1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
1.6 1.38 -2.23 -3.59 0.6 0.65 -1.44 -1.37 -3.47 -2.98
0.95 1.05 -2.17 -1.97 0.82 1.27 -1.53 -1.17 -1.43 -2.36
1.32 1.37 -1.08 -1.72 0.71 1.1 -4.12 -3.12 -3.48 -3.33
1.57 1.44 -2.15 -1.41 0.54 0.66 -2.28 -2.78 -2.52 -2.71
1.57 1.57 -4.38 -4.25 0.84 1.1 - -7.0 - -8.5
1.04 0.89 -1.13 -0.68 0.91 1.18 -2.01 -2.57 -2.39 -1.99
1.59 1.64 -4.08 -7.23 0.9 0.84 -4.93 -4.56 -4.38 -5.3
1.68 1.49 -2.91 -3.94 0.77 1.03 -5.37 -6.81 -7.99 -7.33
1.26 1.28 -4.88 -4.16 1.11 1.55 -9.61 -8.47 -10.64 -
1.55 1.53 -1.96 -2.23 0.53 0.87 -2.83 -2.99 -3.4 -3.45
1.18 1.45 -1.56 -2.55 0.73 1.27 -2.47 -3.9 -3.23 -3.74
1.15 1.23 -3.45 -2.57 1.05 1.44 -3.25 -3.22 -3.12 -4.02
1.61 1.58 -3.99 -3.1 0.33 1.11 -3.9 -3.16 -3.28 -3.56
1.45 1.42 -3.62 -3.42 0.76 1.4 -5.28 -5.15 -5.32 -
1.41 1.4 -1.53 -2.22 0.52 0.88 -2.61 -1.97 -2.01 -2.3
1.22 1.11 -0.64 -1.24 0.63 0.65 -1.77 -1.41 -1.58 -1.64
1.5 1.42 -4.02 -2.43 0.92 1.14 -4.75 -5.6 -3.97 -4.8
1.44 1.52 -2.62 -2.06 0.73 0.88 -3.05 -2.7 -2.78 -3.33
1.47 1.44 -2.05 -1.22 0.56 1.05 -3.4 -4.17 -3.82 -3.77
1.34 1.3 -4.37 -4.03 0.96 1.43 -3.43 -4.12 -3.53 -6.66
1.39 1.55 -1.49 -1.34 0.52 1.15 - -6.46 -6.06 -5.67
1.56 1.6 -4.17 -4.23 0.73 1.13 -5.32 -6.63 -6.53 -8.2
1.31 1.37 -5.32 -4.21 0.95 1.54 - - - -
1.36 1.72 -2.45 -4.19 0.27 0.9 -1.51 -2.17 -2.27 -3.98
1.53 1.51 -1.74 -1.15 0.46 0.84 -3.72 -3.93 -3.52 -3.01
1.74 1.76 -5.87 -3.81 0.52 0.79 -7.03 -7.56 -9.65 -11.29
1.58 1.56 -2.49 -2.64 0.46 1.14 -5.65 -4.93 -5.68 -3.84
1.2 1.17 -0.38 -2.27 0.51 0.83 -1.56 -1.73 -1.61 -1.68
1.08 1.01 -1.17 -1.45 0.91 1.09 -2.19 -1.91 -2.03 -1.6
1.24 1.27 -3.76 -2.94 1.18 1.43 -5.06 -5.91 -6.83 -8.76
1.11 0.96 -1.26 -1.75 0.89 0.95 -1.45 -1.38 -1.66 -1.63
1.26 1.51 -1.42 -2.07 0.66 1.05 -3.25 -2.69 -3.23 -2.88
1.42 1.42 -1.75 -1.0 0.33 0.59 -1.19 -2.34 -1.83 -2.49
1.13 1.28 -1.17 -0.81 0.5 1.22 -2.78 -2.77 -2.5 -2.62
1.36 1.27 -3.05 -2.74 1.21 1.25 -4.65 -7.08 -6.26 -6.46
1.6 1.63 -2.38 -2.88 0.67 0.78 -3.75 -4.29 -3.98 -4.79
1.41 1.35 -1.93 -2.39 0.75 0.98 -2.84 -2.55 -2.22 -2.6
