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Heatmap: Cluster_31 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
- - - - - - - - - - - - 2.18 1.67 - 3.05
2.24 - - - - - - - - - - - 1.58 - - 3.05
4.0 - - - - - - - - - - - - - - -
2.35 - 2.44 - - 2.45 - - - - - - - - - -
-0.65 - - - - - - -2.47 - - - - 3.11 2.71 - -
- - - - - - - 4.0 - - - - - - - -
- - - - - - - 4.0 - - - - - - - -
- 3.13 2.16 - - - 1.48 - - - - - - - - -
-2.7 -1.87 - -2.56 -2.76 -0.93 -0.98 0.7 -0.73 -2.26 - - 0.6 1.51 2.8 -1.11
-0.13 1.08 - - - - - - - - - - - - 3.7 -
- - 2.25 - - - -0.42 -1.4 - - - 0.8 - 3.07 - -
- 1.96 1.48 1.41 - - - - - - -0.64 - - - 2.59 -
- - - - - - - - - - - - - 4.0 - -
- 2.79 1.86 1.0 0.46 -1.6 -2.24 - - - -1.12 0.09 - - - -
- - - - - - - -4.75 - - - - 2.66 1.57 - 2.73
- - - - - - - - - - - - - - - -
3.11 1.03 - - - - - - - - - - - 2.42 - -
0.62 2.74 - 0.18 - - - - - - - - - - 2.73 -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
1.59 - - - - - - - - - - - - - 3.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.69 - 1.53 - 2.17 - 2.81 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
4.0 - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
-5.8 -9.27 -9.46 - - -8.47 - -12.19 - - - -8.84 2.02 1.97 1.86 2.13
1.43 - - - - - 2.26 - 2.02 - 2.16 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.48 3.25 0.6 0.53 - - 1.07 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
-0.07 2.49 -0.24 - - -0.27 - - - - - - - 0.58 2.65 -
-0.58 - 2.03 - 1.67 1.51 - - - - -0.11 - - - 2.11 -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
-0.67 3.01 - 0.57 1.1 - 0.68 -2.46 - - 0.93 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.74 - - 0.52 - - - - - 1.1 - - - - 3.18
- -6.54 - - - -6.05 - - - - - - 2.66 2.18 0.88 1.71
- -6.82 - - - - - - - - - - 1.31 2.11 2.89 0.81
- - 0.29 - - 0.26 - - - - - - - - 3.76 -
- - - - - - - - - - - - - - - -
-1.42 - - - 1.15 0.41 - - - - - - 2.35 - - 2.81
- - - - - 2.32 - 3.46 - - - - - - - -
2.26 3.49 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.07 - - 2.27 - 1.47 - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.0 - - - - - - - -
2.01 2.14 - - - - - -0.22 - - - - - - 2.74 -
- - - - - - - 4.0 - - - - - - - -
-1.19 -0.09 0.38 -0.3 -3.09 0.12 - - 0.37 -0.24 -0.54 -0.64 -1.25 -1.19 2.72 -1.39
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.0 -
2.58 2.64 1.92 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.94 - - 0.15 - 3.46 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.75 1.65 - 2.62
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
4.0 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.93 2.25 1.32 0.22
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.0
- - - - - - - - - - - - 3.19 1.42 - 2.07
- - - - - - - - - - - - - - - -
0.88 - - 0.5 0.97 1.72 0.23 -0.62 - - 0.86 - - - - 1.95
- - 1.75 - - - - - - - - - 3.66 - - -
-1.94 2.95 1.07 1.02 1.53 -0.04 - - - - - - - - - -
- - 3.25 - 1.57 0.42 - - - 1.11 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.43 1.69 1.56 2.14
- - - - - - - - - - - - - - - -
2.09 3.21 1.3 - - - - - - - - - - - - -
- - 0.56 - - - - - - - - - 3.58 1.37 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.0
- - 1.52 - - - - - - - - - - 1.34 3.41 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.0 -
- - - - - - - -0.55 - - - - - - - 3.94
- - - - - - - 1.91 - - - - - 2.05 - 3.02
0.09 2.23 0.78 0.67 0.33 0.51 -0.45 -2.46 -3.52 -3.88 -0.2 -0.18 -1.61 -1.65 -1.56 -1.15
- - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
2.48 - - - - - - - - - - - - - 3.38 -
3.27 - - - - - - - - - - - - 2.66 - -
- 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.0
- 2.72 - -0.56 - - - - - - - - - -0.11 2.96 -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.0 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.1 - 2.89 - - - - - - - - -
-0.11 3.31 - - - - - - - 1.36 1.39 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.