Heatmap: Cluster_60 (Setaria italica HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
cold stress 168h (Nie et al., 2022)
cold stress 24h (Nie et al., 2022)
cold stress 2h (Nie et al., 2022)
cold stress 0h (Nie et al., 2022)
light (Watson‐lazowski et al., 2020)
glacial (Watson‐lazowski et al., 2020)
control (Watson‐lazowski et al., 2020)
0.56 0.88 0.35 0.24 -1.28 -1.34 -1.24
1.04 0.32 0.38 0.57 -1.82 -1.67 -1.66
0.8 0.59 0.52 0.7 -2.1 -1.93 -2.34
1.19 0.62 0.23 0.5 -2.25 -2.52 -2.23
1.01 0.47 0.25 0.36 -1.24 -1.59 -1.42
1.0 0.31 0.05 0.96 -1.47 -2.71 -1.91
0.96 0.37 0.51 0.57 -1.94 -1.65 -1.85
1.21 0.36 0.02 0.47 -1.36 -1.93 -1.52
1.01 0.65 -0.0 0.52 -2.3 -1.69 -1.12
1.27 0.38 0.38 0.42 -2.14 -2.25 -2.26
0.73 0.07 0.39 0.7 -0.88 -1.42 -1.23
1.05 0.56 0.6 0.27 -1.72 -2.31 -2.12
0.49 0.46 0.03 0.88 -1.2 -1.27 -0.98
0.94 0.49 0.6 0.4 -1.74 -2.01 -1.82
0.84 0.64 0.37 0.44 -1.63 -1.43 -1.69
1.47 0.37 0.27 0.27 -2.27 -2.98 -2.47
1.01 0.66 0.6 0.36 -1.31 -3.15 -3.55
1.26 0.72 0.2 0.42 -2.65 -2.97 -2.43
1.15 0.06 0.46 0.65 -2.82 -1.61 -1.63
1.26 0.43 -0.03 0.41 -1.61 -2.16 -1.33
1.38 0.45 0.05 0.59 -2.72 -2.17 -3.11
0.94 0.54 0.03 0.33 -1.31 -1.03 -1.13
1.0 0.6 0.45 0.42 -1.82 -2.17 -1.85
1.12 0.5 0.32 0.47 -1.85 -1.89 -2.08
0.87 0.28 0.14 0.83 -1.37 -1.6 -1.52
0.86 0.35 0.35 0.42 -1.1 -1.45 -1.13
1.02 0.27 0.14 0.47 -1.24 -1.25 -1.17
1.03 0.68 0.35 0.44 -1.85 -2.49 -1.92
1.16 0.43 0.19 0.24 -1.84 -1.3 -1.3
0.96 0.65 0.27 0.33 -1.37 -1.85 -1.44
0.81 0.39 0.29 0.48 -1.19 -1.11 -1.27
0.88 0.48 0.07 0.34 -0.6 -1.34 -1.34
0.93 0.53 0.35 0.25 -1.24 -1.5 -1.28
0.82 0.44 0.38 0.55 -1.86 -1.52 -1.03
1.0 0.67 0.33 0.25 -1.6 -2.02 -1.38
0.67 0.55 0.58 0.48 -1.42 -1.59 -1.48
0.91 0.38 0.54 0.46 -1.61 -1.71 -1.5
1.03 0.68 0.6 0.37 -2.17 -2.96 -2.37
0.89 1.1 -0.11 0.32 -1.9 -1.95 -1.68
0.8 0.01 0.55 0.68 -1.13 -1.51 -1.4
0.61 0.46 0.19 0.57 -1.31 -1.01 -0.79
1.39 0.43 0.05 0.28 -1.84 -2.03 -1.93
0.88 0.34 0.2 0.59 -1.19 -1.48 -1.2
