Heatmap: Cluster_170 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
-0.93 -0.74 0.58 0.66 -0.0 -0.32 -0.14 0.06 -0.1 0.18
-0.25 -0.51 0.85 0.27 -0.54 -0.19 -0.25 0.13 0.07 -0.16
-2.1 -1.94 0.62 0.23 0.32 0.17 -0.43 0.2 0.03 0.6
-1.12 -1.2 0.84 0.82 -0.03 -0.08 -0.33 -0.16 -0.2 0.09
-1.54 -1.41 0.84 0.78 0.04 0.17 -0.21 -0.07 -0.19 -0.12
-1.55 -1.34 0.62 0.45 -0.01 -0.31 0.17 0.28 0.2 0.1
-2.18 -1.9 0.55 0.5 -0.03 -0.01 0.01 0.26 0.18 0.4
-2.4 -2.42 0.91 0.93 -0.19 -0.07 -0.06 -0.14 0.12 0.07
-1.71 -1.44 1.18 0.79 -0.25 0.09 -0.57 -0.2 -0.11 -0.06
-1.25 -1.15 1.05 0.93 -0.36 -0.29 -0.73 -0.23 -0.39 0.42
-1.61 -1.58 0.76 0.55 0.03 -0.15 -0.25 0.1 0.09 0.36
-1.08 -1.1 1.0 0.6 -0.31 -0.19 0.02 0.04 -0.03 -0.23
-1.24 -1.17 0.62 0.28 0.14 0.3 -0.09 0.02 0.03 0.08
-0.67 -0.54 0.66 0.29 -0.12 0.09 -0.05 0.01 -0.03 -0.08
-1.89 -1.89 0.84 0.65 -0.12 -0.16 0.03 0.05 0.09 0.22
-1.81 -1.58 0.72 0.89 -0.4 -0.45 -0.08 0.08 0.26 0.26
-1.64 -1.6 0.92 0.86 -0.37 -0.3 0.04 -0.01 0.02 0.02
-2.74 -2.64 1.24 0.3 0.09 0.13 -0.28 0.1 0.02 0.06
-1.55 -1.83 1.21 0.73 0.02 -0.03 -0.59 -0.28 -0.21 0.08
-1.44 -1.48 0.7 0.01 -0.27 0.24 -0.45 0.21 -0.14 0.87
-0.71 -0.75 0.44 0.32 -0.1 -0.12 0.2 0.08 0.13 0.05
-1.07 -1.03 0.57 0.25 0.1 -0.11 -0.21 0.17 0.19 0.29
-2.8 -2.55 0.88 0.55 0.18 0.45 -0.66 0.03 -0.09 0.36
-1.15 -1.09 1.36 1.03 -0.32 -0.23 -0.85 -0.44 -0.42 -0.36
-1.65 -1.75 0.9 0.12 -0.01 0.29 -0.21 -0.02 0.01 0.44
-1.66 -1.58 1.3 0.67 -0.8 -0.26 0.08 0.03 -0.13 -0.16
-1.93 -1.82 0.94 0.21 -0.14 -0.11 0.22 0.3 0.19 0.01
-1.6 -1.52 1.2 1.02 -0.31 -0.48 -0.65 -0.3 -0.35 0.32
-2.33 -2.58 0.78 0.6 0.1 -0.12 0.12 0.15 0.11 0.18
-1.92 -1.63 1.04 0.24 -0.32 0.18 -0.2 0.23 -0.28 0.45
-2.14 -2.05 0.95 0.56 0.03 -0.22 0.01 0.14 0.1 0.09
-3.97 -4.25 1.35 1.19 -0.16 -0.56 -0.48 -0.12 -0.18 -0.07
-3.74 -3.49 1.16 0.95 0.08 0.03 -0.56 -0.12 -0.14 0.13
-2.68 -2.66 1.14 0.37 0.22 0.26 -0.34 -0.08 -0.07 0.19
-0.66 -0.73 0.61 0.29 -0.1 0.05 -0.11 -0.11 0.01 0.24
-1.45 -1.37 1.07 0.33 -0.05 0.15 -0.3 0.15 -0.28 0.11
-1.38 -1.4 0.7 0.22 -0.1 -0.09 0.18 0.09 0.19 0.31
-3.02 -2.98 0.94 0.49 0.35 0.31 -0.36 0.21 -0.01 -0.02
