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Heatmap: Cluster_128 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.21 0.08 0.66 0.85 -0.66 -0.58 0.15 -0.4 -0.68 -0.69
1.38 1.3 -1.45 0.41 -2.01 -2.99 -0.56 -0.77 -0.36 -0.29
0.61 0.82 0.33 0.68 -1.45 -1.77 -0.83 -0.54 -0.13 0.03
0.82 0.72 0.35 0.45 -1.04 -1.01 -0.13 -0.51 -0.46 -0.66
0.17 0.1 -0.0 0.29 0.0 -0.1 0.08 0.01 -0.18 -0.5
0.86 1.13 0.88 0.19 -1.1 -0.9 -0.88 -1.18 -0.99 -0.96
0.5 0.5 0.21 0.3 -0.51 -0.38 -0.4 -0.22 -0.23 -0.24
0.58 0.55 -0.16 0.11 -0.24 -0.7 -0.02 -0.12 -0.22 -0.26
0.67 0.74 0.34 0.07 -0.24 -0.32 -0.48 -0.61 -0.6 -0.43
0.32 0.32 0.36 0.45 -0.76 -1.03 0.05 0.01 -0.26 -0.14
0.46 0.47 0.19 0.31 -0.19 -0.38 -0.05 -0.46 -0.39 -0.39
0.39 0.49 0.55 0.58 -1.15 -1.11 -0.36 -0.1 -0.31 -0.17
0.56 0.81 0.1 0.13 -0.51 -0.48 -0.22 -0.55 -0.1 -0.49
1.02 0.79 0.46 0.56 -1.61 -1.92 -0.8 -0.51 -0.55 -0.26
0.54 0.48 0.01 0.25 -0.11 -0.41 -0.44 -0.28 -0.28 -0.17
0.65 0.72 0.18 0.73 -0.65 -1.72 -0.74 -0.17 -0.09 -0.68
0.4 0.17 0.1 0.59 -0.98 -1.21 0.58 -0.15 -0.19 -0.37
0.77 0.88 0.33 0.38 -0.49 -0.7 -0.71 -0.79 -0.43 -0.65
1.04 0.78 0.19 0.14 -0.84 -1.16 -0.58 -0.53 -0.42 -0.2
0.58 1.0 0.13 1.53 -3.1 -3.49 -0.77 -0.99 -1.01 -0.43
0.16 0.56 0.09 1.21 -0.02 -1.44 -0.98 -0.63 -0.43 -0.34
0.48 0.45 0.62 0.62 -0.74 -1.2 -0.22 -0.6 -0.43 -0.2
0.22 0.36 0.34 0.53 -0.71 -0.43 -0.24 -0.24 -0.1 -0.22
1.75 - - 2.73 - - - - - -
1.17 0.87 0.21 0.46 -0.75 -1.0 -0.61 -0.91 -1.17 -0.57
0.9 0.71 0.32 0.55 -1.14 -1.44 -0.55 -0.56 -0.48 -0.18
0.37 1.04 0.31 1.2 -1.62 -3.41 -2.68 -0.13 -0.18 -0.42
0.34 0.53 0.54 0.53 -2.49 -1.31 -0.17 -0.75 0.08 0.36
0.61 0.6 0.34 0.86 -1.73 -2.43 -0.38 -0.12 -0.16 -0.31
0.95 0.89 0.41 0.24 -0.9 -1.0 -0.86 -0.67 -0.6 -0.27
0.68 0.66 0.56 0.92 -1.85 -2.4 0.16 -0.53 -0.64 -0.88
0.62 0.48 0.38 0.93 -1.79 -1.99 -0.21 -0.38 -0.26 -0.24
0.33 0.65 0.55 0.73 -1.54 -2.1 -1.09 -0.04 0.04 0.0
0.5 0.39 0.29 0.17 -0.24 -0.47 -0.09 -0.31 -0.2 -0.43
1.05 1.06 -0.61 0.93 -3.7 -4.08 0.22 -1.01 -0.27 -0.62
0.77 0.66 0.61 0.86 -1.92 -2.1 -0.31 -0.61 -0.62 -0.37
0.22 0.21 0.3 0.53 -0.17 -0.52 -0.08 -0.7 -0.06 -0.17
0.5 0.51 0.37 0.18 -0.52 -0.3 -0.23 -0.39 -0.4 -0.22
1.45 1.01 0.01 0.74 -2.98 - -0.84 -1.32 -0.89 -0.06
