1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_80 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.12 0.13 0.46 0.6 0.09 0.06 0.4 0.98 0.56 1.0
0.56 0.61 1.0 0.91 0.43 0.44 0.98 0.85 0.85 0.97
0.36 0.35 0.36 0.48 0.28 0.2 0.65 0.79 0.74 1.0
0.47 0.42 0.92 0.79 0.41 0.48 0.87 1.0 0.84 0.92
0.19 0.13 1.0 0.46 0.04 0.03 0.67 0.54 0.72 0.64
0.26 0.24 0.76 0.76 0.52 0.32 0.59 0.81 1.0 0.89
0.11 0.12 0.56 0.98 0.46 0.37 0.85 1.0 0.98 0.93
0.42 0.41 0.66 0.94 0.47 0.52 1.0 0.89 0.79 0.98
0.25 0.29 0.62 0.7 0.42 0.34 0.39 0.67 0.81 1.0
0.17 0.17 0.7 0.58 0.28 0.18 0.68 0.95 0.98 1.0
0.41 0.37 0.78 0.91 0.3 0.22 0.75 0.98 1.0 0.72
0.45 0.51 1.0 0.56 0.24 0.28 0.76 0.95 0.99 0.81
0.02 0.02 0.51 0.65 0.29 0.24 0.37 0.56 0.66 1.0
0.03 0.04 0.65 0.55 0.12 0.08 0.45 0.66 0.96 1.0
0.48 0.49 0.9 0.8 0.18 0.24 0.62 0.93 0.98 1.0
0.22 0.26 0.8 0.85 0.33 0.23 0.5 0.75 0.77 1.0
0.28 0.25 1.0 0.6 0.14 0.15 0.74 0.84 0.83 0.88
0.22 0.22 0.48 0.79 0.45 0.3 0.76 0.82 0.95 1.0
0.35 0.38 0.62 0.6 0.27 0.21 0.88 0.98 0.97 1.0
0.53 0.52 0.77 0.78 0.42 0.36 0.9 0.89 0.8 1.0
0.46 0.46 0.91 0.62 0.2 0.19 1.0 0.81 0.79 0.79
0.52 0.52 1.0 0.68 0.33 0.3 0.74 0.74 0.85 0.89
0.03 0.02 0.69 0.39 0.25 0.24 0.42 0.75 0.63 1.0
0.13 0.07 0.66 0.9 0.09 0.06 1.0 0.78 0.62 0.89
0.04 0.03 0.94 0.33 0.07 0.1 0.46 0.72 1.0 0.88
0.0 0.0 0.92 0.99 0.13 0.16 0.79 0.89 1.0 0.92
0.6 0.66 1.0 0.78 0.55 0.48 0.88 1.0 0.9 0.87
0.18 0.18 0.66 0.93 0.04 0.06 0.85 0.73 0.68 1.0
0.02 0.03 0.96 0.47 0.32 0.19 0.57 0.75 0.8 1.0
0.28 0.34 1.0 0.7 0.28 0.42 0.66 0.71 0.84 0.93
0.04 0.04 1.0 0.5 0.13 0.15 0.42 0.56 0.65 0.91
0.61 0.62 0.79 1.0 0.71 0.67 0.89 0.93 0.85 0.96
0.04 0.02 0.54 0.88 0.1 0.1 0.77 1.0 0.98 0.8
0.75 0.64 0.83 0.88 0.63 0.51 1.0 0.86 0.96 0.94
0.43 0.52 0.94 0.76 0.28 0.26 0.76 0.78 0.91 1.0
0.21 0.26 0.81 0.67 0.46 0.28 0.61 0.74 0.74 1.0
0.18 0.14 0.96 0.22 0.09 0.13 0.49 0.64 0.85 1.0
0.57 0.65 1.0 0.67 0.5 0.45 0.8 0.9 0.95 0.86
0.13 0.12 0.69 0.44 0.26 0.2 0.64 0.81 0.78 1.0
0.17 0.16 0.82 0.49 0.18 0.16 0.74 0.88 0.9 1.0
0.47 0.51 0.96 0.72 0.3 0.3 1.0 0.85 0.85 0.75
0.68 0.74 0.87 0.92 0.63 0.6 0.77 0.96 0.92 1.0
0.0 0.0 0.81 0.28 0.13 0.13 0.46 0.63 1.0 0.71
