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Heatmap: Cluster_179 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
-0.06 0.09 -0.35 0.09 -0.23 -0.23 0.31 0.18 0.12 -0.07
0.21 0.33 -1.28 -0.97 -0.57 -0.7 0.53 0.72 0.41 -0.07
-0.25 -0.06 -1.02 -0.18 0.07 -0.57 0.72 0.27 0.29 0.03
-0.36 -0.28 -0.04 -0.09 -0.06 -0.2 0.25 0.34 0.17 0.09
-0.17 0.1 -1.29 -0.79 -0.32 0.2 0.48 0.36 0.32 0.23
0.0 0.04 -0.95 0.12 -0.14 -0.43 0.72 -0.06 -0.05 0.2
-0.06 0.78 0.72 0.19 -0.6 -0.5 -1.03 0.29 0.11 -1.41
-0.08 -0.07 0.03 0.47 -0.02 -1.0 -0.15 0.34 0.23 -0.19
-1.09 -0.12 -2.33 -1.96 -0.07 0.21 0.96 0.76 0.72 -0.4
0.03 0.07 -0.55 -0.48 -0.08 -0.75 0.56 0.3 0.29 0.11
0.04 0.04 -0.93 -0.43 0.03 0.03 0.73 -0.02 0.15 -0.18
-0.08 0.0 -0.46 -0.04 -0.12 -0.11 0.29 0.22 0.11 0.06
0.16 0.2 -0.52 -0.3 -0.29 -0.41 0.54 0.14 0.26 -0.15
-0.14 -0.07 -0.6 -0.35 0.05 0.07 0.47 0.13 0.09 0.08
-0.07 0.02 -0.63 -0.0 0.02 0.06 0.11 0.17 0.16 -0.0
-0.11 -0.11 -0.42 -0.16 -0.0 0.07 0.25 0.27 -0.02 0.11
0.0 -0.0 -0.87 -0.18 0.18 0.01 0.28 0.2 0.15 -0.06
0.2 0.18 -1.0 0.02 -0.13 -1.06 0.11 0.15 0.37 0.41
-0.15 -0.06 -1.0 -0.3 0.29 -0.4 0.36 0.44 0.2 0.07
0.17 -0.1 -1.19 -0.72 0.25 0.09 0.52 0.33 0.05 -0.12
-0.45 -0.21 -0.32 0.66 0.15 -1.44 0.28 0.43 -0.07 0.04
-0.69 -1.01 -1.72 -1.24 -0.07 -0.19 0.41 0.94 0.84 0.36
-1.09 0.86 0.46 -0.94 -2.16 -2.56 - 1.15 0.97 0.31
-0.09 0.02 -0.16 -0.56 -0.2 -0.2 0.35 0.54 0.07 -0.05
-0.43 -0.32 -1.75 -1.29 0.05 -0.23 0.8 0.9 0.29 0.06
0.09 0.13 -1.93 -0.49 -0.13 -1.05 0.71 0.46 0.28 0.32
-0.04 -0.16 -0.18 -0.04 -0.41 -0.11 0.17 0.5 0.37 -0.39
-0.09 0.24 -0.27 -0.57 -0.52 -0.52 0.41 0.51 0.28 0.03
-0.09 0.04 0.16 -0.51 -0.52 -0.57 0.53 0.32 0.3 -0.13
0.02 0.03 -0.24 -0.54 0.07 -0.29 0.38 0.17 0.06 0.13
0.22 0.23 0.15 -0.95 -0.46 -0.34 0.19 0.15 0.27 0.08
-0.64 -0.4 -0.08 0.03 0.25 0.05 -0.09 0.4 0.2 -0.02
-0.38 -0.46 -0.58 -0.71 0.11 -0.05 0.44 0.49 0.32 0.23
0.02 0.06 0.19 -0.38 -0.07 -0.16 -0.08 0.22 0.02 0.1
-0.74 -0.98 -1.91 0.03 0.19 -0.47 0.84 0.37 0.67 0.1
-0.11 0.0 -0.95 0.16 -0.24 -0.18 0.54 -0.03 0.16 0.21
-0.19 -0.12 -1.02 0.14 -0.69 -0.19 0.48 0.44 0.48 -0.05
0.17 0.12 -0.6 -0.17 0.02 -0.48 0.12 0.22 0.13 0.23
-0.49 -0.2 -3.0 -0.18 -0.5 -0.37 0.55 0.75 0.84 0.0
0.12 0.15 -0.68 -0.08 -0.08 -0.45 0.43 0.19 0.12 -0.01
