Heatmap: Cluster_68 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
-2.6 -2.58 0.98 0.54 -0.29 -0.03 -0.51 0.32 0.26 0.36
-2.28 -1.9 0.47 0.94 0.05 -0.19 -0.54 0.0 0.23 0.54
-2.82 -3.23 0.88 0.61 -0.17 -0.09 -0.2 0.01 0.26 0.58
-1.91 -1.76 0.59 0.66 -0.11 0.13 0.01 0.07 0.17 0.21
-0.71 -0.48 0.71 0.04 -0.32 -0.23 -0.56 -0.01 0.28 0.55
- - 1.69 0.76 0.19 -0.85 -2.26 -0.95 0.38 0.44
-3.15 -2.64 1.42 -0.1 -0.85 -0.16 -0.22 0.11 0.4 0.5
-2.77 -3.0 0.81 0.13 -0.17 -0.42 0.01 0.33 0.43 0.71
-5.03 - 0.26 0.78 -1.04 0.04 0.05 0.3 0.36 0.99
-1.88 -1.6 0.58 1.16 -0.91 -0.92 -0.06 0.23 0.18 0.42
-1.59 -1.42 1.06 0.74 -0.21 -0.39 -1.0 -0.26 -0.44 0.88
-1.27 -0.92 0.52 1.49 -0.39 -0.62 -0.39 -0.66 -0.03 0.01
-0.71 -0.22 1.12 0.35 -1.28 -1.0 -1.15 0.07 0.2 0.6
-0.53 -0.65 0.46 0.55 -0.29 -0.35 -0.46 -0.0 0.22 0.42
-0.97 -0.88 0.6 1.0 -1.48 -1.38 -0.08 0.31 0.19 0.45
-2.88 -3.36 0.84 0.02 -0.4 0.28 -0.13 0.21 0.95 -0.01
-2.07 -2.26 0.87 0.41 -0.55 -0.1 -0.37 0.46 0.28 0.5
-1.3 -1.1 -0.05 0.98 -0.2 -0.25 -0.29 -0.11 0.29 0.6
-1.23 -1.17 0.64 0.69 -0.38 -0.5 -0.1 0.15 0.33 0.23
-2.17 -1.88 1.36 1.25 -1.89 -2.76 -0.01 -0.49 0.06 0.48
-1.65 -1.5 0.25 0.57 -0.09 0.33 -0.08 0.24 0.07 0.35
-2.89 -3.29 0.13 0.66 0.02 -0.13 -0.05 0.2 0.3 0.86
-5.66 -3.83 0.69 0.95 -1.3 -1.31 -0.27 0.48 0.25 1.09
-1.42 -1.44 0.76 0.77 -1.03 -1.39 -0.38 0.15 -0.19 1.16
-3.27 -2.74 1.17 0.96 -1.18 -0.51 -0.38 -0.21 0.08 0.78
-2.04 -2.84 0.9 -0.3 -0.07 0.15 -0.11 0.44 0.23 0.5
-1.27 -1.16 0.15 0.34 -0.09 -0.2 0.13 0.32 0.16 0.57
-2.48 -2.37 0.33 0.98 -0.1 -0.18 -0.35 0.15 -0.64 1.03
-0.32 0.01 0.43 0.93 -2.03 -2.29 -0.26 -0.02 -0.13 0.81
-1.02 -1.02 0.48 0.85 -0.45 -0.74 -0.13 -0.01 0.1 0.6
-1.05 -1.09 0.68 1.07 -1.31 -1.01 -0.68 0.05 0.29 0.65
-0.99 -1.07 0.31 1.1 -0.07 -0.34 -0.19 -0.18 -0.17 0.33
-2.74 -2.6 0.44 1.36 -0.05 -0.05 -0.21 -0.24 -0.16 0.28
-1.94 -2.74 0.29 0.05 -0.16 0.05 -0.22 0.48 0.47 0.81
