1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_24 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
17.79 4.91 20.12 18.1 13.31 12.08 12.82 8.29 4.08 5.62 15.87 10.0 12.15 8.05 9.41 11.91
0.0 0.0 0.24 0.73 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 0.72 4.29 5.19 1.63 1.16 0.25 0.31 0.2 0.53 1.23 0.53 1.22 1.82 1.37 3.16
7.89 4.99 2.47 3.19 1.33 1.38 3.46 2.01 0.83 0.79 1.43 0.56 6.59 5.59 1.5 6.36
61.73 42.57 46.06 57.21 48.68 41.67 40.11 33.52 51.98 60.8 58.15 40.61 36.85 25.36 21.76 37.46
0.0 0.21 0.33 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.23 0.0 0.23
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.21 2.47 2.79 4.3 1.38 3.42 1.71 2.91 3.12 3.06 1.09 1.24 3.05 2.17 2.0 5.81
0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
41.19 14.34 15.54 22.15 7.15 13.38 17.91 14.21 9.54 7.92 10.29 7.45 30.42 32.53 18.47 40.53
0.48 0.25 0.04 0.05 0.0 0.0 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.19 0.0 0.0
0.1 0.16 0.27 0.22 0.1 0.12 0.38 0.1 0.08 0.0 0.19 0.04 1.26 0.15 0.53 0.53
21.83 2.43 40.09 6.08 11.07 2.12 2.53 13.17 14.15 1.09 4.06 14.38 0.0 0.26 0.18 0.08
0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.35 0.29 0.14
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0
13.61 2.22 5.79 5.39 3.7 2.57 4.53 2.04 0.95 0.0 0.85 4.71 3.47 3.79 2.27 10.27
0.28 0.24 3.72 5.88 1.84 1.98 2.3 2.81 1.85 1.01 1.63 1.5 5.76 4.03 2.1 4.16
87.82 51.38 52.39 39.01 33.78 28.61 40.44 28.1 60.08 43.82 51.41 55.71 46.54 47.75 38.84 51.08
0.38 0.0 0.21 1.06 0.34 0.31 0.0 0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
15.49 4.41 6.89 9.8 4.8 3.16 5.68 6.82 4.52 4.23 2.52 2.32 4.72 2.77 1.46 4.6
168.17 66.6 87.55 49.58 27.82 26.44 46.78 38.5 27.19 54.85 53.2 107.42 45.12 38.07 38.28 87.6
51.23 28.03 28.31 31.19 13.66 14.82 10.45 13.07 2.33 0.61 4.17 6.34 13.31 9.43 10.96 17.4
0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.39 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
309.56 87.03 238.54 289.45 139.12 118.24 138.87 90.56 88.75 90.83 107.1 94.1 83.92 69.11 63.45 114.7
0.04 0.0 0.34 1.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.29 3.59 6.02 4.05 0.61 1.73 0.7 0.26 0.11 0.0 0.94 0.33 0.14 0.13 0.0 0.0
19.88 3.89 11.32 11.4 3.87 2.03 1.79 8.28 1.66 0.64 0.18 0.24 0.19 0.09 0.49 0.0
49.11 50.45 78.0 87.58 55.74 63.64 64.23 46.17 55.85 45.13 67.58 53.12 57.04 48.85 29.2 59.04
0.15 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 4.84 8.5 9.23 2.48
0.03 0.0 0.13 0.24 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.35 0.06 0.62 1.96 0.23 0.39 0.01 0.02 1.21 0.02 0.04 1.38 1.95 1.09 1.5 2.57
10.83 2.46 5.97 4.3 0.72 1.35 3.33 0.27 4.77 3.18 2.4 3.03 42.35 53.57 65.62 25.71
0.03 0.05 0.0 0.28 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0
5.7 8.2 17.14 14.13 5.69 5.15 6.73 5.59 0.46 0.38 7.78 8.08 10.72 7.37 5.21 8.96
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.15
0.4 0.0 0.84 1.07 0.3 0.55 0.0 0.0 0.14 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
3.69 1.85 4.08 5.66 3.61 2.95 1.48 0.22 8.18 4.84 0.5 0.21 0.0 0.04 0.17 0.16
19.11 7.48 5.91 7.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
22.09 0.0 22.94 26.05 21.94 10.97 0.75 0.09 0.12 0.0 0.48 1.04 0.41 1.35 0.2 1.32
1.39 1.95 3.44 2.2 1.17 0.93 0.39 0.09 0.24 0.25 1.55 0.72 1.16 3.25 9.11 0.0
0.11 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
27.38 12.91 22.94 33.53 13.29 10.0 12.21 8.02 11.1 8.16 9.15 8.2 29.99 25.23 15.58 23.11
0.07 0.12 4.28 3.92 1.6 3.04 0.33 0.6 0.88 1.56 0.85 0.52 0.66 0.41 37.16 1.61
29.61 17.24 25.49 38.52 28.79 25.84 20.19 15.88 44.91 41.39 26.25 19.62 20.02 17.42 16.26 23.83
1.19 0.12 0.19 0.32 0.07 0.49 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 6.56 7.35 1.57 4.76 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.57 18.22 163.68 27.79
