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Heatmap: Cluster_104 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.26 0.32 0.06 0.05 -0.44 -0.84 -0.16 0.0 0.18 0.21
0.17 0.33 -0.05 0.2 -0.57 -0.56 -0.06 0.15 0.07 0.06
0.19 0.14 0.48 0.31 -1.26 -1.99 0.08 0.09 0.22 0.22
0.34 0.36 0.19 0.18 -0.95 -1.06 -0.25 0.17 0.09 0.19
0.6 0.61 0.05 0.3 -1.19 -1.15 -0.24 -0.04 0.02 -0.04
0.19 0.26 0.26 0.14 -0.95 -0.98 -0.0 0.1 0.16 0.2
0.56 0.53 0.2 0.32 -1.46 -1.77 -0.3 -0.21 -0.01 0.44
0.28 0.32 0.3 0.68 -1.7 -1.79 -0.26 0.04 0.03 0.29
0.47 0.46 0.39 0.42 -1.05 -1.13 -0.34 -0.29 -0.15 0.19
0.7 0.54 0.01 0.16 -1.04 -1.12 -0.15 -0.04 -0.11 0.07
0.57 0.54 0.48 0.48 -1.74 -2.06 -0.16 -0.23 -0.2 0.16
0.63 0.65 0.42 0.48 -1.61 -1.8 -0.25 -0.39 -0.23 0.11
0.38 0.22 0.24 0.46 -1.43 -1.75 -0.17 0.04 0.17 0.33
0.48 0.52 0.33 0.45 -1.28 -1.27 -0.24 -0.31 -0.09 0.18
0.47 0.51 0.35 0.12 -0.66 -1.4 -0.13 -0.13 -0.06 0.05
0.5 0.48 0.25 0.47 -1.21 -1.38 -0.04 -0.17 -0.04 -0.06
0.4 0.42 0.02 0.42 -2.07 -2.4 0.05 0.11 0.16 0.42
0.24 0.45 0.22 0.36 -1.28 -1.37 0.03 -0.09 -0.04 0.34
0.69 0.66 0.29 0.15 -1.48 -1.69 -0.31 -0.2 -0.08 0.25
0.27 0.44 0.13 0.07 -1.42 -1.52 0.2 0.13 0.2 0.25
0.69 0.64 -0.03 0.45 -1.58 -1.77 -0.18 -0.09 -0.13 0.16
0.39 0.41 0.45 0.4 -1.12 -1.29 -0.27 -0.21 -0.16 0.28
0.56 0.56 0.22 0.41 -1.3 -1.64 -0.04 -0.21 -0.13 0.09
0.55 0.51 0.22 0.22 -1.01 -1.21 -0.28 -0.04 0.01 0.07
0.58 0.62 0.12 0.26 -1.67 -1.88 -0.15 -0.02 0.08 0.21
0.57 0.4 0.39 0.53 -1.38 -1.6 -0.15 -0.22 -0.29 0.21
0.29 0.3 0.14 0.3 -0.54 -1.15 -0.12 -0.22 0.01 0.38
0.29 0.3 0.09 0.27 -1.27 -1.46 0.11 0.05 0.23 0.28
0.37 0.37 0.22 0.74 -2.18 -2.29 -0.21 -0.15 0.22 0.29
0.59 0.41 0.41 0.26 -1.18 -1.65 -0.16 -0.04 -0.01 0.03
0.62 0.6 0.37 0.5 -1.5 -2.0 -0.16 -0.27 -0.27 0.11
0.78 0.7 0.01 0.35 -1.72 -2.2 -0.17 -0.12 0.09 -0.03
0.24 0.3 0.02 0.43 -1.26 -1.83 0.05 0.03 0.18 0.42
0.63 0.22 0.63 0.74 -1.53 -1.86 -0.54 -0.19 -0.27 0.09
0.81 0.77 0.28 0.58 -2.57 -3.1 -0.02 -0.44 -0.29 0.01
0.48 0.47 0.11 0.4 -1.61 -1.64 -0.06 -0.14 -0.02 0.4
0.56 0.58 -0.05 0.61 -1.22 -1.84 -0.38 -0.05 0.03 0.11
0.35 0.5 0.01 0.62 -2.11 -2.44 -0.36 -0.08 0.14 0.61