- - 1.13 1.18 -4.06 -2.64 0.05 0.35 -0.05 1.04
- -7.44 -0.01 2.18 -3.03 -2.31 -3.35 -0.64 -0.18 1.33
-3.56 -3.94 0.89 1.36 -1.1 -0.96 -0.86 -0.05 0.13 0.89
-1.71 -1.18 0.57 0.78 -0.34 -0.34 -0.23 0.19 0.19 0.41
-1.35 -1.19 0.3 0.34 -0.14 -0.39 0.0 0.24 0.03 0.84
-4.05 -4.22 0.28 0.18 0.13 -0.07 0.03 0.49 0.42 0.8
-3.32 -2.88 0.9 0.26 -0.57 -0.42 -0.09 0.62 0.49 0.48
-1.34 -1.04 0.53 -0.03 -0.48 -0.51 0.01 0.64 0.23 0.62
-4.47 -5.05 -0.06 -0.16 0.13 0.08 0.22 0.53 0.38 1.01
-1.34 -1.3 0.22 1.13 -0.41 -0.72 -0.48 -0.23 -0.05 0.96
-1.52 -1.48 0.63 1.29 -2.55 -2.36 -0.49 -0.05 -0.07 1.21
- - 1.67 1.47 - - - -0.31 -2.04 1.59
- - 2.28 - -1.12 -0.53 - 0.41 1.24 -1.68
-1.04 -0.99 -0.49 0.88 -0.22 -0.06 0.11 0.11 0.16 0.45
-0.61 -0.64 1.04 0.84 -1.89 -1.05 -0.65 -0.14 -0.14 0.72
-2.43 -1.73 0.6 0.67 -0.51 -0.22 0.1 0.39 0.2 0.39
-0.82 -1.04 1.41 -0.45 -3.99 -4.25 -0.85 -0.44 0.52 1.44
-1.31 -1.22 0.05 0.61 -0.32 -0.32 -0.26 0.2 0.24 0.88
-4.9 -5.4 0.96 0.6 -0.17 0.32 -1.12 0.07 -0.76 1.17
-1.23 -1.24 0.69 0.85 -0.85 -1.09 -0.54 0.14 0.54 0.55
-1.32 -1.31 0.49 0.81 -0.37 -0.11 -0.28 -0.03 0.03 0.6
-0.32 -0.44 0.22 0.38 -0.28 -0.4 0.21 -0.09 -0.13 0.49
-0.8 -0.76 0.1 0.88 -0.21 -0.33 -0.01 -0.1 0.24 0.21
- - 1.37 0.91 -2.52 -2.2 -0.26 0.1 -0.03 1.18
-0.73 -0.5 0.73 0.8 -0.73 -0.68 -0.13 -0.11 -0.05 0.33
-0.59 -0.45 0.24 0.74 -1.0 -0.75 -0.13 0.05 0.09 0.71
-0.67 -0.72 0.5 0.26 0.02 0.05 -0.34 -0.12 0.1 0.4
-3.5 -3.08 0.58 1.58 -0.64 -0.31 -1.03 -0.37 -0.34 0.86
-0.62 -0.72 0.63 0.55 -0.24 -0.58 -0.22 -0.16 0.04 0.53
-1.92 -1.87 0.07 0.38 0.21 0.17 -0.33 0.18 0.38 0.68
-1.31 -1.24 0.72 0.93 -0.12 -0.16 -0.3 -0.2 -0.02 0.18
-1.15 -1.07 0.96 0.7 -1.17 -1.84 -0.3 -0.14 0.0 1.04
-0.7 -0.55 0.25 0.76 -0.2 -0.26 -0.31 -0.12 0.14 0.35
-1.26 -1.21 0.65 1.04 -0.72 -0.84 -0.32 -0.03 0.09 0.59
-6.24 -5.98 0.15 1.76 0.01 -1.07 -0.95 -0.06 0.01 0.59
