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Heatmap: Cluster_202 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.43 0.36 0.61 0.57 -1.19 -1.42 -0.23 -0.26 -0.15 -0.06
0.03 -0.02 0.27 0.73 -0.8 -1.15 0.09 0.02 0.04 -0.02
-0.07 -0.0 0.4 0.65 -1.09 -1.37 0.04 -0.01 0.13 0.25
0.46 0.39 0.28 0.8 -1.13 -1.24 -0.11 -0.21 -0.42 -0.08
0.6 0.5 0.76 0.81 -1.58 -1.88 -0.64 -0.5 -0.45 -0.11
0.24 0.2 0.03 0.42 -1.01 -1.03 -0.14 0.14 0.1 0.32
0.15 -0.04 0.87 0.66 -1.03 -1.56 -0.07 -0.09 -0.08 -0.23
0.13 0.21 0.15 0.54 -1.16 -1.48 0.08 0.09 0.11 0.23
0.48 0.39 0.79 0.74 -1.36 -1.73 -0.5 -0.47 -0.4 0.01
0.14 0.2 0.53 0.67 -1.79 -2.15 -0.13 -0.15 0.07 0.41
0.19 0.22 0.36 0.62 -0.73 -1.12 -0.08 -0.14 0.03 -0.1
-0.02 0.0 0.35 0.71 -0.46 -1.06 -0.2 0.03 -0.11 0.11
0.46 0.52 0.52 0.88 -2.03 -2.52 -0.4 -0.43 -0.26 0.22
0.22 0.03 0.44 0.72 -1.08 -1.31 -0.29 -0.11 -0.02 0.26
-0.03 0.17 0.43 0.97 -2.11 -2.44 -0.04 -0.13 0.1 0.29
-0.06 0.11 0.52 0.35 -1.21 -1.19 -0.05 0.13 0.13 0.29
0.16 0.12 0.22 0.77 -0.9 -1.24 -0.46 0.02 0.04 0.26
0.22 0.32 0.59 0.39 -1.28 -1.63 -0.3 -0.1 -0.04 0.4
0.3 0.35 0.5 0.61 -1.5 -1.69 -0.66 -0.23 0.06 0.45
0.14 0.04 0.55 0.81 -0.9 -1.23 -0.27 -0.26 -0.13 0.16
0.27 0.28 0.5 0.57 -1.6 -1.82 -0.15 -0.05 0.01 0.25
0.23 0.33 0.53 0.49 -1.97 -2.03 -0.01 -0.06 0.17 0.18
0.15 0.25 0.54 0.61 -1.61 -1.91 0.02 -0.17 0.01 0.29
0.15 -0.0 0.38 0.69 -1.17 -1.52 -0.11 -0.07 0.09 0.31
0.29 0.32 0.68 0.67 -1.43 -1.02 -0.6 -0.28 -0.12 0.09
0.35 0.37 0.28 0.74 -2.53 -2.7 -0.22 -0.04 0.03 0.45
0.1 0.15 0.39 0.82 -1.75 -1.9 -0.04 -0.06 0.12 0.22
-0.08 -0.02 0.37 0.76 -1.6 -2.06 0.07 -0.09 0.25 0.41
0.39 0.36 0.02 0.82 -1.35 -1.68 -0.22 -0.03 -0.05 0.17
0.26 0.26 0.43 0.29 -1.58 -1.9 -0.12 0.05 0.22 0.39
0.05 0.05 0.09 0.56 -1.13 -1.31 0.1 0.13 0.16 0.32
0.32 0.35 0.4 0.67 -1.25 -1.43 -0.29 -0.27 -0.09 0.25
0.32 0.25 0.58 0.46 -1.71 -1.61 -0.2 0.02 -0.06 0.29
0.14 0.18 0.32 0.46 -0.85 -0.87 0.03 0.06 -0.06 0.0
0.37 0.24 0.41 0.52 -1.03 -1.24 0.05 -0.29 -0.05 0.04
0.03 0.19 0.51 0.57 -1.49 -1.6 -0.15 0.18 0.12 0.15
