1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_172 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.0 0.0 0.2 1.0 0.2 0.31 0.67 0.47 0.4 0.39
0.04 0.04 0.45 0.33 0.36 0.35 0.43 0.84 0.55 1.0
0.25 0.26 0.37 1.0 0.32 0.32 0.44 0.63 0.67 0.88
0.37 0.41 0.34 0.4 0.52 0.51 0.53 0.8 0.73 1.0
0.07 0.15 0.26 1.0 0.84 0.69 0.59 0.77 0.68 0.49
0.07 0.07 0.4 0.9 0.62 0.67 0.49 0.67 1.0 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.68 0.0 0.66 1.0 0.7
0.06 0.15 0.15 0.94 0.08 0.24 0.87 0.49 1.0 0.67
0.0 0.0 0.18 0.98 0.4 0.58 0.71 1.0 0.82 0.58
0.37 0.27 0.46 0.49 0.41 0.23 0.39 0.61 0.86 1.0
0.12 0.15 0.02 0.88 0.24 0.13 0.74 1.0 0.92 0.71
0.23 0.23 0.77 1.0 0.97 0.9 0.7 0.91 0.88 0.64
0.02 0.01 0.11 0.09 0.05 0.06 0.41 0.82 0.4 1.0
0.0 0.0 0.22 1.0 0.29 0.27 0.48 0.54 0.33 0.7
0.08 0.15 0.52 1.0 0.81 0.78 0.94 0.98 0.79 0.69
0.04 0.03 0.15 0.69 0.77 0.79 0.45 0.96 1.0 0.8
0.03 0.02 0.34 0.62 0.49 0.54 0.42 0.68 0.74 1.0
0.3 0.37 0.48 0.49 0.42 0.54 0.57 0.81 0.57 1.0
0.09 0.09 0.23 1.0 0.27 0.28 0.4 0.54 0.35 0.84
0.0 0.0 0.34 1.0 0.58 0.6 0.25 0.35 0.24 0.14
0.12 0.18 0.23 0.75 0.65 0.46 0.46 0.54 0.85 1.0
0.05 0.04 0.46 0.45 0.4 0.68 0.74 1.0 0.7 0.8
0.0 0.01 0.31 1.0 0.25 0.18 0.21 0.59 0.58 0.96
0.0 0.0 0.15 1.0 0.17 0.17 0.3 0.68 0.51 0.61
0.26 0.34 0.87 0.66 0.71 1.0 0.86 0.99 0.77 0.92
0.04 0.02 0.09 0.47 0.34 0.48 0.37 1.0 0.7 0.67
0.07 0.05 0.73 0.78 0.54 0.58 0.68 1.0 0.74 0.98
0.27 0.34 0.46 1.0 0.7 0.73 0.86 0.71 0.69 0.74
0.21 0.28 0.41 1.0 0.46 0.33 0.48 0.75 0.6 0.77
0.05 0.04 0.09 0.63 1.0 0.64 0.42 0.68 0.75 0.91
0.04 0.03 0.52 1.0 0.58 0.5 0.88 0.91 0.82 0.6
0.16 0.11 0.17 1.0 0.45 0.42 0.47 0.99 0.49 0.56
0.08 0.11 0.23 1.0 0.16 0.16 0.63 0.51 0.48 0.63
0.0 0.0 0.16 1.0 0.06 0.19 0.29 0.46 0.38 0.57
0.0 0.0 0.5 0.73 0.51 0.82 0.64 1.0 0.48 0.47
0.51 0.46 0.92 0.8 0.84 0.91 0.88 1.0 0.96 0.75
0.4 0.44 0.56 0.69 0.6 0.6 0.96 1.0 0.79 0.92
0.03 0.03 0.05 0.44 0.07 0.04 0.68 0.8 0.42 1.0
0.69 0.67 0.76 0.86 0.76 0.87 0.68 0.83 0.93 1.0
0.0 0.0 0.21 0.97 0.75 0.49 0.26 0.49 1.0 0.81
0.04 0.02 0.5 0.53 0.08 0.18 1.0 0.47 0.34 0.44
0.08 0.07 0.34 0.55 0.35 0.24 0.52 1.0 0.42 0.97
0.07 0.07 0.18 0.89 0.47 0.6 0.32 0.77 0.77 1.0
0.42 0.6 0.53 0.9 0.61 0.66 0.71 0.86 1.0 0.71
0.0 0.0 0.31 1.0 0.27 0.37 0.45 0.72 0.34 0.36
0.0 0.0 0.22 0.57 0.42 0.1 0.37 0.79 0.93 1.0