-1.05 -0.76 0.07 1.34 -2.57 -2.5 -0.09 0.1 0.26 0.84
-6.96 -7.13 1.48 1.03 -1.23 -0.68 -1.24 -0.88 -0.59 1.31
- - 1.44 0.7 -1.0 -0.82 -2.26 -0.57 -0.4 1.56
-1.94 -1.8 0.74 0.66 -0.48 -0.03 0.02 0.08 0.23 0.35
-2.13 -2.06 0.8 0.54 -0.18 -0.24 -0.03 0.26 -0.03 0.55
-0.82 -0.66 0.3 0.49 -0.32 -0.42 -0.18 0.05 0.28 0.58
-4.72 -5.03 0.63 1.48 -0.62 -0.45 -1.04 -0.55 -0.18 1.1
-1.61 -1.33 0.36 0.77 -0.08 -0.32 -0.35 0.21 0.2 0.53
-0.25 -0.08 1.15 0.68 -1.64 -1.26 -0.99 0.05 -0.25 0.35
-1.05 -1.03 0.4 -0.19 -0.01 0.05 0.23 0.16 0.1 0.52
-8.08 -8.26 -0.11 1.64 -0.35 -0.23 -1.88 -0.32 0.48 0.89
-0.98 -0.82 0.39 0.78 -0.54 -0.46 0.03 0.13 0.06 0.41
-1.7 -2.02 0.83 1.09 -1.25 -0.51 -1.07 -0.2 0.05 1.02
-1.7 -1.93 0.63 0.25 -0.18 -0.1 -0.08 -0.05 0.25 0.83
-1.14 -1.13 0.59 0.16 -0.45 -0.11 -0.19 0.36 0.27 0.53
-0.92 -0.87 0.27 1.12 -0.51 -0.31 -0.39 -0.22 -0.16 0.6
-4.65 -4.82 0.87 1.72 -0.4 -0.95 -1.23 -0.65 0.11 0.48
-0.66 -0.66 0.42 0.03 -0.22 0.01 0.12 0.15 0.17 0.26
-1.86 -1.78 -0.34 0.74 0.1 -0.18 -0.4 0.13 0.2 1.02
- - 0.99 0.86 -2.38 -2.45 0.19 0.85 0.85 0.12
-1.25 -1.26 0.24 0.35 -0.03 -0.32 -0.06 0.25 0.33 0.61
-2.34 -2.08 0.37 0.72 -0.15 0.03 -0.03 0.46 -0.15 0.53
-0.34 -0.42 0.18 0.39 -0.25 -0.29 -0.23 0.06 0.19 0.4
-2.68 -2.48 0.55 0.1 -0.51 -0.09 -0.36 0.03 0.82 0.94
-3.48 -4.97 1.44 0.86 -1.28 -1.11 -1.18 0.28 0.25 0.71
-0.97 -0.85 0.54 0.95 -0.45 -0.9 -0.25 0.18 -0.01 0.4
-0.82 -0.95 0.45 0.52 -0.24 -0.51 0.02 0.06 0.16 0.49
-3.36 -3.51 0.85 1.74 -0.73 -0.23 -1.4 -0.71 -0.7 0.7
-1.39 -1.34 0.5 0.71 -0.25 -0.12 -0.36 0.04 0.08 0.63
-2.81 -0.91 1.12 0.47 0.06 -0.16 -0.87 0.24 0.22 -0.09
-3.68 -3.84 0.48 1.09 0.09 -0.25 -0.83 -0.13 -0.13 1.03
-1.9 -1.92 0.63 0.79 -0.33 -0.49 -0.08 0.15 0.15 0.59
-4.83 -5.15 1.21 0.52 -0.73 -0.34 -0.5 0.23 0.25 0.79
-1.3 -1.4 0.4 0.12 0.02 0.22 -0.11 0.26 0.48 0.15
-0.88 -0.88 0.51 -0.03 -0.17 0.03 -0.05 0.21 -0.05 0.6
-5.3 -5.0 1.15 0.78 -1.67 -1.76 -1.01 0.31 -0.0 1.41