0.4 0.29 1.0 0.25 0.36 0.3 0.82 0.83 0.86 0.95
0.61 0.64 0.97 0.78 0.44 0.4 0.92 1.0 0.92 0.9
0.03 0.02 0.71 0.1 0.14 0.17 0.38 0.96 1.0 0.9
0.05 0.05 1.0 0.17 0.13 0.13 0.33 0.88 0.93 0.89
0.03 0.03 0.34 0.39 0.36 0.38 0.8 1.0 0.71 0.98
0.16 0.14 0.23 0.37 0.06 0.04 0.6 0.79 0.75 1.0
0.32 0.26 0.24 0.48 0.13 0.08 0.62 0.72 0.75 1.0
0.07 0.06 0.64 0.5 0.12 0.13 0.45 0.8 0.86 1.0
0.5 0.47 0.71 0.85 0.36 0.3 1.0 0.95 1.0 0.92
0.45 0.44 0.55 0.82 0.37 0.35 1.0 0.89 0.98 0.99
0.18 0.16 0.84 0.52 0.05 0.04 0.61 0.86 0.95 1.0
0.05 0.05 0.49 0.55 0.04 0.1 0.68 0.54 0.22 1.0
0.25 0.25 0.35 0.72 0.28 0.2 0.61 0.9 0.67 1.0
0.52 0.52 0.85 0.8 0.28 0.3 0.89 1.0 0.95 0.86
0.56 0.54 0.75 0.94 0.49 0.43 0.91 0.9 0.87 1.0
0.04 0.01 0.4 0.32 0.22 0.24 0.55 0.93 0.7 1.0
0.29 0.28 1.0 0.91 0.34 0.31 0.83 1.0 1.0 0.97
0.37 0.41 0.69 0.79 0.37 0.29 0.66 0.75 0.77 1.0
0.41 0.44 0.5 0.83 0.25 0.19 0.63 0.82 0.67 1.0
0.44 0.48 0.67 0.63 0.59 0.38 0.7 0.78 0.8 1.0
0.38 0.37 1.0 0.62 0.12 0.15 0.86 0.65 0.72 0.81
0.03 0.03 0.69 0.3 0.08 0.1 0.3 0.63 0.62 1.0
0.05 0.06 1.0 0.37 0.05 0.04 0.65 0.96 0.92 0.91
0.39 0.37 0.68 0.99 0.4 0.34 0.84 0.87 1.0 0.83
0.52 0.54 1.0 0.61 0.2 0.17 0.67 0.93 0.82 0.86
0.14 0.23 0.66 0.31 0.13 0.11 0.31 1.0 0.86 0.8
0.55 0.59 0.83 0.87 0.49 0.39 0.94 1.0 0.96 0.93
0.41 0.45 0.77 0.62 0.23 0.29 0.65 0.77 1.0 0.77
0.44 0.48 0.81 0.76 0.36 0.29 0.76 0.77 0.92 1.0
0.01 0.0 0.41 0.87 0.04 0.05 0.4 0.88 1.0 0.52
0.18 0.19 0.69 0.88 0.21 0.18 0.53 0.84 0.99 1.0
0.45 0.59 1.0 0.81 0.12 0.13 0.97 0.77 0.8 0.82
0.41 0.44 0.67 0.79 0.33 0.29 0.7 0.94 0.98 1.0
0.2 0.24 0.86 0.56 0.08 0.18 1.0 0.97 0.95 0.8
0.48 0.49 0.91 0.65 0.26 0.2 0.8 0.83 0.93 1.0
0.6 0.6 0.93 0.95 0.43 0.37 1.0 0.9 0.95 1.0
0.16 0.16 0.63 0.47 0.18 0.16 0.38 0.79 0.67 1.0
0.26 0.13 0.62 0.94 0.19 0.17 0.67 0.73 1.0 0.96
0.62 0.64 0.68 0.74 0.49 0.52 0.73 1.0 0.88 0.81
0.05 0.04 0.63 0.67 0.44 0.42 0.8 1.0 0.86 0.96
0.36 0.42 0.72 0.61 0.26 0.26 0.63 0.82 0.84 1.0
0.26 0.3 0.91 0.91 0.48 0.42 0.71 0.89 1.0 0.98
0.06 0.05 0.23 0.38 0.07 0.06 0.7 0.61 0.84 1.0
0.48 0.49 0.77 0.76 0.42 0.38 1.0 0.95 0.86 0.92
0.06 0.04 0.55 0.26 0.08 0.08 0.68 1.0 0.93 0.86