0.11 0.0 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24.9 0.89
33.77 25.62 64.74 74.38 50.13 37.24 38.37 21.22 14.38 4.65 41.19 33.6 47.23 45.05 27.55 35.65
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.22 0.46 0.0
0.21 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.3 0.0 0.0
0.0 0.03 0.22 0.47 0.15 0.11 0.0 0.05 0.17 0.22 0.0 0.0 0.0 0.13 0.28 0.38
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 2.29
0.09 0.02 0.15 0.12 0.01 0.03 0.04 0.01 0.1 0.06 0.0 0.0 0.3 0.09 0.11 0.32
0.86 0.0 0.0 1.15 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0
9.41 1.83 7.69 8.79 3.2 1.9 0.0 0.0 0.0 0.06 0.31 0.3 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.05 0.28 0.19 0.0 0.0 0.06 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.68 0.08 0.23 0.23 0.07 0.08 0.16 0.09 0.11 0.04 0.27 0.23 0.92 0.47 0.64 0.37
1.61 1.08 1.62 5.22 1.3 0.41 0.5 0.3 0.31 0.97 0.34 0.31 4.49 1.42 13.24 2.74
11.63 2.06 6.88 8.57 5.69 1.13 1.16 0.68 0.18 0.29 0.41 0.86 6.06 4.54 5.13 3.71
0.0 0.0 0.19 0.08 0.0 0.12 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.23 0.11 0.0 0.0
0.03 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
62.75 42.86 110.89 120.15 49.41 37.88 60.74 36.48 8.44 7.14 60.86 52.57 18.19 12.68 14.25 17.02
0.0 0.19 0.09 0.39 0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
1.05 0.08 0.74 0.96 0.72 0.74 0.07 0.15 0.0 0.12 0.24 0.0 0.51 0.0 0.55 0.0
0.0 0.0 0.12 0.55 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.77 5.95 89.77 110.61 40.18 59.97 45.15 37.8 35.71 46.29 66.06 65.0 67.85 28.97 21.06 49.33
51.55 30.39 37.55 52.69 30.46 34.93 24.14 15.72 43.23 48.48 35.39 41.27 28.28 20.97 20.3 30.64
0.15 0.0 0.21 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.27 0.34 0.44 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0
0.12 0.0 0.28 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 4.15 0.0
2.01 2.01 1.92 3.06 1.57 1.73 1.31 0.77 3.05 2.99 1.72 0.78 1.34 0.66 1.17 3.08
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.21 0.0 0.14
0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.56 1.09 1.28 0.13 0.32 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.44 18.4 15.17 15.18
5.19 3.85 4.34 6.41 3.88 2.68 2.89 3.91 1.21 0.84 1.18 0.8 2.25 1.99 0.98 2.75
0.43 0.28 1.18 0.98 0.14 0.65 0.78 0.26 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.71
0.01 0.05 0.3 0.63 0.38 0.51 0.0 0.06 0.0 0.08 0.04 0.0 0.09 0.88 11.23 0.09
0.0 0.03 0.08 0.32 0.05 0.21 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.18 0.36 0.51 0.05 0.04 1.01 0.09 0.13 0.35 0.0 0.13 0.51 0.09 0.0 0.68
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
0.28 0.06 2.93 2.79 0.09 0.32 0.53 0.19 0.25 0.4 1.33 0.21 1.06 0.28 1.24 1.1
66.78 34.77 49.49 61.01 34.32 38.22 33.27 9.57 8.26 15.64 44.51 38.7 21.05 21.17 30.27 35.56
30.71 21.86 24.75 24.14 24.91 24.32 23.56 16.57 30.37 32.33 27.47 22.53 22.58 17.66 15.47 26.41
5.57 1.11 1.86 0.57 0.73 0.42 0.36 0.44 0.0 0.05 0.1 0.04 0.69 0.0 1.8 0.42
0.47 0.28 0.12 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.1 0.0 0.08 0.04 0.15 0.14
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.19 0.27 0.13
0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
11.16 3.6 8.79 10.48 3.75 5.04 5.39 6.12 1.16 0.58 1.93 1.67 49.5 32.88 30.5 38.52
0.05 0.0 0.82 0.93 0.09 0.72 0.0 0.09 0.06 0.13 0.14 0.06 0.16 0.46 4.47 0.3
2.22 0.68 0.99 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.67 0.32 0.0 0.0
0.26 0.1 0.77 1.1 0.01 0.03 0.07 0.18 0.15 0.21 0.59 0.17 1.24 0.97 1.32 0.66
0.57 0.07 0.25 0.26 0.0 0.1 0.1 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.57 1.7 1.13 0.88

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)