-2.47 -2.42 0.58 0.43 -0.39 -0.6 0.45 0.43 0.38 0.44
-3.3 -3.22 0.78 0.6 -0.52 -1.0 -0.09 0.17 -0.09 1.24
-2.79 -2.59 1.64 0.61 -1.45 -2.01 -0.47 -0.55 -0.28 1.13
-1.27 -1.12 0.2 0.37 -0.17 0.04 -0.15 0.02 -0.05 0.91
-0.77 -0.69 0.31 0.5 -0.57 -0.74 0.25 0.15 0.06 0.61
-1.34 -0.95 0.51 0.12 -0.15 -0.02 0.1 0.28 0.08 0.44
-2.4 -2.32 0.51 1.6 -0.72 -0.68 -0.65 -0.54 -0.1 0.74
-1.76 -1.7 0.43 0.8 -0.52 -0.12 -0.14 -0.12 0.28 0.71
-2.81 -3.14 0.58 1.0 -0.38 -0.52 -0.37 0.19 0.06 0.86
-0.76 -0.78 0.45 0.54 -0.18 -0.5 -0.1 0.09 0.08 0.45
-0.64 -0.64 0.82 0.94 -2.08 -2.35 -0.08 0.17 -0.01 0.61
-1.57 -1.3 0.37 0.27 -0.18 0.09 -0.1 0.28 -0.01 0.74
-1.46 -1.17 0.29 0.02 0.01 -0.04 0.02 0.35 0.34 0.5
-1.09 -1.04 0.56 0.19 -0.29 0.01 0.02 0.25 0.31 0.21
-3.87 -3.98 0.56 1.71 -0.53 -0.58 -0.59 -0.41 -0.47 0.7
-0.56 -0.61 0.23 0.34 -0.24 -0.33 -0.05 0.1 0.25 0.44
-2.42 -2.57 0.28 1.49 -0.83 -1.36 -0.53 0.15 0.36 0.68
-1.44 -1.47 0.4 0.45 -0.51 -0.39 0.1 0.11 0.22 0.84
-1.65 -1.73 -0.3 1.16 -0.69 -0.99 -1.33 -0.84 1.05 1.13
-2.73 -2.12 0.8 1.51 -0.76 -0.55 -0.93 -0.11 0.04 0.36
-2.7 -1.87 1.42 0.34 -1.66 -2.63 0.45 0.26 0.62 0.08
-3.2 -5.37 1.08 0.79 -2.43 -1.13 0.23 0.1 0.76 0.52
-1.31 -1.5 0.78 0.48 -0.75 -0.46 -0.0 0.13 0.03 0.75
-0.32 -0.43 0.42 0.97 -1.12 -1.2 -0.34 -0.17 -0.1 0.73
-1.0 -1.0 0.66 0.58 -0.31 -0.33 -0.19 -0.01 0.16 0.41
- - 2.19 1.68 -2.98 -1.4 - -2.08 -0.67 -0.25
-4.23 -2.78 0.97 0.67 -0.94 0.01 -0.78 -1.36 0.87 0.94
-1.12 -1.04 0.56 1.12 -0.84 -1.07 -0.18 -0.2 -0.1 0.75
-0.64 -1.02 0.6 1.02 -1.81 -0.7 -2.76 -0.67 0.05 1.38
-1.06 -0.83 0.39 0.76 -0.37 -0.46 -0.28 0.08 0.12 0.58
-1.1 -1.13 0.59 0.34 -0.39 -0.3 -0.45 0.45 0.2 0.57
-0.91 -0.93 0.67 0.43 -0.37 -0.3 -0.25 0.13 0.06 0.53
-2.19 -2.13 0.71 0.21 -0.06 0.04 -0.16 0.34 0.24 0.52
-1.01 -0.69 0.36 0.72 -0.48 -0.51 -0.38 0.25 -0.22 0.78
-1.09 -1.09 0.55 0.35 -0.48 -0.07 -0.11 0.29 0.2 0.45
