1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_170 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.33 0.38 0.95 1.0 0.63 0.51 0.57 0.66 0.59 0.72
0.47 0.39 1.0 0.67 0.38 0.49 0.47 0.61 0.58 0.49
0.15 0.17 1.0 0.76 0.81 0.73 0.48 0.75 0.66 0.99
0.26 0.24 1.0 0.98 0.54 0.53 0.44 0.5 0.49 0.59
0.19 0.21 1.0 0.96 0.57 0.63 0.48 0.53 0.49 0.52
0.22 0.26 1.0 0.89 0.65 0.53 0.74 0.79 0.75 0.7
0.15 0.18 1.0 0.97 0.67 0.68 0.69 0.82 0.78 0.9
0.1 0.1 0.99 1.0 0.46 0.5 0.5 0.48 0.57 0.55
0.13 0.16 1.0 0.76 0.37 0.47 0.3 0.38 0.41 0.42
0.2 0.22 1.0 0.92 0.38 0.39 0.29 0.41 0.37 0.64
0.19 0.2 1.0 0.86 0.6 0.53 0.5 0.63 0.63 0.76
0.24 0.23 1.0 0.76 0.4 0.44 0.51 0.52 0.49 0.43
0.28 0.29 1.0 0.79 0.72 0.8 0.61 0.66 0.66 0.69
0.4 0.44 1.0 0.77 0.58 0.67 0.61 0.63 0.62 0.6
0.15 0.15 1.0 0.88 0.51 0.5 0.57 0.58 0.6 0.65
0.15 0.18 0.89 1.0 0.41 0.4 0.51 0.57 0.65 0.65
0.17 0.17 1.0 0.96 0.41 0.43 0.54 0.53 0.54 0.53
0.06 0.07 1.0 0.52 0.45 0.47 0.35 0.45 0.43 0.44
0.15 0.12 1.0 0.72 0.44 0.42 0.29 0.36 0.37 0.45
0.2 0.2 0.89 0.55 0.46 0.64 0.4 0.63 0.49 1.0
0.45 0.44 1.0 0.92 0.69 0.68 0.85 0.78 0.81 0.76
0.32 0.33 1.0 0.8 0.72 0.62 0.58 0.76 0.77 0.82
0.08 0.09 1.0 0.79 0.62 0.74 0.34 0.55 0.51 0.7
0.18 0.18 1.0 0.8 0.31 0.33 0.22 0.29 0.29 0.3
0.17 0.16 1.0 0.58 0.53 0.65 0.46 0.53 0.54 0.73
0.13 0.14 1.0 0.65 0.23 0.34 0.43 0.42 0.37 0.36
0.14 0.15 1.0 0.6 0.47 0.48 0.6 0.64 0.59 0.52
0.14 0.15 1.0 0.88 0.35 0.31 0.28 0.35 0.34 0.54
0.12 0.1 1.0 0.88 0.62 0.53 0.63 0.65 0.63 0.66
0.13 0.16 1.0 0.57 0.39 0.55 0.42 0.57 0.4 0.67
0.12 0.12 1.0 0.76 0.53 0.44 0.52 0.57 0.55 0.55
0.03 0.02 1.0 0.89 0.35 0.27 0.28 0.36 0.35 0.37
0.03 0.04 1.0 0.86 0.47 0.46 0.3 0.41 0.41 0.49
0.07 0.07 1.0 0.59 0.53 0.54 0.36 0.43 0.43 0.52
0.42 0.4 1.0 0.8 0.61 0.68 0.61 0.61 0.66 0.78
0.17 0.18 1.0 0.6 0.46 0.53 0.39 0.53 0.39 0.51
0.24 0.23 1.0 0.72 0.57 0.58 0.7 0.66 0.7 0.77
0.06 0.07 1.0 0.73 0.66 0.64 0.41 0.6 0.52 0.51
0.24 0.23 1.0 0.75 0.63 0.64 0.61 0.76 0.73 0.76