0.5 0.47 0.05 0.3 -0.83 -1.15 -0.08 -0.08 -0.05 0.08
0.5 0.67 0.2 0.4 -1.6 -1.97 -0.19 -0.18 0.25 -0.01
0.18 0.25 0.28 0.46 -1.2 -1.35 0.06 -0.0 0.07 0.23
0.47 0.53 0.26 0.75 -1.49 -1.81 -0.08 -0.2 -0.26 -0.0
0.28 0.39 0.34 0.09 -1.24 -1.4 -0.07 0.11 0.17 0.25
0.49 0.47 0.33 0.21 -0.99 -1.05 -0.26 -0.17 0.03 0.1
0.34 0.22 0.23 0.32 -0.99 -1.26 0.01 0.15 0.03 0.11
0.41 0.34 0.29 0.41 -1.06 -1.32 -0.19 -0.05 -0.0 0.17
0.67 0.62 0.23 0.28 -1.32 -1.4 -0.2 -0.18 -0.18 0.1
0.45 0.39 0.07 0.13 -0.87 -1.13 0.03 -0.1 0.11 0.19
0.4 0.39 0.19 0.27 -0.88 -1.06 0.03 0.01 0.0 -0.03
0.4 0.44 0.25 0.47 -1.59 -1.54 -0.14 -0.02 -0.02 0.25
0.46 0.65 0.37 0.27 -1.33 -2.04 -0.19 -0.38 0.0 0.35
0.46 0.36 0.22 0.37 -1.59 -1.89 0.1 0.02 0.06 0.21
0.68 0.56 -0.02 0.43 -1.83 -2.08 0.08 -0.15 -0.08 0.22
0.3 0.43 0.3 0.7 -1.38 -1.69 -0.3 0.03 0.05 0.02
0.23 0.19 0.09 0.35 -1.41 -1.46 -0.0 0.13 0.26 0.4
0.58 0.51 0.53 0.57 -1.65 -1.75 -0.39 -0.37 -0.1 0.1
0.35 0.32 0.27 0.44 -1.14 -1.56 -0.02 0.07 0.09 0.03
0.49 0.43 0.53 0.47 -1.15 -1.69 -0.21 -0.27 -0.3 0.21
0.3 0.18 0.4 0.36 -0.59 -0.83 -0.15 -0.17 -0.16 0.18
0.37 0.49 0.2 0.27 -0.93 -1.19 -0.08 0.07 -0.03 0.02
0.46 0.44 0.33 0.35 -1.4 -1.8 -0.17 0.06 -0.03 0.21
0.53 0.65 0.02 0.42 -1.93 -1.93 0.14 -0.13 0.17 -0.05
0.48 0.51 0.4 0.02 -1.35 -1.17 -0.28 -0.15 0.13 0.24
0.62 0.58 0.4 0.45 -1.59 -1.58 -0.42 -0.01 -0.04 -0.14
0.52 0.56 0.19 0.23 -1.14 -1.41 -0.07 0.02 0.07 -0.09
0.36 0.27 0.64 0.18 -1.89 -2.15 0.07 0.07 0.07 0.23
0.53 0.5 0.04 0.35 -1.44 -1.51 0.1 -0.05 -0.11 0.19
0.5 0.51 0.02 0.6 -2.34 -2.67 0.12 0.08 0.12 0.06
0.58 0.59 0.25 0.23 -1.22 -1.32 -0.24 -0.13 -0.08 0.13
0.48 0.37 0.45 0.32 -1.19 -1.28 -0.2 -0.05 -0.11 0.13
0.11 0.24 0.27 0.4 -1.28 -1.69 0.08 0.13 0.14 0.31
0.6 0.59 0.07 0.5 -1.74 -1.94 -0.07 -0.12 0.06 0.06
0.37 0.36 0.2 0.15 -1.0 -1.22 -0.01 -0.09 0.12 0.27
0.64 0.55 0.03 0.33 -1.3 -1.6 -0.17 -0.06 -0.03 0.2
0.5 0.39 0.33 0.24 -0.98 -1.05 -0.09 -0.15 -0.03 0.03
0.33 0.36 0.18 0.3 -1.23 -1.4 0.12 0.18 -0.0 0.11
0.6 0.63 0.34 0.44 -1.9 -2.1 -0.02 -0.22 -0.02 -0.02
0.12 0.25 -0.03 0.33 -0.36 -0.66 -0.25 -0.03 0.02 0.3
0.71 0.72 0.29 0.77 -2.64 -2.94 -0.27 -0.3 -0.35 0.11
