Heatmap: Cluster_24 (Setaria italica HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
cold stress 168h (Nie et al., 2022)
cold stress 24h (Nie et al., 2022)
cold stress 2h (Nie et al., 2022)
cold stress 0h (Nie et al., 2022)
light (Watson‐lazowski et al., 2020)
glacial (Watson‐lazowski et al., 2020)
control (Watson‐lazowski et al., 2020)
1.0 0.68 0.21 0.2 0.07 0.04 0.05
1.0 0.63 0.19 0.26 0.15 0.16 0.12
1.0 0.49 0.13 0.13 0.08 0.08 0.14
1.0 0.59 0.18 0.23 0.01 0.07 0.06
1.0 0.39 0.19 0.21 0.05 0.14 0.07
1.0 0.54 0.11 0.12 0.03 0.03 0.03
1.0 0.32 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01
1.0 0.43 0.18 0.28 0.16 0.14 0.12
1.0 0.57 0.15 0.15 0.03 0.02 0.01
1.0 0.63 0.24 0.21 0.04 0.04 0.05
1.0 0.41 0.16 0.09 0.01 0.01 0.01
1.0 0.66 0.09 0.04 0.05 0.0 0.01
1.0 0.55 0.14 0.31 0.03 0.09 0.06
1.0 0.47 0.13 0.11 0.02 0.03 0.03
1.0 0.49 0.1 0.12 0.05 0.04 0.04
1.0 0.45 0.05 0.09 0.02 0.03 0.06
1.0 0.4 0.14 0.26 0.13 0.13 0.12
1.0 0.47 0.05 0.06 0.03 0.03 0.04
1.0 0.82 0.22 0.07 0.02 0.01 0.02
1.0 0.31 0.26 0.15 0.23 0.11 0.04
1.0 0.48 0.03 0.03 0.07 0.04 0.06
1.0 0.33 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.82 0.13 0.04 0.04 0.01 0.03
1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.37 0.26 0.21 0.03 0.02 0.02
1.0 0.49 0.25 0.16 0.05 0.06 0.04
1.0 0.24 0.16 0.07 0.03 0.03 0.01
1.0 0.57 0.15 0.12 0.05 0.05 0.04
1.0 0.47 0.23 0.28 0.11 0.05 0.07
1.0 0.29 0.07 0.05 0.0 0.0 0.01
1.0 0.36 0.17 0.1 0.03 0.03 0.05
1.0 0.59 0.22 0.33 0.17 0.14 0.18
1.0 0.38 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0
1.0 0.33 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0
1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.58 0.14 0.16 0.08 0.07 0.06
1.0 0.29 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0
1.0 0.53 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
1.0 0.6 0.26 0.35 0.16 0.15 0.15
1.0 0.5 0.11 0.28 0.13 0.11 0.1
1.0 0.65 0.15 0.2 0.1 0.04 0.05
1.0 0.3 0.05 0.12 0.12 0.07 0.09
1.0 0.45 0.04 0.17 0.02 0.0 0.02
1.0 0.56 0.16 0.35 0.2 0.16 0.13
1.0 0.31 0.09 0.13 0.05 0.05 0.04
1.0 0.51 0.09 0.11 0.1 0.02 0.08
1.0 0.35 0.03 0.17 0.07 0.03 0.04
1.0 0.31 0.11 0.08 0.02 0.06 0.06
1.0 0.49 0.17 0.38 0.2 0.15 0.16
1.0 0.49 0.06 0.1 0.05 0.03 0.04
1.0 0.55 0.33 0.22 0.16 0.13 0.11
1.0 0.31 0.12 0.1 0.02 0.02 0.04
1.0 0.41 0.12 0.09 0.0 0.0 0.02
1.0 0.4 0.08 0.2 0.04 0.03 0.04
1.0 0.43 0.26 0.1 0.01 0.02 0.02
1.0 0.39 0.05 0.1 0.04 0.03 0.04
1.0 0.61 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.41 0.12 0.11 0.02 0.01 0.01
1.0 0.66 0.17 0.21 0.05 0.04 0.04
1.0 0.4 0.15 0.22 0.07 0.06 0.07
1.0 0.55 0.1 0.11 0.1 0.05 0.08
1.0 0.29 0.16 0.07 0.01 0.01 0.0
1.0 0.29 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.53 0.08 0.05 0.02 0.01 0.0
1.0 0.52 0.24 0.19 0.05 0.05 0.04
1.0 0.63 0.17 0.3 0.0 0.04 0.07
1.0 0.39 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01
1.0 0.62 0.28 0.31 0.08 0.16 0.19
1.0 0.49 0.21 0.01 0.01 0.01 0.0
1.0 0.31 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0
1.0 0.17 0.18 0.16 0.0 0.01 0.02
1.0 0.34 0.02 0.17 0.06 0.0 0.0
1.0 0.73 0.08 0.09 0.08 0.08 0.07
