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Heatmap: Cluster_122 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
-3.46 -3.61 0.26 0.12 0.49 0.8 0.25 0.39 0.17 -0.36
-2.03 -2.1 0.44 0.2 0.46 0.93 -0.43 0.03 -0.02 -0.04
-2.76 -3.05 0.28 0.71 1.47 0.93 -1.42 -0.72 -0.66 -0.76
-1.89 -1.92 0.31 -0.31 0.85 0.93 -0.44 -0.06 0.01 0.02
-1.27 -1.13 0.57 0.02 0.46 0.48 0.09 0.09 -0.14 -0.29
-1.28 -1.17 0.68 0.03 0.36 0.48 -0.12 0.23 -0.2 -0.19
-1.1 -1.05 0.45 -0.32 0.36 0.94 -0.26 0.06 -0.05 -0.25
-3.28 -3.14 0.84 -0.31 0.93 1.03 -0.18 -0.28 -0.45 -0.33
-1.3 -1.28 0.74 -0.4 0.56 0.95 -0.29 -0.15 -0.24 -0.37
-1.5 -1.39 0.18 0.21 0.7 0.72 -0.11 -0.21 -0.14 -0.0
-3.03 - 1.16 -2.25 0.74 1.31 -1.1 0.64 -0.71 -0.67
-0.83 -1.02 0.32 -0.2 0.4 0.59 -0.01 0.2 -0.15 -0.07
-2.73 -2.69 0.45 -0.29 0.79 0.86 -0.04 0.02 0.01 -0.05
-1.39 -1.36 0.57 0.15 0.66 0.66 -0.02 -0.29 -0.27 -0.24
-1.2 -1.33 0.49 0.25 0.42 0.66 -0.19 -0.1 -0.16 -0.08
-0.59 -0.57 0.33 0.09 0.36 0.61 -0.5 -0.15 -0.19 0.07
-2.86 -2.8 0.54 0.05 0.88 0.9 -0.1 0.17 -0.34 -0.56
-1.25 -1.05 0.7 -0.35 0.05 0.95 -0.38 0.14 0.13 -0.38
-0.7 -0.77 0.34 0.11 0.29 0.64 0.05 -0.25 0.02 -0.36
-3.04 -2.95 0.56 -0.04 0.52 1.36 -0.1 -0.18 -0.47 -0.37
-1.85 -1.6 0.9 -0.33 0.37 0.9 -0.42 -0.02 0.01 -0.27
- - 0.46 -1.29 1.1 1.26 0.22 0.15 -0.08 -1.13
-4.62 -3.59 0.43 0.67 0.56 0.61 0.13 0.22 0.01 -0.58
-7.28 -7.44 1.04 -0.59 -0.22 1.15 0.1 0.34 0.18 -0.48
-1.18 -1.09 0.5 -0.14 0.42 0.45 0.17 0.09 0.02 -0.22
-1.68 -1.64 0.56 -0.35 0.46 0.58 0.19 0.24 0.12 -0.27
-2.96 -3.06 0.31 0.27 0.77 0.83 -0.02 0.06 -0.07 -0.26
-2.99 -3.12 0.43 0.04 0.91 1.16 -0.48 -0.17 -0.43 -0.13
-8.57 -9.9 -0.26 -0.08 1.48 1.46 -0.34 -0.36 -0.84 -0.89
-3.65 -3.73 -0.04 0.1 1.3 1.27 -0.39 -0.23 -0.46 -0.76
-1.24 -1.49 0.72 -0.29 0.5 0.66 -0.06 0.12 -0.36 -0.09
-2.33 -2.35 0.52 -0.03 0.79 0.94 -0.17 -0.11 -0.25 -0.15
-1.41 -1.27 0.29 0.11 0.41 0.72 0.17 -0.07 -0.07 -0.14
-2.16 -2.1 0.06 0.09 0.71 0.89 0.16 0.03 0.05 -0.36
-2.57 -2.59 0.72 -0.05 0.88 0.72 -0.43 -0.18 -0.12 0.04
-1.45 -1.6 0.54 0.0 0.53 0.73 -0.23 0.11 -0.13 -0.16
-1.41 -1.35 0.33 0.04 0.43 0.9 0.23 0.02 -0.29 -0.45
-6.57 -6.51 0.78 -0.34 0.91 1.36 -0.86 0.06 -0.48 -0.46
-4.15 -5.54 0.99 0.2 0.68 0.72 -0.38 0.16 -0.11 -0.45
-2.5 -2.45 0.62 0.25 0.77 0.87 -0.58 -0.06 -0.3 -0.09
-1.39 -1.42 0.33 0.11 0.58 0.78 -0.36 -0.02 -0.23 0.12
