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Heatmap: Cluster_202 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.88 0.84 1.0 0.97 0.29 0.24 0.56 0.55 0.59 0.63
0.62 0.59 0.72 1.0 0.35 0.27 0.64 0.61 0.62 0.59
0.61 0.64 0.84 1.0 0.3 0.25 0.65 0.63 0.7 0.76
0.79 0.75 0.7 1.0 0.26 0.24 0.53 0.5 0.43 0.55
0.87 0.81 0.97 1.0 0.19 0.15 0.37 0.4 0.42 0.53
0.89 0.86 0.77 1.0 0.37 0.37 0.68 0.83 0.8 0.93
0.61 0.53 1.0 0.86 0.27 0.19 0.52 0.51 0.52 0.47
0.76 0.8 0.76 1.0 0.31 0.25 0.73 0.74 0.74 0.81
0.81 0.76 1.0 0.97 0.23 0.17 0.41 0.42 0.44 0.58
0.69 0.72 0.9 1.0 0.18 0.14 0.57 0.57 0.66 0.83
0.74 0.76 0.83 1.0 0.39 0.3 0.61 0.59 0.66 0.61
0.6 0.61 0.78 1.0 0.44 0.29 0.53 0.62 0.56 0.66
0.75 0.78 0.78 1.0 0.13 0.09 0.41 0.4 0.45 0.63
0.71 0.62 0.82 1.0 0.29 0.24 0.49 0.56 0.6 0.73
0.5 0.57 0.69 1.0 0.12 0.09 0.5 0.47 0.55 0.62
0.67 0.75 1.0 0.89 0.3 0.31 0.68 0.77 0.77 0.86
0.65 0.64 0.68 1.0 0.31 0.25 0.42 0.59 0.6 0.7
0.77 0.83 1.0 0.87 0.27 0.21 0.54 0.62 0.64 0.87
0.81 0.83 0.92 1.0 0.23 0.2 0.41 0.56 0.68 0.89
0.63 0.58 0.83 1.0 0.31 0.24 0.47 0.48 0.52 0.64
0.81 0.82 0.96 1.0 0.22 0.19 0.61 0.65 0.68 0.8
0.81 0.87 1.0 0.97 0.18 0.17 0.69 0.66 0.78 0.78
0.73 0.78 0.95 1.0 0.22 0.17 0.66 0.58 0.66 0.8
0.69 0.62 0.8 1.0 0.28 0.22 0.58 0.59 0.66 0.77
0.76 0.78 1.0 0.99 0.23 0.31 0.41 0.51 0.57 0.67
0.76 0.77 0.72 1.0 0.1 0.09 0.51 0.58 0.61 0.82
0.61 0.63 0.74 1.0 0.17 0.15 0.55 0.55 0.61 0.66
0.56 0.58 0.76 1.0 0.19 0.14 0.62 0.55 0.7 0.78
0.75 0.73 0.57 1.0 0.22 0.18 0.49 0.56 0.55 0.64
0.89 0.89 1.0 0.91 0.25 0.2 0.69 0.77 0.86 0.97
0.71 0.7 0.72 1.0 0.31 0.27 0.73 0.74 0.76 0.85
0.78 0.8 0.83 1.0 0.26 0.23 0.51 0.52 0.59 0.75
0.83 0.8 1.0 0.92 0.2 0.22 0.58 0.68 0.64 0.82
0.8 0.82 0.91 1.0 0.4 0.4 0.74 0.76 0.7 0.73
0.9 0.83 0.93 1.0 0.34 0.3 0.73 0.57 0.68 0.72
0.69 0.77 0.96 1.0 0.24 0.22 0.61 0.76 0.73 0.75
0.65 0.63 0.73 1.0 0.15 0.11 0.5 0.48 0.55 0.57
0.76 0.85 1.0 0.89 0.16 0.14 0.44 0.49 0.52 0.72
0.74 0.73 0.86 1.0 0.26 0.21 0.79 0.67 0.8 0.86
0.58 0.6 0.73 1.0 0.14 0.13 0.61 0.56 0.63 0.54
0.8 0.79 0.81 1.0 0.27 0.22 0.63 0.7 0.71 0.79
0.75 0.86 1.0 0.99 0.58 0.55 0.71 0.79 0.91 0.8
0.58 0.65 0.85 1.0 0.13 0.13 0.43 0.49 0.5 0.58
0.68 0.64 0.68 1.0 0.07 0.06 0.49 0.35 0.34 0.46