0.52 0.56 1.0 0.76 0.47 0.38 0.72 0.75 0.86 0.81
0.23 0.15 0.88 0.43 0.17 0.19 0.42 1.0 0.91 0.91
0.14 0.15 0.39 0.6 0.1 0.09 0.4 0.69 0.67 1.0
0.47 0.46 0.81 0.67 0.33 0.27 1.0 0.92 0.98 0.82
0.44 0.4 0.9 0.72 0.52 0.37 0.82 0.9 1.0 0.91
0.45 0.44 0.8 0.67 0.52 0.43 0.69 0.86 1.0 0.95
0.28 0.35 0.6 0.75 0.4 0.34 0.74 0.75 0.79 1.0
0.45 0.45 1.0 0.68 0.16 0.12 0.86 0.8 0.91 0.94
0.35 0.38 0.84 0.84 0.59 0.59 0.66 0.94 0.83 1.0
0.07 0.06 0.7 0.31 0.08 0.05 0.56 0.81 0.78 1.0
0.23 0.14 0.64 0.45 0.3 0.12 0.44 0.6 1.0 0.96
0.42 0.46 0.47 0.84 0.29 0.24 0.81 0.77 0.85 1.0
0.16 0.15 0.52 0.42 0.32 0.36 0.75 0.87 0.98 1.0
0.5 0.51 0.52 0.86 0.36 0.33 0.76 0.86 1.0 0.94
0.59 0.58 0.74 0.82 0.51 0.4 0.87 0.92 1.0 0.88
0.02 0.01 0.8 0.35 0.1 0.08 0.55 0.99 1.0 0.86
0.18 0.19 0.5 0.56 0.03 0.01 0.41 0.74 1.0 0.7
0.1 0.12 0.59 0.57 0.19 0.16 0.44 0.76 0.61 1.0
0.0 0.0 0.77 0.48 0.08 0.07 0.59 1.0 0.82 0.84
0.26 0.29 0.58 0.45 0.2 0.12 0.61 0.99 0.86 1.0
0.28 0.42 0.97 0.75 0.46 0.31 0.83 1.0 0.84 0.84
0.41 0.36 0.79 0.64 0.24 0.24 0.78 0.91 0.84 1.0
0.06 0.06 0.56 1.0 0.18 0.11 0.77 0.9 0.87 0.94
0.38 0.39 0.68 0.94 0.4 0.36 0.66 0.92 0.95 1.0
0.28 0.24 1.0 0.52 0.28 0.3 0.54 0.64 0.81 1.0
0.52 0.58 0.75 0.9 0.73 0.62 0.94 1.0 0.95 0.99
0.05 0.06 0.52 0.45 0.12 0.1 0.67 0.88 0.8 1.0
0.0 0.0 0.17 0.15 0.11 0.06 0.52 0.78 0.64 1.0
0.04 0.04 0.48 0.39 0.13 0.13 0.48 0.54 0.57 1.0
0.63 0.61 1.0 0.69 0.61 0.58 0.85 0.78 0.96 0.85
0.01 0.01 0.54 0.2 0.19 0.2 0.29 0.92 0.75 1.0
0.09 0.16 0.73 0.09 0.0 0.0 0.49 0.4 1.0 0.65
0.15 0.15 0.71 0.5 0.08 0.1 0.5 1.0 0.82 0.65
0.46 0.5 0.97 0.84 0.3 0.26 0.98 0.99 1.0 0.9
0.45 0.52 0.75 0.62 0.34 0.25 0.94 1.0 0.87 0.87
0.1 0.1 0.74 0.35 0.12 0.11 0.51 0.45 0.34 1.0
0.28 0.34 0.8 0.47 0.22 0.22 0.41 0.76 0.73 1.0
0.28 0.25 0.91 0.57 0.33 0.29 0.79 0.91 0.93 1.0
0.13 0.13 0.93 0.75 0.0 0.03 0.51 0.97 0.64 1.0
0.32 0.35 0.51 0.72 0.26 0.21 0.55 1.0 0.99 0.94
0.47 0.49 0.85 1.0 0.25 0.19 0.91 0.8 0.86 0.99
0.3 0.31 0.66 0.75 0.34 0.26 0.55 0.61 0.62 1.0
0.14 0.09 0.92 0.64 0.21 0.22 1.0 0.51 0.79 0.64
0.32 0.31 0.5 0.7 0.32 0.26 0.67 0.85 0.79 1.0
0.19 0.14 0.77 0.35 0.27 0.25 0.64 1.0 0.87 0.89