0.0 0.04 1.0 0.78 0.09 0.28 0.22 0.27 0.46 0.36
0.07 0.08 1.0 0.47 0.45 0.46 0.34 0.43 0.45 0.6
0.01 0.01 0.94 1.0 0.33 0.36 0.35 0.4 0.4 0.43
0.17 0.17 0.9 1.0 0.45 0.45 0.46 0.55 0.56 0.65
0.13 0.13 0.66 1.0 0.49 0.45 0.38 0.41 0.44 0.55
0.12 0.12 1.0 0.75 0.49 0.44 0.34 0.39 0.37 0.41
0.14 0.15 1.0 0.69 0.34 0.35 0.4 0.43 0.44 0.55
0.34 0.32 1.0 0.78 0.5 0.51 0.49 0.54 0.55 0.53
0.1 0.1 1.0 0.68 0.41 0.55 0.27 0.4 0.42 0.49
0.23 0.2 1.0 0.88 0.58 0.66 0.7 0.66 0.59 0.74
0.04 0.05 1.0 0.32 0.25 0.55 0.16 0.9 0.39 0.91
0.04 0.05 1.0 0.77 0.64 0.75 0.34 0.59 0.55 0.65
0.48 0.51 1.0 0.9 0.7 0.72 0.71 0.88 0.87 0.92
0.32 0.35 0.83 0.89 0.74 0.48 0.66 0.95 0.91 1.0
0.01 0.0 0.78 1.0 0.53 0.4 0.22 0.35 0.24 0.44
0.17 0.11 1.0 0.34 0.08 0.14 0.42 0.57 0.59 0.6
0.17 0.19 1.0 0.9 0.66 0.66 0.53 0.59 0.54 0.73
0.28 0.32 1.0 0.89 0.7 0.63 0.63 0.96 0.93 0.93
0.14 0.19 1.0 0.8 0.42 0.54 0.45 0.53 0.46 0.62
0.35 0.34 1.0 0.89 0.67 0.69 0.58 0.56 0.58 0.65
0.5 0.5 0.96 0.93 0.81 0.6 0.75 0.8 0.89 1.0
0.01 0.01 1.0 0.67 0.28 0.37 0.33 0.5 0.4 0.69
0.11 0.13 0.89 1.0 0.45 0.4 0.52 0.55 0.46 0.56
0.02 0.03 1.0 0.83 0.43 0.43 0.35 0.34 0.29 0.28
0.0 0.0 0.88 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.36 0.79
0.32 0.32 1.0 0.79 0.63 0.74 0.49 0.64 0.61 0.64
0.01 0.02 1.0 0.98 0.3 0.22 0.15 0.41 0.27 0.31
0.03 0.02 1.0 0.76 0.27 0.27 0.22 0.26 0.24 0.4
0.11 0.13 1.0 0.72 0.45 0.42 0.5 0.51 0.45 0.45
0.03 0.04 1.0 0.74 0.24 0.28 0.33 0.39 0.31 0.22
0.01 0.0 1.0 0.57 0.26 0.31 0.29 0.52 0.43 0.39
0.24 0.25 1.0 0.8 0.54 0.65 0.67 0.69 0.64 0.68
0.29 0.13 1.0 0.24 0.07 0.16 0.25 0.27 0.24 0.62
0.32 0.35 0.69 0.91 0.62 0.68 0.84 0.68 0.69 1.0
0.0 0.0 1.0 0.95 0.3 0.37 0.42 0.67 0.44 0.46
0.14 0.15 1.0 0.47 0.36 0.5 0.3 0.39 0.34 0.49
0.24 0.25 1.0 0.82 0.67 0.73 0.58 0.69 0.57 0.89
0.28 0.29 1.0 0.7 0.42 0.44 0.48 0.51 0.5 0.53
0.13 0.14 0.99 0.71 0.56 0.55 0.8 1.0 0.89 0.84
0.18 0.19 0.79 1.0 0.46 0.41 0.41 0.46 0.46 0.51
