1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_231 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.97 1.0 0.11 0.41 0.03 0.02 0.58 0.41 0.46 0.44
1.0 0.99 0.42 0.6 0.39 0.31 0.83 0.58 0.6 0.5
0.94 1.0 0.31 0.43 0.37 0.24 0.7 0.51 0.47 0.31
0.97 1.0 0.44 0.49 0.38 0.4 0.85 0.46 0.57 0.32
1.0 0.94 0.14 0.35 0.04 0.04 0.81 0.67 0.54 0.28
1.0 0.97 0.21 0.16 0.2 0.11 0.54 0.23 0.37 0.22
1.0 0.94 0.41 0.47 0.13 0.12 0.5 0.51 0.37 0.39
0.99 1.0 0.11 0.28 0.11 0.09 0.8 0.57 0.52 0.53
0.95 1.0 0.45 0.52 0.5 0.34 0.88 0.62 0.64 0.47
0.97 1.0 0.2 0.46 0.33 0.27 0.58 0.41 0.43 0.32
1.0 0.96 0.43 0.57 0.4 0.38 0.83 0.58 0.63 0.6
1.0 0.9 0.55 0.61 0.53 0.46 0.8 0.53 0.52 0.51
0.93 0.97 0.22 0.69 0.18 0.14 1.0 0.91 0.74 0.49
1.0 0.91 0.34 0.46 0.49 0.39 0.62 0.53 0.53 0.5
1.0 0.99 0.33 0.42 0.19 0.17 0.6 0.57 0.51 0.4
1.0 0.73 0.15 0.3 0.14 0.12 0.49 0.38 0.43 0.38
0.9 1.0 0.08 0.25 0.05 0.03 0.74 0.44 0.48 0.51
0.96 1.0 0.13 0.31 0.14 0.19 0.48 0.42 0.53 0.39
0.89 1.0 0.34 0.52 0.19 0.14 0.8 0.66 0.69 0.51
1.0 0.93 0.15 0.39 0.08 0.05 0.47 0.35 0.39 0.25
0.86 1.0 0.09 0.17 0.04 0.02 0.6 0.46 0.45 0.56
1.0 0.9 0.3 0.46 0.31 0.27 0.64 0.43 0.5 0.41
1.0 0.9 0.51 0.52 0.41 0.36 0.62 0.52 0.47 0.59
1.0 0.87 0.17 0.35 0.16 0.12 0.49 0.38 0.35 0.23
1.0 0.97 0.36 0.57 0.27 0.22 0.61 0.62 0.54 0.57
0.96 1.0 0.15 0.34 0.1 0.05 0.59 0.49 0.6 0.48
1.0 0.99 0.14 0.46 0.1 0.05 0.63 0.55 0.55 0.52
0.89 1.0 0.19 0.5 0.15 0.14 0.59 0.41 0.52 0.5
0.98 1.0 0.05 0.09 0.03 0.03 0.46 0.21 0.24 0.09
0.98 1.0 0.24 0.36 0.24 0.19 0.77 0.48 0.54 0.43
0.87 1.0 0.23 0.5 0.23 0.18 0.42 0.27 0.26 0.14
0.97 1.0 0.18 0.47 0.22 0.21 0.54 0.42 0.56 0.33
1.0 0.92 0.42 0.36 0.38 0.28 0.62 0.58 0.64 0.48
0.97 1.0 0.11 0.54 0.06 0.07 0.57 0.48 0.53 0.53
1.0 0.98 0.18 0.39 0.09 0.05 0.51 0.53 0.6 0.51
0.83 1.0 0.08 0.23 0.03 0.03 0.62 0.41 0.43 0.4
0.87 1.0 0.09 0.43 0.1 0.07 0.6 0.38 0.48 0.36
0.97 1.0 0.18 0.43 0.14 0.14 0.66 0.49 0.43 0.33
0.99 1.0 0.3 0.42 0.26 0.21 0.71 0.58 0.59 0.47
0.88 1.0 0.12 0.33 0.03 0.02 0.7 0.44 0.51 0.58
0.94 1.0 0.21 0.59 0.3 0.23 0.83 0.65 0.68 0.49
0.97 1.0 0.08 0.28 0.09 0.06 0.61 0.48 0.53 0.48
1.0 0.85 0.06 0.06 0.04 0.04 0.52 0.23 0.2 0.07
1.0 0.95 0.35 0.37 0.27 0.23 0.68 0.51 0.57 0.52
0.78 1.0 0.3 0.51 0.39 0.3 0.71 0.72 0.67 0.61
1.0 0.95 0.5 0.48 0.62 0.41 0.61 0.59 0.65 0.58
1.0 0.88 0.27 0.5 0.17 0.14 0.53 0.48 0.51 0.47
1.0 0.99 0.06 0.18 0.04 0.02 0.71 0.44 0.48 0.51
0.99 1.0 0.39 0.49 0.33 0.22 0.61 0.55 0.56 0.53
0.92 1.0 0.11 0.39 0.1 0.08 0.62 0.43 0.56 0.49
0.8 1.0 0.19 0.36 0.05 0.02 0.65 0.4 0.54 0.3
0.92 1.0 0.52 0.57 0.5 0.46 0.67 0.52 0.57 0.47
1.0 0.99 0.29 0.5 0.2 0.25 0.51 0.28 0.22 0.24
0.98 1.0 0.37 0.4 0.32 0.26 0.65 0.56 0.6 0.53
1.0 0.91 0.18 0.18 0.1 0.11 0.5 0.31 0.31 0.17
0.89 1.0 0.12 0.4 0.07 0.03 0.63 0.41 0.45 0.59
1.0 0.99 0.23 0.45 0.25 0.19 0.66 0.47 0.49 0.36
1.0 0.91 0.52 0.67 0.57 0.48 0.7 0.57 0.59 0.56
1.0 0.97 0.44 0.55 0.51 0.4 0.69 0.54 0.55 0.49
1.0 0.98 0.26 0.31 0.31 0.26 0.69 0.57 0.55 0.43
0.81 1.0 0.1 0.46 0.12 0.09 0.6 0.5 0.54 0.6
0.82 1.0 0.21 0.58 0.12 0.07 0.73 0.67 0.47 0.43
1.0 0.99 0.37 0.6 0.37 0.28 0.99 0.62 0.62 0.51
1.0 0.92 0.13 0.25 0.03 0.02 0.73 0.48 0.5 0.5
0.9 1.0 0.15 0.39 0.13 0.09 0.56 0.36 0.43 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)