1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_113 (Brachypodium distachyon HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
sid-dev (Zhang et al., 2022)
wt-dev (Zhang et al., 2022)
untreated (Thomas et al., 2018)
treated - synthetic auxin (Thomas et al., 2018)
untreated (Wang et al., 2019)
mowed (Wang et al., 2019)
time point 1 (Ogden et al., 2020)
time point 2 (Ogden et al., 2020)
time point 3 (Ogden et al., 2020)
time point 4 (Ogden et al., 2020)
0.24 0.23 1.0 0.86 0.44 0.38 0.55 0.59 0.58 0.58
0.08 0.08 1.0 0.64 0.25 0.22 0.46 0.46 0.49 0.5
0.0 0.0 1.0 0.36 0.04 0.04 0.28 0.52 0.35 0.42
0.1 0.11 1.0 0.57 0.32 0.32 0.41 0.53 0.54 0.66
0.0 0.0 1.0 0.16 0.21 0.3 0.45 0.61 0.44 0.57
0.27 0.26 1.0 0.76 0.39 0.37 0.55 0.61 0.53 0.52
0.24 0.26 1.0 0.9 0.51 0.43 0.68 0.67 0.69 0.58
0.2 0.17 1.0 0.4 0.33 0.37 0.43 0.63 0.57 0.56
0.29 0.32 1.0 0.74 0.26 0.27 0.46 0.62 0.56 0.56
0.35 0.34 1.0 0.86 0.53 0.48 0.55 0.64 0.63 0.68
0.22 0.25 1.0 0.96 0.55 0.54 0.68 0.79 0.72 0.66
0.12 0.19 1.0 0.61 0.32 0.35 0.72 0.64 0.65 0.48
0.29 0.31 1.0 0.63 0.34 0.38 0.47 0.56 0.62 0.62
0.13 0.13 1.0 0.69 0.31 0.35 0.53 0.71 0.59 0.57
0.14 0.14 1.0 0.86 0.35 0.38 0.48 0.55 0.54 0.54
0.32 0.36 1.0 0.84 0.48 0.46 0.82 0.76 0.76 0.77
0.29 0.31 1.0 0.79 0.49 0.45 0.47 0.56 0.59 0.59
0.17 0.17 1.0 0.79 0.44 0.36 0.51 0.59 0.52 0.54
0.07 0.06 1.0 0.54 0.23 0.28 0.27 0.36 0.42 0.45
0.12 0.15 1.0 0.67 0.42 0.5 0.57 0.64 0.58 0.62
0.1 0.13 1.0 0.75 0.26 0.31 0.65 0.59 0.5 0.49
0.26 0.27 1.0 0.52 0.45 0.48 0.58 0.66 0.59 0.62
0.01 0.01 1.0 0.74 0.2 0.16 0.49 0.5 0.55 0.5
0.27 0.28 1.0 0.8 0.36 0.36 0.44 0.53 0.55 0.65
0.03 0.01 1.0 0.14 0.08 0.15 0.29 0.31 0.29 0.33
0.16 0.18 1.0 0.88 0.34 0.33 0.5 0.63 0.49 0.58
0.05 0.06 1.0 0.36 0.2 0.22 0.28 0.42 0.4 0.49
0.05 0.05 1.0 0.73 0.27 0.26 0.59 0.5 0.58 0.44
0.2 0.25 1.0 0.71 0.28 0.31 0.51 0.56 0.51 0.46
0.0 0.0 1.0 0.38 0.07 0.02 0.31 0.21 0.24 0.26
0.03 0.03 1.0 0.5 0.47 0.4 0.53 0.57 0.56 0.52