-0.37 -0.42 -1.79 -0.14 0.14 0.08 0.28 0.47 0.39 0.27
-0.97 -1.35 0.27 -0.51 -1.47 -0.25 0.17 1.09 0.17 0.68
-0.29 -0.1 -2.43 -2.57 -1.99 -0.55 1.43 0.79 0.88 -0.54
-1.44 -1.25 -2.81 -3.18 -0.19 -1.58 1.27 1.01 0.98 0.44
-0.02 0.14 -0.97 -0.4 0.34 -0.24 0.41 0.23 0.07 -0.03
0.04 0.06 -0.68 -0.39 -0.2 -0.43 0.6 0.36 0.17 0.02
-1.19 0.29 0.17 -0.15 0.16 -0.66 -1.03 0.63 0.31 0.36
-0.01 -0.06 -0.83 0.04 -0.01 -0.21 0.4 0.32 0.17 -0.14
0.1 -0.07 -0.46 -0.22 -0.02 -0.34 0.7 0.11 0.05 -0.18
-0.04 -0.08 -0.51 -0.18 -0.12 -0.22 0.42 0.25 0.23 0.02
-0.02 0.02 -0.84 -0.61 -0.13 -0.12 0.59 0.29 0.11 0.19
-1.12 -0.99 -1.5 -0.13 -0.34 -0.42 0.62 0.82 0.88 0.11
-0.51 -0.71 -0.88 0.16 0.21 -0.41 0.35 0.36 0.37 0.34
0.1 0.12 -0.43 -0.39 -0.23 -0.34 0.57 0.23 0.15 -0.11
-0.02 0.08 -0.27 -0.58 -0.02 -0.58 0.37 0.28 0.26 0.13
-0.37 -0.43 -0.37 -0.12 0.27 -0.01 0.2 0.28 0.1 0.2
0.0 -0.04 -0.67 0.36 -0.46 -0.61 0.5 0.4 -0.02 0.01
-1.28 -1.46 -1.33 -1.44 0.19 -1.45 1.0 0.92 1.22 -0.48
-0.96 -0.95 -1.43 -0.29 0.04 -0.26 0.75 0.64 0.42 0.41
-0.02 0.1 -0.23 -0.21 -0.15 -0.22 0.4 0.15 0.18 -0.15
-0.12 -0.09 -1.17 -0.48 0.25 0.13 0.39 0.26 0.23 0.03
-0.09 0.07 -0.34 0.11 0.05 -0.8 0.39 0.2 0.02 0.08
-0.08 -0.31 -0.7 -0.82 -0.12 -0.37 0.65 0.61 0.47 -0.16
-0.02 0.0 -0.61 -0.4 -0.17 -0.04 0.43 0.27 0.19 0.08
-0.06 0.11 0.1 0.25 0.02 -0.73 0.18 0.39 -0.19 -0.39
-0.32 -0.07 -0.5 -0.19 0.29 -0.53 0.15 0.43 -0.01 0.37
-0.08 0.05 -0.95 -0.37 -0.37 -0.34 0.44 0.68 0.21 0.08
0.28 0.07 0.02 0.62 -0.13 -0.23 -1.21 -0.27 0.14 0.09
0.24 0.21 0.21 -1.43 -0.83 -0.64 0.21 0.87 0.1 -0.2
-0.66 -0.2 0.0 0.11 0.11 -0.11 -0.02 0.53 0.09 -0.13
-0.18 -0.04 -0.18 0.24 -0.32 -0.41 0.25 0.36 0.06 0.02
-0.27 -0.19 -0.66 -0.25 -0.31 -0.16 0.93 0.19 0.41 -0.43
-0.21 -0.19 -0.76 -0.71 0.26 0.03 0.62 0.33 0.14 -0.1
-0.18 -0.04 -0.31 -0.3 -0.02 -0.5 0.44 0.23 0.25 0.16
-0.46 -0.43 -1.34 -0.85 -0.08 -0.34 0.62 0.69 0.51 0.35
-0.14 0.19 -0.49 0.22 -0.57 -0.49 0.11 0.56 0.45 -0.4
0.03 0.06 -1.77 0.02 -0.25 -0.39 0.65 0.2 0.27 0.15
-0.19 -0.01 -0.09 0.05 0.08 -0.09 -0.06 0.29 0.03 -0.06
0.19 0.22 -0.62 -0.19 -0.15 -0.39 0.54 0.04 0.14 -0.12
-0.41 -0.37 -0.69 -0.65 0.28 0.08 0.43 0.36 0.22 0.22
-0.55 -0.46 0.01 -0.2 0.03 -0.17 0.05 0.63 0.3 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.