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Heatmap: Cluster_104 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.96 1.0 0.84 0.83 0.59 0.45 0.72 0.8 0.91 0.93
0.89 1.0 0.77 0.91 0.54 0.54 0.76 0.88 0.83 0.83
0.82 0.79 1.0 0.89 0.3 0.18 0.76 0.77 0.84 0.84
0.98 1.0 0.88 0.88 0.4 0.37 0.66 0.88 0.83 0.89
0.99 1.0 0.68 0.81 0.29 0.29 0.55 0.64 0.66 0.64
0.95 1.0 1.0 0.92 0.43 0.42 0.83 0.89 0.93 0.96
1.0 0.98 0.78 0.85 0.25 0.2 0.55 0.59 0.67 0.92
0.76 0.78 0.77 1.0 0.19 0.18 0.52 0.64 0.64 0.76
1.0 0.99 0.94 0.96 0.35 0.33 0.57 0.59 0.65 0.82
1.0 0.89 0.62 0.68 0.3 0.28 0.55 0.6 0.57 0.64
1.0 0.98 0.94 0.93 0.2 0.16 0.6 0.57 0.58 0.75
0.99 1.0 0.85 0.89 0.21 0.18 0.54 0.49 0.54 0.69
0.95 0.85 0.86 1.0 0.27 0.22 0.65 0.75 0.82 0.92
0.98 1.0 0.88 0.96 0.29 0.29 0.59 0.56 0.66 0.79
0.97 1.0 0.89 0.76 0.44 0.26 0.64 0.64 0.67 0.72
1.0 0.99 0.84 0.98 0.31 0.27 0.69 0.63 0.69 0.68
0.98 1.0 0.76 1.0 0.18 0.14 0.78 0.8 0.83 1.0
0.87 1.0 0.85 0.94 0.3 0.28 0.75 0.69 0.71 0.93
1.0 0.98 0.76 0.69 0.22 0.19 0.5 0.54 0.59 0.74
0.89 1.0 0.81 0.77 0.28 0.26 0.85 0.81 0.85 0.88
1.0 0.96 0.6 0.84 0.21 0.18 0.55 0.58 0.56 0.69
0.96 0.97 1.0 0.97 0.34 0.3 0.61 0.63 0.66 0.89
1.0 1.0 0.79 0.9 0.28 0.22 0.66 0.58 0.62 0.72
1.0 0.97 0.8 0.8 0.34 0.3 0.56 0.67 0.69 0.72
0.97 1.0 0.71 0.78 0.2 0.18 0.58 0.64 0.69 0.75
1.0 0.89 0.88 0.97 0.26 0.22 0.61 0.58 0.55 0.78
0.94 0.94 0.85 0.95 0.53 0.35 0.71 0.66 0.78 1.0
0.99 1.0 0.86 0.98 0.34 0.3 0.88 0.84 0.95 0.99
0.77 0.77 0.69 1.0 0.13 0.12 0.52 0.54 0.7 0.73
1.0 0.89 0.89 0.8 0.29 0.21 0.6 0.65 0.66 0.68
1.0 0.99 0.84 0.92 0.23 0.16 0.59 0.54 0.54 0.71
1.0 0.94 0.58 0.74 0.18 0.13 0.52 0.54 0.62 0.57
0.87 0.91 0.75 1.0 0.31 0.21 0.76 0.76 0.84 0.99
0.92 0.7 0.92 1.0 0.21 0.16 0.41 0.52 0.5 0.64
1.0 0.97 0.69 0.85 0.1 0.07 0.56 0.42 0.47 0.57
1.0 0.99 0.77 0.94 0.23 0.23 0.69 0.65 0.71 0.94
0.97 0.98 0.63 1.0 0.28 0.18 0.5 0.63 0.67 0.71
0.83 0.92 0.65 1.0 0.15 0.12 0.51 0.61 0.72 0.99