0.71 0.74 0.73 1.0 0.28 0.2 0.73 0.77 0.86 0.96
0.91 0.9 0.95 1.0 0.36 0.31 0.59 0.55 0.69 0.85
0.74 0.78 1.0 0.9 0.21 0.24 0.47 0.45 0.52 0.63
0.92 0.85 0.91 0.74 0.42 0.43 0.73 0.71 0.82 1.0
0.78 0.75 1.0 0.83 0.25 0.22 0.41 0.55 0.53 0.6
0.68 0.84 0.8 1.0 0.32 0.27 0.6 0.49 0.58 0.5
0.69 0.66 1.0 0.91 0.4 0.28 0.47 0.66 0.68 0.6
0.67 0.67 0.62 1.0 0.23 0.15 0.69 0.61 0.63 0.66
0.78 0.69 0.96 1.0 0.3 0.3 0.56 0.65 0.67 0.58
0.75 0.73 0.72 1.0 0.25 0.22 0.41 0.44 0.49 0.51
0.93 0.91 0.95 1.0 0.35 0.22 0.67 0.75 0.7 0.98
0.71 0.71 0.93 1.0 0.32 0.28 0.7 0.6 0.84 0.79
0.71 0.77 0.97 1.0 0.31 0.29 0.83 0.83 0.79 0.88
0.73 0.75 0.78 1.0 0.39 0.35 0.73 0.72 0.78 0.7
0.65 0.68 0.88 1.0 0.2 0.16 0.52 0.51 0.56 0.71
0.77 0.68 0.91 1.0 0.44 0.34 0.71 0.61 0.6 0.64
0.92 0.85 0.99 1.0 0.42 0.41 0.7 0.72 0.73 0.89
0.79 0.76 0.7 1.0 0.42 0.37 0.78 0.75 0.78 0.84
0.84 0.77 0.96 1.0 0.35 0.35 0.55 0.54 0.58 0.58
0.82 0.87 0.98 1.0 0.3 0.29 0.56 0.6 0.72 0.8
0.61 0.7 0.61 1.0 0.4 0.24 0.71 0.71 0.68 0.74
0.71 0.77 0.83 1.0 0.15 0.13 0.49 0.51 0.54 0.62
0.7 0.74 0.85 1.0 0.24 0.21 0.55 0.64 0.66 0.83
0.76 0.86 0.97 1.0 0.29 0.25 0.54 0.6 0.58 0.72
0.7 0.68 0.81 1.0 0.38 0.41 0.63 0.58 0.61 0.63
0.64 0.72 1.0 0.85 0.16 0.16 0.3 0.42 0.43 0.62
1.0 0.97 0.96 1.0 0.52 0.5 0.67 0.7 0.79 0.91
0.73 0.63 0.66 1.0 0.08 0.06 0.52 0.47 0.65 0.65
0.72 0.69 0.86 1.0 0.42 0.33 0.56 0.48 0.53 0.61
0.81 0.76 0.73 1.0 0.2 0.18 0.5 0.46 0.45 0.43
0.76 0.77 0.8 1.0 0.42 0.31 0.58 0.63 0.61 0.74
0.65 0.67 0.79 1.0 0.29 0.27 0.66 0.6 0.67 0.59
0.64 0.59 0.77 1.0 0.19 0.18 0.54 0.45 0.54 0.54
0.57 0.72 0.74 1.0 0.23 0.16 0.37 0.38 0.44 0.59
0.61 0.61 0.77 1.0 0.22 0.2 0.53 0.77 0.74 0.85
0.93 0.86 0.89 1.0 0.11 0.09 0.42 0.41 0.37 0.62
0.95 0.86 0.87 1.0 0.34 0.25 0.5 0.48 0.53 0.66
0.84 0.82 0.99 0.9 0.36 0.34 0.8 0.82 0.74 1.0
0.67 0.69 0.63 1.0 0.38 0.28 0.62 0.58 0.62 0.72
0.87 0.84 0.94 1.0 0.49 0.49 0.72 0.83 0.76 0.95
0.82 0.78 0.83 1.0 0.45 0.43 0.67 0.7 0.71 0.79
0.68 0.74 0.85 1.0 0.25 0.21 0.38 0.49 0.47 0.55
0.86 0.78 0.69 1.0 0.28 0.23 0.53 0.51 0.56 0.53
0.51 0.51 0.68 1.0 0.15 0.09 0.54 0.6 0.69 0.77
0.52 0.52 0.74 1.0 0.17 0.14 0.35 0.35 0.41 0.47
0.67 0.7 0.81 1.0 0.21 0.19 0.6 0.62 0.61 0.69
