1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_65 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.77 0.74 1.0 1.0 0.54 0.48 0.81 0.81 0.75 0.84
0.46 0.46 0.91 1.0 0.23 0.21 0.52 0.49 0.55 0.6
0.31 0.34 0.93 1.0 0.21 0.21 0.39 0.5 0.46 0.53
0.5 0.52 1.0 0.99 0.21 0.18 0.46 0.53 0.64 0.75
0.57 0.67 0.94 1.0 0.1 0.09 0.3 0.34 0.38 0.53
0.48 0.44 1.0 0.94 0.19 0.17 0.6 0.58 0.64 0.69
0.62 0.6 1.0 0.78 0.19 0.2 0.41 0.53 0.53 0.76
0.41 0.47 0.95 1.0 0.17 0.15 0.4 0.39 0.48 0.63
0.58 0.56 1.0 0.99 0.34 0.31 0.62 0.66 0.72 0.77
0.31 0.32 0.85 1.0 0.19 0.15 0.46 0.45 0.45 0.56
0.62 0.61 1.0 0.77 0.27 0.26 0.45 0.54 0.58 0.82
0.39 0.5 1.0 0.95 0.3 0.3 0.55 0.61 0.66 0.6
0.53 0.54 1.0 0.9 0.16 0.16 0.42 0.48 0.5 0.68
0.47 0.48 1.0 0.98 0.14 0.12 0.43 0.45 0.56 0.7
0.5 0.56 1.0 0.81 0.15 0.15 0.33 0.44 0.5 0.69
0.72 0.73 1.0 0.83 0.29 0.25 0.58 0.6 0.58 0.76
0.52 0.58 1.0 0.81 0.19 0.17 0.54 0.51 0.61 0.71
0.46 0.48 1.0 0.65 0.3 0.26 0.48 0.65 0.61 0.64
0.53 0.53 1.0 0.94 0.28 0.22 0.53 0.5 0.58 0.7
0.61 0.65 1.0 0.95 0.25 0.25 0.45 0.53 0.59 0.65
0.51 0.55 1.0 0.6 0.16 0.16 0.4 0.52 0.53 0.77
0.62 0.65 1.0 0.93 0.17 0.16 0.44 0.4 0.42 0.63
0.46 0.46 1.0 0.89 0.12 0.13 0.35 0.39 0.47 0.59
0.48 0.53 1.0 0.91 0.22 0.21 0.42 0.5 0.53 0.68
0.41 0.39 1.0 0.87 0.16 0.1 0.5 0.46 0.48 0.69
0.52 0.56 0.84 1.0 0.13 0.1 0.39 0.38 0.43 0.55
0.6 0.64 1.0 0.86 0.19 0.19 0.4 0.4 0.43 0.57
0.62 0.61 1.0 0.79 0.21 0.23 0.6 0.63 0.61 0.77
0.41 0.47 1.0 0.86 0.13 0.12 0.37 0.43 0.54 0.78
0.67 0.7 0.94 1.0 0.18 0.2 0.54 0.69 0.71 0.89
0.44 0.47 0.95 1.0 0.19 0.16 0.51 0.53 0.54 0.77
0.64 0.68 0.98 1.0 0.24 0.23 0.53 0.56 0.65 0.75
0.48 0.52 0.94 1.0 0.14 0.12 0.39 0.42 0.45 0.55
0.54 0.58 1.0 0.95 0.16 0.14 0.49 0.46 0.52 0.61
0.64 0.61 1.0 1.0 0.16 0.16 0.5 0.57 0.56 0.67
0.37 0.39 0.86 1.0 0.24 0.21 0.44 0.44 0.52 0.59
0.62 0.63 0.97 1.0 0.12 0.13 0.4 0.38 0.48 0.61
0.53 0.62 1.0 1.0 0.43 0.37 0.54 0.73 0.65 0.74
0.49 0.54 1.0 0.97 0.26 0.25 0.61 0.62 0.65 0.76
0.44 0.47 1.0 0.93 0.12 0.11 0.39 0.43 0.49 0.57
0.55 0.61 1.0 0.75 0.14 0.12 0.51 0.45 0.56 0.66