-0.68 -0.45 0.87 0.69 -2.12 -2.29 -0.78 -0.42 -0.29 1.39
-2.02 -2.16 -0.06 1.56 -0.64 -0.51 -0.0 -0.12 0.05 0.4
-0.35 -0.43 0.53 0.53 -0.32 -0.04 -0.39 0.0 -0.24 0.26
-0.65 -0.54 0.37 0.49 -0.54 -0.55 0.42 -0.06 0.1 0.3
-2.39 -2.5 0.71 1.34 -0.25 -0.2 -0.23 -0.32 -0.01 0.14
-0.9 -0.63 0.63 0.83 -1.52 -1.57 0.01 0.15 0.31 0.55
-1.15 -0.91 0.17 0.38 -0.0 0.08 0.21 0.2 0.19 0.11
-0.56 -0.44 0.34 0.37 -0.05 -0.42 -0.1 0.04 -0.02 0.44
-2.14 -1.99 0.2 0.93 -0.16 0.14 -0.42 -0.19 0.37 0.64
-2.09 -2.1 0.13 0.98 0.03 -0.23 -0.5 -0.09 0.01 0.96
- - 1.25 0.97 -1.45 -0.68 0.37 0.07 -0.07 0.47
- -4.86 1.35 1.31 -1.65 -2.03 -2.35 -0.29 -1.37 1.57
-0.42 -0.56 -0.34 0.56 0.15 -0.07 -0.1 -0.15 0.18 0.36
-2.7 -2.08 0.74 1.41 -1.65 -2.67 -1.56 -0.27 -0.56 1.56
-0.68 -0.59 0.22 1.07 -0.71 -0.69 -0.31 -0.22 -0.21 0.75
-1.01 -0.92 0.36 0.82 -0.55 -0.19 -0.25 -0.03 0.27 0.42
-0.72 -0.82 0.6 0.33 -0.24 -0.72 -0.53 0.11 0.09 0.82
-2.08 -1.98 0.99 0.84 -0.34 -0.5 -1.73 0.39 0.32 0.46
-2.54 -2.35 0.7 0.23 -0.5 -0.16 -0.02 0.34 0.19 0.88
-2.46 -2.89 0.52 -0.27 -0.31 -0.01 0.49 0.33 0.44 0.68
-0.68 -0.64 0.16 0.29 0.06 -0.05 -0.17 0.09 0.2 0.37
-5.93 -4.09 0.84 0.55 -1.48 -0.47 -0.41 0.76 0.47 0.81
-0.58 -0.55 0.35 0.98 -0.7 -0.95 -0.11 -0.25 0.06 0.53
-3.25 -2.47 0.19 1.56 -0.32 0.03 -0.45 -0.23 -0.3 0.5
- -3.21 1.52 1.33 -1.43 -2.27 -1.69 -0.75 -0.26 1.13
- - 1.01 0.71 -0.43 -0.26 -0.37 0.08 0.29 0.78
-1.19 -0.96 0.55 0.65 -0.45 -0.33 -0.45 0.08 -0.05 0.79
-2.52 -3.06 0.4 1.34 -0.46 -0.91 -0.06 0.37 0.1 0.35
-1.4 -1.29 0.85 1.02 -1.23 -0.79 -0.81 -0.18 0.33 0.74
- - 0.16 2.03 -1.37 -0.29 -1.46 -0.43 -0.58 0.86
-2.62 -2.67 1.77 1.32 -1.39 -1.1 -3.72 -1.62 -0.31 0.78
-2.62 -2.3 0.84 1.28 -1.49 -1.37 -0.7 -0.15 0.11 1.06
-2.03 -1.81 0.59 1.07 -0.77 -0.56 -0.25 0.0 0.15 0.72
-1.88 -1.59 0.67 0.03 -0.23 0.08 -0.4 0.12 0.45 0.73
-2.25 -2.35 1.03 1.01 -0.94 -0.62 -0.55 -0.06 -0.15 0.86
