1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_19 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
1.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.01 0.01 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.73 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.0 0.71 0.01 0.03 0.14 0.4 0.02 0.01 0.0 0.0
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.78 0.0 0.0 0.1 0.38 0.0 0.19 0.08 0.13
1.0 0.87 0.0 0.01 0.39 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.25 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.09 0.06 0.14
1.0 0.84 0.26 0.09 0.14 0.08 0.09 0.03 0.03 0.02
1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.15 0.23 0.1 0.14 0.15 0.26 0.15 0.13 0.0
1.0 0.92 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.06
0.22 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.73 0.09 0.13 0.04 0.0 0.0 0.02 0.19 0.13
1.0 0.76 0.01 0.05 0.07 0.05 0.03 0.04 0.08 0.13
1.0 0.28 0.0 0.05 0.09 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03
1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.47 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.97 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.08 0.08 0.08
0.55 1.0 0.17 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.68 0.02 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.87 0.02 0.01 0.17 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.59 0.01 0.01 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.65 0.01 0.02 0.15 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.88 0.0 0.07 0.17 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.55 0.13 0.06 0.15 0.27 0.09 0.03 0.03 0.01
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.68 0.35 0.09 0.19 0.14 0.05 0.08 0.02 0.05
1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.15
1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.62 0.02 0.17 0.26 0.18 0.19 0.17 0.23 0.13
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.05 0.08 0.03
1.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.51 0.07 0.15 0.0 0.0 0.12 0.07 0.3 0.0
0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
1.0 0.89 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1 0.06 0.15 0.16
1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.76 0.32 0.13 0.12 0.09 0.26 0.07 0.05 0.1
1.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.8 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01
0.91 1.0 0.08 0.18 0.08 0.29 0.0 0.08 0.0 0.0
1.0 0.33 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.84 0.47 0.2 0.06 0.02 0.22 0.07 0.09 0.05
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.82 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.04
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.91 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.0 0.02 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01
0.91 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.05 0.0 0.11 0.1 0.07 0.04 0.13 0.09
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.31 0.0
1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
1.0 0.45 0.02 0.07 0.06 0.05 0.04 0.11 0.13 0.06
1.0 0.38 0.02 0.01 0.15 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0
1.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0
1.0 0.21 0.0 0.25 0.03 0.01 0.06 0.04 0.09 0.04
1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
1.0 0.76 0.01 0.02 0.05 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.1
0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.64 0.09 0.05 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01
1.0 0.59 0.03 0.1 0.12 0.16 0.0 0.02 0.0 0.01
0.78 1.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.22 0.08 0.0 0.08
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.84 0.05 0.16 0.08 0.07 0.08 0.11 0.07 0.17
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.84 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.03
1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 1.0 0.02 0.15 0.04 0.05 0.08 0.13 0.18 0.15
1.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.08
0.85 1.0 0.0 0.0 0.14 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.86 0.04 0.05 0.18 0.19 0.09 0.1 0.09 0.06
0.72 1.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0
1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.96 0.08 0.05 0.21 0.2 0.06 0.03 0.02 0.02
0.89 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0
1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 1.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.01 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.65 0.01 0.0 0.07 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.75 0.06 0.03 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)