0.28 0.22 0.45 0.9 -1.82 -2.34 -0.11 -0.15 0.04 0.08
0.35 0.5 0.75 0.57 -1.88 -2.07 -0.45 -0.27 -0.21 0.27
0.1 0.07 0.31 0.53 -1.43 -1.7 0.19 -0.04 0.21 0.32
0.08 0.12 0.41 0.86 -2.0 -2.14 0.15 0.02 0.18 -0.03
0.25 0.24 0.27 0.57 -1.31 -1.6 -0.1 0.05 0.07 0.24
-0.08 0.11 0.33 0.31 -0.45 -0.53 -0.16 -0.01 0.19 0.01
0.12 0.27 0.67 0.9 -2.03 -2.02 -0.3 -0.14 -0.09 0.12
0.51 0.42 0.51 1.07 -2.69 -3.06 0.05 -0.47 -0.47 -0.04
0.02 0.09 0.07 0.52 -1.33 -1.82 0.06 0.14 0.31 0.46
0.35 0.34 0.41 0.49 -0.98 -1.18 -0.26 -0.38 -0.05 0.26
0.32 0.39 0.75 0.6 -1.47 -1.33 -0.35 -0.39 -0.2 0.09
0.28 0.18 0.27 -0.02 -0.83 -0.82 -0.04 -0.08 0.12 0.41
0.39 0.34 0.76 0.5 -1.27 -1.43 -0.54 -0.09 -0.17 0.01
0.17 0.46 0.4 0.72 -0.93 -1.17 -0.03 -0.32 -0.07 -0.27
0.12 0.05 0.66 0.51 -0.66 -1.16 -0.44 0.07 0.09 -0.09
0.19 0.17 0.06 0.76 -1.38 -1.97 0.22 0.04 0.08 0.16
0.27 0.09 0.57 0.62 -1.1 -1.11 -0.23 -0.0 0.05 -0.16
0.44 0.4 0.38 0.86 -1.13 -1.3 -0.44 -0.32 -0.17 -0.12
0.31 0.29 0.35 0.42 -1.1 -1.74 -0.16 0.0 -0.08 0.4
0.05 0.04 0.43 0.54 -1.1 -1.3 0.02 -0.21 0.29 0.2
-0.06 0.06 0.39 0.44 -1.23 -1.33 0.16 0.18 0.1 0.25
0.07 0.11 0.17 0.53 -0.84 -0.99 0.07 0.06 0.18 0.02
0.14 0.21 0.58 0.77 -1.57 -1.9 -0.17 -0.2 -0.06 0.28
0.2 0.03 0.44 0.58 -0.6 -0.99 0.09 -0.14 -0.16 -0.06
0.27 0.16 0.37 0.39 -0.86 -0.91 -0.12 -0.09 -0.06 0.22
0.13 0.09 -0.03 0.47 -0.79 -0.97 0.12 0.06 0.11 0.23
0.36 0.24 0.56 0.62 -0.88 -0.89 -0.25 -0.28 -0.17 -0.16
0.25 0.32 0.49 0.52 -1.21 -1.26 -0.31 -0.21 0.06 0.21
-0.07 0.13 -0.07 0.65 -0.67 -1.44 0.15 0.16 0.09 0.21
0.31 0.42 0.53 0.8 -1.95 -2.16 -0.22 -0.18 -0.1 0.12
0.12 0.2 0.41 0.64 -1.41 -1.63 -0.22 -0.01 0.04 0.38
0.21 0.39 0.56 0.6 -1.19 -1.38 -0.29 -0.13 -0.17 0.13
0.12 0.09 0.34 0.64 -0.77 -0.64 -0.03 -0.15 -0.08 -0.04
0.28 0.45 0.92 0.68 -1.71 -1.74 -0.83 -0.34 -0.31 0.23
0.31 0.27 0.26 0.32 -0.62 -0.68 -0.25 -0.2 -0.02 0.19
0.42 0.2 0.27 0.88 -2.85 -3.08 -0.07 -0.22 0.26 0.26
0.22 0.15 0.47 0.69 -0.57 -0.91 -0.15 -0.36 -0.22 -0.02
0.56 0.47 0.4 0.86 -1.48 -1.65 -0.13 -0.27 -0.31 -0.36
