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Heatmap: Cluster_148 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
-0.59 -0.6 -0.29 -0.01 0.14 0.48 0.29 -0.35 0.38 0.4 0.88 0.79 -0.84 -1.07 -1.15 -0.56
0.83 -1.49 -4.24 -1.1 -0.94 2.05 -0.52 -0.51 1.62 - 1.08 -0.09 -1.33 -2.43 -1.35 -2.45
0.66 0.25 -1.26 -1.56 -1.18 0.31 -0.2 -0.99 -0.48 -0.18 0.23 -0.51 0.66 0.42 0.02 1.01
-0.48 -0.76 -0.36 0.13 -0.12 0.15 -0.02 -0.39 0.31 0.58 1.07 0.67 -0.43 -0.82 -0.95 -0.35
-0.38 -0.33 -0.49 -0.61 -0.73 0.11 0.14 -0.08 -0.53 -0.05 0.5 0.32 0.12 0.25 0.73 0.12
-0.55 -1.65 -1.72 -1.09 -0.59 0.09 -0.36 -0.41 -0.21 -0.17 0.32 -0.31 0.89 0.87 0.83 0.76
-0.38 -0.08 -2.82 -1.37 -2.16 1.79 0.67 -0.13 0.52 -0.38 1.22 0.25 -0.53 -1.77 -3.04 -0.42
-0.04 -1.11 -0.72 -0.26 0.08 0.17 -0.3 -0.83 -0.31 -0.3 0.52 0.76 0.73 0.1 -0.65 0.53
0.26 0.3 -2.4 -2.18 -1.78 1.09 -0.47 -1.42 -0.21 -0.73 0.81 0.21 0.66 0.15 0.31 0.41
-1.14 -0.77 -0.46 0.27 0.27 0.08 0.35 -1.32 0.78 0.99 0.92 0.33 -0.85 -1.05 -1.72 -0.14
0.3 0.8 - - -0.03 0.82 0.76 -0.13 - - - 1.01 - 1.24 1.73 -
0.19 -1.02 -0.57 -0.5 -0.07 0.46 -0.21 -0.78 0.01 0.28 0.64 -0.3 0.54 -0.04 -0.26 0.44
-0.56 -1.36 -1.49 -1.39 -0.26 0.46 0.41 -0.17 -0.61 -0.9 1.22 -0.14 0.89 0.32 -0.68 0.67
0.27 -0.32 -0.62 0.02 -0.28 0.29 0.48 -0.51 0.3 0.18 0.79 0.14 -0.25 -0.57 -1.18 0.03
-0.17 -1.25 -1.03 -1.52 -0.07 -0.5 -0.56 0.41 -0.53 0.1 0.26 -0.04 1.13 0.73 -0.25 0.64
0.49 -2.59 -1.06 -0.74 -1.0 0.41 0.37 0.1 0.3 -0.31 0.61 -0.53 0.68 0.0 -0.42 0.62
0.07 -0.51 -0.71 -0.23 -0.77 0.38 0.16 -1.01 0.14 0.72 0.72 0.12 0.25 -0.7 -0.73 0.48
0.03 -1.34 -0.75 -1.15 -0.47 0.02 0.05 -0.94 -1.01 0.04 1.19 0.51 0.59 0.03 0.02 0.55
-0.19 -1.05 -1.22 -1.05 -0.2 0.02 -0.29 -1.01 -0.26 0.24 0.42 -0.44 0.84 0.83 0.12 0.83
0.09 -0.5 -4.29 -0.83 0.09 -0.16 -0.47 -0.49 -0.28 0.03 1.43 0.03 0.1 -0.48 0.27 0.73
0.37 -0.46 -0.21 0.25 -0.35 0.57 0.37 -0.29 0.26 -0.26 0.41 0.12 -0.05 -0.73 -0.64 -0.17
- -2.9 -0.03 -0.46 -0.24 0.31 -0.72 -0.41 0.61 1.03 0.91 0.55 0.6 -0.68 -1.26 0.32
-0.34 -0.61 -0.88 -0.32 -0.16 -0.05 0.4 -0.42 0.3 -0.05 0.43 -0.34 0.57 0.14 -0.26 0.62