1.02 0.36 0.32 0.28 -1.44 -1.26 -1.2
0.97 0.68 0.06 0.43 -2.34 -1.26 -1.21
0.86 0.74 0.34 0.21 -1.38 -2.38 -0.97
1.14 0.6 0.28 0.18 -1.85 -1.45 -1.73
0.98 0.23 0.26 0.13 -0.59 -1.2 -1.1
0.8 -0.09 1.02 0.21 -1.06 -1.9 -1.38
0.75 0.61 0.21 0.48 -1.04 -1.53 -1.29
0.86 0.52 0.49 0.4 -1.57 -1.59 -1.49
0.65 0.62 0.49 0.39 -1.43 -1.3 -1.3
0.9 0.44 0.57 0.63 -2.17 -1.93 -1.94
0.81 0.34 0.45 0.21 -1.15 -1.11 -0.87
0.74 -0.08 0.42 0.48 -0.47 -1.2 -1.03
0.88 0.51 0.47 0.54 -1.74 -1.83 -1.7
0.91 0.39 -0.16 0.59 -0.84 -1.04 -1.46
1.21 0.48 0.57 0.09 -1.85 -1.95 -2.25
0.73 0.44 0.2 0.39 -0.85 -1.07 -1.04
1.07 0.25 0.4 0.44 -2.21 -1.18 -1.41
0.81 0.27 0.52 0.27 -1.09 -1.25 -0.97
0.66 0.57 0.28 0.57 -1.19 -1.36 -1.31
1.33 0.45 0.38 0.11 -1.66 -2.61 -1.91
0.95 0.54 0.59 0.28 -1.43 -1.87 -2.05
1.01 0.59 0.12 0.07 -1.25 -1.22 -1.01
1.14 0.57 0.02 0.31 -1.08 -1.63 -1.89
0.86 0.36 0.34 0.34 -2.01 -0.75 -0.92
1.21 0.41 0.36 0.69 -2.31 -2.92 -3.03
1.05 0.64 0.58 0.44 -2.56 -2.86 -2.25
0.81 0.64 0.41 0.41 -1.68 -1.47 -1.46
0.86 0.79 0.32 0.31 -1.45 -1.67 -1.81
1.04 0.46 0.39 0.56 -1.61 -2.42 -1.96
0.83 0.62 0.67 0.42 -2.02 -2.06 -1.91
1.34 0.46 0.39 0.17 -1.66 -2.54 -2.44
1.07 0.42 0.3 0.26 -1.2 -1.47 -1.56
1.05 0.65 0.28 0.75 -3.09 -2.62 -2.45
1.03 0.56 0.04 0.35 -1.74 -1.08 -1.3
0.91 0.43 0.29 0.49 -1.38 -1.67 -1.2
1.22 0.47 0.27 0.38 -2.36 -1.77 -1.79
1.23 0.24 0.15 0.77 -3.06 -1.94 -1.88
1.57 0.27 0.03 0.2 -2.09 -2.35 -2.2
1.29 0.43 0.28 0.54 -2.52 -2.35 -2.56
1.11 0.41 0.3 0.66 -2.01 -2.36 -1.93
0.76 0.4 0.51 0.31 -1.2 -0.98 -1.39
1.45 0.25 0.09 0.32 -2.19 -1.79 -1.98
1.24 0.43 0.31 0.5 -2.21 -2.36 -2.14
1.15 0.37 0.45 0.7 -2.58 -3.02 -2.31
0.83 -0.08 0.29 0.51 -1.05 -0.72 -0.9
0.82 0.42 0.47 0.58 -1.53 -1.74 -1.41
1.25 0.31 0.05 0.31 -1.27 -1.62 -1.42
1.04 0.41 0.73 0.31 -1.94 -2.53 -1.79
0.74 0.66 0.35 0.52 -1.28 -1.89 -1.51
0.87 0.77 0.18 0.41 -1.27 -1.66 -1.88
1.18 0.61 0.21 0.51 -2.42 -2.32 -2.08
0.88 0.67 0.1 0.72 -1.89 -2.07 -1.53
