1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_98 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.99 -5.79 -4.45 - - - -6.87 - - - - - - - -
- 4.0 - - - - -6.26 - - - - - - - - -
-6.3 3.99 -6.08 - -7.95 -5.31 - - -7.51 - - - - -6.27 - -
- 3.93 - - - - - - - - - - -2.34 -2.44 -1.37 -
-4.88 3.99 -8.16 - - -9.2 - -6.72 - - - - -7.25 -7.34 -6.27 -5.37
-6.32 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-4.41 3.98 - - - -4.87 - - - - - - - -4.61 -3.53 -
-4.43 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - -4.31 - - -
-8.86 4.0 - - - - - -11.58 -5.31 - - - - - - -
- 4.0 -8.88 - - -9.91 - -9.53 -9.31 - - - -7.97 - - -
-5.95 4.0 -7.17 - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.99 - - - -3.15 - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-6.8 4.0 - - - - - - - - - - - -5.13 - -
-7.8 4.0 -8.82 - - - - - - - -9.72 -8.82 - -9.59 -7.52 -
-5.33 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-5.92 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-8.79 4.0 -11.69 -12.53 -9.38 -14.89 - -11.36 - - - -12.7 -12.95 - -11.98 -
-7.53 4.0 - - - - - - - - - - - - -6.76 -
- 3.99 - - - -3.87 - - - - - - - -4.01 - -
-3.85 3.98 - - - -6.48 - -6.86 - - - - - -3.68 - -3.7
-7.0 4.0 - -11.66 - - - - - - - - - -11.79 -10.72 -
-4.78 3.96 -4.77 -4.6 -6.08 -3.97 -5.52 -5.83 -5.46 -6.4 -6.04 -7.47 -5.11 -5.61 -5.76 -4.93
-6.09 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.9 - - - - - - - - - - -1.53 - -0.55 -
-8.07 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-8.23 3.74 -8.41 - - - - - - - - - -0.85 -0.16 -0.16 -1.66
- 3.99 -7.73 -8.99 -6.6 -7.77 - - - - - - -5.82 -5.17 -4.84 -6.52
-8.36 3.99 - -6.21 - - - -8.62 -5.38 -6.91 - - -5.63 - - -
- 4.0 - - - -7.45 - - - - - - - - - -
- 3.98 - - - - - - - - - - - - -1.89 -
-4.34 3.98 -5.51 - -6.39 -6.54 -4.86 -5.86 -4.93 - - - - - - -
-5.78 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.96 - - - - - - - - - - - - -1.36 -
- 3.99 - - - - - - - - - - - -3.95 - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-4.98 3.99 - - - -5.25 - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - -5.95 - - - -4.72 - - - -
-7.73 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-4.09 3.99 -8.86 -9.53 -8.73 -9.9 - -9.05 - - - - - - -5.97 -8.07
-5.88 3.92 - - - - - -8.69 - - - - -1.79 -2.21 -3.13 -2.23
- 3.93 - - - - - - - - - - -2.55 -3.06 -0.99 -
- 4.0 - - - -4.68 - -6.3 - - - - - - - -
- 3.9 - - - - - - - - - - - - 0.07 -
- 3.34 - - - - - - - - - - 1.84 -2.06 1.01 -
- 3.92 - - - - - - - - - - -3.19 -1.12 -2.22 -3.32
-6.92 4.0 - -7.62 - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - -5.21 - - - - - - -
- 4.0 -7.57 - -7.45 - - - - - - - - -8.34 - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - -5.63 - -
- 3.71 - - - - - - - - - - - - 1.54 -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - -5.84 -
-6.93 4.0 -7.14 - - - - - - - - -6.58 - - - -
-7.55 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-7.28 4.0 - - - - - - - - - - - - -5.44 -
-5.65 4.0 - - - - - -9.4 -5.07 - - - - - - -
- 3.99 - -7.08 -6.27 -5.13 - - - - - - - -6.59 -4.52 -
- 3.99 - - - - - - - - - - - - -2.97 -
- 3.99 - -5.98 - -5.35 - - - -5.68 - - - - -3.43 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.