0.21 0.21 0.27 0.6 -0.64 -1.11 -0.2 -0.07 -0.11 0.16
0.07 0.11 0.35 0.69 -1.07 -1.19 0.09 -0.05 0.11 -0.06
0.23 0.12 0.51 0.88 -1.51 -1.58 -0.02 -0.28 -0.02 -0.01
0.12 0.47 0.51 0.94 -1.18 -1.69 -0.48 -0.45 -0.23 0.19
-0.04 -0.04 0.28 0.67 -1.51 -1.64 -0.26 0.29 0.23 0.43
0.7 0.59 0.64 0.81 -2.32 -2.74 -0.44 -0.47 -0.61 0.13
0.55 0.42 0.44 0.63 -0.94 -1.34 -0.37 -0.42 -0.27 0.03
0.14 0.11 0.38 0.24 -1.08 -1.17 0.07 0.11 -0.04 0.39
0.12 0.15 0.02 0.69 -0.7 -1.15 -0.0 -0.09 0.01 0.22
0.13 0.08 0.26 0.34 -0.7 -0.68 -0.13 0.08 -0.05 0.27
0.2 0.12 0.2 0.48 -0.67 -0.74 -0.1 -0.04 -0.01 0.13
0.26 0.39 0.59 0.83 -1.15 -1.4 -0.55 -0.19 -0.26 -0.02
0.52 0.39 0.21 0.74 -1.11 -1.36 -0.16 -0.23 -0.1 -0.16
-0.13 -0.13 0.29 0.86 -1.92 -2.67 -0.04 0.13 0.32 0.48
0.16 0.16 0.66 1.1 -1.44 -1.78 -0.42 -0.42 -0.19 0.01
0.14 0.2 0.4 0.71 -1.52 -1.65 -0.02 0.02 -0.01 0.19
0.35 0.34 0.39 0.66 -1.04 -1.37 -0.28 -0.18 -0.11 0.08
0.45 0.34 0.53 0.6 -0.92 -1.24 -0.53 -0.27 -0.34 0.2
0.17 0.15 0.69 0.99 -1.72 -2.01 -0.7 -0.3 -0.03 0.27
0.1 0.13 0.21 0.41 -0.64 -0.98 0.07 -0.02 0.14 0.1
0.15 0.15 -0.06 0.36 -0.48 -0.86 0.11 0.05 0.14 0.06
0.3 0.2 0.32 0.84 -2.1 -2.45 -0.2 -0.17 0.07 0.45
0.06 0.09 0.27 0.43 -1.17 -1.36 0.25 0.02 0.21 0.19
0.16 0.22 0.67 0.57 -1.83 -1.96 -0.34 -0.21 0.08 0.47
0.22 0.24 0.5 0.59 -1.38 -1.52 -0.52 -0.05 0.02 0.4
0.06 0.19 0.95 0.5 -1.12 -1.37 -0.57 0.08 0.17 -0.37
0.26 0.31 0.13 0.73 -1.48 -2.1 0.15 -0.0 -0.08 0.23
0.32 0.28 1.16 1.17 -2.05 -2.54 -1.13 -0.74 -0.49 -0.2
0.13 0.14 0.2 0.42 -1.39 -1.59 0.28 0.05 0.19 0.26
0.11 0.3 0.26 0.66 -1.29 -1.58 0.03 -0.13 0.09 0.23
0.06 0.06 0.2 0.33 -0.87 -1.09 0.19 0.12 0.11 0.26
0.27 0.33 0.66 0.77 -1.63 -1.59 -0.41 -0.28 -0.23 0.22
0.16 0.35 0.53 0.83 -1.9 -1.88 -0.31 -0.11 -0.19 0.31
0.47 0.46 0.85 0.92 -1.81 -1.85 -0.7 -0.53 -0.42 -0.12
-0.07 -0.1 0.27 0.65 -1.31 -1.67 0.27 0.05 0.21 0.29
0.38 0.25 0.45 0.66 -1.0 -1.31 -0.31 -0.05 -0.13 -0.05
0.28 0.32 0.34 0.53 -1.43 -1.55 0.16 -0.08 0.06 0.01
0.04 0.05 0.51 0.88 -0.98 -1.34 -0.25 -0.17 -0.13 0.17