1.07 0.35 0.31 0.36 -1.62 -1.32 -1.43
0.87 0.32 0.19 0.61 -1.07 -1.47 -1.27
1.07 0.34 0.36 0.43 -1.56 -2.02 -1.26
1.06 0.4 -0.06 0.42 -1.28 -1.24 -1.15
1.04 0.58 0.52 0.04 -1.39 -2.01 -1.49
1.15 0.61 0.16 0.31 -2.2 -1.39 -1.75
1.2 0.53 -0.04 0.53 -2.56 -1.36 -1.86
0.96 0.65 0.19 0.2 -1.18 -1.64 -1.21
0.75 0.7 0.27 0.66 -1.04 -2.44 -2.05
1.24 0.51 -0.01 0.39 -1.91 -1.78 -1.48
1.0 0.43 0.57 0.3 -1.57 -1.49 -2.11
1.12 0.31 0.29 0.3 -1.44 -1.35 -1.44
0.74 0.42 0.45 0.65 -1.04 -1.67 -1.98
0.84 0.31 -0.05 0.35 -0.93 -0.67 -0.78
0.76 0.53 0.31 0.61 -1.47 -1.84 -1.12
1.38 0.51 -0.08 0.29 -2.11 -1.75 -1.89
0.98 0.43 0.37 0.35 -1.34 -1.41 -1.58
0.98 0.58 0.32 0.31 -1.77 -1.51 -1.33
0.9 0.31 0.07 0.56 -1.01 -1.41 -0.99
1.05 0.3 0.47 0.47 -1.99 -1.78 -1.36
0.79 0.62 0.41 0.41 -1.6 -1.79 -1.17
0.91 0.53 0.05 0.72 -1.85 -1.67 -1.33
0.66 0.69 0.56 0.38 -1.59 -1.73 -1.36
1.12 0.46 0.26 0.18 -1.03 -1.64 -1.74
0.93 0.02 0.41 0.74 -1.41 -1.29 -1.72
0.88 0.71 0.55 0.62 -2.53 -2.46 -2.65
1.22 0.53 0.05 0.5 -1.57 -2.39 -1.97
1.24 0.5 0.42 0.21 -1.99 -2.13 -1.97
1.04 0.36 0.22 0.29 -1.13 -1.3 -1.28
0.91 0.27 0.36 0.46 -1.35 -1.27 -1.16
1.24 0.47 0.34 0.24 -1.76 -2.06 -1.94
0.97 0.71 0.28 0.37 -1.44 -2.23 -1.68
0.99 0.5 0.37 0.59 -1.79 -2.0 -1.88
1.02 0.68 -0.17 0.54 -1.38 -1.47 -1.83
0.77 0.22 0.27 0.49 -1.04 -1.11 -0.79
0.85 0.41 0.57 0.4 -1.51 -1.38 -1.58
0.75 0.42 0.25 0.61 -0.98 -1.47 -1.32
1.0 0.39 0.62 0.3 -1.56 -2.11 -1.53
0.9 0.36 0.31 0.37 -0.79 -1.66 -1.21
0.72 0.32 0.07 0.3 -0.93 -0.75 -0.5
0.94 0.38 0.45 0.71 -2.37 -1.7 -1.84
1.02 0.57 0.44 0.41 -1.9 -1.79 -2.04
1.18 -0.13 0.66 0.62 -1.69 -2.1 -2.7
0.87 0.6 0.25 0.15 -0.87 -1.3 -1.31
0.74 0.62 0.28 0.37 -0.92 -1.52 -1.33
0.96 0.12 0.2 0.64 -0.83 -1.54 -1.48
0.78 0.52 0.13 0.21 -0.91 -1.01 -0.81
1.05 0.16 0.33 0.49 -1.58 -1.58 -1.06
1.17 0.61 -0.3 0.67 -2.09 -2.23 -1.39
0.76 0.57 0.36 0.4 -1.28 -1.34 -1.3
1.09 0.61 0.33 0.4 -1.61 -2.31 -2.04
0.99 0.58 0.56 0.36 -1.84 -2.31 -1.85