1.81 1.66 - -7.17 0.49 0.94 - - - -
1.78 1.69 -4.28 - 0.63 0.79 - -7.64 - -
1.73 1.75 -4.28 -3.33 0.52 0.78 -8.11 -8.61 -11.95 -9.1
1.8 1.71 -5.62 -3.66 0.46 0.81 -9.39 -7.24 -8.1 -7.18
1.54 1.33 -1.6 -1.45 0.55 0.97 -3.21 -3.47 -2.8 -3.15
1.08 1.59 - - 0.98 1.42 - -3.53 -3.71 -4.06
1.72 1.06 -4.68 -3.31 1.04 1.11 -4.07 -4.15 -3.62 -3.74
1.16 1.39 -1.21 -1.68 0.33 0.45 -1.19 -0.99 -1.31 -1.23
1.71 1.52 -4.55 -3.09 0.63 1.1 -6.02 -7.87 -8.64 -8.98
1.2 1.27 -0.99 -1.9 0.95 1.29 - -5.01 -4.38 -3.82
1.47 1.73 -4.87 -4.41 0.59 1.19 - - -5.97 -5.76
1.62 1.64 -4.01 -3.65 0.94 0.78 -6.59 -7.71 -7.97 -9.48
1.37 1.27 -4.76 -3.61 1.23 1.34 -6.38 -7.69 -8.29 -7.94
1.79 1.69 -4.22 -3.69 0.53 0.78 -6.6 -8.15 -8.22 -8.55
1.42 1.65 -3.37 -2.86 0.84 1.05 -3.78 -5.64 -8.4 -7.73
1.62 1.67 -2.35 -1.77 0.05 0.59 -2.54 -2.29 -2.64 -2.38
1.79 1.58 -4.14 -5.71 0.32 0.9 -3.39 -2.95 -3.34 -4.76
0.97 1.31 -2.06 -1.53 0.7 1.33 -2.39 -2.23 -1.72 -2.77
1.72 1.75 -6.86 -4.11 0.53 0.82 -7.08 -5.76 -6.94 -4.42
1.61 1.62 -2.45 -2.11 0.46 0.71 -3.2 -3.09 -3.1 -3.07
0.95 0.99 -0.42 -0.51 0.52 0.46 -1.31 -1.16 -1.09 -0.98
1.65 1.63 -4.26 -3.24 0.69 0.93 -5.11 -5.33 -5.94 -5.9
1.28 1.52 -1.95 -1.74 0.7 0.58 -1.5 -2.02 -2.01 -2.56
1.48 1.42 -3.5 -2.31 0.98 1.17 -6.56 - -9.18 -8.94
1.18 1.49 -1.81 -2.67 0.72 1.24 -2.88 -3.36 -3.32 -2.94
0.92 1.15 -1.33 -0.96 0.38 0.69 -0.87 -1.06 -1.08 -0.81
1.51 1.61 -1.92 -4.53 0.58 0.89 -3.42 -3.02 -4.02 -2.55
1.34 1.39 -1.14 -0.61 0.29 0.33 -2.1 -1.45 -1.52 -1.73
1.61 1.6 -3.84 -3.09 0.75 1.0 -5.64 -6.29 -6.15 -6.64
1.73 1.48 - - 0.62 1.23 - - - -
1.44 1.1 -2.26 -2.56 0.51 1.1 -2.37 -1.33 -1.84 -1.57
1.47 1.48 -1.27 -1.71 0.25 0.67 -1.75 -2.11 -2.1 -2.54
1.3 1.24 -3.7 -0.49 0.6 0.95 -3.91 -2.53 -2.27 -1.06
1.24 1.31 -2.83 -2.7 0.78 1.48 -3.06 -3.83 -3.32 -3.92
1.5 1.41 -2.2 -1.66 0.55 1.2 -4.03 -4.3 -4.24 -4.23
1.08 1.43 -2.4 -1.25 0.72 1.13 -3.12 -1.72 -2.45 -2.8
0.99 0.85 -1.38 -0.42 0.95 0.81 -1.26 -1.6 -1.55 -1.74
1.3 1.06 -0.99 -0.74 0.42 0.84 -1.55 -1.57 -1.67 -2.13
1.89 1.55 -2.49 -4.49 0.62 0.63 - - -4.17 -