0.81 0.8 0.83 1.0 0.31 0.24 0.52 0.56 0.59 0.67
0.9 0.83 0.96 1.0 0.35 0.28 0.46 0.55 0.52 0.76
0.57 0.56 0.81 1.0 0.15 0.12 0.31 0.41 0.49 0.6
0.81 0.82 0.87 1.0 0.48 0.38 0.79 0.74 0.83 0.81
0.86 0.86 0.75 1.0 0.56 0.43 0.84 0.81 0.86 0.81
0.68 0.64 0.7 1.0 0.13 0.1 0.48 0.5 0.59 0.76
0.77 0.79 0.89 1.0 0.33 0.29 0.88 0.75 0.86 0.84
0.7 0.73 1.0 0.93 0.18 0.16 0.5 0.54 0.66 0.87
0.77 0.78 0.94 1.0 0.25 0.23 0.46 0.64 0.67 0.88
0.54 0.59 1.0 0.73 0.24 0.2 0.35 0.55 0.58 0.4
0.72 0.75 0.66 1.0 0.22 0.14 0.67 0.6 0.57 0.71
0.56 0.54 0.99 1.0 0.11 0.08 0.2 0.27 0.32 0.39
0.81 0.82 0.86 1.0 0.29 0.25 0.91 0.77 0.85 0.9
0.68 0.78 0.76 1.0 0.26 0.21 0.64 0.58 0.67 0.74
0.83 0.83 0.92 1.0 0.44 0.37 0.91 0.87 0.86 0.95
0.71 0.74 0.93 1.0 0.19 0.19 0.44 0.49 0.5 0.68
0.63 0.72 0.81 1.0 0.15 0.15 0.45 0.52 0.49 0.7
0.73 0.73 0.95 1.0 0.15 0.15 0.33 0.36 0.39 0.48
0.61 0.6 0.77 1.0 0.26 0.2 0.77 0.66 0.73 0.78
0.82 0.75 0.86 1.0 0.32 0.26 0.51 0.61 0.58 0.61
0.84 0.87 0.88 1.0 0.26 0.24 0.77 0.66 0.72 0.7
0.56 0.56 0.77 1.0 0.27 0.22 0.46 0.48 0.5 0.61
0.94 0.94 0.97 1.0 0.51 0.4 0.91 0.91 0.97 0.98
0.82 0.79 0.66 1.0 0.15 0.12 0.55 0.8 0.65 0.77
0.61 0.6 0.74 1.0 0.25 0.2 0.48 0.37 0.45 0.54
0.73 0.78 0.91 1.0 0.19 0.14 0.58 0.34 0.43 0.52
0.74 0.8 0.83 1.0 0.29 0.27 0.63 0.6 0.64 0.73
0.83 0.86 0.94 1.0 0.51 0.42 0.77 0.76 0.88 0.92
0.86 0.87 0.83 1.0 0.37 0.35 0.69 0.63 0.7 0.77
0.72 0.71 0.96 1.0 0.24 0.23 0.64 0.65 0.62 0.74
0.78 0.82 1.0 0.88 0.26 0.24 0.49 0.5 0.64 0.67
0.59 0.53 1.0 0.88 0.07 0.06 0.3 0.23 0.3 0.47
0.69 0.69 0.88 1.0 0.25 0.21 0.63 0.53 0.65 0.71
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0.64 0.67 1.0 0.95 0.22 0.18 0.41 0.52 0.56 0.63
0.6 0.62 0.68 1.0 0.46 0.29 0.63 0.66 0.65 0.75
0.6 0.61 0.67 1.0 0.27 0.22 0.69 0.55 0.61 0.7
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0.68 0.7 0.89 1.0 0.26 0.23 0.72 0.72 0.76 0.81
0.93 0.94 0.9 1.0 0.38 0.37 0.78 0.6 0.67 0.69
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0.56 0.56 0.62 1.0 0.19 0.14 0.42 0.43 0.48 0.58
0.78 0.81 0.79 1.0 0.34 0.34 0.54 0.63 0.57 0.64
0.93 0.91 0.96 0.98 0.32 0.27 0.75 0.78 0.84 1.0
0.77 0.8 0.91 1.0 0.33 0.25 0.62 0.63 0.73 0.82
0.58 0.61 0.86 1.0 0.14 0.09 0.53 0.64 0.63 0.85
0.66 0.68 0.92 1.0 0.18 0.16 0.42 0.44 0.5 0.57