1.19 0.29 0.25 0.09 -0.91 -1.51 -1.48
1.25 0.3 0.62 0.47 -2.86 -2.98 -2.28
1.03 0.55 0.38 0.36 -1.58 -1.89 -1.71
1.05 0.07 0.91 0.41 -2.24 -1.98 -2.24
0.87 0.68 0.21 0.33 -1.1 -1.75 -1.36
0.81 0.49 0.2 0.32 -1.56 -1.13 -0.61
0.7 0.63 0.52 0.39 -1.33 -1.87 -1.28
1.35 0.13 0.42 0.67 -2.35 -3.63 -2.75
0.75 0.53 0.22 0.42 -1.2 -1.17 -1.0
0.82 0.5 0.53 0.58 -1.8 -2.13 -1.48
0.97 0.74 0.46 0.19 -1.74 -1.83 -1.9
0.64 0.58 0.2 0.49 -1.3 -1.23 -0.82
1.31 0.41 -0.09 0.21 -1.67 -1.48 -1.23
0.89 0.7 0.43 0.55 -2.31 -2.2 -1.78
1.09 0.54 0.24 0.49 -2.04 -1.86 -1.73
1.22 0.29 0.23 0.14 -1.05 -1.56 -1.52
1.17 0.45 -0.15 0.29 -0.91 -1.45 -1.45
1.06 0.44 0.2 0.25 -1.17 -1.45 -1.26
0.83 0.32 0.66 0.77 -2.12 -1.63 -2.71
0.84 0.67 0.37 0.51 -1.51 -1.84 -1.87
1.08 0.66 0.47 0.45 -2.23 -2.62 -2.49
1.06 0.4 0.36 0.35 -1.54 -1.65 -1.43
1.23 0.25 0.32 0.17 -1.03 -1.75 -1.74
0.88 0.61 0.24 0.5 -1.76 -1.67 -1.24
1.0 0.2 -0.01 0.34 -0.8 -1.09 -0.88
1.26 0.4 0.27 0.39 -2.02 -2.09 -1.78
1.1 0.75 0.06 0.24 -1.81 -1.57 -1.55
1.16 0.4 0.45 0.23 -1.82 -1.95 -1.46
1.22 0.42 0.4 0.55 -2.38 -2.62 -2.27
0.83 0.51 0.46 0.55 -1.26 -2.0 -1.82
1.1 0.52 0.32 0.43 -2.04 -1.74 -1.82
0.7 0.75 0.63 0.37 -1.69 -1.94 -1.81
0.82 0.47 0.56 0.46 -1.51 -1.75 -1.51
0.8 0.41 0.23 0.48 -1.1 -1.16 -1.15
1.1 0.34 -0.2 0.46 -1.03 -1.38 -1.08
0.81 0.64 0.32 0.68 -1.74 -2.0 -1.8
0.73 0.14 0.51 0.56 -0.96 -1.32 -1.23
0.98 0.34 0.25 0.49 -1.65 -1.23 -1.23
0.87 0.6 0.31 0.48 -1.33 -1.78 -1.59
0.97 0.56 0.25 0.48 -1.35 -1.63 -1.85
0.49 0.84 0.28 0.45 -1.4 -1.02 -1.52
0.69 0.75 0.65 0.11 -1.21 -2.0 -1.39
1.31 0.67 0.01 0.26 -2.1 -2.06 -1.9
0.94 0.59 0.23 0.3 -1.42 -1.4 -1.28
1.1 0.64 -0.36 0.48 -1.41 -1.51 -1.33
1.28 0.25 -0.03 0.39 -1.41 -1.52 -1.47
1.18 0.67 0.29 0.32 -2.05 -2.15 -2.25
0.97 0.77 0.15 0.16 -1.28 -1.77 -1.3
1.18 0.45 0.42 0.41 -2.34 -1.99 -1.95
1.13 0.65 0.15 0.36 -1.53 -2.06 -1.98
0.9 -0.03 0.03 0.26 -0.62 -0.74 -0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.