0.59 0.65 1.0 0.81 0.26 0.24 0.52 0.62 0.75 0.92
0.67 0.65 1.0 0.91 0.23 0.2 0.53 0.53 0.55 0.67
0.45 0.46 0.8 1.0 0.27 0.25 0.44 0.46 0.5 0.6
0.51 0.5 1.0 0.91 0.3 0.34 0.53 0.67 0.67 0.72
0.34 0.39 1.0 0.71 0.16 0.17 0.39 0.43 0.43 0.55
0.48 0.5 0.79 1.0 0.23 0.2 0.52 0.5 0.54 0.61
0.34 0.35 0.85 1.0 0.17 0.14 0.31 0.35 0.42 0.56
0.5 0.54 0.91 1.0 0.13 0.13 0.37 0.36 0.41 0.58
0.64 0.67 1.0 0.94 0.3 0.26 0.66 0.66 0.7 0.83
0.68 0.68 1.0 0.96 0.18 0.17 0.44 0.42 0.54 0.58
0.36 0.4 1.0 0.77 0.15 0.13 0.32 0.34 0.36 0.53
0.34 0.37 1.0 0.75 0.14 0.14 0.34 0.39 0.42 0.61
0.64 0.73 1.0 0.95 0.2 0.21 0.4 0.42 0.52 0.61
0.26 0.26 1.0 0.82 0.14 0.13 0.26 0.34 0.39 0.54
0.29 0.32 1.0 0.93 0.17 0.13 0.35 0.38 0.41 0.48
0.59 0.66 1.0 0.97 0.23 0.23 0.52 0.52 0.51 0.66
0.66 0.64 1.0 0.91 0.14 0.14 0.49 0.59 0.62 0.78
0.33 0.35 1.0 0.89 0.14 0.14 0.34 0.38 0.46 0.63
0.71 0.71 1.0 0.89 0.19 0.15 0.46 0.5 0.57 0.8
0.45 0.49 1.0 0.79 0.17 0.16 0.32 0.4 0.47 0.65
0.23 0.23 0.76 1.0 0.1 0.09 0.33 0.36 0.41 0.51
0.62 0.57 0.97 1.0 0.54 0.51 0.66 0.73 0.75 0.83
0.49 0.54 1.0 0.88 0.28 0.23 0.71 0.65 0.65 0.7
0.37 0.4 1.0 0.98 0.19 0.18 0.42 0.47 0.48 0.64
0.55 0.58 1.0 0.92 0.19 0.19 0.45 0.62 0.66 0.91
0.72 0.75 0.97 1.0 0.37 0.32 0.7 0.77 0.75 0.83
0.54 0.56 1.0 0.9 0.18 0.15 0.36 0.38 0.41 0.55
0.6 0.67 0.96 1.0 0.26 0.25 0.49 0.72 0.69 0.79
0.59 0.62 1.0 0.92 0.24 0.21 0.5 0.58 0.61 0.72
0.57 0.66 0.82 1.0 0.15 0.16 0.47 0.6 0.61 0.68
0.65 0.61 1.0 0.92 0.2 0.19 0.5 0.51 0.61 0.73
0.57 0.59 1.0 0.94 0.22 0.2 0.42 0.52 0.59 0.71
0.71 0.77 0.97 1.0 0.23 0.3 0.46 0.58 0.6 0.79
0.69 0.72 0.94 1.0 0.29 0.25 0.56 0.66 0.7 0.75
0.6 0.64 1.0 0.95 0.35 0.35 0.67 0.56 0.63 0.77
0.59 0.63 1.0 0.94 0.26 0.24 0.6 0.6 0.63 0.68
0.6 0.63 0.93 1.0 0.28 0.26 0.47 0.53 0.61 0.73
0.61 0.62 0.95 1.0 0.37 0.35 0.66 0.69 0.66 0.72
0.58 0.56 1.0 0.94 0.19 0.17 0.43 0.43 0.5 0.67
0.49 0.51 0.96 1.0 0.24 0.29 0.52 0.57 0.64 0.65
0.47 0.5 1.0 0.77 0.17 0.15 0.57 0.58 0.6 0.81
0.66 0.68 0.95 1.0 0.21 0.19 0.54 0.54 0.61 0.66
0.5 0.53 1.0 0.98 0.23 0.18 0.44 0.51 0.59 0.82
