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Heatmap: Cluster_30 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.69 0.68 0.49 1.0 0.15 0.21 0.76 0.54 0.49 0.49
1.0 0.97 0.35 0.98 0.16 0.14 0.5 0.57 0.69 0.59
1.0 0.91 0.24 0.49 0.06 0.09 0.74 0.6 0.65 0.54
0.71 0.69 0.44 1.0 0.12 0.08 0.68 0.51 0.43 0.35
1.0 0.94 0.52 0.9 0.47 0.45 0.6 0.6 0.59 0.62
1.0 0.95 0.43 0.87 0.45 0.38 0.5 0.56 0.66 0.52
0.83 0.78 0.49 1.0 0.14 0.11 0.72 0.56 0.57 0.58
0.87 0.86 0.76 1.0 0.53 0.37 0.79 0.73 0.61 0.65
0.89 0.69 0.37 1.0 0.35 0.29 0.66 0.55 0.57 0.61
1.0 0.92 0.57 0.83 0.65 0.54 0.77 0.75 0.75 0.75
1.0 0.79 0.67 0.84 0.47 0.52 0.8 0.7 0.81 0.81
0.89 1.0 0.45 0.97 0.13 0.1 0.83 0.59 0.57 0.57
1.0 0.95 0.56 0.97 0.46 0.35 1.0 0.67 0.76 0.69
0.93 0.9 0.7 0.89 0.5 0.27 1.0 0.65 0.62 0.62
0.86 1.0 0.28 0.72 0.09 0.07 0.58 0.62 0.41 0.63
0.88 0.86 0.61 1.0 0.33 0.31 0.67 0.65 0.71 0.76
0.94 0.96 0.46 1.0 0.2 0.18 0.82 0.66 0.65 0.58
0.86 1.0 0.71 0.99 0.37 0.31 0.81 0.63 0.62 0.63
0.77 1.0 0.17 0.93 0.25 0.09 0.48 0.55 0.56 0.5
0.84 0.7 0.45 1.0 0.25 0.19 0.71 0.6 0.61 0.54
0.91 0.91 0.79 1.0 0.4 0.36 0.74 0.67 0.68 0.77
0.89 0.96 0.58 1.0 0.25 0.18 0.76 0.62 0.64 0.7
0.91 1.0 0.49 0.99 0.16 0.1 0.77 0.73 0.55 0.81
0.92 1.0 0.61 0.81 0.31 0.3 0.62 0.58 0.53 0.52
0.78 0.78 0.64 1.0 0.38 0.35 0.64 0.61 0.63 0.64
0.78 0.82 0.43 1.0 0.17 0.15 0.66 0.46 0.54 0.49
0.88 1.0 0.59 0.97 0.17 0.16 0.64 0.43 0.63 0.5
1.0 1.0 0.1 0.9 0.03 0.02 0.42 0.49 0.33 0.71
0.78 0.96 0.52 0.85 0.24 0.17 1.0 0.6 0.76 0.52
1.0 0.9 0.67 0.83 0.18 0.25 0.57 0.52 0.4 0.56
0.77 0.83 0.17 1.0 0.14 0.11 0.72 0.45 0.5 0.37
0.92 1.0 0.26 0.75 0.12 0.08 0.63 0.5 0.55 0.49
0.87 0.79 0.68 1.0 0.52 0.53 0.78 0.67 0.7 0.72
1.0 0.74 0.4 0.72 0.39 0.26 0.53 0.48 0.39 0.47
0.85 1.0 0.4 0.87 0.27 0.19 0.99 0.76 0.77 0.56
0.92 1.0 0.62 0.99 0.39 0.35 0.92 0.82 0.94 0.7
0.87 0.74 0.25 1.0 0.46 0.41 0.59 0.59 0.4 0.8
1.0 0.94 0.33 0.89 0.16 0.07 0.54 0.8 0.36 0.34
0.94 0.91 0.53 1.0 0.58 0.43 0.99 0.84 0.83 0.72
0.98 1.0 0.82 0.73 0.15 0.2 0.45 0.49 0.36 0.71
0.91 1.0 0.51 0.94 0.27 0.25 0.63 0.7 0.53 0.61
0.89 1.0 0.67 0.82 0.27 0.26 0.66 0.62 0.58 0.51
1.0 0.92 0.73 0.98 0.53 0.4 0.8 0.74 0.66 0.81
1.0 0.99 0.77 0.95 0.53 0.43 0.77 0.79 0.64 0.74
0.71 0.72 0.16 1.0 0.11 0.07 0.6 0.44 0.4 0.27
0.79 1.0 0.48 0.83 0.17 0.14 0.62 0.49 0.69 0.47
1.0 0.96 0.54 0.82 0.36 0.22 0.8 0.68 0.63 0.72
0.97 1.0 0.27 0.96 0.05 0.03 0.61 0.7 0.53 0.45
0.88 0.86 0.58 1.0 0.13 0.12 0.62 0.62 0.66 0.74