1.66 1.8 -3.76 -3.06 0.36 0.92 - - - -8.15
1.18 1.24 -0.72 -0.88 0.31 0.51 -1.47 -1.31 -1.22 -1.48
1.32 1.36 -2.56 -1.99 0.41 0.73 -1.36 -1.43 -1.57 -1.28
1.45 1.55 -2.06 -3.06 0.81 1.09 - -5.11 -4.45 -5.29
1.37 1.21 -2.0 -1.71 0.88 0.9 -2.18 -2.38 -2.12 -2.43
1.61 1.69 -4.29 -5.37 0.55 1.13 - - -8.7 -
1.42 1.44 -2.25 -1.81 0.85 0.69 -2.47 -2.47 -2.41 -2.7
1.22 1.4 -0.88 -0.77 0.4 0.55 -2.35 -1.69 -2.18 -1.3
1.4 1.31 -1.63 -1.26 0.67 0.96 -2.9 -2.45 -2.91 -2.61
1.55 1.78 -4.13 -4.1 0.56 1.02 - -7.47 -8.97 -
1.61 1.69 -6.62 -3.82 0.32 1.26 - - - -
1.51 1.4 -1.88 -1.46 0.47 0.84 -2.23 -2.23 -2.99 -2.88
1.3 1.39 -1.32 -2.14 0.84 0.83 - -2.34 -2.25 -1.71
1.69 1.6 -2.92 -3.04 0.37 1.1 -6.07 -6.19 -5.69 -6.21
1.61 1.59 -2.99 -2.54 0.54 0.92 - -3.65 -2.84 -3.93
1.18 1.26 -1.53 -0.58 0.5 0.82 -1.56 -1.72 -2.04 -1.95
1.37 1.33 -1.7 -1.47 0.54 0.54 -1.45 -1.49 -1.52 -1.94
1.22 1.14 -2.41 -4.36 0.83 1.33 -1.81 -1.58 -2.03 -3.67
1.24 1.11 -1.62 -0.62 0.52 0.62 -0.91 -1.78 -2.01 -1.12
0.89 1.45 -2.37 -1.98 0.53 1.09 -1.56 -1.54 -1.28 -1.76
1.57 1.49 -6.08 -6.51 0.84 1.26 -7.64 -9.07 -9.25 -11.6
1.63 1.69 -2.69 -2.75 0.48 0.73 -3.98 -3.63 -3.88 -3.44
1.45 1.51 -7.13 -2.91 0.9 1.16 - -4.67 -3.92 -3.44
1.35 1.6 -3.62 -3.43 0.86 1.28 - - - -
1.65 1.67 -2.67 -2.4 0.33 0.72 -2.9 -3.31 -3.3 -3.42
1.32 1.12 -3.06 -2.61 1.17 1.47 -6.94 -8.08 -7.62 -10.19
1.16 1.09 -1.23 -0.47 0.59 0.77 -1.61 -1.91 -2.06 -1.19
1.09 0.94 -1.71 -0.4 0.72 0.95 -2.18 -1.37 -1.67 -1.33
1.22 1.56 -0.83 -1.02 0.38 0.55 -3.21 -1.74 -1.92 -2.03
1.2 1.22 -2.12 -2.08 0.56 1.41 -1.92 -2.61 -2.26 -2.88
1.48 1.47 -1.67 -1.09 0.62 1.06 - -5.03 -6.79 -7.13
1.42 1.34 -2.96 -1.33 0.81 1.24 -5.89 -4.84 -5.75 -3.42
1.39 1.26 -0.8 -1.13 0.62 0.78 -2.31 -2.5 -2.73 -2.63
1.18 1.19 -1.71 -0.85 0.78 1.15 -1.85 -2.89 -2.62 -3.46
1.41 1.37 -4.09 -4.56 1.0 1.4 -5.61 -7.47 -7.06 -6.97
1.41 1.44 -4.15 -3.92 1.02 1.31 -8.68 -10.41 -12.17 -10.91
1.25 1.27 -1.08 -1.01 0.47 0.88 -2.17 -1.64 -2.08 -2.18
1.18 1.22 -1.4 -0.83 0.53 0.69 -1.33 -1.82 -1.39 -1.5
1.14 1.17 -1.44 -0.95 0.2 0.55 -0.81 -1.06 -0.88 -1.1