0.59 0.59 1.0 0.83 0.31 0.3 0.45 0.54 0.56 0.74
0.34 0.35 1.0 0.89 0.14 0.12 0.42 0.4 0.44 0.64
0.46 0.49 1.0 0.73 0.14 0.14 0.42 0.49 0.54 0.69
0.34 0.41 1.0 0.64 0.14 0.15 0.36 0.53 0.53 0.6
0.54 0.57 1.0 0.94 0.25 0.23 0.45 0.48 0.6 0.85
0.44 0.47 1.0 0.92 0.24 0.21 0.43 0.44 0.51 0.61
0.68 0.72 0.97 1.0 0.26 0.24 0.53 0.6 0.65 0.73
0.53 0.61 1.0 0.84 0.18 0.18 0.53 0.6 0.6 0.78
0.34 0.36 1.0 0.98 0.14 0.12 0.35 0.38 0.41 0.6
0.66 0.68 1.0 0.92 0.26 0.28 0.54 0.64 0.7 0.83
0.5 0.54 1.0 0.89 0.12 0.12 0.38 0.43 0.48 0.65
0.72 0.74 1.0 0.98 0.49 0.46 0.76 0.76 0.78 0.86
0.39 0.44 1.0 0.84 0.21 0.24 0.45 0.59 0.64 0.63
0.4 0.4 1.0 1.0 0.24 0.22 0.42 0.42 0.45 0.52
0.71 0.71 1.0 0.81 0.29 0.27 0.52 0.67 0.67 0.74
0.52 0.55 0.97 1.0 0.32 0.34 0.59 0.63 0.69 0.65
0.6 0.61 1.0 0.9 0.24 0.21 0.7 0.66 0.74 0.76
0.46 0.46 0.9 1.0 0.2 0.15 0.49 0.55 0.55 0.65
0.51 0.52 1.0 0.96 0.18 0.15 0.35 0.37 0.44 0.56
0.66 0.71 1.0 0.96 0.2 0.19 0.47 0.6 0.63 0.83
0.37 0.4 1.0 0.81 0.2 0.17 0.4 0.48 0.53 0.77
0.73 0.7 0.94 1.0 0.39 0.34 0.55 0.61 0.71 0.72
0.35 0.36 1.0 0.98 0.23 0.24 0.43 0.5 0.52 0.58
0.26 0.28 1.0 0.92 0.12 0.11 0.28 0.32 0.37 0.63
0.5 0.57 0.93 1.0 0.25 0.21 0.42 0.52 0.54 0.65
0.79 0.71 0.96 1.0 0.42 0.33 0.58 0.71 0.75 0.78
0.44 0.47 1.0 0.82 0.23 0.22 0.41 0.49 0.53 0.65
0.39 0.4 0.98 1.0 0.24 0.24 0.5 0.57 0.57 0.65
0.46 0.47 0.87 1.0 0.13 0.12 0.32 0.35 0.4 0.55
0.5 0.58 1.0 0.91 0.24 0.21 0.65 0.75 0.72 0.76
0.51 0.55 1.0 0.9 0.25 0.3 0.7 0.68 0.66 0.67
0.31 0.33 1.0 0.87 0.2 0.19 0.31 0.38 0.39 0.54
0.56 0.58 0.97 1.0 0.19 0.23 0.47 0.51 0.63 0.67
0.52 0.54 1.0 0.89 0.2 0.2 0.62 0.6 0.67 0.8
0.54 0.54 0.89 1.0 0.28 0.26 0.64 0.62 0.65 0.72
0.48 0.48 1.0 0.92 0.15 0.13 0.43 0.48 0.54 0.81
0.62 0.59 1.0 0.81 0.22 0.19 0.45 0.5 0.53 0.66
0.66 0.65 0.94 1.0 0.22 0.2 0.62 0.63 0.69 0.67
0.44 0.53 0.97 1.0 0.12 0.1 0.59 0.61 0.62 0.74
0.45 0.48 1.0 0.9 0.18 0.17 0.41 0.48 0.5 0.7
0.3 0.37 1.0 0.56 0.09 0.1 0.34 0.43 0.51 0.52
0.47 0.53 0.93 1.0 0.19 0.16 0.55 0.47 0.52 0.64
0.74 0.8 0.95 1.0 0.4 0.35 0.69 0.7 0.8 0.85
0.41 0.42 1.0 0.93 0.18 0.16 0.4 0.42 0.52 0.61