0.3 0.33 0.45 0.66 0.14 0.1 0.67 0.92 0.82 1.0
0.09 0.09 1.0 0.21 0.08 0.12 0.5 0.69 0.81 0.67
0.0 0.06 0.51 0.27 0.06 0.04 1.0 0.9 0.93 0.88
0.09 0.1 0.59 0.32 0.11 0.08 0.47 0.65 0.67 1.0
0.6 0.63 0.99 0.67 0.43 0.37 0.83 1.0 0.98 0.96
0.23 0.28 1.0 0.45 0.06 0.02 0.75 0.3 0.5 0.77
0.17 0.16 0.69 0.55 0.3 0.25 0.45 0.77 0.69 1.0
0.22 0.19 0.71 0.64 0.27 0.2 0.67 0.84 0.73 1.0
0.41 0.45 1.0 0.7 0.45 0.35 0.94 0.96 0.97 0.9
0.34 0.35 0.69 0.86 0.38 0.49 1.0 0.75 0.83 0.84
0.06 0.04 0.35 0.58 0.12 0.07 0.59 0.81 1.0 0.79
0.1 0.08 0.8 0.78 0.15 0.15 0.68 0.79 1.0 0.8
0.36 0.4 0.86 0.87 0.44 0.41 0.8 0.84 0.85 1.0
0.19 0.2 0.52 0.31 0.29 0.09 0.47 0.51 1.0 0.54
0.09 0.05 0.56 0.55 0.08 0.09 0.74 0.78 1.0 0.83
0.6 0.61 0.76 0.81 0.4 0.34 0.96 0.99 1.0 0.97
0.13 0.14 0.83 0.63 0.24 0.27 0.85 0.75 0.82 1.0
0.36 0.46 0.87 1.0 0.26 0.19 0.84 0.47 0.44 0.82
0.0 0.0 0.35 0.15 0.1 0.07 0.43 0.57 0.58 1.0
0.38 0.38 0.61 0.78 0.3 0.29 0.89 0.92 1.0 0.93
0.35 0.37 0.44 0.58 0.18 0.13 0.72 0.73 0.78 1.0
0.23 0.37 0.21 0.56 0.09 0.07 0.45 1.0 0.88 0.88
0.32 0.37 0.74 0.56 0.29 0.32 0.8 0.95 0.72 1.0
0.23 0.23 0.96 0.53 0.11 0.11 0.68 0.79 0.91 1.0
0.1 0.11 0.74 0.84 0.24 0.29 0.54 0.59 0.63 1.0
0.52 0.58 0.72 0.72 0.48 0.46 0.64 0.84 0.69 1.0
0.0 0.0 0.45 0.33 0.22 0.28 0.61 0.95 0.67 1.0
0.0 0.0 0.64 0.27 0.06 0.03 0.3 0.52 0.56 1.0
0.25 0.3 0.76 0.71 0.24 0.23 0.62 0.71 0.65 1.0
0.01 0.01 0.81 0.32 0.02 0.05 0.62 1.0 0.71 0.62
0.37 0.34 0.67 0.63 0.25 0.19 0.92 1.0 0.9 0.83
0.12 0.1 0.65 0.15 0.04 0.04 0.37 0.77 1.0 0.87
0.45 0.48 0.86 0.7 0.53 0.42 0.8 1.0 0.87 0.98
0.35 0.35 1.0 0.58 0.27 0.18 0.55 0.78 0.79 0.86
0.0 0.0 0.63 0.2 0.06 0.05 0.61 1.0 0.9 0.98
0.0 0.0 0.81 0.7 0.14 0.17 0.62 0.74 0.78 1.0
0.27 0.2 0.57 0.59 0.41 0.32 0.72 0.87 0.83 1.0
0.32 0.34 0.75 0.66 0.23 0.24 0.73 1.0 0.89 0.68
0.28 0.35 0.7 0.84 0.23 0.2 0.91 0.75 0.8 1.0
0.54 0.49 0.91 0.79 0.21 0.19 1.0 0.84 0.84 0.93
0.15 0.19 0.72 0.51 0.29 0.15 0.73 0.98 0.96 1.0
0.26 0.17 0.68 0.22 0.1 0.07 0.61 1.0 0.93 0.77
0.0 0.0 0.76 0.76 0.04 0.03 1.0 0.8 0.72 0.76
0.26 0.26 0.92 0.53 0.13 0.15 1.0 0.75 0.9 0.62
0.09 0.09 0.46 0.41 0.17 0.11 0.44 0.64 0.75 1.0
0.18 0.22 0.88 0.8 0.38 0.4 0.58 1.0 0.86 0.97