0.75 0.76 0.27 1.0 0.28 0.18 0.67 0.56 0.51 0.53
1.0 0.78 0.72 0.96 0.66 0.35 0.95 0.66 0.65 0.65
0.75 0.84 0.37 0.78 0.22 0.17 1.0 0.68 0.61 0.45
1.0 0.83 0.22 1.0 0.43 0.25 0.72 0.54 0.72 0.53
1.0 0.91 0.66 0.75 0.29 0.32 0.72 0.53 0.54 0.52
0.98 0.87 0.63 0.87 0.42 0.39 1.0 0.74 0.76 0.7
1.0 0.97 0.49 0.83 0.09 0.06 0.73 0.57 0.62 0.68
0.89 0.96 0.35 1.0 0.11 0.09 0.73 0.65 0.47 0.5
0.96 0.94 0.34 0.98 0.2 0.16 1.0 0.74 0.86 0.59
1.0 0.9 0.54 0.81 0.3 0.24 0.93 0.71 0.75 0.65
0.92 0.94 0.22 1.0 0.08 0.04 0.72 0.62 0.6 0.51
1.0 0.94 0.64 0.91 0.42 0.32 0.8 0.62 0.59 0.61
0.99 1.0 0.83 1.0 0.48 0.44 0.89 0.78 0.78 0.67
0.76 0.72 0.28 1.0 0.17 0.1 0.68 0.54 0.6 0.42
0.99 1.0 0.6 0.9 0.33 0.34 0.73 0.75 0.65 0.58
0.72 0.8 0.47 0.89 0.2 0.19 1.0 0.6 0.71 0.41
0.9 0.94 0.73 0.85 0.49 0.39 1.0 0.82 0.77 0.94
1.0 0.98 0.21 0.74 0.2 0.19 0.36 0.42 0.2 0.41
0.93 1.0 0.59 0.95 0.38 0.27 0.9 0.74 0.8 0.66
1.0 0.96 0.57 0.9 0.43 0.37 0.81 0.59 0.65 0.77
0.86 0.92 0.62 1.0 0.34 0.25 0.83 0.66 0.69 0.64
0.87 0.78 0.62 1.0 0.24 0.19 0.66 0.67 0.67 0.72
0.94 0.85 0.27 1.0 0.28 0.23 0.36 0.45 0.53 0.44
0.64 0.75 0.47 1.0 0.25 0.23 0.57 0.46 0.53 0.48
1.0 0.94 0.56 0.97 0.35 0.37 0.67 0.61 0.62 0.55
0.92 0.95 0.81 1.0 0.56 0.55 0.88 0.83 0.82 0.79
0.85 1.0 0.27 0.93 0.06 0.04 0.28 0.5 0.43 0.58
0.89 1.0 0.4 0.99 0.14 0.11 0.7 0.41 0.5 0.56
0.66 1.0 0.11 0.83 0.03 0.06 0.35 0.39 0.42 0.33
0.99 1.0 0.63 0.94 0.52 0.35 0.93 0.81 0.84 0.77
0.68 0.74 0.24 1.0 0.22 0.14 0.73 0.47 0.41 0.35
0.96 0.93 0.63 0.85 0.41 0.3 1.0 0.8 0.89 0.78
0.83 0.85 0.7 1.0 0.22 0.2 0.68 0.61 0.57 0.59
0.85 0.92 0.55 1.0 0.65 0.51 0.96 0.85 0.87 0.74
0.98 0.89 0.43 0.8 0.23 0.23 1.0 0.78 0.71 0.61
0.95 0.92 0.81 1.0 0.55 0.45 0.84 0.78 0.75 0.76
0.68 0.65 0.76 1.0 0.16 0.16 0.61 0.39 0.43 0.51
1.0 0.91 0.67 0.81 0.36 0.29 0.88 0.73 0.73 0.79
0.96 1.0 0.23 0.97 0.13 0.1 0.72 0.66 0.57 0.61
0.97 0.9 0.78 1.0 0.54 0.5 0.82 0.76 0.81 0.73
1.0 0.96 0.54 0.72 0.37 0.21 0.86 0.6 0.73 0.57
0.76 0.95 0.54 1.0 0.1 0.15 0.92 0.56 0.55 0.5
0.93 1.0 0.71 0.78 0.32 0.22 0.78 0.61 0.5 0.6
0.89 0.91 0.8 1.0 0.15 0.21 0.74 0.81 0.66 0.53
0.84 0.89 0.75 1.0 0.37 0.33 0.74 0.68 0.77 0.77
0.86 1.0 0.12 0.73 0.04 0.02 0.41 0.47 0.45 0.44
1.0 0.99 0.83 0.89 0.32 0.22 0.73 0.7 0.59 0.68
1.0 0.95 0.72 0.88 0.5 0.39 0.82 0.77 0.82 0.82
1.0 1.0 0.24 0.87 0.03 0.02 0.36 0.28 0.19 0.36
0.85 0.83 0.66 1.0 0.29 0.18 0.85 0.59 0.61 0.51
0.94 1.0 0.36 0.92 0.33 0.28 0.9 0.67 0.67 0.54