-0.13 -0.81 -0.42 -0.29 -0.07 0.01 0.22 -0.58 -0.1 0.16 0.63 0.46 0.31 -0.22 -0.64 0.52
0.23 0.6 -1.03 -0.83 -0.32 0.7 -0.21 -0.97 -0.29 -1.01 0.41 0.64 0.16 -0.64 0.28 0.34
-0.01 -0.2 -0.3 -0.17 -0.37 0.33 0.39 -0.8 -0.68 -0.25 0.59 0.33 0.18 0.17 -0.7 0.5
1.7 0.29 - - - 1.42 - - - - 1.07 0.95 2.27 - - -
0.12 -0.49 -0.27 -0.2 0.26 0.33 0.27 -0.41 -0.05 0.27 0.84 0.07 -0.15 -0.71 -0.86 0.02
0.41 -0.9 -1.1 -0.53 -0.65 1.11 0.45 -0.03 -0.05 0.15 0.42 -0.26 0.11 -0.38 -0.85 0.24
0.13 -1.08 -0.4 -0.27 -0.28 0.15 0.1 -0.69 0.13 0.15 0.66 0.46 0.08 0.14 0.09 -0.27
0.15 -0.14 -0.49 0.19 0.11 0.17 0.1 -0.67 0.71 0.73 0.65 0.7 -0.96 -1.68 -2.1 -0.54
-0.19 -0.37 -0.43 0.11 0.01 0.35 -0.04 -0.2 0.4 0.43 0.34 0.03 0.06 -0.41 -0.6 -0.03
-0.17 -0.27 -0.59 -0.1 -0.16 0.13 0.34 -0.76 -0.3 0.58 0.92 0.84 -0.31 -0.88 -0.71 -0.19
-0.13 -1.07 -0.33 -0.46 -0.03 0.17 0.17 -0.45 0.08 -0.02 0.56 0.05 0.32 -0.24 0.07 0.52
0.38 -0.13 -1.44 -1.34 -0.57 0.18 -0.27 -1.52 -1.99 -0.39 1.08 0.66 0.72 0.31 -0.52 0.79
0.15 -0.52 -0.96 -0.48 -0.41 0.17 0.31 -0.41 -0.23 0.45 0.66 0.42 0.1 -0.03 -0.64 0.34
-0.85 -1.7 -0.46 -0.16 -0.04 0.11 -0.19 -0.47 0.43 0.55 0.9 0.79 0.16 -0.36 -0.95 0.06
-0.27 -1.14 -0.56 -0.35 -0.08 0.67 -0.36 -0.36 -0.28 0.43 0.7 0.26 0.54 -0.13 -0.96 0.37
0.21 -0.51 -0.46 0.15 -0.23 0.93 0.49 -0.24 0.19 0.05 1.02 0.54 -1.01 -1.09 -3.58 -0.77
-0.31 -0.57 -0.7 -0.22 -0.46 0.52 0.09 -0.06 0.28 0.29 0.29 0.21 0.19 -0.2 -0.34 0.31
-0.58 -2.82 -0.59 -0.33 -0.42 0.32 -0.85 -0.67 0.51 1.12 0.94 0.29 0.52 -0.24 -2.12 0.39
-0.03 -1.18 -0.93 -1.22 -0.48 -0.18 -0.53 -1.21 -0.62 0.07 0.01 -0.38 0.96 0.57 0.47 1.38
-0.34 -0.56 -0.57 -0.47 -0.22 0.27 -0.37 -0.25 0.39 0.7 -0.03 0.05 0.59 0.16 -0.63 0.3
0.16 -0.88 -1.07 -0.53 -0.5 0.58 0.02 -1.28 0.51 0.03 0.67 0.04 0.29 -0.32 -0.22 0.68
-0.18 -1.64 -0.72 -0.56 0.01 0.23 0.46 -0.46 -0.19 -0.08 0.93 0.2 0.54 0.05 -0.66 0.3
0.21 -1.26 -0.82 -1.22 -1.86 0.46 0.11 -0.82 0.31 -0.51 0.41 0.21 0.48 0.31 0.78 0.43
-0.19 -0.61 -0.84 -1.1 -0.13 -0.15 0.59 -1.18 -0.74 -0.33 0.43 0.28 0.52 0.29 0.74 0.48
