1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_19 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.24 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
98.39 55.69 0.91 1.42 10.89 11.05 0.0 0.08 0.0 0.31
12.95 19.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
219.58 160.72 4.14 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 1.19 1.95
196.07 139.89 2.84 5.32 27.2 77.64 4.41 1.74 0.0 0.0
0.28 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.38 1.07 0.0 0.0 0.14 0.53 0.0 0.26 0.12 0.19
187.39 163.72 0.0 1.23 72.24 45.9 0.98 0.9 0.69 0.76
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
51.26 12.69 0.0 5.15 0.0 0.18 5.83 4.41 2.9 7.41
19.26 16.13 4.92 1.67 2.75 1.58 1.76 0.55 0.49 0.47
0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 0.13 0.19 0.09 0.12 0.12 0.22 0.12 0.11 0.0
1.45 1.33 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.09
0.06 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.01 0.74 0.1 0.13 0.04 0.0 0.0 0.02 0.19 0.13
40.13 30.66 0.23 2.14 2.85 2.0 1.03 1.61 3.29 5.12
1.06 0.3 0.0 0.05 0.09 0.04 0.0 0.05 0.0 0.03
3.4 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.72 0.81 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.47 3.35 0.12 0.02 0.0 0.0 0.12 0.28 0.26 0.27
1.78 3.24 0.55 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
22.62 15.39 0.56 0.0 1.03 1.83 0.0 0.1 0.0 0.0
24.33 21.18 0.5 0.25 4.08 4.63 0.0 0.0 0.0 0.04
44.53 26.08 0.42 0.25 3.1 2.55 0.0 0.0 0.03 0.0
50.62 32.85 0.45 0.91 7.59 7.42 0.0 0.08 0.0 0.0
7.61 6.7 0.0 0.53 1.28 0.0 0.15 0.0 0.0 0.04
16.35 9.05 2.19 1.05 2.52 4.41 1.47 0.52 0.49 0.1
0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
15.94 10.88 5.57 1.36 3.1 2.24 0.77 1.25 0.37 0.76
2.61 1.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.45 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.51
5.26 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
32.62 20.22 0.51 5.67 8.51 5.89 6.05 5.69 7.44 4.21
0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.58 1.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.07 0.13 0.05
0.58 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0
0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.73 0.37 0.05 0.11 0.0 0.0 0.09 0.05 0.22 0.0
0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.76 0.67 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.04 0.11 0.12
0.29 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
806.99 611.39 258.7 103.0 97.21 69.69 210.26 59.64 39.75 77.61
0.33 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
33.48 42.46 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
36.36 17.26 0.0 0.0 0.14 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.72 4.6 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.07
0.86 0.95 0.07 0.17 0.07 0.28 0.0 0.07 0.0 0.0
0.12 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.41 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.72 4.79 2.67 1.16 0.35 0.13 1.23 0.42 0.53 0.3
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.78 0.64 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.03
0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.2 4.72 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.44 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.97 5.71 0.0 0.18 0.08 2.34 0.0 0.0 0.0 0.1
0.98 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.23 1.27 0.12 0.0 0.25 0.22 0.15 0.08 0.3 0.2
0.33 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0
0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
1.84 0.83 0.04 0.12 0.11 0.09 0.07 0.19 0.24 0.11
7.24 2.77 0.14 0.04 1.1 1.07 0.0 0.04 0.0 0.0
0.22 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.89 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.08 0.0 0.0
12.37 2.64 0.0 3.12 0.36 0.13 0.78 0.52 1.15 0.55
0.56 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.48 3.31 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
271.15 204.88 3.99 4.33 13.75 147.15 0.56 0.46 0.54 0.0
0.13 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02
2.62 3.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 1.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
59.3 37.79 5.2 2.76 2.57 11.97 0.0 0.0 0.0 0.48
2.1 1.24 0.07 0.2 0.26 0.34 0.0 0.04 0.0 0.03
0.42 0.54 0.02 0.0 0.0 0.03 0.12 0.04 0.0 0.05
0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
38.67 32.53 1.79 6.18 2.97 2.89 3.04 4.08 2.53 6.39
0.27 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.01 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.72 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.03
0.99 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.4 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.23 8.83 0.14 1.31 0.39 0.43 0.72 1.13 1.58 1.34
3.48 2.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05
150.35 177.87 0.0 0.0 25.77 33.13 0.0 0.0 0.0 0.0
15.51 13.4 0.57 0.73 2.81 2.88 1.45 1.58 1.42 0.95
14.25 19.83 0.0 0.0 0.39 4.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
7.88 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
1.3 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.22 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
68739.5 65736.6 5351.79 3277.23 14250.3 13987.2 4023.8 2193.32 1380.57 1555.13
1.89 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.22 0.0 0.0
0.27 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.66 3.38 0.0 0.23 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
16.82 7.65 0.09 0.0 1.66 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0
1.06 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
43.27 28.23 0.4 0.17 2.95 3.74 0.0 0.0 0.07 0.0
2666.65 1989.03 149.62 77.57 340.87 266.99 13.17 6.53 3.31 9.1
0.31 0.29 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)