0.57 0.61 0.25 0.82 -1.53 -1.75 -0.3 -0.44 -0.21 -0.04
0.49 0.47 0.35 0.19 -0.41 -0.6 -0.15 -0.3 -0.25 -0.27
0.65 0.45 0.29 0.67 -1.64 -1.28 -0.35 -0.34 -0.1 0.01
0.52 0.49 0.38 0.61 -0.82 -0.88 -0.18 -0.59 -0.17 -0.34
0.84 0.94 0.54 0.27 -0.23 -1.6 -0.9 -0.74 -0.6 -0.63
0.71 0.86 -0.25 0.39 -1.08 -0.76 0.01 -0.18 -0.21 -0.79
0.43 0.32 0.83 0.76 -0.82 -1.36 0.23 -0.8 -0.65 -0.76
0.5 0.43 0.9 1.06 -1.87 -2.53 -0.33 -0.42 -0.72 -0.52
0.58 0.62 0.87 0.18 -1.38 -0.77 -0.22 -0.43 -0.47 -0.48
1.03 0.67 0.38 1.43 -3.14 -4.54 -1.32 -1.59 -0.49 -0.36
0.27 0.62 -0.3 0.56 -0.47 -0.77 0.18 -0.22 -0.07 -0.48
0.39 0.37 0.16 0.71 -0.72 -1.02 -0.18 -0.25 -0.31 0.0
1.03 0.86 -0.18 0.63 -1.12 -1.86 -0.5 -0.49 -0.4 -0.31
0.79 0.84 -0.09 0.87 -1.83 -2.11 -0.27 -0.44 -0.43 -0.18
0.1 0.3 0.17 0.54 -0.4 -0.28 -0.0 -0.39 -0.01 -0.37
0.66 0.52 0.17 0.58 -1.04 -1.17 -0.13 -0.14 -0.25 -0.35
0.77 0.64 0.6 0.91 -1.59 -1.53 -0.28 -0.67 -1.05 -0.48
0.37 0.39 0.28 0.47 -0.77 -0.87 -0.2 -0.21 -0.05 -0.06
0.84 1.08 -0.97 1.03 -1.39 -1.76 -0.56 -0.6 -0.49 -0.32
0.76 0.83 -0.17 0.84 -1.88 -2.28 -0.44 -0.33 -0.2 -0.06
0.4 0.19 0.33 0.73 -0.91 -1.08 0.45 -0.39 -0.45 -0.41
0.81 0.59 0.54 0.36 -1.34 -1.03 -0.55 -0.22 -0.21 -0.47
0.4 0.36 0.28 0.62 -0.56 -0.75 -0.32 -0.27 -0.06 -0.35
0.99 1.47 0.96 1.08 - - - - 0.26 -
0.7 0.88 -0.0 0.6 -1.15 -1.19 -0.12 -0.38 -0.16 -0.87
0.43 0.49 0.79 0.71 -2.03 -2.35 -0.18 -0.28 -0.38 -0.04
0.76 1.11 0.2 0.41 -3.65 -1.27 0.25 -1.21 -0.37 -0.37
0.41 0.6 0.16 0.74 -0.99 -1.06 -0.26 -0.18 -0.11 -0.4
0.26 0.21 0.06 0.37 -0.11 -0.82 -0.23 0.07 -0.11 -0.01
0.65 0.51 0.33 0.4 -0.6 -0.91 -0.4 -0.52 -0.32 -0.05
0.76 0.8 0.12 0.96 -3.64 -2.93 0.33 -0.37 -0.49 -0.77
0.49 0.32 0.1 0.34 -0.5 -0.92 0.16 -0.19 -0.1 -0.23
0.8 0.69 0.23 0.6 -1.1 -1.32 -0.5 -0.4 -0.29 -0.3
0.39 0.47 0.2 0.58 -0.88 -0.74 0.08 -0.35 -0.19 -0.31
0.84 0.79 -0.39 0.64 -0.83 -1.32 -0.12 -0.31 -0.43 -0.46
0.74 0.6 0.21 0.35 -0.46 -0.78 -0.48 -0.39 -0.41 -0.25
0.36 0.28 0.02 0.14 -0.23 -0.25 -0.07 -0.19 -0.2 -0.01
0.57 0.35 0.22 0.73 -0.57 -1.01 -0.45 -0.34 -0.34 -0.11
1.46 1.41 - 1.42 - -1.0 - 0.02 -2.13 -2.4
0.5 0.62 -0.2 0.84 -0.99 -1.04 -0.24 -0.37 -0.2 -0.14
0.27 0.37 -0.11 -0.0 -0.3 -0.66 0.12 -0.02 -0.03 0.11