-0.82 -0.56 -0.65 -0.74 -0.55 -0.0 -0.42 -0.35 -0.24 -0.01 0.44 0.97 0.55 0.14 -0.1 0.71
0.31 -0.01 -0.47 -0.09 -0.14 1.42 0.09 -0.56 0.8 0.2 0.91 0.42 -2.28 -2.37 -3.21 -2.5
-0.93 -2.61 0.31 0.54 -0.46 0.97 -0.2 0.53 1.01 -0.03 1.48 0.7 -4.47 -5.56 -4.08 -3.5
-0.32 -0.72 -1.21 -0.64 -0.78 0.3 0.16 -0.79 -0.51 0.07 0.62 0.2 0.68 0.38 0.1 0.68
-0.2 -1.43 -1.43 -1.49 -0.52 0.26 -0.25 -0.89 -1.11 -0.56 0.57 0.37 0.85 0.94 0.63 0.64
-0.27 -0.94 -1.34 -0.97 -0.64 0.07 0.06 -1.25 -1.29 -0.12 0.41 -0.41 0.8 0.9 0.88 0.8
-0.11 -1.72 -0.49 -0.59 -0.29 0.21 0.04 -0.63 -0.31 -0.1 0.47 0.12 0.79 0.31 -0.17 0.74
0.38 -2.51 -1.56 -1.08 -0.65 0.89 0.88 -0.09 -0.13 -0.32 1.23 0.82 -0.99 -0.52 -0.54 -0.45
-1.15 0.81 -0.49 -0.17 0.14 0.16 0.35 -0.93 0.4 0.54 0.85 1.16 -1.42 -1.89 -2.5 -0.89
-0.42 -1.26 -2.45 -2.02 -2.7 0.58 -2.17 -0.44 -0.19 0.13 0.57 -0.55 1.46 -0.51 -1.66 1.96
-0.97 -0.09 -0.49 -0.31 0.59 0.36 0.51 -1.29 0.61 0.73 0.89 0.71 -1.26 -1.05 -2.21 -0.71
0.1 -1.12 -0.61 -0.4 -0.1 0.36 0.07 -0.65 -0.26 -0.06 0.98 0.43 0.5 -0.16 -0.41 -0.02
0.45 0.33 -0.6 -0.23 0.04 0.24 -0.19 -1.06 0.16 0.56 1.32 0.55 -0.96 -1.49 -1.85 -0.77
0.4 -0.07 -0.51 -0.32 0.12 0.63 0.13 -1.09 -0.17 -0.09 1.07 0.48 -0.29 -0.86 -0.66 -0.52
-0.16 -0.68 -0.85 -0.69 -0.46 -0.23 0.07 -0.85 -0.81 -0.08 0.18 -0.13 1.05 0.53 0.3 0.86
0.02 -0.67 -0.54 -0.41 -0.09 0.66 0.19 -0.9 -0.15 0.38 0.99 0.61 -0.37 -0.52 -0.67 -0.13
-0.7 -1.8 -0.58 -0.22 -0.14 0.23 0.5 -0.02 -0.39 0.19 0.78 0.3 0.69 -0.11 -1.11 0.32
-0.23 -1.02 -1.09 -0.72 -0.29 -0.23 0.0 -0.5 -1.63 -0.16 0.7 1.08 0.54 0.1 -0.61 1.05
-0.16 -1.62 -1.39 -1.06 -0.29 0.14 0.0 -1.28 0.05 1.14 0.7 0.1 0.7 0.15 -1.45 0.63
0.52 -0.84 -1.4 -1.05 -1.07 0.39 0.08 -0.5 -0.36 -0.57 0.35 -0.55 0.86 0.34 0.35 0.86
-0.0 -0.37 -0.39 -0.39 0.17 0.36 0.43 -0.07 0.18 0.2 0.62 0.02 0.03 -0.72 -0.43 -0.33
-0.56 -1.08 -1.35 -1.47 -0.82 -0.01 0.4 -0.87 -0.16 0.28 0.79 -0.64 0.86 0.83 -0.7 0.99
0.42 -0.07 -1.56 -2.33 -1.44 0.18 0.21 -1.5 -1.37 -0.18 0.41 -0.49 1.07 0.81 0.42 0.73
-0.02 -1.04 -2.32 -1.46 -0.71 1.49 -4.17 -1.27 -1.68 -2.05 1.91 1.39 0.24 -1.31 -1.46 0.26