0.14 0.18 1.0 0.85 0.36 0.45 0.38 0.47 0.49 0.39
0.19 0.24 1.0 0.99 0.51 0.58 0.46 0.59 0.51 0.67
0.0 0.0 1.0 0.55 0.27 0.13 0.2 0.16 0.1 0.2
0.19 0.2 1.0 0.76 0.56 0.51 0.49 0.56 0.54 0.59
0.17 0.2 1.0 0.55 0.47 0.63 0.33 0.48 0.45 0.83
0.21 0.21 0.91 0.97 0.58 0.51 0.91 0.9 1.0 0.8
0.13 0.15 0.92 0.88 0.54 0.62 0.74 1.0 0.76 0.89
0.26 0.27 0.92 1.0 0.72 0.79 0.74 0.8 0.7 0.83
0.15 0.15 1.0 0.67 0.42 0.46 0.32 0.48 0.42 0.45
0.28 0.28 1.0 0.79 0.5 0.54 0.43 0.48 0.51 0.58
0.22 0.24 1.0 0.64 0.52 0.56 0.44 0.66 0.66 0.7
0.05 0.06 1.0 0.49 0.26 0.31 0.21 0.32 0.19 0.44
0.3 0.3 1.0 0.94 0.68 0.69 0.98 0.94 0.95 0.82
0.16 0.18 1.0 0.67 0.57 0.54 0.67 0.76 0.74 0.82
0.02 0.01 1.0 0.6 0.32 0.43 0.36 0.24 0.32 0.19
0.37 0.39 1.0 0.91 0.69 0.67 0.73 0.81 0.73 0.7
0.06 0.07 1.0 0.28 0.3 0.55 0.29 0.46 0.52 0.45
0.13 0.14 1.0 0.77 0.54 0.64 0.39 0.47 0.47 0.52
0.19 0.23 1.0 0.67 0.34 0.38 0.3 0.44 0.45 0.44
0.12 0.12 1.0 0.83 0.53 0.48 0.35 0.48 0.48 0.45
0.36 0.37 1.0 0.98 0.64 0.53 0.93 0.98 0.87 0.87
0.16 0.18 1.0 0.67 0.49 0.49 0.53 0.6 0.55 0.61
0.11 0.11 1.0 0.69 0.31 0.31 0.31 0.4 0.39 0.45
0.04 0.09 0.86 1.0 0.51 0.37 0.0 0.18 0.27 0.53
0.35 0.36 0.91 1.0 0.62 0.52 0.53 0.62 0.62 0.77
0.0 0.0 1.0 0.42 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1
0.18 0.22 1.0 0.73 0.5 0.6 0.61 0.7 0.54 0.72
0.2 0.2 1.0 0.67 0.55 0.41 0.72 0.65 0.67 0.64
0.05 0.06 1.0 0.72 0.36 0.37 0.27 0.34 0.31 0.32
0.42 0.43 0.94 1.0 0.61 0.58 0.5 0.76 0.73 0.78
0.16 0.18 1.0 0.89 0.7 0.74 0.57 0.66 0.62 0.74
0.14 0.14 1.0 0.6 0.59 0.59 0.45 0.52 0.49 0.5
0.0 0.0 1.0 0.54 0.3 0.4 0.27 0.32 0.32 0.19
0.04 0.04 1.0 0.59 0.27 0.22 0.13 0.2 0.22 0.45
0.1 0.12 1.0 0.54 0.34 0.44 0.43 0.32 0.32 0.3
0.29 0.28 0.92 1.0 0.49 0.49 0.51 0.7 0.6 0.79
0.12 0.11 1.0 0.92 0.32 0.35 0.36 0.41 0.43 0.51
0.11 0.08 1.0 0.68 0.15 0.66 0.2 0.61 0.58 0.98
0.21 0.22 1.0 0.78 0.55 0.59 0.57 0.57 0.61 0.51
0.36 0.41 1.0 0.79 0.52 0.72 0.61 0.65 0.61 0.62