1.0 0.98 0.73 0.87 0.4 0.32 0.67 0.67 0.68 0.75
0.88 1.0 0.72 0.83 0.21 0.16 0.55 0.55 0.74 0.62
0.82 0.86 0.88 1.0 0.32 0.28 0.75 0.72 0.76 0.85
0.82 0.86 0.71 1.0 0.21 0.17 0.56 0.52 0.5 0.59
0.93 1.0 0.97 0.81 0.32 0.29 0.73 0.83 0.86 0.91
1.0 0.99 0.89 0.82 0.36 0.34 0.59 0.63 0.73 0.76
1.0 0.92 0.93 0.98 0.4 0.33 0.8 0.87 0.81 0.85
1.0 0.95 0.91 1.0 0.36 0.3 0.66 0.72 0.75 0.85
1.0 0.96 0.73 0.76 0.25 0.24 0.55 0.55 0.55 0.67
1.0 0.96 0.77 0.8 0.4 0.34 0.75 0.69 0.79 0.84
1.0 0.99 0.87 0.92 0.41 0.37 0.77 0.76 0.76 0.74
0.95 0.98 0.86 1.0 0.24 0.25 0.66 0.71 0.71 0.86
0.88 1.0 0.83 0.77 0.25 0.16 0.56 0.49 0.64 0.81
1.0 0.94 0.85 0.94 0.24 0.2 0.78 0.74 0.76 0.84
1.0 0.93 0.62 0.84 0.18 0.15 0.66 0.56 0.59 0.73
0.76 0.83 0.76 1.0 0.24 0.19 0.5 0.63 0.64 0.62
0.89 0.87 0.81 0.97 0.29 0.27 0.76 0.83 0.91 1.0
1.0 0.96 0.97 0.99 0.21 0.2 0.51 0.52 0.63 0.72
0.94 0.92 0.89 1.0 0.33 0.25 0.73 0.77 0.79 0.75
0.97 0.93 1.0 0.96 0.31 0.22 0.6 0.58 0.56 0.8
0.94 0.86 1.0 0.98 0.5 0.43 0.68 0.68 0.68 0.86
0.92 1.0 0.82 0.86 0.37 0.31 0.67 0.75 0.7 0.72
1.0 0.99 0.92 0.93 0.28 0.21 0.65 0.76 0.71 0.84
0.92 1.0 0.65 0.85 0.17 0.17 0.7 0.58 0.72 0.61
0.98 1.0 0.92 0.71 0.28 0.31 0.58 0.63 0.77 0.83
1.0 0.97 0.86 0.89 0.22 0.22 0.49 0.64 0.63 0.59
0.98 1.0 0.78 0.8 0.31 0.26 0.65 0.69 0.71 0.64
0.82 0.77 1.0 0.72 0.17 0.14 0.67 0.67 0.67 0.75
1.0 0.98 0.71 0.88 0.25 0.24 0.74 0.67 0.64 0.79
0.93 0.94 0.67 1.0 0.13 0.1 0.72 0.7 0.72 0.69
0.99 1.0 0.79 0.78 0.28 0.26 0.56 0.6 0.63 0.73
1.0 0.93 0.98 0.9 0.32 0.3 0.63 0.69 0.67 0.79
0.81 0.89 0.91 1.0 0.31 0.23 0.8 0.83 0.83 0.94
1.0 0.99 0.69 0.93 0.2 0.17 0.63 0.6 0.69 0.69
1.0 0.99 0.88 0.86 0.38 0.33 0.77 0.73 0.84 0.93
1.0 0.94 0.65 0.8 0.26 0.21 0.57 0.61 0.63 0.74
1.0 0.93 0.89 0.84 0.36 0.34 0.67 0.64 0.69 0.72
0.98 1.0 0.88 0.96 0.33 0.3 0.85 0.89 0.78 0.84
0.98 1.0 0.82 0.88 0.17 0.15 0.64 0.56 0.64 0.64
0.87 0.95 0.78 1.0 0.62 0.5 0.67 0.78 0.81 0.98
0.96 0.97 0.72 1.0 0.09 0.08 0.49 0.48 0.46 0.63