-1.42 -1.45 0.66 0.23 -0.02 0.01 -0.06 0.27 0.2 0.27
- -3.19 1.51 1.15 -1.93 -0.33 -0.67 -0.36 0.39 0.05
-2.58 -2.47 1.2 0.11 0.05 0.09 -0.35 -0.03 0.06 0.46
-5.14 -5.31 1.14 1.24 -0.34 -0.22 -0.28 -0.07 -0.09 0.02
-1.64 -1.67 0.74 0.9 -0.26 -0.24 -0.21 0.03 0.07 0.28
-1.79 -1.85 0.51 1.11 0.07 -0.05 -0.27 -0.18 -0.09 0.24
-1.9 -1.93 1.18 0.77 0.14 0.01 -0.4 -0.19 -0.26 -0.11
-1.71 -1.59 1.16 0.61 -0.4 -0.35 -0.18 -0.05 -0.01 0.28
-0.71 -0.78 0.85 0.49 -0.17 -0.14 -0.17 -0.04 -0.02 -0.06
-2.19 -2.15 1.18 0.63 -0.1 0.3 -0.69 -0.14 -0.06 0.14
-1.47 -1.63 0.68 0.5 -0.1 0.08 0.16 0.08 -0.08 0.25
-3.69 -3.2 1.13 -0.5 -0.88 0.26 -1.47 0.98 -0.23 0.99
-3.78 -3.57 0.9 0.51 0.24 0.48 -0.65 0.13 0.04 0.27
-0.67 -0.59 0.38 0.23 -0.14 -0.09 -0.11 0.19 0.18 0.25
-1.13 -1.04 0.22 0.32 0.05 -0.58 -0.11 0.42 0.35 0.49
-4.99 - 0.98 1.33 0.42 0.02 -0.83 -0.2 -0.71 0.14
-1.27 -1.85 1.31 -0.25 -2.42 -1.47 0.08 0.51 0.55 0.58
-1.82 -1.67 0.74 0.6 0.13 0.15 -0.16 -0.02 -0.14 0.29
-1.39 -1.18 0.46 0.3 -0.05 -0.2 -0.22 0.41 0.35 0.35
-1.86 -1.43 0.96 0.63 -0.28 0.07 -0.19 0.04 -0.17 0.27
-0.83 -0.91 0.66 0.5 0.09 0.12 -0.11 -0.18 -0.13 0.04
-0.64 -0.63 0.31 0.26 0.07 -0.38 -0.04 0.05 0.2 0.37
-6.1 -6.41 1.23 0.66 -0.61 -0.2 -0.38 0.24 -0.1 0.7
-2.21 -1.92 0.81 0.98 -0.16 -0.33 0.04 0.1 -0.16 0.13
-4.31 -3.81 1.32 1.05 0.1 0.1 -0.19 -0.24 -0.44 -0.52
- - 1.37 1.55 - - - 0.17 0.05 1.22
-0.94 -0.97 0.69 0.35 0.03 0.27 -0.33 0.05 -0.03 0.05
-5.06 -4.37 1.45 1.42 -0.27 -0.73 -1.33 0.16 -0.43 -0.26
-3.79 -3.85 1.53 1.13 -0.36 -0.38 -0.64 -0.4 -0.53 0.2
-2.11 -1.91 1.08 0.6 -0.08 -0.19 0.08 0.11 -0.07 -0.06
-3.43 -3.17 1.49 1.05 -0.58 -0.34 -0.13 0.12 -0.22 -0.72
-6.07 -7.24 1.4 0.59 -0.52 -0.3 -0.37 0.46 0.19 0.06
-1.39 -1.27 0.7 0.38 -0.18 0.08 0.11 0.16 0.06 0.13
-0.18 -1.34 1.62 -0.42 -2.24 -1.06 -0.41 -0.27 -0.44 0.92
-1.09 -0.97 0.02 0.43 -0.12 -0.0 0.31 0.01 0.03 0.56
-9.26 - 1.12 1.04 -0.63 -0.32 -0.14 0.53 -0.05 0.0
-1.53 -1.51 1.27 0.18 -0.21 0.28 -0.48 -0.08 -0.27 0.24
-1.45 -1.35 0.64 0.35 0.05 0.19 -0.14 0.1 -0.18 0.47
-0.87 -0.83 0.96 0.44 -0.31 -0.22 -0.09 -0.02 -0.04 0.03
-2.4 -2.27 0.58 0.1 -0.24 -0.27 0.28 0.6 0.44 0.34