0.25 0.24 1.0 0.77 0.3 0.33 0.61 0.55 0.55 0.47
0.04 0.04 1.0 0.42 0.18 0.25 0.42 0.64 0.56 0.5
0.11 0.14 1.0 0.7 0.23 0.19 0.55 0.49 0.43 0.56
0.24 0.25 1.0 0.57 0.18 0.2 0.27 0.44 0.4 0.42
0.22 0.21 1.0 0.64 0.24 0.23 0.52 0.47 0.49 0.47
0.3 0.33 1.0 0.77 0.41 0.45 0.62 0.65 0.69 0.63
0.49 0.52 1.0 0.8 0.59 0.61 0.74 0.87 0.8 0.78
0.13 0.11 1.0 0.5 0.3 0.35 0.73 0.6 0.66 0.64
0.43 0.4 1.0 0.63 0.41 0.4 0.43 0.6 0.56 0.6
0.17 0.17 1.0 0.64 0.27 0.31 0.54 0.69 0.62 0.72
0.12 0.12 1.0 0.71 0.36 0.34 0.46 0.57 0.62 0.62
0.53 0.53 1.0 0.96 0.65 0.68 0.74 0.84 0.88 0.77
0.04 0.04 1.0 0.36 0.3 0.34 0.39 0.53 0.57 0.59
0.33 0.32 1.0 0.91 0.51 0.45 0.68 0.8 0.87 0.84
0.31 0.34 1.0 0.55 0.4 0.37 0.5 0.58 0.69 0.72
0.16 0.16 1.0 0.5 0.3 0.34 0.46 0.56 0.52 0.46
0.31 0.36 1.0 0.69 0.39 0.42 0.59 0.58 0.6 0.53
0.04 0.05 1.0 0.59 0.22 0.23 0.32 0.49 0.47 0.47
0.13 0.15 1.0 0.53 0.29 0.3 0.43 0.49 0.56 0.57
0.2 0.21 1.0 0.71 0.47 0.49 0.54 0.56 0.57 0.64
0.16 0.15 1.0 0.73 0.38 0.41 0.65 0.63 0.63 0.57
0.05 0.05 1.0 0.61 0.24 0.31 0.33 0.45 0.43 0.53
0.21 0.23 1.0 0.76 0.34 0.3 0.47 0.6 0.62 0.69
0.22 0.22 1.0 0.65 0.49 0.44 0.47 0.6 0.58 0.63
0.09 0.11 1.0 0.8 0.28 0.25 0.42 0.63 0.67 0.87
0.24 0.26 1.0 0.67 0.33 0.35 0.38 0.52 0.57 0.58
0.22 0.25 1.0 0.51 0.25 0.31 0.33 0.58 0.5 0.44
0.04 0.04 1.0 0.66 0.19 0.2 0.47 0.48 0.47 0.49
0.28 0.3 1.0 0.76 0.45 0.43 0.65 0.6 0.64 0.57
0.19 0.19 1.0 0.67 0.3 0.26 0.34 0.44 0.48 0.45
0.17 0.17 1.0 0.66 0.3 0.26 0.55 0.55 0.56 0.62
0.09 0.11 1.0 0.7 0.27 0.28 0.51 0.57 0.66 0.66
0.13 0.14 1.0 0.44 0.17 0.17 0.48 0.42 0.43 0.28
0.18 0.19 1.0 0.69 0.27 0.3 0.61 0.59 0.68 0.5
0.39 0.51 1.0 1.0 0.51 0.56 0.78 0.84 0.79 0.78
0.28 0.26 1.0 0.64 0.43 0.48 0.46 0.49 0.5 0.64
0.24 0.24 1.0 0.74 0.43 0.45 0.59 0.67 0.58 0.63
0.01 0.01 1.0 0.56 0.12 0.11 0.26 0.31 0.28 0.24
0.39 0.45 1.0 0.76 0.58 0.54 0.74 0.66 0.67 0.64
0.37 0.38 1.0 0.68 0.39 0.43 0.63 0.57 0.66 0.66
0.3 0.31 1.0 0.7 0.44 0.36 0.45 0.54 0.51 0.58