0.88 0.96 0.19 1.0 0.19 0.15 0.6 0.54 0.6 0.34
0.89 0.98 0.36 0.88 0.26 0.16 1.0 0.74 0.7 0.51
1.0 0.92 0.17 0.9 0.16 0.03 0.31 0.39 0.31 0.57
0.83 0.79 0.33 1.0 0.28 0.2 0.73 0.51 0.52 0.51
1.0 0.79 0.68 0.89 0.19 0.13 0.77 0.54 0.51 0.6
0.88 1.0 0.28 0.99 0.24 0.16 0.96 0.61 0.52 0.52
0.83 0.92 0.47 0.79 0.23 0.17 1.0 0.82 0.78 0.59
1.0 0.82 0.55 0.8 0.51 0.37 0.51 0.42 0.43 0.6
0.95 0.95 0.79 1.0 0.48 0.39 0.88 0.8 0.77 0.77
0.72 1.0 0.53 0.33 0.06 0.09 0.05 0.42 0.26 0.35
1.0 0.81 0.56 0.77 0.28 0.2 0.64 0.55 0.52 0.67
1.0 0.98 0.65 0.84 0.44 0.37 0.86 0.8 0.8 0.66
0.83 1.0 0.53 0.94 0.24 0.11 0.78 0.6 0.61 0.5
0.87 0.91 0.58 1.0 0.38 0.23 0.9 0.89 0.8 0.58
0.69 0.74 0.75 1.0 0.2 0.12 0.67 0.44 0.56 0.54
1.0 0.75 0.54 0.75 0.36 0.21 0.75 0.51 0.67 0.67
0.84 0.63 0.41 1.0 0.06 0.06 0.76 0.45 0.34 0.46
0.85 1.0 0.3 0.79 0.02 0.01 0.29 0.44 0.35 0.29
0.82 0.83 0.49 0.85 0.18 0.11 1.0 0.53 0.73 0.63
1.0 0.95 0.51 0.93 0.06 0.05 0.77 0.6 0.59 0.7
0.7 0.74 0.42 1.0 0.24 0.25 0.65 0.52 0.58 0.45
1.0 0.87 0.6 0.92 0.32 0.3 0.73 0.51 0.46 0.57
0.9 0.97 0.42 1.0 0.12 0.11 0.86 0.53 0.45 0.6
0.71 0.81 0.53 1.0 0.16 0.16 0.68 0.46 0.46 0.6
0.95 0.93 0.79 1.0 0.34 0.31 0.88 0.72 0.73 0.79
0.97 1.0 0.27 0.95 0.06 0.07 0.88 0.54 0.37 0.46
0.72 0.84 0.23 1.0 0.24 0.11 0.73 0.47 0.36 0.37
0.92 0.98 0.53 1.0 0.26 0.24 1.0 0.75 0.75 0.7
0.97 0.88 0.28 1.0 0.26 0.19 0.65 0.55 0.48 0.48
0.68 0.74 0.33 1.0 0.08 0.07 0.53 0.36 0.33 0.32
0.92 0.92 0.72 1.0 0.54 0.35 0.9 0.69 0.6 0.62
0.95 1.0 0.28 0.77 0.1 0.06 0.89 0.52 0.56 0.56
1.0 0.9 0.56 1.0 0.35 0.21 0.65 0.57 0.63 0.55
1.0 0.96 0.46 0.83 0.42 0.32 0.81 0.95 0.81 0.59
1.0 1.0 0.65 0.86 0.11 0.12 0.56 0.44 0.39 0.44
1.0 0.94 0.67 0.88 0.33 0.33 0.73 0.63 0.57 0.64
1.0 0.94 0.29 0.83 0.12 0.07 0.83 0.63 0.72 0.66
1.0 0.8 0.38 0.87 0.26 0.21 0.62 0.61 0.53 0.54
1.0 0.91 0.89 0.99 0.71 0.71 0.87 0.85 0.81 0.8
0.99 0.78 0.68 1.0 0.32 0.28 0.76 0.59 0.63 0.66
1.0 0.95 0.69 0.77 0.43 0.31 0.84 0.76 0.77 0.7
0.87 0.95 0.29 1.0 0.23 0.16 0.83 0.58 0.65 0.47
0.99 0.95 0.55 0.85 0.32 0.18 1.0 0.68 0.7 0.68
1.0 0.8 0.65 0.88 0.54 0.4 0.79 0.63 0.65 0.75
0.77 1.0 0.55 0.77 0.34 0.31 0.66 0.67 0.59 0.61
0.89 0.84 0.21 0.8 0.21 0.14 1.0 0.63 0.8 0.52
0.97 1.0 0.6 0.95 0.35 0.31 0.88 0.74 0.76 0.75
0.9 0.98 0.34 1.0 0.14 0.11 0.77 0.58 0.67 0.47
0.99 1.0 0.35 0.91 0.39 0.31 1.0 0.66 0.74 0.6
1.0 0.97 0.74 0.78 0.65 0.55 0.64 0.74 0.64 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)