1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_5 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.52 12.64 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.62 0.0
0.77 16.61 0.0 0.0 0.21 0.0 0.02 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 9.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 116.94 103.75 48.48 115.07
13.31 553.11 0.24 0.94 0.47 1.27 0.35 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.09 0.0 0.18
0.05 2.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 11.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0
0.02 65.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.17 0.28 0.0 0.0 0.8 0.44 0.0 0.86
0.19 66.24 0.04 0.0 0.28 0.11 0.09 3.47 0.6 0.46 0.06 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0
0.24 54.62 0.08 0.05 0.34 0.18 0.6 1.54 0.06 0.27 0.46 0.11 0.87 0.07 0.14 0.17
0.04 13.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.14 0.29 0.0 0.05 0.0 0.06 0.46 0.0
0.09 12.34 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0
0.13 8.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 20.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 85.64 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.45 0.38 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.74 50.94 0.57 0.2 0.3 0.11 0.2 0.0 0.44 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09
18.73 611.86 0.0 0.21 0.0 0.0 0.16 0.03 0.0 0.0 0.28 0.13 7.29 8.01 8.73 9.31
0.08 5.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 5.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 28.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.95 0.0
0.36 10.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11 2.38 0.72 0.8
0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.14 0.0
0.25 41.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 2.55 0.0
0.03 2.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 9.3 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 86.29 0.29 0.0 0.11 0.0 1.91 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.07 7.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 33.53 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.21 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.4 962.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21.68 0.0 0.0
0.93 18.92 0.03 0.0 0.07 0.19 0.02 0.01 0.0 0.0 0.05 0.05 0.16 0.06 0.0 0.0
1.41 152.68 0.24 0.0 0.18 0.4 0.31 0.09 0.12 0.26 0.0 0.0 1.21 0.14 0.0 0.0
0.0 8.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 393.96 0.22 0.47 0.0 0.0 5.43 5.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 14.11 0.0 0.0 0.16 0.0 0.09 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.63 1.59 0.25
0.14 7.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 5.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
1.62 46.51 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.3 0.28
0.06 3.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.39 0.39 0.27 3.44
0.51 17.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.67 285.77 1.96 2.31 1.43 2.15 3.16 7.98 11.68 5.15 0.59 0.6 0.0 0.16 0.0 0.97
0.03 46.12 0.19 0.0 0.0 0.0 0.03 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.7 0.0
0.18 13.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.61 0.0
10.46 2742.99 66.98 56.65 64.89 26.6 19.1 152.34 45.74 109.93 13.34 59.19 19.42 14.21 15.05 32.64
0.0 2.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.01 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.13 27.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.44 0.0
0.0 4.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 30.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.99 0.0 1.8
0.0 4.9 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.16 0.08
0.08 15.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.05 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0
0.1 13.58 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.3 24.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.72 0.48 0.0 0.0 0.0 1.14 1.6 1.12 1.05
0.02 6.34 0.15 0.08 0.04 0.04 0.09 0.24 0.0 0.0 0.06 0.0 0.14 0.06 0.0 0.0
0.11 58.49 0.0 0.0 0.03 0.05 0.15 0.5 0.14 0.0 0.15 0.17 14.53 2.73 0.18 5.19
0.01 99.5 0.09 0.34 0.0 0.04 0.14 0.01 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.04 0.33 0.0
4.85 294.99 0.0 0.0 0.66 0.45 0.43 13.12 1.85 1.56 1.6 2.29 3.42 3.6 0.56 6.53
0.19 19.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.93 0.65 0.45 0.0 0.07 0.0 0.76 0.35 0.0
0.28 11.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.28 0.39 0.54 0.0
13.81 1285.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 6.48 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.13 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.32 51.31 0.07 0.43 0.0 0.2 0.13 1.05 1.03 0.43 0.22 0.21 2.31 2.88 0.5 1.88
0.11 5.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.57 44.84 0.51 0.22 0.0 0.11 0.54 2.67 0.86 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
27.43 2219.98 56.85 105.76 38.21 51.56 54.69 84.75 108.53 109.77 30.07 56.17 16.59 17.13 13.87 18.56
0.03 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.14 0.59 1.65
0.0 161.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.04 0.0
0.08 6.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 8.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0
0.0 17.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.61 0.0
0.24 19.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
0.1 17.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.22 0.0 0.14
0.07 4.22 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0
0.05 16.38 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 17.25 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 6.43 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.0 10.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 42.6 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.74 1035.07 1.47 5.5 2.64 2.13 1.74 0.0 3.44 0.82 0.28 1.7 0.0 0.0 0.64 0.89
0.13 30.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 0.07 0.0 0.0 92.73 48.82 2.3 54.82
1.09 47.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0
0.05 27.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.07 0.31 0.0
0.33 640.42 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0
0.12 5.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
0.15 17.92 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.4 0.0
0.0 2.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 13.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 24.93 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 103.57 0.0 0.13 0.0 0.0 0.69 1.37 0.75 0.78 0.48 0.0 1.32 1.32 0.37 1.55
0.0 6.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 3.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0
0.0 13.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.01 118.6 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24 1.07 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
14.88 5644.16 1.28 1.65 1.5 2.74 7.62 98.49 29.15 10.9 7.35 5.48 18.24 15.66 9.51 20.16
1.15 54.32 0.0 0.0 0.3 0.27 1.05 0.45 0.21 0.22 0.0 0.1 0.52 0.24 0.0 0.96
0.0 20.9 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 12.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 6.46 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21
0.0 19.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.6 13.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 3.69
0.0 5.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 2.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0
7.48 185.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.55 0.0
236.13 6489.61 12.29 1.96 11.84 1.65 0.07 15.72 17.61 120.51 74.47 24.4 1.12 1.36 0.44 2.05
0.08 4.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.13 685.42 0.75 1.02 0.06 0.23 0.04 8.49 0.35 0.09 0.0 0.0 46.34 41.34 27.24 48.1
0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.7 0.42 0.99
2.21 88.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 4.99 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.3 0.36 0.33
0.81 23.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0
1.27 136.17 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.41 0.0 0.0 0.75
0.0 126.78 0.37 1.58 0.16 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 983.5 0.61 0.45 0.06 0.25 0.06 3.23 1.89 0.39 0.0 0.0 0.76 0.0 0.75 0.0
0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
0.0 3.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 11.99 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 521.51 0.29 0.28 2.2 0.21 0.04 0.39 9.03 6.15 0.1 3.73 0.23 0.11 4.57 0.46
0.1 2.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.0
0.0 5.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 1275.02 2.16 3.26 0.37 2.69 0.24 14.31 0.0 0.0 0.2 0.31 0.48 0.81 0.63 0.0
0.02 5.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 7.98 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.22 33.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.76 0.0 0.0 0.0
2.2 129.17 0.58 0.49 0.16 0.43 0.86 3.59 0.95 1.06 0.39 0.22 0.0 0.77 1.08 0.34
0.23 6.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.8 0.0
0.0 41.37 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 1.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)