0.14 0.15 0.18 0.23 -0.74 -1.11 0.09 0.09 0.19 0.2
0.38 0.33 0.06 0.66 -2.08 -2.42 -0.2 0.35 0.04 0.29
0.23 0.18 0.5 0.93 -1.09 -1.41 -0.12 -0.5 -0.21 0.04
0.38 0.46 0.7 0.83 -1.58 -2.02 0.05 -0.71 -0.4 -0.11
0.19 0.29 0.35 0.62 -1.18 -1.27 -0.05 -0.13 -0.04 0.17
0.07 0.12 0.25 0.34 -0.62 -0.91 -0.03 -0.05 0.16 0.21
0.27 0.3 0.23 0.5 -0.93 -1.02 -0.03 -0.16 -0.01 0.13
0.15 0.13 0.57 0.62 -1.43 -1.53 -0.03 -0.0 -0.08 0.19
0.32 0.38 0.67 0.49 -1.26 -1.38 -0.37 -0.32 0.02 0.09
0.42 0.27 1.18 0.98 -2.7 -2.99 -0.58 -0.94 -0.56 0.1
0.15 0.14 0.5 0.68 -1.3 -1.6 0.01 -0.25 0.05 0.19
0.43 0.22 0.56 0.59 -1.66 -1.63 -0.16 -0.14 -0.1 0.17
0.35 0.21 0.72 0.88 -1.3 -1.33 -0.31 -0.3 -0.31 -0.22
0.37 0.26 0.22 0.52 -1.05 -1.19 -0.19 -0.17 0.03 0.27
0.08 0.11 0.38 0.65 -0.91 -1.37 -0.09 -0.17 0.1 0.23
0.09 0.22 0.35 0.69 -1.39 -1.38 -0.11 -0.24 -0.1 0.49
0.35 0.32 0.61 0.94 -1.47 -1.84 -0.41 -0.36 -0.28 0.05
0.14 0.2 0.79 0.72 -1.37 -1.66 -0.5 -0.17 -0.04 0.13
-0.08 -0.04 0.1 0.66 -0.45 -1.11 -0.0 0.05 0.04 0.23
0.03 0.04 0.17 0.75 -1.13 -1.41 0.23 -0.1 0.03 0.23
0.2 0.09 0.64 0.78 -1.45 -2.1 0.04 -0.33 -0.01 0.11
0.0 0.05 0.4 0.56 -1.37 -1.57 0.08 0.1 0.16 0.27
0.36 0.37 0.31 0.46 -0.92 -0.96 0.1 -0.27 -0.12 -0.07
0.09 0.24 0.43 0.79 -1.23 -1.58 -0.22 -0.03 -0.03 0.13
0.16 0.17 0.31 1.01 -1.41 -1.88 -0.23 -0.22 -0.04 0.23
0.27 0.32 0.3 0.64 -0.93 -0.91 -0.25 -0.03 -0.19 -0.01
0.26 0.24 0.31 0.33 -1.25 -1.5 -0.05 0.01 0.12 0.37
0.16 0.22 0.41 0.54 -1.04 -1.44 -0.15 -0.12 0.09 0.26
-0.04 0.04 0.54 0.75 -2.1 -2.65 -0.17 0.12 0.08 0.52
0.24 0.3 0.73 0.85 -1.65 -1.75 -0.41 -0.32 -0.14 0.05
0.0 0.05 0.11 0.55 -0.98 -1.05 0.06 0.08 0.16 0.27
0.25 0.17 0.27 0.76 -1.37 -1.85 0.03 -0.06 0.08 0.11
0.11 0.08 0.33 0.59 -1.54 -2.02 0.2 -0.06 0.22 0.31
0.09 0.1 0.29 0.47 -0.96 -1.22 0.06 -0.05 0.16 0.24
0.31 0.24 0.64 0.54 -1.46 -1.59 -0.21 -0.18 -0.18 0.31
0.07 0.28 0.37 0.85 -1.26 -1.42 0.09 -0.11 -0.11 -0.11
0.19 0.16 0.31 0.75 -1.68 -2.12 0.15 -0.03 0.11 0.14
-0.02 0.07 0.25 0.56 -1.18 -1.61 0.15 0.09 0.33 0.15