-1.43 -1.37 0.69 1.04 -0.07 -0.25 -0.25 -0.08 -0.07 0.06
-1.71 -1.41 1.09 0.85 -0.39 -0.07 -0.32 -0.01 0.06 -0.27
-1.58 -1.24 0.8 0.78 -0.17 0.01 -0.32 0.04 -0.17 0.22
- - 1.94 1.08 0.04 -1.01 -0.41 -0.69 -1.45 -0.35
-1.53 -1.47 0.89 0.5 0.06 -0.08 -0.15 0.04 0.01 0.14
-1.61 -1.34 0.97 0.11 -0.11 0.3 -0.62 -0.1 -0.18 0.69
-1.74 -1.77 0.38 0.46 -0.26 -0.45 0.37 0.36 0.52 0.2
-2.37 -2.15 0.47 0.4 -0.31 -0.09 0.16 0.59 0.2 0.43
-1.44 -1.39 0.39 0.51 0.04 0.16 0.07 0.19 -0.01 0.24
-1.59 -1.55 1.15 0.56 -0.11 0.01 -0.49 0.08 -0.1 0.0
-0.96 -0.94 0.89 0.55 -0.12 0.01 -0.34 -0.16 -0.07 0.11
-1.35 -1.23 0.83 0.18 -0.11 -0.01 -0.37 0.23 0.22 0.3
-2.64 -2.44 1.59 0.56 -0.38 -0.09 -0.68 -0.07 -0.77 0.4
-1.35 -1.34 0.4 0.31 -0.17 -0.14 0.37 0.3 0.33 0.11
-1.96 -1.74 0.71 0.14 -0.11 -0.17 0.14 0.32 0.28 0.42
-4.41 -4.57 1.52 0.79 -0.12 0.29 0.05 -0.56 -0.13 -0.89
-0.94 -0.84 0.52 0.37 -0.03 -0.06 0.06 0.21 0.07 -0.0
-2.79 -2.54 1.33 -0.49 -0.4 0.47 -0.48 0.22 0.39 0.17
-1.98 -1.82 0.98 0.6 0.08 0.33 -0.38 -0.09 -0.11 0.03
-1.22 -0.95 1.17 0.6 -0.39 -0.21 -0.58 -0.02 0.03 -0.03
-2.0 -2.02 1.05 0.78 0.14 -0.01 -0.48 -0.02 -0.01 -0.09
-1.07 -1.01 0.41 0.38 -0.24 -0.51 0.31 0.39 0.21 0.2
-1.7 -1.56 0.92 0.34 -0.12 -0.11 0.02 0.18 0.07 0.21
-1.89 -1.95 1.3 0.75 -0.39 -0.38 -0.38 -0.04 -0.07 0.14
-3.45 -2.17 1.16 1.38 0.41 -0.05 - -1.08 -0.52 0.46
-0.87 -0.79 0.54 0.67 -0.02 -0.27 -0.26 -0.01 -0.03 0.28
- - 2.61 1.36 - -0.47 - - - -0.7
-1.69 -1.37 0.79 0.34 -0.2 0.04 0.07 0.27 -0.11 0.3
-1.51 -1.5 0.81 0.23 -0.07 -0.48 0.34 0.18 0.23 0.17
-2.87 -2.73 1.4 0.92 -0.09 -0.02 -0.49 -0.16 -0.3 -0.25
-0.68 -0.66 0.48 0.57 -0.15 -0.22 -0.44 0.16 0.12 0.21
-1.98 -1.82 0.68 0.51 0.16 0.24 -0.13 0.08 -0.02 0.25
-1.8 -1.84 0.99 0.25 0.24 0.24 -0.16 0.05 -0.05 -0.01
-7.36 -7.53 1.58 0.7 -0.17 0.25 -0.31 -0.05 -0.06 -0.8
-3.03 -2.93 1.67 0.91 -0.23 -0.55 -1.27 -0.67 -0.5 0.5
-1.99 -1.75 1.36 0.46 -0.2 0.18 0.13 -0.28 -0.28 -0.38
-1.08 -1.13 0.6 0.72 -0.29 -0.31 -0.25 0.2 -0.02 0.39
-1.97 -2.0 1.15 1.02 -0.51 -0.37 -0.33 -0.13 -0.08 0.17
-2.26 -2.72 0.99 0.43 -1.77 0.4 -1.32 0.28 0.19 0.96
-1.43 -1.38 0.84 0.48 -0.03 0.08 0.02 0.01 0.11 -0.12