0.58 0.63 0.7 0.8 0.65 0.52 0.83 0.93 0.78 1.0
0.13 0.12 0.42 0.5 0.23 0.22 0.53 0.68 0.7 1.0
0.33 0.36 0.78 0.45 0.25 0.22 0.73 0.83 0.76 1.0
0.13 0.16 0.42 0.52 0.48 0.23 0.79 0.97 0.72 1.0
0.49 0.54 1.0 0.91 0.54 0.41 0.81 0.89 0.85 0.98
0.07 0.07 1.0 0.37 0.24 0.25 0.58 0.71 0.83 0.77
0.12 0.09 0.58 0.65 0.2 0.2 0.59 0.61 0.71 1.0
0.34 0.35 0.54 0.55 0.24 0.18 1.0 0.79 0.84 0.99
0.37 0.31 1.0 0.41 0.27 0.24 0.9 0.66 0.89 0.9
0.47 0.68 0.84 0.86 0.21 0.25 1.0 0.72 0.47 1.0
0.42 0.44 0.64 0.61 0.15 0.15 0.71 1.0 0.81 0.98
0.35 0.38 0.67 0.85 0.29 0.25 0.66 0.76 0.71 1.0
0.33 0.32 0.67 0.79 0.27 0.25 0.9 0.89 0.9 1.0
0.52 0.51 0.8 0.76 0.44 0.43 0.59 1.0 0.93 0.9
0.52 0.55 0.77 0.75 0.47 0.36 0.8 0.97 0.88 1.0
0.23 0.23 0.88 0.73 0.54 0.43 0.6 0.84 0.73 1.0
0.15 0.17 0.66 1.0 0.2 0.17 0.5 0.66 0.72 0.96
0.63 0.55 0.72 0.8 0.24 0.25 0.9 0.95 1.0 0.94
0.47 0.47 0.89 0.54 0.34 0.29 0.66 0.69 0.81 1.0
0.22 0.29 0.79 0.8 0.31 0.34 0.6 0.73 0.72 1.0
0.37 0.42 0.87 0.8 0.56 0.56 0.74 0.92 0.82 1.0
0.0 0.0 0.57 0.64 0.06 0.04 0.41 1.0 0.91 0.86
0.56 0.51 0.79 0.77 0.28 0.17 0.93 0.88 1.0 0.88
0.33 0.3 0.97 0.56 0.22 0.35 1.0 0.83 0.98 0.85
0.2 0.21 0.69 0.77 0.32 0.29 0.77 0.86 0.94 1.0
0.56 0.59 0.91 0.89 0.25 0.22 0.88 0.87 0.9 1.0
0.3 0.35 0.57 0.75 0.16 0.12 0.63 0.94 1.0 1.0
0.24 0.34 0.9 0.98 0.08 0.08 0.96 0.67 0.7 1.0
0.3 0.32 0.77 0.73 0.59 0.51 0.78 0.84 0.92 1.0
0.54 0.54 0.78 0.7 0.44 0.53 0.95 1.0 1.0 0.94
0.5 0.66 0.88 0.89 0.4 0.48 1.0 0.97 1.0 0.95
0.11 0.11 0.77 0.51 0.28 0.29 0.57 0.95 0.87 1.0
0.51 0.45 0.64 0.76 0.46 0.39 0.8 0.87 0.81 1.0
0.05 0.05 0.34 0.4 0.11 0.09 0.45 0.82 0.48 1.0
0.27 0.32 0.66 0.49 0.18 0.19 0.61 0.61 0.59 1.0
0.13 0.13 1.0 0.34 0.06 0.08 0.41 0.66 0.9 0.85
0.12 0.08 0.71 0.39 0.1 0.07 0.23 0.7 1.0 0.67
0.33 0.32 0.47 0.67 0.26 0.25 0.78 0.94 0.85 1.0
0.58 0.57 0.71 0.71 0.36 0.27 0.82 0.83 1.0 0.82
0.44 0.53 0.73 0.77 0.33 0.21 1.0 0.91 0.91 0.84
0.17 0.17 0.95 0.56 0.33 0.32 0.84 0.91 1.0 0.81
0.21 0.27 0.78 0.58 0.16 0.13 0.69 0.96 0.76 1.0
0.38 0.37 0.89 0.82 0.37 0.37 1.0 0.99 1.0 0.87
0.33 0.3 0.85 0.51 0.4 0.3 0.88 0.93 1.0 0.82

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)