0.61 0.8 0.27 0.88 -1.49 -1.77 -0.32 -0.46 -0.56 -0.26
0.34 0.28 0.46 0.45 -0.61 -0.97 0.18 -0.27 -0.29 -0.26
0.4 0.2 -0.26 0.52 -0.45 -0.9 0.09 -0.12 0.07 -0.05
0.84 0.95 0.84 0.53 -1.91 -2.63 -0.37 -1.28 -0.16 -0.9
0.86 0.9 0.52 0.4 -1.54 -1.54 -0.64 -0.28 -0.46 -0.55
0.8 0.86 -0.16 0.7 -1.9 -2.3 -0.2 -0.31 -0.27 -0.08
0.65 0.54 0.62 1.14 -1.55 -2.43 -0.2 -0.86 -0.88 -0.43
0.66 0.64 0.61 0.58 -1.48 -1.59 -0.27 -0.28 -0.51 -0.33
0.63 0.52 0.04 0.18 -0.2 -0.47 -0.25 -0.36 -0.35 -0.22
0.3 0.23 0.38 0.49 -0.48 -0.65 -0.25 -0.23 -0.11 -0.12
0.78 0.68 -0.02 0.34 -0.86 -1.54 0.03 -0.31 -0.16 -0.3
0.7 0.78 0.3 0.53 -1.44 -1.74 -0.44 -0.39 -0.24 -0.03
0.46 0.36 -0.03 0.1 -0.33 -0.62 -0.02 -0.07 -0.1 -0.05
0.85 0.65 0.66 0.77 -1.47 -1.57 -0.67 -0.74 -0.73 -0.31
0.53 0.46 0.09 0.54 -0.85 -1.14 -0.03 -0.31 -0.22 0.02
0.53 0.58 -0.06 0.57 -1.12 -1.37 -0.0 -0.24 -0.03 -0.09
0.98 0.67 0.16 0.58 -1.14 -1.8 -0.63 -0.38 -0.32 -0.21
0.79 0.83 0.34 0.66 -1.75 -1.72 -0.76 -0.6 -0.19 -0.13
0.25 0.26 0.36 0.4 -0.43 -0.66 -0.05 -0.38 -0.23 0.07
0.86 0.83 0.39 0.56 -0.6 -1.22 -0.01 -1.28 -0.7 -0.99
0.78 0.62 0.52 0.49 -1.16 -1.11 -0.57 -0.5 -0.27 -0.34
0.37 0.41 -0.01 0.21 -0.36 -0.45 -0.12 -0.1 -0.17 -0.03
0.94 0.75 0.4 0.67 -1.6 -1.68 -0.95 -0.48 -0.58 -0.08
0.23 0.27 0.03 0.28 -0.48 -0.31 0.01 -0.13 -0.07 -0.03
1.26 1.16 -0.75 0.94 -3.03 -3.93 -0.38 -0.65 -0.86 -0.49
0.72 0.7 -0.24 0.19 -0.51 -0.34 -0.31 -0.23 -0.31 -0.36
0.69 0.72 0.49 0.26 -0.89 -1.48 0.0 -0.42 -0.57 -0.3
0.72 0.68 0.35 0.67 -1.47 -1.72 -0.38 -0.41 -0.45 -0.05
0.7 0.63 0.31 0.76 -1.0 -1.19 -0.45 -0.52 -0.64 -0.19
0.61 0.72 0.32 0.13 -0.71 -0.85 -0.0 -0.41 -0.3 -0.4
0.53 0.48 0.21 0.61 -0.55 -0.63 -0.18 -0.36 -0.43 -0.45
0.57 0.49 0.49 0.73 -1.24 -1.53 0.12 -0.42 -0.45 -0.5
0.64 0.63 0.42 0.35 -0.69 -1.08 -0.13 -0.45 -0.36 -0.4
0.54 1.05 -1.86 1.21 -0.49 -0.88 -0.12 -0.96 -0.36 -1.3
1.16 0.95 0.62 0.48 -0.81 -0.91 -0.69 -1.53 -1.38 -1.21
0.09 0.25 0.31 0.55 -0.35 -0.87 0.16 -0.41 -0.12 -0.12
0.47 0.53 -0.01 0.09 -0.23 -0.37 -0.1 -0.27 -0.12 -0.32
0.96 0.83 -0.2 0.49 -1.09 -1.66 -0.01 -0.59 -0.24 -0.48
0.81 0.78 0.14 0.84 -1.56 -1.51 -0.06 -0.36 -0.67 -0.79
0.75 0.8 0.03 0.38 -0.67 -1.0 -0.13 -0.42 -0.36 -0.52