0.69 0.71 0.74 1.0 0.35 0.33 0.72 0.72 0.77 0.83
0.7 0.66 0.71 1.0 0.23 0.16 0.6 0.56 0.62 0.64
0.72 0.7 0.83 1.0 0.23 0.16 0.76 0.64 0.77 0.82
0.77 0.77 0.89 1.0 0.37 0.31 0.75 0.7 0.81 0.85
0.79 0.76 1.0 0.93 0.23 0.21 0.55 0.56 0.56 0.79
0.58 0.68 0.72 1.0 0.23 0.21 0.59 0.51 0.52 0.52
0.68 0.66 0.74 1.0 0.19 0.14 0.66 0.58 0.64 0.65
0.67 0.71 0.81 1.0 0.3 0.22 0.75 0.72 0.85 0.75
0.92 0.75 0.96 1.0 0.22 0.21 0.53 0.48 0.46 0.59
0.82 0.81 0.81 1.0 0.36 0.32 0.47 0.55 0.61 0.64
0.65 0.74 0.8 1.0 0.16 0.14 0.51 0.54 0.54 0.6
0.88 0.83 1.0 1.0 0.42 0.4 0.72 0.78 0.82 0.99
0.78 0.72 1.0 0.93 0.28 0.24 0.59 0.53 0.5 0.6
0.77 0.69 0.74 1.0 0.32 0.28 0.62 0.59 0.72 0.75
0.9 0.84 0.89 1.0 0.19 0.18 0.51 0.49 0.49 0.6
0.87 0.84 0.75 1.0 0.29 0.29 0.58 0.63 0.64 0.63
0.6 0.66 0.78 1.0 0.25 0.2 0.67 0.56 0.62 0.56
0.85 0.75 0.9 1.0 0.19 0.18 0.43 0.43 0.43 0.5
0.75 0.8 1.0 0.97 0.34 0.34 0.65 0.8 0.83 0.84
0.57 0.56 0.77 1.0 0.11 0.09 0.35 0.33 0.37 0.43
0.78 0.9 0.68 1.0 0.11 0.08 0.61 0.44 0.61 0.61
0.74 0.67 0.78 1.0 0.22 0.15 0.48 0.49 0.5 0.6
1.0 0.98 0.87 0.95 0.27 0.23 0.82 0.69 0.76 0.75
0.79 0.86 0.78 1.0 0.38 0.36 0.62 0.7 0.68 0.71
0.56 0.61 0.8 1.0 0.15 0.16 0.41 0.4 0.49 0.5
0.64 0.71 1.0 0.92 0.3 0.28 0.65 0.7 0.72 0.85
0.76 0.69 1.0 0.83 0.14 0.13 0.37 0.39 0.44 0.55
0.54 0.54 0.83 1.0 0.2 0.19 0.5 0.46 0.48 0.58
0.82 0.81 0.76 1.0 0.37 0.33 0.73 0.7 0.73 0.78
0.74 0.87 1.0 0.97 0.25 0.29 0.66 0.58 0.6 0.55
0.91 0.83 0.77 1.0 0.39 0.34 0.79 0.68 0.66 0.71
0.44 0.46 0.73 1.0 0.17 0.13 0.63 0.55 0.62 0.64
0.77 0.81 0.81 1.0 0.33 0.26 0.67 0.68 0.78 0.86
0.6 0.64 0.78 1.0 0.14 0.12 0.49 0.54 0.63 0.67
0.79 0.87 1.0 1.0 0.28 0.25 0.83 0.83 0.8 0.74
0.69 0.75 0.9 1.0 0.3 0.31 0.91 0.75 0.79 0.83
0.64 0.67 0.82 1.0 0.22 0.17 0.59 0.49 0.52 0.56
0.68 0.7 0.9 1.0 0.35 0.29 0.74 0.69 0.75 0.71
0.75 0.76 0.94 1.0 0.26 0.21 0.48 0.63 0.66 0.76
0.86 0.68 1.0 0.89 0.17 0.15 0.41 0.62 0.57 0.72
0.79 0.79 1.0 0.92 0.19 0.16 0.56 0.59 0.59 0.82
0.69 0.7 0.68 1.0 0.11 0.09 0.42 0.39 0.46 0.57
0.83 0.79 0.93 1.0 0.38 0.32 0.57 0.66 0.72 0.78
0.87 0.88 0.92 1.0 0.44 0.39 0.8 0.77 0.83 0.89
0.54 0.56 0.76 1.0 0.09 0.08 0.38 0.38 0.44 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)