0.08 0.16 -0.64 -0.03 -0.3 0.22 -0.0 -0.92 0.22 1.13 0.7 0.61 -0.61 -1.01 -1.34 -0.63
- - - - - - - - - - 2.08 3.56 - - - -
0.3 -2.08 -0.98 -1.21 -0.45 0.72 0.18 -0.09 -0.13 -0.26 0.79 0.05 0.31 0.22 0.08 0.22
-0.32 -1.51 -0.63 -0.55 -0.26 0.35 -0.18 -0.72 -0.11 0.32 0.81 0.19 0.49 0.3 -0.0 0.28
-0.28 -1.04 -1.84 -1.38 -0.92 -0.11 -1.35 -2.17 -0.41 0.1 0.36 0.34 1.18 0.99 -0.04 1.23
1.71 -0.81 -0.62 0.46 -2.9 1.3 1.03 -1.01 0.35 -1.61 0.63 -0.01 -1.9 -1.05 -3.73 -4.83
0.07 -0.12 -0.62 -0.38 0.46 0.04 0.59 -0.57 -1.02 0.15 0.89 0.96 -0.29 -1.08 -1.64 0.03
0.43 -0.05 -0.67 -0.82 -0.51 -0.22 -0.36 -1.53 -0.08 0.56 0.51 0.04 0.39 0.11 0.09 0.57
0.18 -2.12 -0.94 -1.23 -0.45 0.25 -0.45 -0.77 -0.74 -0.4 1.48 0.76 0.5 0.03 -0.36 0.49
-0.4 -1.54 -1.0 -0.84 -0.29 0.14 0.36 -0.18 0.08 0.39 0.88 -0.29 0.57 0.21 -0.1 0.2
0.38 -0.8 -0.56 -0.61 -0.03 0.25 0.27 -0.21 -0.08 -0.14 0.92 0.55 0.09 -0.34 -0.43 -0.43
0.09 -2.26 -0.76 -1.21 -0.24 0.52 -0.34 -1.02 -1.48 -0.16 1.59 0.05 0.87 0.15 -0.31 0.14
0.6 0.63 -1.35 -0.99 -1.84 0.33 -0.46 -1.57 -0.36 1.23 0.97 0.46 -0.07 -0.63 -1.31 -0.04
-0.48 -1.27 -0.73 -0.87 -0.08 0.62 0.09 -0.49 0.13 0.39 0.41 0.19 0.46 0.15 -0.18 0.29
0.39 -0.87 -1.24 -2.41 -0.59 -0.99 -0.52 -1.55 -0.73 0.12 0.86 0.78 0.13 0.43 0.37 1.24
0.42 -0.7 -0.72 -0.37 -0.14 0.23 0.04 -0.87 0.02 0.05 0.71 0.65 0.06 -0.26 -0.11 -0.07
0.98 -0.33 -1.69 -0.58 -1.28 0.88 0.19 -0.53 -0.82 -0.23 0.18 -0.6 0.48 -0.15 -1.82 1.25
-0.53 -0.74 -1.12 -1.69 -0.77 0.05 -0.56 -1.11 -0.53 -0.31 0.63 0.59 0.86 0.75 0.43 0.83
-0.42 -0.6 -0.57 -0.14 0.02 0.25 0.76 0.11 0.35 0.62 0.92 0.14 -0.67 -1.06 -1.22 -0.51
-0.16 -2.1 -1.59 -1.55 -1.06 0.11 -0.38 0.02 -0.55 -0.38 0.76 0.04 1.07 0.38 -0.27 1.29
0.59 -0.38 -0.56 -0.45 -0.05 0.37 -0.19 -1.01 -0.28 0.14 0.66 0.47 0.02 -0.07 -0.51 0.18
0.12 -0.65 -1.22 -0.94 -1.04 0.05 -0.02 -0.72 -0.16 0.38 0.58 -1.0 1.01 0.38 -0.2 0.87
0.43 -0.3 -0.28 -0.28 0.04 0.17 0.15 -0.33 0.27 -0.15 0.82 0.65 -0.58 -0.78 -0.56 -0.4
-0.22 -0.8 -0.48 0.08 -0.08 0.47 0.07 -0.53 0.46 0.45 0.76 0.06 0.27 -0.62 -0.71 -0.37