1.06 0.98 0.46 0.55 -2.34 -2.06 -0.58 -0.63 -0.59 -0.55
0.76 0.61 0.29 0.38 -0.65 -0.66 -0.59 -0.48 -0.37 -0.27
0.6 0.56 -0.16 0.76 -0.7 -0.87 -0.06 -0.32 -0.34 -0.49
0.36 0.3 0.26 0.52 -0.5 -0.82 -0.33 -0.31 -0.17 0.12
0.75 0.75 0.74 0.15 -1.72 -1.97 0.07 -0.35 -0.46 -0.44
0.28 0.45 0.53 0.73 -0.82 -0.93 0.05 -0.47 -0.5 -0.39
0.55 0.55 0.41 0.53 -0.73 -1.06 -0.37 -0.56 -0.27 -0.1
0.43 0.41 0.17 0.34 -0.6 -0.71 -0.04 -0.23 -0.08 -0.14
0.75 0.7 0.05 0.58 -0.91 -1.04 -0.57 -0.54 -0.27 -0.07
0.62 0.61 0.66 0.6 -0.99 -1.38 -0.27 -0.71 -0.43 -0.36
0.29 0.3 -0.02 0.23 -0.15 -0.06 0.0 -0.22 -0.18 -0.36
1.22 1.13 -0.16 0.32 -1.17 -1.55 -0.68 -0.94 -0.38 -0.64
0.88 1.02 0.89 0.03 -1.67 -1.83 -0.32 -0.51 -0.79 -0.79
0.71 0.85 -0.4 0.5 -1.1 -1.65 0.22 -0.11 -0.01 -0.92
0.46 0.59 0.32 0.54 -0.89 -1.39 -0.2 -0.21 -0.3 -0.08
0.63 0.65 0.67 0.57 -1.14 -1.26 -0.01 -0.88 -0.66 -0.38
0.31 0.34 0.48 0.46 -0.84 -1.25 0.12 -0.11 -0.41 -0.03
0.4 0.44 -0.56 0.59 -0.25 -0.57 0.08 -0.25 0.02 -0.48
0.65 0.51 0.18 0.22 -0.41 -0.49 0.02 -0.49 -0.37 -0.42
0.43 0.36 0.47 0.51 -0.53 -0.84 -0.58 -0.28 -0.18 -0.09
0.58 0.38 -0.35 0.68 -0.48 -0.95 -0.05 -0.22 -0.22 -0.13
0.46 0.4 0.05 0.64 -0.65 -0.58 -0.03 -0.33 -0.27 -0.33
0.84 0.67 0.47 0.7 -0.92 -1.86 -0.39 -0.76 -0.65 -0.27
1.26 1.44 -0.09 0.51 -2.39 -1.59 -0.52 -1.48 -0.97 -1.18
0.38 0.49 0.49 0.48 -0.93 -1.21 -0.39 0.02 -0.37 -0.02
1.36 1.27 0.15 0.76 -1.73 -2.36 -1.94 -0.8 -1.02 -1.29
0.55 0.34 0.41 0.49 -0.77 -1.02 -0.85 -0.12 -0.2 0.15
0.53 0.58 0.05 0.81 -1.61 -1.38 -0.01 -0.39 -0.32 -0.01
0.91 1.07 0.44 0.12 -0.98 -0.59 -0.85 -0.71 -0.6 -0.77
0.66 0.76 0.36 0.45 -1.6 -1.93 -0.28 -0.23 -0.09 -0.2
0.35 0.68 0.59 0.36 -1.57 -1.33 -0.09 -0.13 -0.24 -0.17
1.05 1.19 -0.08 0.65 -3.39 -2.97 -0.09 -1.11 -0.62 -0.22
1.04 1.21 -0.03 0.83 -3.07 -2.69 -0.45 -0.9 -0.49 -0.68
0.6 0.93 0.09 0.64 -0.9 -1.71 0.1 -0.74 -0.29 -0.67
0.56 0.43 0.07 0.48 -0.51 -0.59 -0.17 -0.27 -0.2 -0.36
0.08 0.3 0.23 0.48 -0.38 -0.17 -0.35 -0.16 -0.14 -0.13
0.74 0.64 0.61 0.33 -1.21 -0.88 -0.21 -0.66 -0.5 -0.31
1.63 1.51 0.15 0.47 -2.86 -4.85 -0.17 -2.91 - -1.41
0.56 0.56 0.51 0.45 -0.98 -1.04 -0.4 -0.35 -0.37 -0.07
0.5 0.58 0.13 0.54 -1.17 -1.1 0.09 -0.26 -0.27 -0.15