1.48 1.63 -3.81 -4.47 0.84 1.07 -6.14 -4.49 -6.17 -4.92
1.55 1.29 -1.78 -2.36 0.89 1.09 -4.89 -4.46 -4.82 -4.26
1.57 1.49 -2.03 -0.99 0.45 0.87 -3.54 -4.01 -3.88 -4.24
1.64 1.57 -6.24 -4.48 0.94 0.95 -7.93 -10.29 -11.0 -14.51
1.52 1.53 -4.33 -3.52 0.84 1.2 -7.15 -8.01 -7.83 -8.39
1.58 1.66 -2.73 -2.57 0.53 0.97 - -4.81 -3.99 -5.34
1.05 1.16 -1.29 -0.51 0.23 0.52 -0.93 -0.97 -1.13 -1.05
0.91 0.91 -1.49 -0.59 0.79 0.95 -1.26 -1.35 -1.45 -1.35
1.26 1.21 -3.14 -1.51 1.02 1.15 -2.86 -3.71 -3.4 -1.91
1.66 1.64 -2.8 -2.67 0.41 0.9 -3.33 -4.41 -3.94 -5.5
1.14 1.23 -2.22 -1.81 1.03 1.48 -5.2 -4.47 -5.65 -5.25
1.09 1.22 -0.63 -2.54 0.8 1.26 -3.25 -2.33 -2.91 -2.71
1.62 1.53 -4.61 -3.05 0.72 0.95 -3.73 -3.84 -3.81 -3.51
1.61 1.52 -1.96 -1.91 0.62 0.84 -4.59 -4.21 -3.91 -4.56
0.75 0.6 -0.37 -0.73 0.19 0.4 -0.41 -0.25 -0.51 -0.57
0.91 0.87 -1.09 -0.44 0.81 0.75 -1.4 -1.26 -1.51 -0.95
1.71 1.89 -6.05 -4.89 0.52 0.64 - - - -
1.76 1.49 -4.11 -3.07 0.68 0.9 -4.49 -4.85 -4.77 -4.4
1.61 1.62 -5.5 -5.61 0.73 1.09 -5.31 -6.66 -6.89 -7.59
1.28 1.4 -2.37 -2.24 0.92 1.39 - - -8.04 -7.39
1.6 1.68 -2.58 -3.31 0.5 0.84 -3.77 -3.1 -3.52 -4.88
0.94 1.06 -0.69 -0.68 0.46 0.37 -1.0 -0.9 -0.85 -1.02
1.24 1.27 -2.83 -1.95 1.1 1.31 -3.01 -5.6 -5.36 -4.9
0.91 1.23 -0.33 -1.49 0.61 1.18 -1.74 -2.54 -2.3 -2.65
1.57 1.55 -3.14 -3.52 0.91 1.01 -8.04 -9.88 -9.33 -10.41
1.34 1.21 -1.76 -1.62 0.56 0.95 -2.32 -1.7 -1.6 -1.8
1.22 1.51 -1.95 -1.47 0.64 0.74 -1.74 -1.6 -2.29 -2.86
1.32 1.38 -6.33 -2.46 1.23 0.99 -2.42 -3.1 -4.12 -5.21
1.65 1.48 -5.08 -3.01 0.7 1.0 -2.88 -3.75 -3.91 -5.55
1.25 1.23 -2.26 -1.13 0.78 0.99 -2.46 -2.17 -1.82 -2.22
1.66 1.7 -3.98 -2.52 0.61 0.75 -3.5 -5.58 -7.34 -4.87
1.26 1.37 -5.34 -3.64 1.06 1.44 - -4.56 -5.38 -4.72
1.09 1.18 -1.35 -1.45 0.9 1.21 -2.42 -2.43 -2.68 -2.96
1.68 1.59 -4.52 -3.83 0.69 1.04 - - -9.09 -9.43
1.4 1.4 - -4.17 0.88 1.49 - - -4.8 -
1.38 1.38 -2.27 -0.86 0.6 0.72 -2.27 -1.54 -3.08 -2.23
1.81 1.61 - - 0.7 0.86 - - - -
1.18 1.31 -3.32 -2.79 1.15 1.47 -7.96 - - -6.01
1.41 1.56 -1.71 -1.67 0.32 0.78 -2.23 -2.37 -2.16 -2.48
