1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_122 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.05 0.05 0.69 0.62 0.81 1.0 0.68 0.75 0.65 0.45
0.13 0.12 0.71 0.6 0.72 1.0 0.39 0.53 0.52 0.51
0.05 0.04 0.44 0.59 1.0 0.69 0.14 0.22 0.23 0.21
0.14 0.14 0.65 0.42 0.95 1.0 0.39 0.5 0.53 0.53
0.28 0.31 1.0 0.68 0.93 0.94 0.72 0.72 0.61 0.55
0.26 0.28 1.0 0.64 0.8 0.87 0.58 0.73 0.54 0.55
0.24 0.25 0.71 0.42 0.67 1.0 0.43 0.54 0.5 0.44
0.05 0.06 0.87 0.39 0.93 1.0 0.43 0.4 0.36 0.39
0.21 0.21 0.87 0.39 0.76 1.0 0.42 0.47 0.44 0.4
0.21 0.23 0.69 0.7 0.99 1.0 0.56 0.52 0.55 0.61
0.05 0.0 0.9 0.08 0.67 1.0 0.19 0.63 0.25 0.25
0.38 0.33 0.83 0.58 0.88 1.0 0.66 0.77 0.6 0.63
0.08 0.09 0.75 0.45 0.95 1.0 0.54 0.56 0.55 0.53
0.24 0.25 0.94 0.7 1.0 1.0 0.62 0.52 0.52 0.53
0.27 0.25 0.89 0.75 0.85 1.0 0.55 0.59 0.57 0.6
0.44 0.44 0.83 0.7 0.84 1.0 0.46 0.59 0.57 0.69
0.07 0.08 0.78 0.56 0.99 1.0 0.5 0.6 0.42 0.36
0.22 0.25 0.84 0.4 0.54 1.0 0.4 0.57 0.57 0.4
0.4 0.38 0.81 0.7 0.79 1.0 0.67 0.54 0.65 0.5
0.05 0.05 0.57 0.38 0.56 1.0 0.36 0.34 0.28 0.3
0.15 0.18 0.99 0.43 0.69 1.0 0.4 0.53 0.54 0.44
0.0 0.0 0.57 0.17 0.89 1.0 0.49 0.46 0.4 0.19
0.03 0.05 0.84 1.0 0.93 0.96 0.69 0.73 0.63 0.42
0.0 0.0 0.92 0.3 0.39 1.0 0.48 0.57 0.51 0.32
0.31 0.33 1.0 0.64 0.94 0.97 0.79 0.75 0.72 0.61
0.21 0.21 0.98 0.52 0.92 1.0 0.76 0.79 0.73 0.55
0.07 0.07 0.7 0.68 0.96 1.0 0.55 0.59 0.54 0.47
0.06 0.05 0.6 0.46 0.84 1.0 0.32 0.4 0.33 0.41
0.0 0.0 0.3 0.34 1.0 0.99 0.28 0.28 0.2 0.19
0.03 0.03 0.4 0.44 1.0 0.98 0.31 0.35 0.3 0.24
0.26 0.22 1.0 0.5 0.86 0.96 0.58 0.66 0.47 0.57
0.1 0.1 0.75 0.51 0.9 1.0 0.46 0.48 0.44 0.47
0.23 0.25 0.74 0.65 0.81 1.0 0.68 0.58 0.58 0.55
0.12 0.13 0.56 0.57 0.88 1.0 0.6 0.55 0.56 0.42
0.09 0.09 0.9 0.52 1.0 0.89 0.4 0.48 0.5 0.56
0.22 0.2 0.87 0.6 0.87 1.0 0.51 0.65 0.55 0.54
0.2 0.21 0.68 0.55 0.72 1.0 0.63 0.54 0.44 0.39
0.0 0.0 0.67 0.31 0.73 1.0 0.21 0.4 0.28 0.28
0.03 0.01 1.0 0.58 0.81 0.83 0.39 0.56 0.47 0.37
0.1 0.1 0.84 0.65 0.93 1.0 0.36 0.52 0.44 0.51
0.22 0.22 0.73 0.63 0.87 1.0 0.46 0.58 0.5 0.64