0.17 0.2 0.15 1.0 0.48 0.31 0.61 0.55 0.36 0.28
0.55 0.55 0.8 0.75 0.87 0.88 0.94 1.0 0.95 0.85
0.0 0.0 0.33 1.0 0.32 0.33 0.44 0.87 0.59 0.57
0.18 0.2 0.78 0.71 0.5 0.74 0.92 1.0 0.92 0.88
0.05 0.14 0.18 0.56 0.07 0.02 0.35 0.61 0.41 1.0
0.21 0.23 0.64 0.86 0.51 0.51 0.67 0.89 1.0 0.73
0.01 0.01 0.3 1.0 0.01 0.02 0.29 0.61 0.24 0.68
0.18 0.17 0.37 1.0 0.45 0.33 0.57 0.78 0.54 0.45
0.22 0.25 0.32 1.0 0.56 0.31 0.61 0.89 0.96 0.94
0.12 0.13 0.76 0.72 0.7 0.97 0.82 1.0 0.92 0.71
0.0 0.0 0.13 1.0 0.32 0.53 0.33 0.45 0.31 0.28
0.32 0.28 0.37 0.58 0.65 0.63 1.0 0.83 0.68 0.78
0.09 0.08 0.14 1.0 0.29 0.09 0.21 0.52 0.64 0.9
0.01 0.01 0.1 1.0 0.79 0.57 0.3 0.63 0.72 0.94
0.18 0.0 0.23 0.16 0.57 0.44 0.24 1.0 0.58 0.58
0.0 0.0 0.04 0.53 0.64 0.71 0.3 0.63 0.93 1.0
0.32 0.25 0.56 0.94 0.6 0.65 0.78 1.0 0.93 0.57
0.04 0.06 0.26 1.0 0.73 0.59 0.93 0.94 0.71 0.75
0.03 0.02 0.15 1.0 0.1 0.08 0.3 0.35 0.53 0.48
0.0 0.0 0.15 1.0 0.29 0.0 0.53 0.29 0.52 0.21
0.11 0.17 0.18 0.53 0.46 0.74 0.4 0.58 1.0 0.62
0.03 0.04 0.13 0.37 0.36 0.26 0.38 0.77 0.77 1.0
0.01 0.02 0.21 1.0 0.34 0.16 0.56 0.39 0.41 0.5
0.01 0.02 0.09 0.03 0.05 0.04 0.29 0.77 0.17 1.0
0.17 0.12 0.46 0.62 0.48 0.57 0.57 0.86 0.56 1.0
0.1 0.11 1.0 0.98 0.57 0.71 0.83 0.65 0.48 0.6
0.0 0.0 0.57 0.82 0.97 0.79 0.62 1.0 0.79 0.87
0.14 0.19 0.17 0.6 0.15 0.13 0.15 0.11 0.26 1.0
0.13 0.12 0.62 0.69 0.39 0.45 0.49 0.97 0.84 1.0
0.0 0.04 0.0 1.0 0.07 0.35 0.0 0.13 0.0 0.59
0.01 0.0 0.18 0.32 0.51 0.3 0.41 0.89 1.0 0.98
0.04 0.04 0.02 1.0 0.12 0.12 0.23 0.2 0.39 0.56
0.36 0.38 0.56 0.68 0.62 0.62 0.77 0.76 0.75 1.0
0.04 0.03 0.38 0.57 0.5 0.18 0.54 1.0 0.84 0.94
0.04 0.03 0.72 0.85 0.91 0.77 0.77 0.94 0.86 1.0
0.26 0.27 0.27 0.7 0.58 0.84 0.76 1.0 0.85 0.7
0.0 0.0 0.39 0.66 0.81 0.94 0.93 1.0 0.94 0.73
0.19 0.28 0.09 1.0 0.8 0.47 0.53 0.81 0.82 0.83
0.01 0.01 0.75 0.75 0.68 0.67 0.71 1.0 0.65 0.47
0.0 0.0 0.26 0.9 0.26 0.34 0.83 1.0 0.7 0.72
0.0 0.0 0.5 0.68 0.65 0.65 0.79 1.0 0.81 0.8
0.1 0.12 0.07 1.0 0.06 0.14 0.35 0.47 0.43 0.49
0.55 0.59 0.7 1.0 0.67 0.61 0.69 0.83 0.73 0.92
0.0 0.05 0.04 0.08 0.15 0.17 0.33 0.4 0.29 1.0
0.13 0.15 0.13 1.0 0.41 0.49 0.49 0.59 0.71 0.63
0.29 0.29 0.62 1.0 0.54 0.67 0.57 0.62 0.64 0.51
0.36 0.49 0.39 0.93 0.54 0.43 0.42 0.87 0.63 1.0
0.0 0.01 0.26 1.0 0.14 0.14 0.04 0.42 0.32 0.85
0.06 0.06 0.73 0.75 0.9 0.79 0.7 0.9 0.71 1.0
0.54 0.3 0.53 0.58 0.33 0.33 0.56 0.91 0.44 1.0