-0.17 - - -1.01 -1.58 2.49 0.06 -2.13 1.93 - 1.29 -0.24 - -2.7 - -2.73
0.12 -0.82 -0.44 -0.57 0.27 0.33 0.21 -0.66 -0.3 -0.13 1.06 0.6 -0.11 -0.25 -0.69 -0.04
-0.18 -0.92 -0.93 -0.42 0.03 -0.19 -0.13 -1.05 0.55 0.45 0.71 0.68 0.42 -0.46 -0.85 0.41
0.21 -1.24 -1.36 -0.62 0.15 0.86 1.21 -1.5 0.29 -0.94 1.33 0.46 -0.71 -0.89 -1.09 -0.86
-0.87 -0.32 -0.83 -0.75 -0.26 0.74 0.37 -0.86 -0.01 -0.56 0.43 0.19 0.58 0.4 -0.48 0.54
0.15 -1.91 -0.2 -0.31 -0.13 0.21 0.26 -0.15 -0.29 -0.02 0.54 -0.2 0.55 -0.02 -0.66 0.65
-0.24 -1.0 -0.97 -0.52 -0.04 0.13 -0.13 0.58 -0.34 0.55 0.93 0.34 0.38 -0.37 -1.36 0.11
0.25 -0.49 -0.09 -0.03 0.07 0.26 0.06 -0.61 0.26 0.55 0.81 0.5 -0.59 -0.87 -0.87 -0.64
0.37 -0.06 -0.98 -0.59 -0.25 0.24 0.05 -1.22 -1.28 -0.15 0.32 0.09 0.51 0.39 -0.08 0.84
-1.6 -1.32 -2.88 -2.68 0.05 0.12 1.3 -0.39 0.38 -0.62 1.31 -0.03 0.44 -0.42 -0.74 0.59
0.13 -0.82 -0.49 -0.12 -0.39 0.21 0.25 -0.09 -0.4 0.65 0.98 -0.25 -0.09 -0.52 -0.38 0.15
-7.53 -5.28 -0.28 -0.59 -0.64 1.49 0.74 -0.88 1.13 -4.09 2.19 0.93 -4.81 - -3.84 -
-0.24 -0.57 -0.49 -0.47 -0.09 0.32 0.03 -0.8 -0.03 -0.12 0.58 0.14 0.92 -0.03 -0.59 0.31
-0.12 -0.44 -0.98 -1.21 -0.13 -0.15 0.12 -1.4 -0.14 0.44 1.35 1.61 -0.6 -0.99 -1.56 -0.41
-0.0 -2.06 -1.18 -1.04 -0.51 -0.04 -0.35 -0.76 -0.82 -0.35 0.81 0.46 1.15 0.51 -0.18 0.84
0.33 -0.79 -1.23 -0.44 -0.62 0.31 0.4 -0.12 -0.22 0.32 0.87 -0.37 0.53 0.03 -0.84 0.2
0.26 -1.19 -1.21 -1.33 -0.62 -0.68 -0.31 -0.65 -0.8 -0.24 0.72 0.62 1.2 0.47 0.26 0.42
0.74 -0.59 -0.7 -1.69 -1.02 -0.38 -0.46 -0.63 0.27 0.46 0.97 0.65 0.02 -0.16 -0.52 0.48
0.12 -1.17 -1.01 -0.36 -0.23 0.43 -0.34 -1.09 0.08 0.65 0.94 0.31 0.38 -0.14 -0.5 0.05
-0.06 -1.48 -1.17 -0.63 -0.13 0.18 0.4 -0.14 -0.48 0.5 1.31 0.3 0.52 -0.59 -1.75 0.11
-0.17 -1.11 -0.79 0.49 -0.14 1.17 0.13 -0.35 0.6 0.63 1.12 0.65 -2.43 -2.88 -2.54 -1.54
0.33 -0.58 -0.57 -0.33 0.07 0.09 -0.08 -0.81 -0.09 0.12 0.65 0.52 0.11 -0.07 -0.35 0.16
- -2.99 -0.65 -1.01 -1.8 1.92 0.97 -0.24 1.24 -0.98 1.72 0.71 - - - -3.96

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.