0.31 0.3 1.0 0.85 0.62 0.71 0.52 0.57 0.53 0.81
0.28 0.27 1.0 0.91 0.46 0.55 0.34 0.43 0.48 0.64
0.32 0.3 1.0 0.83 0.48 0.55 0.57 0.5 0.47 0.46
0.12 0.11 1.0 0.83 0.6 0.51 0.66 0.72 0.7 0.74
0.0 0.13 0.85 0.66 0.0 0.0 0.0 0.77 0.17 1.0
0.02 0.02 1.0 0.87 0.34 0.49 0.43 0.54 0.46 0.67
0.08 0.09 1.0 0.87 0.61 0.53 0.55 0.6 0.61 0.72
0.21 0.21 0.83 1.0 0.52 0.61 0.68 0.72 0.71 0.67
0.08 0.07 1.0 0.96 0.54 0.5 0.49 0.41 0.47 0.72
0.01 0.01 1.0 0.44 0.43 0.36 0.3 0.43 0.32 0.36
0.0 0.01 1.0 0.35 0.09 0.3 0.08 0.34 0.37 0.31
0.16 0.18 0.79 1.0 0.44 0.43 0.46 0.5 0.47 0.68
0.2 0.25 1.0 0.85 0.43 0.42 0.31 0.41 0.43 0.59
0.26 0.29 1.0 0.43 0.22 0.26 0.42 0.44 0.37 0.71
0.19 0.19 0.78 1.0 0.49 0.44 0.42 0.5 0.54 0.56
0.02 0.02 1.0 0.04 0.06 0.21 0.22 0.14 0.27 0.1
0.43 0.42 1.0 0.97 0.56 0.53 0.53 0.48 0.54 0.48
0.0 0.0 1.0 0.86 0.43 0.33 0.69 0.97 0.82 0.95
0.04 0.05 1.0 0.74 0.23 0.29 0.24 0.26 0.2 0.21
0.14 0.15 0.83 1.0 0.51 0.55 0.7 0.89 0.81 0.87
0.02 0.02 1.0 0.44 0.35 0.42 0.37 0.39 0.32 0.42
0.02 0.02 1.0 0.96 0.35 0.54 0.42 0.5 0.45 0.45
0.09 0.12 1.0 0.89 0.31 0.45 0.43 0.41 0.43 0.55
0.25 0.31 1.0 0.62 0.41 0.59 0.69 0.63 0.59 0.75
0.47 0.48 1.0 0.66 0.49 0.64 0.46 0.57 0.59 0.67
0.32 0.32 1.0 0.72 0.44 0.44 0.47 0.46 0.45 0.54
0.17 0.19 1.0 1.0 0.51 0.49 0.47 0.57 0.55 0.72
0.38 0.37 0.95 0.95 0.66 0.58 0.75 1.0 0.87 0.9
0.02 0.03 1.0 0.79 0.31 0.43 0.16 0.44 0.27 0.61
0.08 0.09 1.0 0.67 0.32 0.33 0.33 0.35 0.35 0.45
0.39 0.46 0.97 1.0 0.64 0.73 0.75 0.82 0.77 0.82
0.28 0.29 0.85 1.0 0.85 0.74 0.86 0.88 0.82 0.95
0.2 0.2 1.0 0.77 0.57 0.34 0.74 0.73 0.67 0.82
0.07 0.07 1.0 0.6 0.47 0.5 0.51 0.64 0.57 0.58
0.13 0.16 1.0 0.74 0.61 0.65 0.48 0.54 0.49 0.53
0.05 0.08 1.0 0.66 0.4 0.5 0.27 0.41 0.42 0.37
0.2 0.17 0.99 1.0 0.54 0.68 0.33 0.49 0.55 0.72
0.0 0.0 1.0 0.8 0.35 0.4 0.24 0.31 0.29 0.32
0.26 0.32 1.0 0.63 0.51 0.58 0.57 0.6 0.63 0.54
0.39 0.39 1.0 0.68 0.56 0.65 0.48 0.57 0.54 0.71
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.2 0.0