-0.82 -0.61 0.67 0.34 -0.28 0.19 -0.05 0.05 -0.04 -0.03
-1.02 -1.03 0.68 0.46 -0.01 0.18 -0.25 -0.12 -0.23 0.38
-0.92 -1.0 0.9 0.76 -0.21 0.04 -0.65 -0.31 -0.17 0.26
-0.76 -0.86 0.87 0.6 -0.2 -0.01 0.05 -0.12 -0.23 -0.25
-2.33 -2.4 0.74 0.48 0.01 -0.24 0.14 0.27 0.21 0.31
- -1.52 1.25 0.88 - - - 1.1 -1.05 1.48
-4.98 -4.77 1.05 0.85 -0.51 0.01 -0.18 0.17 -0.06 0.47
-2.86 -2.71 0.83 0.62 0.11 -0.1 -0.03 0.09 0.11 0.35
-1.54 -1.56 0.44 0.7 -0.25 -0.02 0.14 0.23 0.2 0.13
-2.74 -2.84 0.93 0.87 0.03 -0.06 -0.11 -0.34 -0.17 0.46
-5.53 -4.7 1.45 0.26 0.24 -0.04 -0.27 0.22 -0.2 -0.02
-7.05 -5.6 1.8 0.3 -1.68 0.08 -1.79 0.26 0.38 0.13
-1.69 -1.54 0.63 0.97 -0.22 -0.25 -0.13 -0.04 -0.13 0.42
-1.27 -0.99 1.03 0.79 -0.18 -0.21 -0.65 -0.26 -0.2 0.28
-0.78 -0.58 1.18 -0.03 -1.01 -0.77 -0.06 0.0 -0.26 0.69
-1.46 -1.4 0.6 0.97 -0.05 -0.23 -0.28 -0.02 0.07 0.14
-3.62 -3.77 2.28 -2.47 -1.87 -0.01 0.07 -0.55 0.4 -1.01
-0.46 -0.49 0.75 0.7 -0.1 -0.17 -0.15 -0.3 -0.15 -0.3
- - 0.72 0.51 -0.5 -0.88 0.18 0.68 0.45 0.65
-2.93 -2.67 1.61 1.18 -0.48 -0.16 -0.43 -0.34 -0.73 -0.63
-2.21 -2.09 0.36 0.63 -0.33 -0.23 0.11 0.47 0.32 0.44
-4.34 -4.36 1.41 0.22 -0.09 0.17 -0.03 0.05 -0.21 0.17
-4.28 -4.38 1.09 1.03 -0.43 0.2 -0.18 0.08 -0.06 -0.07
-2.38 -2.01 1.1 0.93 -0.57 -0.07 -0.12 -0.19 -0.12 0.22
-1.2 -0.93 0.78 0.1 -0.52 0.01 0.24 0.11 0.01 0.36
-0.36 -0.33 0.73 0.14 -0.31 0.07 -0.38 -0.07 -0.02 0.14
-0.71 -0.7 0.95 0.49 -0.22 -0.23 -0.15 -0.16 -0.18 0.07
-1.77 -1.6 0.82 0.82 -0.15 -0.21 -0.26 0.01 -0.04 0.34
-0.98 -1.0 0.36 0.36 -0.17 -0.36 0.02 0.43 0.24 0.28
-4.06 -3.94 1.3 0.97 -0.39 0.07 -1.36 0.13 -0.59 0.58
-2.24 -2.11 1.33 0.75 -0.29 -0.27 -0.26 -0.21 -0.18 0.18
-0.91 -0.69 0.4 0.44 -0.19 -0.01 0.03 0.16 0.07 0.15
-1.41 -1.38 0.18 0.41 0.18 -0.02 0.19 0.22 0.12 0.34
-1.56 -1.62 0.73 0.36 -0.09 -0.84 0.29 0.27 0.16 0.44
-2.92 -2.8 1.0 0.25 -0.1 0.01 0.02 0.36 0.18 0.22
-2.05 -1.76 0.91 0.48 0.2 0.3 -0.16 0.01 -0.12 -0.02
-2.94 -2.38 1.26 0.67 -0.07 0.27 -0.62 -0.04 0.02 -0.18
-1.48 -1.76 0.81 0.82 -0.07 0.27 -0.8 -0.2 -0.05 0.34
- - 1.43 1.12 -0.09 0.1 -0.64 -0.28 -0.35 -0.19
-1.13 -0.83 0.83 0.17 -0.14 0.04 0.02 0.08 0.15 -0.06