-1.28 -1.43 0.46 0.08 0.29 0.39 0.06 0.25 0.22 -0.23
-0.93 -1.07 0.46 0.27 0.79 0.69 -0.57 -0.25 -0.41 -0.28
-1.04 -0.98 0.31 0.22 0.32 0.24 0.07 0.21 -0.0 -0.05
-1.37 -1.26 0.44 0.58 0.6 0.64 -0.24 -0.43 -0.4 -0.11
-0.97 -1.05 0.25 0.27 0.47 0.54 -0.21 -0.05 -0.02 -0.07
-1.26 -1.31 0.5 0.12 0.59 0.56 -0.27 -0.1 -0.12 0.03
-1.94 -1.98 0.62 -0.04 0.46 0.84 -0.25 0.05 -0.11 0.01
-1.69 -1.57 0.03 0.32 0.84 0.98 -0.26 -0.16 -0.22 -0.43
-0.51 -0.35 0.2 -0.04 0.21 0.25 -0.03 0.1 0.08 -0.1
-1.74 -1.86 0.76 0.06 0.49 0.79 -0.44 -0.05 -0.2 -0.02
-1.85 -1.71 0.33 -0.07 0.87 0.85 -0.29 -0.13 -0.13 -0.1
-5.66 -5.58 0.51 -0.04 0.74 0.76 0.13 0.5 0.1 -0.68
-1.93 -1.91 0.27 0.28 0.48 0.57 0.31 -0.08 0.25 -0.32
-3.1 -3.34 -0.05 0.1 1.56 0.94 -0.41 -0.21 -0.3 -1.18
-2.13 -1.86 0.21 0.3 0.74 0.92 -0.5 0.04 -0.23 -0.08
-1.12 -1.13 0.39 0.36 0.41 0.59 -0.03 -0.06 -0.14 -0.31
- - - 1.68 1.59 1.57 -0.31 - - -
-2.04 -1.99 0.44 0.39 0.87 0.82 -0.13 -0.29 -0.37 -0.42
-4.09 -3.9 0.96 0.31 0.97 0.57 -0.61 -0.22 -0.25 -0.16
-6.74 -6.54 0.85 0.07 0.46 1.03 -0.31 0.35 -0.39 -0.22
-2.29 -2.18 0.77 0.41 0.74 0.64 -0.29 -0.25 -0.38 -0.17
-1.54 -1.49 0.17 -0.16 0.67 0.8 -0.07 0.01 -0.05 0.03
-3.5 -3.33 0.69 0.32 0.81 1.15 -0.88 -0.47 -0.7 0.14
-2.53 -2.51 0.5 0.58 0.48 0.73 0.09 -0.03 -0.19 -0.38
-4.75 -4.91 0.57 -0.69 0.84 1.33 -0.26 0.23 -0.31 -0.51
-3.79 -4.57 0.64 -0.11 1.06 0.91 -0.86 0.03 0.14 -0.38
-1.13 -1.55 0.49 -0.59 0.5 0.9 0.37 0.21 -0.28 -0.8
-2.71 -2.75 0.04 0.04 0.93 1.07 -0.41 -0.02 -0.27 0.09
-0.24 -2.58 0.2 0.65 1.34 1.19 - -1.59 -1.28 -0.53
-1.31 -1.2 0.39 0.2 0.78 0.8 -0.62 -0.18 -0.19 -0.25
-1.04 -1.06 0.57 -0.02 0.25 0.46 -0.01 0.07 -0.15 0.07
-6.64 -7.06 1.15 -0.37 0.43 1.17 -0.93 -0.15 -0.34 0.23
-4.93 -5.1 0.65 0.47 0.32 0.82 -0.14 0.33 0.1 -0.46
-2.04 -1.94 0.44 0.02 0.7 1.04 -0.11 -0.24 -0.2 -0.33
-1.64 -1.65 0.51 0.34 0.75 1.01 -0.23 -0.45 -0.47 -0.58
-1.75 -1.69 0.65 -0.08 0.51 0.64 -0.13 0.01 -0.04 -0.01
-1.92 -1.73 0.48 0.23 0.64 0.74 -0.33 -0.11 -0.14 0.01
-1.05 -0.86 0.28 0.11 0.46 0.54 0.09 0.02 -0.02 -0.35
-3.06 -3.04 0.8 0.25 0.75 0.87 -0.69 -0.2 -0.3 0.02
-1.01 -0.95 0.44 0.12 0.29 0.48 0.06 -0.06 0.1 -0.24
-1.19 -1.23 0.66 0.02 0.59 0.83 -0.76 -0.17 -0.32 -0.03
-0.81 -0.67 0.38 -0.11 0.27 0.77 -0.21 0.04 -0.16 -0.18
-3.15 -3.08 0.55 0.45 0.95 1.28 -1.13 -0.52 -0.94 -0.14