0.3 0.27 1.0 0.77 0.89 0.95 0.75 0.86 0.85 0.62
0.3 0.28 0.8 0.7 1.0 0.93 0.39 0.49 0.44 0.48
0.39 0.41 1.0 0.94 1.0 0.95 0.84 0.93 0.8 0.77
0.25 0.27 0.87 0.96 0.97 1.0 0.54 0.48 0.49 0.59
0.35 0.33 0.81 0.83 0.95 1.0 0.59 0.66 0.67 0.65
0.28 0.27 0.93 0.72 1.0 0.98 0.55 0.62 0.61 0.68
0.15 0.14 0.86 0.54 0.77 1.0 0.47 0.58 0.52 0.56
0.16 0.17 0.52 0.63 0.91 1.0 0.43 0.46 0.44 0.38
0.59 0.66 0.97 0.82 0.98 1.0 0.82 0.9 0.89 0.79
0.17 0.16 0.98 0.6 0.82 1.0 0.43 0.56 0.51 0.57
0.15 0.17 0.69 0.52 1.0 0.99 0.45 0.5 0.5 0.51
0.01 0.01 0.84 0.58 0.98 1.0 0.65 0.83 0.63 0.37
0.18 0.18 0.81 0.82 0.94 1.0 0.84 0.64 0.8 0.54
0.04 0.03 0.33 0.36 1.0 0.65 0.26 0.29 0.27 0.15
0.12 0.15 0.61 0.65 0.88 1.0 0.37 0.54 0.45 0.5
0.31 0.3 0.87 0.85 0.89 1.0 0.65 0.64 0.6 0.54
0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.93 0.25 0.0 0.0 0.0
0.13 0.14 0.75 0.72 1.0 0.97 0.5 0.45 0.43 0.41
0.03 0.03 0.99 0.63 1.0 0.76 0.34 0.44 0.43 0.46
0.0 0.01 0.88 0.51 0.67 1.0 0.4 0.62 0.37 0.42
0.12 0.13 1.0 0.78 0.98 0.91 0.48 0.49 0.45 0.52
0.2 0.2 0.64 0.51 0.91 1.0 0.54 0.58 0.55 0.58
0.04 0.04 0.73 0.56 0.79 1.0 0.25 0.33 0.28 0.5
0.1 0.11 0.85 0.9 0.85 1.0 0.65 0.59 0.53 0.46
0.01 0.01 0.59 0.25 0.71 1.0 0.33 0.47 0.32 0.28
0.03 0.02 0.75 0.44 1.0 0.91 0.26 0.49 0.53 0.37
0.24 0.18 0.75 0.35 0.76 1.0 0.69 0.62 0.44 0.31
0.07 0.07 0.49 0.49 0.91 1.0 0.36 0.47 0.39 0.51
0.33 0.07 0.45 0.62 1.0 0.9 0.0 0.13 0.16 0.27
0.23 0.25 0.75 0.66 0.99 1.0 0.38 0.51 0.5 0.48
0.33 0.32 1.0 0.67 0.8 0.92 0.67 0.71 0.61 0.71
0.0 0.0 0.98 0.34 0.6 1.0 0.23 0.4 0.35 0.52
0.02 0.02 0.89 0.78 0.71 1.0 0.51 0.71 0.61 0.41
0.12 0.13 0.66 0.49 0.79 1.0 0.45 0.41 0.42 0.38
0.16 0.16 0.71 0.63 0.83 1.0 0.42 0.36 0.36 0.33
0.19 0.2 1.0 0.6 0.91 0.99 0.58 0.64 0.62 0.63
0.16 0.18 0.84 0.7 0.94 1.0 0.48 0.55 0.54 0.6
0.33 0.38 0.83 0.74 0.94 1.0 0.73 0.7 0.68 0.54
0.07 0.07 0.95 0.65 0.92 1.0 0.34 0.48 0.44 0.56
0.35 0.37 0.97 0.78 0.88 1.0 0.74 0.69 0.77 0.61
0.25 0.24 0.89 0.57 0.85 1.0 0.33 0.5 0.45 0.55
0.33 0.37 0.76 0.54 0.71 1.0 0.51 0.61 0.53 0.52
0.05 0.05 0.6 0.56 0.79 1.0 0.19 0.29 0.21 0.37