1.21 1.07 -2.31 -0.56 0.44 0.74 -1.53 -1.11 -1.07 -1.34
1.42 1.45 -3.22 -3.1 0.95 1.25 -6.07 -6.04 -7.07 -5.74
1.2 1.09 -2.65 -2.94 1.2 1.57 -7.45 -8.32 -8.87 -10.75
1.31 1.33 - -1.47 1.07 1.09 - -5.96 -3.14 -1.76
1.36 1.44 -6.44 -4.44 0.97 1.41 -7.68 -4.96 -6.72 -6.46
1.63 1.55 -2.51 -2.12 0.61 0.79 -3.82 -3.24 -3.84 -4.12
1.35 1.42 -1.52 -2.87 0.23 0.88 -2.26 -1.59 -1.64 -1.25
1.72 1.59 -2.9 -2.07 0.56 0.83 -6.41 -6.26 -5.56 -5.56
1.17 1.09 -4.0 -1.09 1.03 1.58 -4.73 -5.58 - -
1.45 1.56 -5.25 -3.83 1.09 1.01 -6.26 -5.89 -5.88 -4.76
1.45 1.19 -5.92 -3.25 0.4 1.21 -1.57 -1.47 -1.81 -2.06
1.25 1.55 -1.88 -1.26 0.69 0.62 -2.75 -1.81 -3.04 -1.73
1.28 1.08 -1.39 -1.38 0.69 0.87 -1.73 -1.74 -1.59 -1.63
1.47 1.65 -2.4 -2.31 0.53 1.11 -5.03 -5.65 -5.15 -5.36
1.22 1.25 -1.91 -1.2 0.84 1.26 -4.78 -2.96 -3.05 -3.1
1.55 1.57 -2.31 -2.52 0.37 0.73 -2.24 -2.33 -2.0 -3.17
1.3 1.08 -2.3 -0.79 0.7 1.09 -1.84 -2.54 -2.0 -2.53
1.48 1.46 -1.39 -2.27 0.61 0.96 -4.21 -3.27 -2.72 -3.4
1.34 1.51 -1.25 -1.46 0.47 0.58 -2.58 -1.7 -2.05 -2.04
1.3 1.43 -1.75 -1.39 0.82 0.82 -2.25 -2.87 -2.43 -3.51
1.2 1.33 -4.83 -3.84 0.98 1.64 -9.6 - -8.31 -10.97
1.27 1.31 -3.11 -1.49 1.08 1.16 -5.19 -4.34 -5.2 -2.5
1.09 1.04 -1.6 -0.8 0.67 0.97 -2.38 -1.23 -1.73 -1.2
1.78 1.66 -6.34 -5.64 0.6 0.9 - - - -
1.49 1.46 -4.03 -1.45 0.78 1.05 -4.47 -4.06 -4.03 -4.2
0.78 0.76 -0.84 -0.73 0.38 0.67 -0.4 -0.76 -0.66 -0.84
1.76 1.7 -4.56 -4.46 0.47 0.9 -6.11 -7.15 -10.2 -8.95
1.4 1.42 -4.97 -1.04 0.71 0.87 - -1.93 -2.87 -1.77
1.51 1.46 -2.11 -2.85 0.3 0.9 -1.24 -2.2 -2.23 -3.71
1.56 1.82 -3.14 -3.26 0.43 0.95 - -5.4 - -
1.61 1.34 - -3.14 0.77 1.1 -1.93 -4.37 -2.96 -
1.53 1.56 -5.11 -3.17 0.89 1.09 -5.67 -6.44 -7.58 -7.03
1.34 1.28 -3.86 -2.02 1.09 1.33 - -7.26 -6.44 -4.33
1.39 1.36 -1.6 -0.4 0.39 0.85 -3.65 -2.68 -2.67 -2.17
1.28 1.01 -0.5 -1.07 0.29 0.73 -1.78 -1.06 -1.53 -1.39
1.35 1.61 -3.72 -2.7 0.47 1.47 - - - -
1.07 1.01 -1.3 -1.43 0.64 0.96 -1.16 -1.34 -1.56 -1.23
1.03 1.32 -0.79 -1.25 0.55 0.95 -1.51 -1.95 -2.17 -2.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.