0.42 0.41 0.13 0.4 -1.37 -1.61 0.02 0.01 0.06 0.2
0.61 0.47 0.18 0.52 -1.3 -1.84 -0.05 -0.06 -0.11 -0.02
0.48 0.38 0.31 0.24 -1.44 -1.57 -0.03 -0.05 -0.07 0.37
0.37 0.45 0.18 0.82 -2.22 -2.53 -0.33 -0.06 0.03 0.35
0.71 0.78 0.05 0.25 -2.6 -2.5 -0.15 -0.11 0.1 0.25
0.59 0.4 0.18 0.52 -0.9 -1.37 -0.25 -0.16 -0.16 0.08
0.33 0.68 0.67 -0.07 -1.07 -1.91 -0.29 -0.06 -0.83 0.6
0.55 0.65 -0.04 0.81 -2.19 -2.49 -0.05 -0.05 -0.2 0.05
0.32 0.42 0.35 0.49 -1.04 -1.45 -0.32 -0.1 -0.0 0.2
0.57 0.55 -0.25 0.46 -1.11 -1.23 0.09 -0.25 -0.23 0.25
0.51 0.67 0.38 -0.11 -1.37 -1.18 -0.17 -0.11 0.03 0.13
0.47 0.83 -0.08 -0.01 -2.14 -2.21 -0.14 0.06 0.19 0.45
0.62 0.64 -0.19 0.68 -1.81 -2.03 0.08 -0.19 -0.18 0.11
0.56 0.52 0.13 0.01 -1.39 -1.4 -0.08 0.15 0.09 0.13
0.46 0.53 0.06 0.06 -0.88 -0.99 -0.14 -0.04 0.07 0.16
0.21 0.21 0.14 0.48 -1.26 -1.6 0.21 0.02 0.15 0.22
0.53 0.56 0.04 0.4 -1.86 -1.88 -0.17 0.04 0.18 0.18
0.31 0.18 0.3 0.11 -0.87 -0.91 -0.04 0.09 0.09 0.18
0.48 0.52 0.39 0.52 -1.45 -1.56 -0.14 -0.15 -0.19 0.06
0.18 0.2 0.14 0.45 -1.16 -1.57 0.12 -0.08 0.19 0.36
0.41 0.33 0.0 0.42 -1.04 -1.39 0.15 -0.03 0.07 0.1
0.2 0.23 0.33 0.41 -1.26 -1.52 0.16 -0.03 0.05 0.26
0.49 0.49 0.27 0.3 -1.1 -1.1 -0.12 -0.01 -0.12 -0.01
0.68 0.62 -0.05 0.41 -1.34 -1.68 -0.17 -0.02 -0.02 0.0
0.29 0.13 0.27 0.07 -0.33 -0.57 -0.02 -0.19 0.01 0.13
0.46 0.56 0.0 -0.02 -1.17 -1.14 -0.11 0.09 0.09 0.27
0.49 0.6 0.08 -0.31 -1.01 -1.07 -0.06 0.06 0.2 0.13
0.41 0.29 0.25 0.11 -0.84 -1.04 -0.07 0.07 0.09 0.1
0.31 0.37 0.03 0.5 -0.89 -1.19 -0.1 0.06 -0.12 0.21
0.58 0.52 0.02 -0.02 -0.85 -1.32 -0.25 0.12 -0.09 0.31
0.25 0.29 0.21 0.34 -1.46 -1.48 0.01 0.13 0.25 0.21
0.5 0.66 0.51 0.25 -1.57 -1.62 -0.59 -0.34 -0.28 0.53
0.58 0.53 0.3 0.13 -1.28 -1.34 -0.3 0.05 0.15 -0.05
0.38 0.4 0.35 0.28 -0.86 -0.89 -0.15 -0.11 -0.17 0.11
0.44 0.52 0.06 0.51 -1.67 -1.94 -0.01 -0.01 0.11 0.13
0.57 0.55 0.09 0.59 -1.56 -1.85 -0.14 -0.21 -0.08 0.18
0.66 0.49 0.31 0.11 -1.07 -1.46 -0.06 -0.21 -0.14 0.18
0.56 0.47 0.26 0.55 -1.1 -1.36 -0.22 -0.14 -0.26 0.03
0.4 0.5 0.42 0.62 -2.12 -2.46 -0.15 -0.15 0.06 0.19
0.57 0.56 0.33 0.33 -1.3 -1.23 -0.52 -0.22 -0.26 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.