.27 -0.49
0.35 0.3 -0.26 0.17 -0.87 -1.34 0.41 0.08 0.24 0.04
0.4 0.44 0.17 0.68 -1.49 -1.66 0.12 -0.03 -0.12 -0.09
0.11 0.22 -0.53 0.34 -0.29 -0.63 0.28 0.11 0.13 -0.09
0.55 0.42 -0.63 0.27 -1.51 -1.56 0.59 0.22 0.09 -0.12
0.29 0.23 0.05 0.36 -0.51 -0.81 0.11 0.0 -0.06 -0.04
0.35 0.28 0.5 0.9 -1.76 -1.72 0.19 -0.44 -0.3 -0.08
0.48 0.35 -0.1 0.18 -0.99 -1.31 0.29 0.02 0.03 0.14
0.68 0.75 -1.36 0.71 -2.17 -2.58 0.27 0.15 -0.07 0.05
0.32 0.2 0.0 0.35 -0.52 -0.65 0.07 -0.05 0.06 -0.09
0.61 0.55 -0.27 0.14 -0.83 -1.67 0.4 -0.13 0.16 -0.21
0.34 0.65 -0.15 0.73 -2.63 -2.05 0.62 -0.1 -0.14 -0.28
0.53 0.63 0.14 0.28 -1.0 -1.58 0.26 -0.08 -0.38 -0.09
0.42 0.44 0.25 0.58 -2.17 -1.68 0.15 0.27 -0.03 -0.32
0.24 0.32 0.06 0.49 -0.95 -1.12 0.05 -0.07 0.11 0.11
0.92 1.14 -1.98 0.69 -3.43 -4.3 -0.14 0.04 -0.01 -0.03
0.53 0.51 0.26 0.36 -1.1 -1.67 0.07 0.0 -0.23 -0.03
0.38 0.31 -0.09 0.19 -0.62 -0.97 0.1 0.01 0.09 0.1
1.2 1.2 -0.87 1.0 -4.1 -4.61 -0.26 -0.65 -1.19 -0.27
0.41 0.39 0.06 0.65 -1.13 -1.79 0.41 -0.11 -0.07 -0.32
0.52 0.6 -0.89 0.48 -1.02 -1.26 0.45 0.02 0.03 -0.29
0.69 0.81 -1.53 0.88 -1.49 -1.88 0.15 -0.02 0.14 -0.68
0.46 0.59 -0.86 0.44 -1.32 -1.97 0.63 0.19 0.12 -0.35
1.07 0.95 -1.45 0.92 -1.53 -4.0 -0.62 -0.3 -0.61 0.25
0.54 0.48 -0.78 0.81 -1.05 -1.53 0.35 -0.16 -0.13 -0.16
0.71 0.37 0.16 0.55 -1.67 -2.21 0.34 -0.17 -0.26 -0.03
0.52 0.7 -1.12 0.68 -1.35 -1.97 0.64 -0.02 -0.23 -0.25
0.33 0.48 -0.5 0.26 -1.53 -1.96 0.6 0.32 0.25 -0.15
0.73 0.45 -0.12 0.42 -0.25 -0.7 -0.23 -0.51 -0.49 -0.02
0.29 0.29 0.03 0.36 -0.7 -1.0 0.17 0.04 -0.02 -0.01
0.91 1.39 0.47 -0.21 -2.69 -2.08 -2.83 0.13 -0.53 -0.11
0.74 0.43 -0.1 0.36 -1.12 -1.57 0.1 -0.12 -0.21 0.15
0.44 0.41 -0.19 0.19 -0.75 -1.01 0.22 0.11 0.11 -0.17
0.44 0.7 -0.22 0.62 -1.36 -2.48 0.35 -0.04 -0.01 -0.31
0.29 0.35 -0.3 0.49 -0.92 -1.63 0.33 0.31 0.16 -0.29
0.27 0.38 0.39 0.81 -1.53 -2.22 0.22 -0.38 -0.02 -0.09
0.69 0.27 -0.2 0.28 -0.78 -1.55 0.27 -0.29 0.1 0.12