0.59 0.3 0.64 0.71 -1.46 -1.57 -0.2 -0.35 -0.41 -0.06
0.36 0.35 0.34 0.65 -0.81 -1.01 -0.45 -0.23 -0.07 0.0
0.2 0.38 0.49 0.82 -1.85 -1.97 -0.14 -0.08 -0.08 0.08
0.17 0.08 0.35 0.35 -0.9 -0.96 -0.12 -0.01 0.06 0.33
0.34 0.23 0.7 0.59 -1.16 -1.39 -0.06 -0.22 -0.3 -0.04
0.24 0.09 0.19 0.63 -1.01 -1.23 -0.06 -0.13 0.16 0.21
0.56 0.47 0.54 0.72 -1.67 -1.77 -0.26 -0.31 -0.31 -0.01
0.41 0.37 0.21 0.62 -1.15 -1.16 -0.18 -0.04 -0.04 -0.04
0.03 0.16 0.4 0.76 -1.22 -1.59 0.18 -0.07 0.08 -0.08
0.59 0.4 0.67 0.82 -1.55 -1.65 -0.38 -0.4 -0.41 -0.19
0.04 0.13 0.45 0.41 -1.11 -1.1 -0.17 0.12 0.19 0.19
0.31 0.3 0.76 1.13 -2.09 -2.43 -0.4 -0.48 -0.31 -0.07
0.41 0.62 0.23 0.78 -2.41 -2.81 0.07 -0.39 0.06 0.07
0.39 0.25 0.48 0.83 -1.36 -1.87 -0.23 -0.2 -0.18 0.1
0.45 0.42 0.25 0.37 -1.45 -1.68 0.17 -0.08 0.06 0.03
0.2 0.32 0.19 0.54 -0.87 -0.93 -0.14 0.02 -0.01 0.05
0.14 0.26 0.65 0.98 -1.77 -1.7 -0.31 -0.34 -0.05 -0.02
-0.09 0.07 0.56 0.44 -1.19 -1.26 -0.06 0.05 0.09 0.33
0.52 0.38 0.92 0.65 -1.95 -2.07 -0.51 -0.43 -0.28 0.05
0.02 0.03 0.64 0.91 -1.42 -1.52 -0.1 -0.21 -0.14 0.13
0.22 0.21 0.11 0.51 -0.94 -1.11 0.05 0.0 0.05 0.16
0.18 0.43 0.62 0.57 -1.39 -1.16 0.01 -0.16 -0.12 -0.24
0.35 0.23 0.13 0.5 -0.85 -1.06 0.15 -0.05 -0.1 -0.0
-0.28 -0.23 0.44 0.9 -1.62 -2.09 0.23 0.04 0.2 0.25
0.15 0.22 0.22 0.52 -1.08 -1.43 -0.07 -0.03 0.16 0.3
0.09 0.18 0.48 0.83 -2.03 -2.17 -0.18 -0.05 0.16 0.26
0.1 0.23 0.44 0.43 -1.38 -1.54 0.16 0.16 0.12 -0.0
-0.06 0.05 0.32 0.47 -1.29 -1.23 0.33 0.06 0.13 0.19
0.17 0.23 0.52 0.82 -1.39 -1.74 0.06 -0.21 -0.12 -0.02
0.01 0.04 0.4 0.55 -0.98 -1.23 0.12 0.03 0.14 0.05
0.22 0.23 0.54 0.63 -1.32 -1.62 -0.41 -0.03 0.03 0.24
0.5 0.17 0.72 0.55 -1.88 -2.01 -0.56 0.04 -0.09 0.25
0.3 0.3 0.65 0.53 -1.77 -1.97 -0.2 -0.13 -0.12 0.35
0.43 0.45 0.42 0.97 -2.17 -2.49 -0.27 -0.4 -0.15 0.15
0.25 0.19 0.41 0.52 -0.89 -1.1 -0.3 -0.09 0.04 0.17
0.16 0.18 0.24 0.36 -0.83 -0.98 0.03 -0.03 0.09 0.2
0.17 0.21 0.66 1.06 -2.47 -2.65 -0.35 -0.32 -0.13 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.