0.14 0.15 1.0 0.59 0.23 0.18 0.37 0.47 0.44 0.62
0.29 0.31 1.0 0.79 0.42 0.41 0.64 0.71 0.71 0.72
0.31 0.33 1.0 0.71 0.5 0.57 0.62 0.69 0.68 0.65
0.43 0.5 1.0 0.81 0.56 0.56 0.62 0.72 0.75 0.79
0.05 0.04 1.0 0.46 0.13 0.14 0.48 0.38 0.44 0.33
0.16 0.16 1.0 0.72 0.35 0.37 0.61 0.7 0.78 0.67
0.17 0.19 1.0 0.57 0.51 0.54 0.59 0.71 0.64 0.67
0.29 0.33 1.0 0.61 0.3 0.31 0.47 0.6 0.66 0.63
0.04 0.04 1.0 0.55 0.27 0.33 0.67 0.71 0.6 0.5
0.29 0.35 1.0 0.88 0.58 0.45 0.72 0.73 0.66 0.65
0.22 0.24 1.0 0.83 0.37 0.37 0.57 0.54 0.61 0.52
0.24 0.25 1.0 0.69 0.29 0.37 0.52 0.6 0.56 0.49
0.26 0.27 1.0 0.95 0.49 0.47 0.57 0.65 0.62 0.7
0.33 0.4 1.0 0.72 0.39 0.42 0.6 0.58 0.55 0.5
0.31 0.37 1.0 0.74 0.49 0.53 0.48 0.57 0.66 0.6
0.43 0.46 1.0 0.63 0.35 0.43 0.55 0.65 0.71 0.71
0.11 0.15 1.0 0.8 0.4 0.32 0.48 0.56 0.63 0.49
0.19 0.21 1.0 0.66 0.26 0.27 0.44 0.67 0.64 0.72
0.29 0.32 1.0 0.66 0.46 0.54 0.64 0.71 0.63 0.65
0.07 0.06 1.0 0.6 0.12 0.12 0.37 0.26 0.4 0.35
0.22 0.21 1.0 0.77 0.39 0.43 0.52 0.56 0.53 0.58
0.25 0.24 1.0 0.75 0.45 0.43 0.53 0.59 0.62 0.61
0.21 0.23 1.0 0.88 0.38 0.37 0.64 0.61 0.65 0.55
0.18 0.18 1.0 0.68 0.44 0.47 0.6 0.52 0.6 0.51
0.13 0.13 1.0 0.42 0.3 0.3 0.57 0.6 0.58 0.6
0.22 0.23 1.0 0.47 0.47 0.43 0.66 0.63 0.58 0.56
0.13 0.16 1.0 0.54 0.35 0.41 0.51 0.45 0.56 0.58
0.15 0.14 1.0 0.55 0.42 0.41 0.48 0.59 0.64 0.7
0.31 0.35 1.0 0.79 0.3 0.37 0.6 0.58 0.64 0.61
0.42 0.58 1.0 0.67 0.43 0.56 0.63 0.76 0.76 0.7
0.27 0.27 1.0 0.72 0.4 0.37 0.48 0.56 0.66 0.73
0.08 0.09 1.0 0.52 0.11 0.09 0.59 0.4 0.45 0.44
0.24 0.28 1.0 0.83 0.46 0.45 0.53 0.66 0.64 0.69
0.01 0.01 1.0 0.57 0.05 0.06 0.53 0.46 0.44 0.39
0.27 0.32 1.0 0.76 0.32 0.39 0.74 0.72 0.69 0.53
0.1 0.12 1.0 0.45 0.06 0.04 0.18 0.52 0.47 0.71
0.2 0.2 1.0 0.44 0.18 0.25 0.32 0.55 0.53 0.64
0.3 0.25 1.0 0.59 0.42 0.45 0.61 0.71 0.73 0.8
0.14 0.14 1.0 0.64 0.26 0.25 0.39 0.46 0.46 0.37
0.11 0.14 1.0 0.34 0.26 0.28 0.31 0.47 0.59 0.42