-4.96 -3.8 1.23 -0.12 -0.3 0.32 -1.03 0.16 0.32 0.78
-0.62 -0.58 0.08 0.62 -0.21 -0.37 0.02 0.1 0.1 0.36
-1.13 -0.93 0.52 1.33 -0.41 -0.9 -1.23 -0.58 -0.51 0.99
-3.02 -2.88 0.62 1.11 -0.23 -0.54 -0.31 -0.06 0.06 0.77
-0.95 -1.47 0.88 0.87 -1.62 -0.65 -0.08 -0.19 0.04 0.72
- - 1.52 -0.62 0.18 -1.22 - -0.83 1.0 1.24
-0.36 -0.34 0.6 0.62 -0.69 0.02 -0.09 -0.34 -0.05 0.06
-1.39 -1.54 0.41 0.31 -0.04 0.05 0.14 0.08 0.14 0.52
-1.26 -2.65 0.73 0.21 -0.53 -0.41 0.27 0.19 0.38 0.6
-1.04 -1.03 0.34 0.08 -0.24 0.08 0.06 0.14 0.43 0.39
-0.47 -0.89 0.69 -0.31 -1.62 -1.23 -0.28 0.1 0.45 1.2
-5.65 -8.35 1.91 0.28 -2.17 -0.81 -3.91 -0.47 -0.02 1.29
-1.52 -1.17 0.77 0.49 -0.52 -0.29 -0.18 0.32 -0.21 0.66
-5.45 -5.62 0.18 0.39 -0.45 0.08 -0.28 0.48 0.52 1.05
-1.78 -1.88 1.22 1.24 -2.26 -2.01 -1.02 0.29 0.2 0.52
-2.52 -2.41 0.66 -0.15 -0.09 0.28 -0.41 0.32 0.06 0.97
-1.72 -1.6 0.4 0.87 -0.35 -0.48 0.06 0.18 0.26 0.41
-4.7 -4.49 0.2 1.99 -0.76 -1.02 -1.19 -0.56 -1.02 1.07
-1.23 -1.14 0.7 1.0 -1.4 -0.79 -0.27 -0.61 0.58 0.65
-1.42 -1.24 0.22 0.71 -0.17 -0.08 -0.68 -0.31 0.27 0.95
-2.05 -2.06 -0.05 0.41 -0.08 -0.48 0.37 0.34 0.24 0.86
-5.98 -5.44 -0.13 1.49 -0.74 -0.4 -1.31 -0.34 0.51 1.17
- - 0.18 0.36 -0.48 -0.39 -0.17 0.75 0.21 1.24
-3.96 -3.78 0.84 0.51 -0.41 0.27 -0.06 0.28 0.3 0.37
-1.48 -1.05 0.13 0.91 -0.21 -0.38 -0.35 0.23 -0.05 0.7
-1.6 -1.54 0.67 0.82 -0.32 -0.97 0.23 0.23 0.11 0.31
-1.09 -0.86 0.64 0.66 -1.68 -1.79 -0.33 0.12 0.15 1.17
-2.33 -2.4 0.75 0.79 -0.85 -1.19 -0.45 0.25 0.25 1.07
-0.37 -0.69 0.46 0.39 -0.14 -0.13 -0.51 0.13 0.15 0.26
-0.69 -0.7 0.41 0.45 -0.38 -0.24 -0.21 0.16 0.14 0.46
-1.38 -1.27 0.84 0.52 -0.32 -0.65 -0.45 -0.02 -0.03 0.88
-0.61 -0.55 -0.2 0.3 -0.64 0.09 0.22 0.03 0.39 0.44
-1.6 -1.35 0.39 0.5 -0.19 0.14 -0.42 0.24 0.41 0.39
-2.39 -2.41 0.51 0.75 -0.34 -0.3 -0.92 -0.05 0.47 1.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.