0.66 0.69 1.0 0.94 0.24 0.21 0.59 0.66 0.74 0.95
0.63 0.68 0.96 1.0 0.2 0.2 0.55 0.57 0.59 0.66
0.65 0.64 0.98 1.0 0.27 0.21 0.61 0.55 0.6 0.71
0.61 0.63 1.0 0.93 0.2 0.19 0.46 0.54 0.61 0.81
0.52 0.52 1.0 0.9 0.35 0.28 0.64 0.55 0.61 0.7
0.5 0.54 1.0 0.86 0.21 0.18 0.42 0.51 0.59 0.89
0.52 0.57 1.0 0.83 0.22 0.19 0.46 0.44 0.57 0.8
0.59 0.61 0.84 1.0 0.19 0.16 0.41 0.44 0.48 0.67
0.44 0.45 1.0 0.84 0.28 0.28 0.48 0.54 0.57 0.67
0.41 0.43 1.0 0.78 0.21 0.22 0.46 0.42 0.47 0.55
0.49 0.5 1.0 0.96 0.19 0.17 0.41 0.59 0.58 0.73
0.57 0.49 1.0 0.76 0.25 0.18 0.6 0.61 0.61 0.56
0.66 0.64 0.92 1.0 0.28 0.23 0.53 0.58 0.58 0.76
0.51 0.5 0.99 1.0 0.37 0.33 0.57 0.58 0.64 0.71
0.42 0.45 1.0 0.67 0.35 0.32 0.55 0.6 0.61 0.62
0.56 0.63 1.0 0.89 0.23 0.16 0.51 0.48 0.61 0.56
0.71 0.71 0.99 1.0 0.32 0.27 0.58 0.61 0.67 0.69
0.55 0.55 1.0 0.87 0.23 0.21 0.56 0.64 0.71 0.77
0.57 0.62 1.0 0.73 0.29 0.3 0.54 0.62 0.63 0.74
0.42 0.5 1.0 0.64 0.2 0.22 0.43 0.59 0.62 0.68
0.56 0.59 1.0 1.0 0.19 0.18 0.56 0.62 0.69 0.9
0.51 0.56 1.0 0.85 0.31 0.31 0.7 0.67 0.7 0.73
0.55 0.58 1.0 0.77 0.34 0.43 0.54 0.65 0.68 0.64
0.64 0.67 0.94 1.0 0.26 0.23 0.57 0.6 0.61 0.73
0.79 0.78 1.0 0.98 0.27 0.29 0.55 0.64 0.69 0.98
0.51 0.52 0.77 1.0 0.26 0.21 0.47 0.51 0.59 0.63
0.62 0.65 1.0 0.8 0.37 0.36 0.58 0.67 0.69 0.69
0.48 0.46 0.87 1.0 0.3 0.26 0.58 0.57 0.57 0.7
0.61 0.63 1.0 0.78 0.11 0.11 0.48 0.44 0.48 0.69
0.54 0.58 1.0 0.95 0.23 0.21 0.59 0.59 0.66 0.72
0.46 0.47 1.0 0.74 0.25 0.25 0.51 0.53 0.58 0.6
0.65 0.66 0.93 1.0 0.19 0.16 0.44 0.5 0.54 0.7
0.5 0.52 0.92 1.0 0.17 0.15 0.3 0.36 0.41 0.59
0.53 0.56 0.89 1.0 0.22 0.21 0.51 0.52 0.56 0.66
0.38 0.4 1.0 0.92 0.22 0.21 0.45 0.53 0.53 0.66
0.53 0.55 0.86 1.0 0.22 0.21 0.62 0.61 0.68 0.75
0.44 0.43 1.0 0.8 0.18 0.15 0.59 0.55 0.6 0.65
0.59 0.62 0.92 1.0 0.24 0.24 0.62 0.7 0.72 0.72
0.52 0.54 0.98 1.0 0.37 0.31 0.51 0.61 0.56 0.64
0.42 0.44 1.0 0.89 0.15 0.15 0.42 0.48 0.46 0.65
0.47 0.5 1.0 0.89 0.15 0.17 0.45 0.43 0.47 0.56
0.75 0.72 1.0 0.92 0.49 0.42 0.68 0.69 0.79 0.84

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)