0.04 0.02 1.0 0.38 0.11 0.11 0.28 0.33 0.45 0.49
0.26 0.29 1.0 0.95 0.45 0.38 0.55 0.62 0.59 0.65
0.02 0.06 1.0 0.76 0.17 0.13 0.34 0.49 0.44 0.4
0.29 0.31 1.0 0.63 0.5 0.43 0.57 0.57 0.67 0.56
0.01 0.02 1.0 0.6 0.26 0.21 0.31 0.42 0.49 0.4
0.06 0.07 1.0 0.4 0.26 0.26 0.39 0.44 0.38 0.41
0.32 0.33 1.0 1.0 0.52 0.47 0.6 0.73 0.65 0.72
0.0 0.0 1.0 0.19 0.04 0.02 0.29 0.45 0.44 0.36
0.0 0.0 1.0 0.64 0.01 0.01 0.56 0.4 0.46 0.28
0.0 0.0 1.0 0.56 0.09 0.11 0.45 0.4 0.37 0.33
0.0 0.0 1.0 0.61 0.12 0.1 0.36 0.39 0.32 0.32
0.14 0.14 1.0 0.44 0.22 0.21 0.36 0.42 0.46 0.42
0.22 0.25 1.0 0.87 0.42 0.38 0.65 0.75 0.73 0.52
0.33 0.36 1.0 0.81 0.55 0.52 0.63 0.61 0.61 0.53
0.22 0.23 1.0 0.73 0.31 0.33 0.66 0.65 0.71 0.54
0.3 0.3 1.0 0.86 0.43 0.42 0.6 0.71 0.71 0.72
0.2 0.19 1.0 0.93 0.47 0.4 0.52 0.55 0.54 0.66
0.37 0.4 1.0 0.69 0.51 0.55 0.8 0.8 0.79 0.62
0.29 0.3 1.0 0.65 0.54 0.44 0.61 0.64 0.63 0.6
0.01 0.01 1.0 0.51 0.05 0.05 0.23 0.31 0.33 0.23
0.22 0.19 1.0 0.7 0.32 0.31 0.56 0.56 0.65 0.68
0.03 0.03 1.0 0.3 0.13 0.09 0.25 0.43 0.43 0.69
0.1 0.08 1.0 0.34 0.23 0.26 0.27 0.44 0.46 0.4
0.03 0.03 1.0 0.45 0.21 0.27 0.38 0.49 0.47 0.68
0.25 0.26 1.0 0.7 0.42 0.39 0.62 0.85 0.78 0.85
0.36 0.43 1.0 0.87 0.54 0.55 0.58 0.64 0.72 0.63
0.27 0.25 1.0 0.49 0.28 0.24 0.34 0.4 0.43 0.54
0.01 0.01 1.0 0.22 0.08 0.11 0.26 0.37 0.34 0.36
0.37 0.52 1.0 0.75 0.39 0.36 0.65 0.68 0.71 0.72
0.0 0.0 1.0 0.4 0.25 0.18 0.33 0.67 0.4 0.38
0.03 0.03 1.0 0.42 0.18 0.22 0.48 0.68 0.58 0.55
0.01 0.0 1.0 0.38 0.18 0.23 0.39 0.59 0.61 0.68
0.24 0.27 1.0 0.61 0.4 0.42 0.58 0.55 0.7 0.61
0.09 0.06 1.0 0.42 0.28 0.23 0.25 0.29 0.5 0.54
0.41 0.38 1.0 0.69 0.41 0.38 0.52 0.57 0.63 0.56
0.4 0.38 1.0 0.78 0.48 0.48 0.57 0.63 0.68 0.7
0.2 0.21 1.0 0.8 0.44 0.43 0.48 0.6 0.6 0.69
0.24 0.27 1.0 0.9 0.44 0.47 0.76 0.81 0.66 0.66
0.22 0.24 1.0 0.59 0.42 0.39 0.43 0.55 0.6 0.73
0.06 0.07 1.0 0.28 0.06 0.06 0.32 0.21 0.34 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)