0.76 0.78 0.26 0.39 -0.77 -0.84 -0.56 -0.38 -0.31 -0.52
1.76 1.33 -0.61 1.19 - - - -0.24 - -1.65
2.4 2.24 - - - - - - - -
0.58 0.81 0.23 0.79 -2.56 -2.04 -0.34 -0.03 -0.26 -0.26
1.14 1.34 0.59 0.45 -4.32 -3.7 -0.85 -1.45 -0.95 -0.28
0.39 0.5 0.42 0.82 -1.19 -0.94 -0.16 -0.47 -0.35 -0.3
0.74 0.91 -0.21 0.83 -1.06 -1.76 -0.31 -0.51 -0.37 -0.39
0.99 0.91 0.89 0.14 -1.61 -1.96 -0.2 -0.6 -1.03 -0.77
0.46 0.44 0.4 0.46 -0.73 -1.16 -0.01 -0.21 -0.3 -0.24
0.76 0.74 0.11 0.56 -1.52 -1.99 -0.19 -0.25 -0.29 -0.08
0.67 0.48 0.38 0.38 -0.44 -0.64 -0.1 -0.45 -0.47 -0.62
0.95 0.94 -0.81 0.91 -2.71 -2.95 -0.17 -0.37 -0.25 -0.12
0.9 0.95 0.18 0.34 -1.16 -0.81 -0.76 -0.47 -0.34 -0.56
0.78 0.54 0.32 0.17 -0.43 -0.81 -0.3 -0.3 -0.45 -0.34
0.35 0.7 0.45 0.86 -2.07 -1.63 0.08 -0.15 -0.55 -0.5
0.89 1.13 0.83 0.52 -1.26 -1.09 -1.3 -1.37 -0.98 -0.83
0.29 0.26 0.17 0.3 -0.41 -0.71 0.14 -0.05 -0.07 -0.26
0.53 0.47 0.17 0.54 -0.45 -0.73 0.11 -0.38 -0.49 -0.53
0.57 0.76 0.53 0.62 -2.96 -1.89 0.22 -0.61 -0.05 -0.63
0.39 0.28 0.13 0.43 -0.53 -0.86 0.09 -0.17 -0.11 -0.14
0.81 0.75 0.11 0.34 -0.85 -1.33 -0.35 -0.63 -0.32 0.05
0.96 0.95 0.97 0.05 -1.36 -1.06 -0.67 -0.77 -0.94 -0.94
0.55 0.56 -0.02 0.56 -0.73 -1.07 -0.0 -0.22 -0.12 -0.42
0.81 0.87 0.27 0.63 -1.69 -2.16 -0.45 -0.42 -0.35 -0.19
0.26 0.2 0.17 0.31 -0.33 -0.44 -0.05 -0.0 -0.06 -0.26
0.61 0.65 0.53 0.16 -0.58 -0.44 -0.55 -0.42 -0.41 -0.41
0.64 0.52 0.2 0.76 -1.41 -1.53 -0.16 -0.29 -0.22 -0.21
1.49 1.33 -0.57 0.56 - - -1.42 -0.25 -1.29 -0.15
0.16 0.33 0.06 0.4 -0.8 -0.47 -0.11 -0.07 0.03 0.09
0.94 0.87 0.09 0.13 -0.74 -1.04 -0.5 -0.56 -0.28 -0.32
0.75 0.74 -0.35 0.22 -0.59 -0.85 -0.24 -0.33 -0.24 -0.01
0.49 0.58 0.39 0.83 -0.7 -1.1 -0.25 -0.59 -0.51 -0.47
0.33 0.46 0.2 0.3 -0.83 -0.91 0.06 0.04 0.01 -0.27
1.11 1.32 0.38 -0.14 -1.4 -1.25 -0.52 -0.7 -0.64 -1.35
1.41 1.54 -0.31 -0.15 - -1.22 - -0.2 0.03 -1.32
0.57 0.52 0.43 0.45 -0.61 -1.03 -0.19 -0.43 -0.38 -0.25
0.46 0.35 -0.34 0.54 -0.32 -0.35 -0.12 -0.18 -0.23 -0.23
0.59 0.59 0.47 0.77 -1.37 -1.79 -0.29 -0.4 -0.16 -0.42
1.03 1.25 0.42 0.33 -1.39 -1.08 -1.0 -0.83 -0.93 -0.87
0.44 0.31 0.08 0.13 -0.37 -0.48 0.07 -0.02 -0.08 -0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.