1.0 0.99 0.82 0.98 0.29 0.25 0.76 0.75 0.78 0.86
1.0 0.91 0.74 0.94 0.27 0.18 0.63 0.63 0.61 0.65
1.0 0.94 0.89 0.85 0.26 0.24 0.7 0.69 0.68 0.93
0.73 0.77 0.64 1.0 0.12 0.1 0.45 0.54 0.58 0.72
0.95 1.0 0.6 0.69 0.1 0.1 0.53 0.54 0.63 0.69
1.0 0.88 0.75 0.96 0.36 0.26 0.56 0.6 0.59 0.71
0.78 1.0 0.99 0.59 0.3 0.17 0.51 0.6 0.35 0.94
0.83 0.9 0.55 1.0 0.12 0.1 0.55 0.55 0.5 0.59
0.89 0.95 0.9 1.0 0.34 0.26 0.57 0.66 0.71 0.82
1.0 0.99 0.57 0.92 0.31 0.29 0.72 0.57 0.57 0.8
0.89 1.0 0.82 0.58 0.24 0.28 0.56 0.58 0.64 0.68
0.78 1.0 0.53 0.56 0.13 0.12 0.51 0.59 0.64 0.77
0.96 0.97 0.55 1.0 0.18 0.15 0.66 0.55 0.55 0.67
1.0 0.97 0.74 0.68 0.26 0.26 0.64 0.75 0.72 0.74
0.95 1.0 0.72 0.72 0.38 0.35 0.63 0.67 0.72 0.77
0.83 0.83 0.79 1.0 0.3 0.24 0.83 0.73 0.79 0.83
0.98 1.0 0.69 0.89 0.19 0.18 0.6 0.7 0.76 0.77
1.0 0.91 0.99 0.87 0.44 0.43 0.78 0.86 0.86 0.91
0.97 1.0 0.91 1.0 0.26 0.24 0.63 0.63 0.61 0.72
0.83 0.84 0.8 1.0 0.33 0.25 0.79 0.69 0.84 0.94
0.99 0.94 0.75 1.0 0.36 0.29 0.83 0.73 0.78 0.8
0.87 0.89 0.95 1.0 0.32 0.26 0.84 0.74 0.78 0.9
1.0 1.0 0.86 0.88 0.33 0.33 0.65 0.7 0.65 0.71
1.0 0.96 0.6 0.83 0.25 0.2 0.56 0.62 0.61 0.63
1.0 0.9 0.99 0.86 0.65 0.55 0.81 0.72 0.83 0.9
0.93 1.0 0.68 0.67 0.3 0.31 0.63 0.72 0.72 0.82
0.92 1.0 0.7 0.53 0.33 0.31 0.63 0.69 0.76 0.72
1.0 0.92 0.89 0.81 0.42 0.37 0.72 0.79 0.8 0.81
0.88 0.91 0.72 1.0 0.38 0.31 0.66 0.74 0.65 0.81
1.0 0.96 0.68 0.66 0.37 0.27 0.57 0.73 0.63 0.83
0.94 0.96 0.92 1.0 0.29 0.28 0.79 0.86 0.94 0.92
0.89 1.0 0.9 0.75 0.21 0.21 0.42 0.5 0.52 0.91
1.0 0.97 0.82 0.73 0.28 0.26 0.54 0.69 0.74 0.65
0.98 1.0 0.97 0.92 0.42 0.41 0.68 0.7 0.67 0.82
0.95 1.0 0.73 0.99 0.22 0.18 0.69 0.69 0.75 0.76
0.99 0.97 0.7 1.0 0.22 0.18 0.6 0.57 0.63 0.75
1.0 0.89 0.79 0.68 0.3 0.23 0.6 0.55 0.57 0.72
1.0 0.94 0.82 0.99 0.32 0.27 0.59 0.62 0.57 0.69
0.86 0.92 0.87 1.0 0.15 0.12 0.59 0.59 0.68 0.74
1.0 1.0 0.85 0.85 0.27 0.29 0.47 0.58 0.56 0.87

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)