0.26 0.37 0.4 1.0 0.64 0.5 0.48 0.78 0.75 0.71
0.13 0.18 0.42 1.0 0.63 0.8 0.78 0.85 0.71 0.67
0.15 0.13 0.14 0.56 0.5 0.16 0.39 1.0 0.94 0.83
0.0 0.0 0.06 1.0 0.1 0.12 0.18 0.33 0.0 0.72
0.53 0.64 0.51 0.79 0.82 0.57 0.82 0.94 1.0 0.96
0.17 0.17 0.69 0.51 0.6 0.74 0.89 1.0 0.75 0.67
0.0 0.0 0.3 0.98 0.05 0.04 0.37 0.5 0.41 1.0
0.09 0.02 0.44 0.39 0.13 0.58 0.52 1.0 0.88 0.7
0.12 0.14 0.32 0.93 0.39 0.41 0.5 1.0 0.98 0.94
0.02 0.01 0.19 1.0 0.33 0.24 0.3 0.46 0.44 0.63
0.0 0.0 0.46 0.68 0.26 0.11 0.51 1.0 0.55 0.81
0.0 0.0 0.21 1.0 0.24 0.08 0.41 0.94 0.55 0.71
0.25 0.27 0.16 1.0 0.28 0.37 0.36 0.54 0.5 0.5
0.01 0.01 0.26 0.3 0.25 0.06 0.38 1.0 0.28 0.87
0.21 0.18 0.5 0.54 0.59 0.73 0.55 0.91 0.6 1.0
0.07 0.02 0.75 0.56 0.74 0.82 0.42 1.0 0.94 0.58
0.03 0.02 0.17 1.0 0.06 0.03 0.4 0.6 0.44 0.59
0.02 0.03 0.32 0.69 0.22 0.06 0.75 1.0 0.42 0.62
0.0 0.0 0.83 1.0 0.37 0.39 0.26 0.69 0.68 0.82
0.02 0.02 0.45 0.68 0.6 0.65 0.36 0.95 0.93 1.0
0.13 0.18 0.54 1.0 0.62 0.65 0.72 0.67 0.46 0.57
0.08 0.08 0.44 0.67 0.64 0.56 0.41 0.76 0.65 1.0
0.09 0.17 0.42 1.0 0.39 0.29 0.35 0.68 0.62 0.49
0.07 0.05 0.02 0.21 0.0 0.03 0.62 0.87 0.5 1.0
0.02 0.03 0.3 0.96 0.63 0.77 0.47 1.0 0.86 0.89
0.25 0.29 0.1 1.0 0.08 0.08 0.13 0.28 0.43 0.57
0.01 0.0 0.72 0.83 0.95 0.58 0.78 1.0 0.74 0.61
0.42 0.46 0.67 0.96 0.35 0.48 0.41 0.77 1.0 0.83
0.04 0.07 0.12 1.0 0.08 0.07 0.16 0.38 0.37 0.55
0.1 0.09 0.8 0.87 0.7 0.78 0.65 1.0 0.76 0.56
0.08 0.08 0.36 1.0 0.65 0.56 0.27 0.49 0.56 0.59
0.39 0.4 0.52 1.0 0.82 0.76 0.7 0.77 0.78 0.74
0.04 0.13 0.22 0.49 0.15 0.18 0.33 1.0 0.56 0.71
0.0 0.0 0.04 0.65 0.01 0.03 0.03 0.27 0.31 1.0
0.0 0.0 0.08 0.61 0.03 0.04 0.04 0.16 0.26 1.0
0.2 0.2 0.54 1.0 0.25 0.29 0.44 0.69 0.51 0.58
0.0 0.0 0.17 0.57 0.17 0.13 0.0 1.0 0.29 0.93
0.0 0.0 0.06 1.0 0.1 0.14 0.35 0.46 0.55 0.38
0.01 0.01 0.49 0.81 0.41 0.67 0.72 0.72 1.0 0.66
0.17 0.17 0.39 1.0 0.61 0.57 0.75 0.84 0.66 0.69
0.12 0.13 0.34 1.0 0.51 0.36 0.62 0.74 0.53 0.47
0.04 0.01 0.35 1.0 0.4 0.61 0.67 0.9 0.92 0.94
0.02 0.04 0.55 0.93 1.0 0.84 0.51 0.74 0.7 0.83
0.0 0.0 0.39 1.0 0.25 0.25 0.24 0.52 0.34 0.4
0.0 0.0 0.27 0.35 0.15 0.31 0.14 0.77 0.59 1.0
0.37 0.33 0.82 0.98 0.67 0.89 1.0 0.8 0.76 0.92
0.26 0.33 0.61 1.0 0.68 0.76 0.6 0.88 0.5 0.53
0.41 0.42 0.39 1.0 0.6 0.64 0.72 0.91 0.72 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)