0.12 0.13 0.65 0.55 0.91 1.0 0.35 0.39 0.43 0.37
0.35 0.4 1.0 0.73 0.67 0.94 0.7 0.81 0.76 0.71
0.4 0.42 0.78 0.76 0.85 1.0 0.68 0.75 0.7 0.74
0.22 0.26 0.67 0.53 0.79 1.0 0.55 0.59 0.59 0.54
0.48 0.53 0.86 0.97 1.0 0.98 0.66 0.81 0.7 0.81
0.07 0.06 0.47 0.26 0.68 1.0 0.33 0.38 0.43 0.38
0.34 0.29 0.83 0.41 1.0 0.97 0.69 0.69 0.61 0.54
0.1 0.11 0.75 0.64 0.86 1.0 0.36 0.52 0.43 0.56
0.1 0.09 0.72 0.42 1.0 0.79 0.45 0.65 0.48 0.53
0.13 0.15 0.91 0.57 0.97 1.0 0.49 0.7 0.72 0.62
0.15 0.15 0.63 0.6 0.96 1.0 0.56 0.54 0.45 0.37
0.18 0.17 0.66 0.93 0.96 1.0 0.46 0.43 0.41 0.44
0.3 0.32 0.8 0.83 0.93 1.0 0.47 0.61 0.58 0.54
0.44 0.44 0.94 0.9 1.0 1.0 0.85 0.8 0.88 0.65
0.01 0.0 0.66 0.66 0.77 1.0 0.2 0.5 0.35 0.16
0.14 0.13 0.72 0.61 1.0 0.9 0.52 0.52 0.51 0.41
0.04 0.04 1.0 0.61 0.71 0.94 0.47 0.58 0.39 0.47
0.08 0.09 0.75 0.42 0.7 1.0 0.36 0.4 0.34 0.28
0.0 0.0 0.77 0.4 0.68 1.0 0.31 0.58 0.52 0.42
0.19 0.2 0.93 0.47 0.79 1.0 0.72 0.62 0.64 0.48
0.14 0.16 0.93 0.63 0.79 1.0 0.52 0.61 0.66 0.46
0.16 0.16 0.93 0.94 1.0 0.93 0.65 0.42 0.48 0.3
0.05 0.06 0.66 0.16 0.46 1.0 0.15 0.48 0.21 0.23
0.0 0.0 0.84 0.59 1.0 0.96 0.23 0.41 0.35 0.53
0.23 0.21 0.76 0.68 0.91 1.0 0.52 0.52 0.52 0.62
0.34 0.35 1.0 0.75 0.79 0.94 0.74 0.62 0.66 0.6
0.17 0.18 0.73 0.46 0.74 1.0 0.61 0.66 0.55 0.33
0.18 0.17 0.72 0.66 0.97 1.0 0.62 0.58 0.56 0.55
0.15 0.19 0.66 0.69 0.71 1.0 0.46 0.38 0.46 0.37
0.1 0.13 0.65 0.81 0.75 1.0 0.43 0.42 0.45 0.5
0.0 0.0 0.41 0.24 0.94 1.0 0.05 0.31 0.28 0.22
0.12 0.13 0.71 0.48 0.9 1.0 0.41 0.43 0.45 0.42
0.13 0.14 0.75 0.3 0.87 1.0 0.34 0.39 0.51 0.41
0.09 0.08 0.89 0.54 0.9 1.0 0.48 0.54 0.53 0.4
0.06 0.05 0.72 0.38 0.87 1.0 0.33 0.57 0.34 0.62
0.0 0.0 0.84 0.53 1.0 0.99 0.49 0.54 0.3 0.13
0.05 0.03 1.0 0.47 0.88 0.93 0.57 0.28 0.38 0.19
0.29 0.28 0.67 0.52 0.93 1.0 0.58 0.75 0.62 0.55
0.12 0.12 0.58 0.6 0.82 1.0 0.34 0.48 0.42 0.52
0.22 0.21 0.81 0.92 0.96 1.0 0.63 0.51 0.55 0.54
0.29 0.32 0.92 0.81 0.96 1.0 0.63 0.69 0.57 0.54
0.34 0.32 0.7 0.58 0.89 1.0 0.52 0.54 0.54 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)