1.0 0.38 0.0 0.07 0.08 0.02 0.01
1.0 0.38 0.11 0.2 0.07 0.05 0.09
1.0 0.59 0.13 0.11 0.04 0.04 0.02
1.0 0.6 0.09 0.14 0.02 0.03 0.02
1.0 0.43 0.16 0.27 0.14 0.12 0.11
1.0 0.64 0.2 0.18 0.05 0.04 0.04
1.0 0.33 0.07 0.11 0.06 0.02 0.0
1.0 0.4 0.22 0.2 0.02 0.03 0.03
1.0 0.42 0.34 0.28 0.06 0.06 0.06
1.0 0.48 0.28 0.21 0.02 0.02 0.02
1.0 0.34 0.11 0.07 0.04 0.04 0.1
1.0 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.3 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01
1.0 0.4 0.11 0.14 0.05 0.04 0.04
1.0 0.54 0.15 0.21 0.03 0.04 0.03
1.0 0.28 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01
1.0 0.5 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.37 0.13 0.16 0.05 0.05 0.08
1.0 0.43 0.07 0.06 0.01 0.02 0.02
1.0 0.36 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01
1.0 0.48 0.1 0.23 0.16 0.13 0.13
1.0 0.5 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0
1.0 0.35 0.01 0.12 0.01 0.03 0.04
1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.13 0.16 0.03 0.03 0.04
1.0 0.3 0.03 0.09 0.06 0.06 0.04
1.0 0.67 0.11 0.06 0.02 0.05 0.02
1.0 0.68 0.03 0.08 0.03 0.02 0.02
1.0 0.6 0.09 0.14 0.05 0.05 0.08
1.0 0.45 0.19 0.2 0.03 0.03 0.04
1.0 0.64 0.26 0.27 0.08 0.04 0.05
1.0 0.32 0.05 0.03 0.03 0.02 0.03
1.0 0.43 0.11 0.26 0.11 0.1 0.11
1.0 0.36 0.09 0.11 0.05 0.0 0.0
1.0 0.59 0.08 0.13 0.07 0.1 0.14
1.0 0.39 0.09 0.14 0.1 0.05 0.06
1.0 0.49 0.17 0.16 0.07 0.03 0.04
1.0 0.24 0.12 0.04 0.04 0.08 0.05
1.0 0.72 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.56 0.13 0.2 0.1 0.11 0.14
1.0 0.55 0.13 0.35 0.12 0.11 0.17
1.0 0.42 0.26 0.21 0.05 0.06 0.06
1.0 0.85 0.26 0.23 0.12 0.11 0.1
1.0 0.64 0.29 0.31 0.07 0.08 0.09
1.0 0.36 0.09 0.21 0.12 0.09 0.09
1.0 0.41 0.3 0.27 0.11 0.17 0.12
1.0 0.73 0.12 0.17 0.05 0.05 0.03
1.0 0.71 0.24 0.08 0.02 0.07 0.08
1.0 0.41 0.06 0.06 0.01 0.03 0.01
1.0 0.49 0.26 0.22 0.06 0.2 0.07
1.0 0.83 0.31 0.32 0.22 0.27 0.26
1.0 0.99 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01
1.0 0.43 0.15 0.24 0.16 0.13 0.15
1.0 0.33 0.23 0.3 0.15 0.12 0.1
1.0 0.39 0.1 0.08 0.05 0.09 0.04
1.0 0.37 0.08 0.15 0.03 0.02 0.02
1.0 0.54 0.19 0.26 0.12 0.08 0.08
1.0 0.34 0.08 0.11 0.03 0.06 0.03
1.0 0.42 0.07 0.02 0.01 0.03 0.01
1.0 0.43 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
1.0 0.48 0.09 0.11 0.02 0.02 0.01
1.0 0.45 0.11 0.26 0.17 0.12 0.13
1.0 0.52 0.21 0.12 0.03 0.04 0.03
1.0 0.31 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01
1.0 0.52 0.19 0.32 0.2 0.13 0.15
1.0 0.53 0.22 0.15 0.14 0.13 0.14
1.0 0.37 0.22 0.23 0.14 0.09 0.08
1.0 0.56 0.23 0.26 0.03 0.06 0.04
1.0 0.63 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0
1.0 0.45 0.15 0.16 0.13 0.12 0.13
1.0 0.36 0.17 0.07 0.0 0.0 0.01
1.0 0.48 0.35 0.31 0.08 0.09 0.09
1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
1.0 0.65 0.17 0.16 0.03 0.03 0.03
1.0 0.53 0.22 0.17 0.04 0.04 0.05
1.0 0.43 0.17 0.09 0.01 0.01 0.01
1.0 0.65 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.61 0.05 0.07 0.03 0.06 0.02
1.0 0.41 0.2 0.05 0.01 0.01 0.01
1.0 0.4 0.06 0.19 0.04 0.05 0.01
1.0 0.34 0.04 0.1 0.07 0.09 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)