-0.63 -0.6 0.75 0.19 -0.09 0.12 -0.31 -0.06 -0.15 0.24
- - 2.56 - - 1.54 - - 0.25 -
-2.42 -2.26 0.39 0.41 -0.19 -0.04 0.21 0.5 0.28 0.41
-0.44 -0.39 0.42 0.17 -0.24 0.16 -0.19 0.02 0.01 0.22
- - 2.24 - - - - 1.37 - 1.43
-1.99 -1.8 1.18 0.88 -0.18 -0.18 -0.16 -0.2 -0.05 -0.22
-2.04 -2.01 0.94 0.4 -0.6 0.07 0.11 0.28 0.05 0.3
-1.71 -1.36 1.14 0.25 -0.48 -0.07 -0.27 0.21 -0.23 0.5
-1.37 -1.4 0.83 0.12 0.27 0.14 -0.1 0.15 -0.07 0.09
-1.6 -1.66 0.98 0.35 -0.11 0.04 -0.06 0.02 0.12 0.14
-1.67 -1.7 0.82 0.88 -0.16 -0.01 -0.41 0.0 -0.1 0.27
-4.2 -4.08 0.75 1.14 -0.01 0.03 -0.68 0.22 0.09 0.19
-3.59 -3.04 1.4 0.65 -0.01 0.42 -0.47 -0.33 -0.46 0.01
-2.27 -2.41 1.2 1.01 -0.34 -0.46 -0.3 -0.04 -0.04 0.01
-1.85 -1.53 0.77 0.78 -0.27 -0.37 -0.0 0.18 0.2 0.1
-1.51 -1.42 0.97 0.57 -0.34 -0.1 -0.24 -0.06 -0.06 0.42
-2.11 -2.11 0.84 0.28 0.11 -0.04 0.09 0.26 0.21 0.08
-1.67 -1.4 0.66 0.28 -0.12 -0.28 0.17 0.26 0.23 0.35
-0.85 -0.83 0.4 0.3 0.14 -0.09 -0.02 0.12 0.12 0.17
-1.62 -1.26 1.26 0.34 0.15 -0.19 -0.77 -0.11 -0.11 0.23
-10.71 -9.24 1.1 0.17 -0.05 -0.45 0.41 0.56 0.3 0.0
-1.95 -2.2 1.64 0.75 -0.43 0.19 -0.27 -0.59 -0.7 -0.45
-2.85 -2.46 1.3 0.74 -0.41 -0.08 0.07 -0.13 -0.24 0.05
-2.58 - 1.84 1.14 -0.48 -0.4 -1.23 -0.42 -0.68 -0.37
-1.98 -1.74 0.47 0.49 0.17 0.17 -0.11 0.16 0.11 0.37
-0.54 -0.57 0.59 0.35 -0.08 -0.06 -0.17 -0.06 0.09 0.06
-0.37 -0.34 0.12 0.31 0.02 -0.06 -0.07 0.1 0.1 0.08
-1.2 -1.24 0.94 0.36 -0.06 0.3 -0.16 -0.01 -0.15 -0.07
-2.36 -2.08 1.09 0.16 0.11 -0.13 0.09 0.21 -0.08 0.22
-2.89 -3.21 1.44 1.11 -0.38 -0.55 -0.17 -0.25 -0.2 -0.25
-1.2 -1.26 1.2 0.1 -0.02 0.26 -0.26 0.0 -0.16 -0.22
-1.34 -1.4 1.03 0.52 -0.22 0.26 -0.19 -0.18 -0.12 0.02
-0.86 -0.81 0.49 0.61 0.12 -0.3 0.01 -0.04 -0.17 0.24
-0.88 -0.76 0.68 0.15 -0.04 -0.04 0.17 0.01 0.06 0.04
-0.68 -0.46 0.64 0.64 -0.03 0.07 -0.68 -0.39 -0.46 0.48
- - 1.53 -0.46 -1.12 0.23 -1.14 0.78 -1.77 1.2
- - 2.62 - - 1.27 - 0.51 - -
-3.89 -3.7 0.56 0.24 0.47 0.35 -0.54 0.48 0.09 0.48
-1.59 -1.7 0.95 0.22 0.04 0.09 -0.03 0.1 0.13 0.05
- - 1.71 0.87 -0.38 -0.38 -0.2 -0.38 -0.68 0.14
-3.62 -3.54 1.28 0.1 -0.06 -0.29 -0.29 0.36 -0.11 0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.