0.13 0.15 0.92 0.93 0.62 0.69 0.82 1.0 0.86 0.93
0.55 0.57 1.0 0.84 0.63 0.83 0.66 0.76 0.75 0.87
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.57
0.11 0.13 1.0 0.81 0.39 0.39 0.39 0.38 0.43 0.38
0.13 0.13 1.0 0.69 0.34 0.54 0.56 0.63 0.54 0.64
0.14 0.18 1.0 0.54 0.33 0.43 0.38 0.53 0.39 0.64
0.22 0.21 1.0 0.61 0.68 0.62 0.53 0.63 0.54 0.6
0.17 0.16 1.0 0.65 0.47 0.52 0.49 0.52 0.55 0.56
0.17 0.17 0.96 1.0 0.49 0.54 0.41 0.55 0.51 0.66
0.02 0.03 0.76 1.0 0.45 0.46 0.28 0.53 0.48 0.52
0.03 0.05 1.0 0.6 0.38 0.51 0.27 0.3 0.28 0.38
0.09 0.08 1.0 0.88 0.34 0.32 0.35 0.42 0.42 0.44
0.16 0.2 0.99 1.0 0.48 0.45 0.58 0.66 0.67 0.62
0.18 0.19 1.0 0.76 0.4 0.47 0.43 0.49 0.49 0.68
0.13 0.13 1.0 0.68 0.6 0.54 0.59 0.67 0.65 0.59
0.2 0.24 1.0 0.77 0.58 0.52 0.71 0.76 0.74 0.8
0.42 0.43 1.0 0.93 0.83 0.71 0.75 0.82 0.82 0.85
0.14 0.17 1.0 0.53 0.46 0.37 0.25 0.39 0.39 0.49
0.0 0.0 1.0 0.52 0.45 0.34 0.62 0.68 0.57 0.47
0.08 0.07 1.0 0.54 0.24 0.37 0.27 0.21 0.2 0.24
0.06 0.07 1.0 0.68 0.31 0.39 0.43 0.37 0.35 0.42
0.05 0.0 1.0 0.61 0.2 0.21 0.12 0.21 0.17 0.22
0.18 0.21 0.99 1.0 0.8 0.8 0.66 0.8 0.77 0.92
0.46 0.45 1.0 0.85 0.63 0.64 0.59 0.64 0.71 0.7
0.63 0.64 0.88 1.0 0.82 0.78 0.77 0.87 0.87 0.85
0.23 0.22 1.0 0.67 0.5 0.64 0.47 0.52 0.47 0.5
0.09 0.11 1.0 0.53 0.51 0.43 0.5 0.55 0.45 0.55
0.05 0.04 1.0 0.79 0.28 0.25 0.33 0.31 0.32 0.31
0.19 0.18 1.0 0.47 0.43 0.52 0.36 0.44 0.39 0.37
0.19 0.19 1.0 0.7 0.42 0.58 0.43 0.43 0.45 0.5
0.36 0.37 0.92 1.0 0.71 0.53 0.66 0.64 0.58 0.77
0.34 0.37 1.0 0.69 0.61 0.61 0.7 0.63 0.65 0.64
0.4 0.46 1.0 0.99 0.63 0.67 0.4 0.49 0.46 0.89
0.0 0.0 1.0 0.25 0.16 0.41 0.16 0.59 0.1 0.79
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.23 0.0 0.0
0.05 0.05 1.0 0.8 0.94 0.87 0.46 0.94 0.72 0.94
0.17 0.16 1.0 0.6 0.53 0.55 0.51 0.55 0.57 0.53
0.0 0.0 1.0 0.56 0.24 0.24 0.27 0.24 0.19 0.34
0.03 0.04 1.0 0.44 0.4 0.34 0.34 0.53 0.38 0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)