-2.01 -1.94 0.4 0.16 0.9 1.03 -0.48 -0.33 -0.2 -0.39
-1.0 -0.82 0.5 0.05 -0.09 0.41 -0.01 0.2 0.1 0.0
-0.83 -0.74 0.14 0.1 0.27 0.5 -0.05 0.08 -0.02 0.06
-1.4 -1.14 0.22 -0.12 0.47 0.8 -0.07 0.03 0.05 -0.09
-0.69 -0.56 0.15 0.31 0.36 0.33 -0.24 0.05 -0.16 0.05
-2.57 -2.7 0.21 -0.64 0.74 1.3 -0.3 -0.09 0.09 -0.09
-0.93 -1.12 0.38 -0.63 0.65 0.61 0.12 0.11 -0.06 -0.23
-2.34 -2.29 0.49 0.26 0.69 0.91 -0.57 -0.03 -0.32 0.08
-2.37 -2.51 0.46 -0.31 0.94 0.59 -0.22 0.31 -0.13 0.02
-2.24 -2.04 0.54 -0.15 0.63 0.67 -0.36 0.17 0.2 -0.01
-1.87 -1.81 0.21 0.15 0.82 0.88 0.05 0.0 -0.25 -0.55
-1.65 -1.73 0.23 0.72 0.77 0.83 -0.29 -0.39 -0.45 -0.37
-1.09 -1.01 0.32 0.38 0.54 0.65 -0.43 -0.06 -0.13 -0.24
-0.83 -0.83 0.25 0.18 0.34 0.34 0.11 0.01 0.15 -0.28
-5.29 -6.46 0.62 0.62 0.83 1.21 -1.14 0.22 -0.3 -1.47
-1.93 -2.02 0.41 0.15 0.87 0.72 -0.08 -0.07 -0.11 -0.41
-3.6 -3.55 0.93 0.22 0.43 0.84 -0.17 0.14 -0.43 -0.15
-2.49 -2.27 0.77 -0.07 0.67 1.18 -0.32 -0.13 -0.37 -0.68
- -8.5 0.72 -0.21 0.54 1.09 -0.58 0.31 0.14 -0.17
-1.67 -1.61 0.62 -0.36 0.39 0.73 0.25 0.05 0.09 -0.34
-2.03 -1.92 0.65 0.1 0.42 0.76 -0.19 0.06 0.16 -0.35
-1.89 -1.91 0.64 0.65 0.74 0.64 0.11 -0.5 -0.31 -0.97
-2.69 -2.48 0.92 -1.1 0.41 1.53 -1.21 0.48 -0.71 -0.59
- -7.23 0.77 0.27 1.03 0.97 -1.11 -0.28 -0.48 0.1
-1.39 -1.48 0.34 0.19 0.61 0.74 -0.19 -0.19 -0.19 0.05
-0.98 -0.95 0.56 0.15 0.22 0.47 0.12 -0.14 -0.05 -0.17
-1.66 -1.56 0.43 -0.25 0.44 0.88 0.18 0.27 0.01 -0.71
-1.7 -1.79 0.26 0.13 0.68 0.73 0.04 -0.05 -0.09 -0.13
-1.74 -1.45 0.37 0.45 0.49 0.98 -0.14 -0.4 -0.15 -0.44
-2.44 -2.02 0.31 0.63 0.52 0.94 -0.3 -0.32 -0.21 -0.07
- - 0.25 -0.5 1.44 1.53 -2.74 -0.14 -0.31 -0.67
-2.02 -1.95 0.49 -0.06 0.84 0.98 -0.32 -0.23 -0.17 -0.27
-1.86 -1.8 0.62 -0.68 0.85 1.04 -0.51 -0.3 0.08 -0.24
-2.64 -2.86 0.71 -0.02 0.73 0.88 -0.19 -0.02 -0.04 -0.43
-3.05 -3.23 0.53 -0.37 0.82 1.02 -0.61 0.22 -0.53 0.33
- - 0.8 0.13 1.06 1.04 0.03 0.16 -0.67 -1.93
-3.18 -4.21 1.07 -0.02 0.88 0.96 0.25 -0.79 -0.34 -1.31
-1.09 -1.15 0.11 -0.25 0.58 0.69 -0.09 0.27 -0.01 -0.16
-2.01 -2.08 0.21 0.26 0.72 1.0 -0.55 -0.07 -0.26 0.06
-1.53 -1.57 0.34 0.54 0.6 0.65 -0.01 -0.31 -0.22 -0.25
-1.19 -1.05 0.45 0.27 0.51 0.57 -0.1 0.04 -0.25 -0.32
-0.84 -0.91 0.21 -0.05 0.57 0.73 -0.2 -0.16 -0.16 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.