0.74 0.34 -0.29 1.0 -3.17 -2.97 0.6 -0.16 -0.57 -0.12
0.96 1.2 -0.52 0.87 -4.29 -4.87 -0.58 0.02 -0.33 -0.57
0.42 0.42 -0.35 0.46 -1.76 -2.49 0.7 -0.22 0.25 0.03
0.7 0.63 -0.27 0.6 -3.46 -3.77 0.33 -0.03 -0.06 0.18
0.33 0.41 -0.41 0.85 -1.19 -1.13 0.23 -0.09 0.07 -0.3
0.67 0.47 -0.06 0.55 -0.95 -1.06 0.21 -0.31 -0.44 -0.15
0.59 0.7 -0.52 0.74 -2.27 -2.38 0.53 -0.17 -0.4 0.02
0.34 0.53 -0.06 0.84 -1.8 -1.79 0.29 -0.27 -0.27 0.11
0.36 0.32 0.09 0.43 -1.13 -1.28 0.24 -0.05 -0.03 0.09
0.79 0.84 -1.03 0.77 -3.12 -2.91 0.67 -0.05 -0.61 -0.29
0.51 0.73 -1.16 0.98 -1.09 -2.19 0.52 -0.11 -0.48 -0.45
0.36 0.46 -0.42 0.48 -1.43 -1.57 0.49 0.08 0.08 -0.03
0.75 0.62 -1.02 0.8 -1.17 -1.62 0.19 -0.05 -0.27 -0.25
0.62 0.74 -0.44 1.17 -2.45 -2.63 0.24 -0.31 -0.42 -0.47
0.35 0.34 -0.01 0.46 -0.44 -1.06 0.31 -0.08 -0.27 -0.22
0.74 0.81 -1.05 0.44 -2.45 -3.25 0.64 -0.14 -0.01 -0.01
0.64 0.49 -0.19 0.64 -0.86 -1.63 0.02 -0.18 -0.03 -0.22
0.48 0.42 -0.65 0.21 -0.76 -1.16 0.18 0.41 0.18 -0.27
0.84 0.84 0.22 0.62 -2.36 -2.22 0.01 -0.33 -0.5 -0.33
0.57 0.49 -0.0 0.39 -1.04 -1.04 0.11 -0.09 -0.23 -0.08
0.71 0.62 -1.07 0.45 -2.31 -3.16 0.45 0.06 0.23 0.12
0.78 0.46 -0.62 0.59 -1.19 -1.5 0.09 0.07 -0.14 -0.1
0.23 0.1 0.06 0.21 -0.28 -0.26 0.03 -0.0 -0.09 -0.09
0.56 0.23 0.02 0.58 -1.06 -1.24 0.18 -0.18 -0.08 -0.03
0.47 0.4 -0.07 0.1 -0.74 -1.21 0.22 0.07 0.1 -0.05
0.53 0.66 -1.08 0.73 -1.37 -1.94 0.46 -0.07 0.11 -0.35
0.52 0.46 -0.34 0.3 -1.12 -1.91 0.53 -0.02 0.01 -0.01
0.5 0.18 -0.12 0.32 -0.4 -0.82 0.15 -0.16 -0.13 0.07
0.3 0.67 -0.19 0.29 -0.89 -1.01 0.07 0.11 -0.09 -0.03
0.57 0.48 -1.54 0.41 -1.53 -2.12 0.73 0.06 0.4 -0.23
0.41 0.45 -0.29 0.38 -1.05 -1.24 0.27 0.01 0.05 0.03
0.59 0.71 -0.81 0.75 -2.1 -2.43 0.38 -0.04 0.17 -0.35
0.52 0.53 -0.99 0.38 -0.85 -1.17 0.52 -0.07 0.09 -0.2
0.41 0.37 -0.02 0.06 -0.22 -0.44 -0.23 -0.02 -0.24 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.