1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_172 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.58 0.23 0.35 0.58 1.0 0.97 0.44 0.52 0.73 0.77 0.62 0.31 0.57 0.46 0.53 0.8
0.33 0.29 0.32 0.38 1.0 0.61 0.54 0.39 0.5 0.53 0.47 0.4 0.68 0.68 0.58 0.67
0.02 0.0 0.0 0.09 0.41 0.07 0.0 0.02 0.05 0.11 0.0 0.0 0.13 0.24 1.0 0.0
0.5 0.53 0.3 0.28 0.57 1.0 0.39 0.4 0.75 0.64 0.61 0.73 0.28 0.23 0.2 0.27
0.68 0.23 0.22 0.46 0.72 0.91 0.32 0.32 0.75 0.35 0.34 0.46 0.59 0.64 1.0 0.79
0.44 0.46 0.62 0.53 1.0 0.83 0.91 0.7 0.68 0.7 0.72 0.64 0.84 0.7 0.74 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 1.0 0.95 0.75 0.84
0.01 0.03 0.24 0.22 1.0 0.86 0.28 0.43 0.92 0.96 0.97 0.74 0.03 0.02 0.09 0.03
1.0 0.67 0.58 0.57 0.99 0.86 0.08 0.11 0.89 0.14 0.29 0.2 0.82 0.86 0.5 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.02 0.21 0.21 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.92
0.04 0.16 0.04 0.0 1.0 0.82 0.05 0.46 0.78 0.56 0.0 0.0 0.15 0.07 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.11 0.43 0.58 0.13 0.15 0.3 0.94 0.49 0.19 1.0 0.49 0.27 0.86
0.16 0.06 0.06 0.03 0.82 0.92 0.01 0.01 0.46 1.0 0.73 0.97 0.01 0.01 0.01 0.0
0.72 0.65 0.25 0.21 0.62 0.93 0.85 0.46 0.57 0.54 0.53 0.59 0.82 0.76 1.0 0.89
0.31 0.12 0.21 0.22 0.29 0.41 0.07 0.14 0.59 1.0 0.24 0.2 0.3 0.26 0.17 0.26
0.05 0.04 0.31 0.0 0.8 0.73 0.5 0.23 1.0 0.54 0.65 0.13 0.11 0.5 0.42 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.32 0.42 0.25 0.15 0.1 0.25 0.1 1.0 0.59 0.36 0.4
0.34 0.23 0.16 0.08 0.17 0.36 0.19 0.22 0.28 0.26 0.28 0.19 1.0 0.95 0.59 0.85
0.17 0.0 0.06 0.11 0.83 0.46 0.09 0.78 0.21 0.21 0.25 0.33 1.0 0.93 0.47 0.39
0.0 0.0 0.01 0.0 0.98 1.0 0.99 0.34 0.31 0.22 0.59 0.32 0.65 0.54 0.29 0.7
0.0 0.0 0.01 0.0 0.62 0.86 0.44 0.22 0.74 1.0 0.75 0.47 0.35 0.16 0.12 0.3
0.36 0.12 0.16 0.14 0.17 0.4 0.22 0.22 0.16 0.2 0.33 0.32 1.0 0.53 0.17 1.0
0.67 0.89 0.28 0.39 0.64 0.79 1.0 0.53 0.82 0.5 0.9 0.8 0.39 0.28 0.25 0.41
0.24 0.0 0.15 0.18 0.16 1.0 0.0 0.3 0.22 0.46 0.0 0.22 0.55 0.26 0.0 0.0
0.35 0.0 0.0 0.0 0.19 0.61 0.0 0.15 0.26 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.0 0.92
0.01 0.0 0.06 0.19 0.34 1.0 0.68 0.02 0.2 0.84 0.37 0.3 0.02 0.01 0.0 0.06
0.02 0.03 0.02 0.23 1.0 0.51 0.57 0.25 0.53 0.71 0.76 0.22 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.26 0.24 0.35 1.0 0.9 0.3 0.0 0.0 0.18 0.62 0.27 0.0 0.0 0.5
0.54 0.46 0.56 0.68 0.99 0.93 0.77 0.5 0.85 0.87 1.0 0.76 0.26 0.22 0.17 0.28
0.05 0.04 0.04 0.03 0.61 0.45 0.01 0.02 1.0 0.53 0.5 0.47 0.01 0.0 0.0 0.0
0.42 0.43 0.05 0.03 0.53 0.53 0.18 0.69 0.65 0.49 0.09 0.06 0.58 0.64 0.56 1.0
0.14 0.27 0.21 0.16 1.0 0.53 0.43 0.23 0.62 0.91 0.81 0.63 0.06 0.04 0.06 0.13
0.0 0.0 0.02 0.04 0.83 0.62 0.11 0.12 0.51 0.98 1.0 0.67 0.0 0.0 0.02 0.0
0.57 0.56 0.06 0.0 0.66 0.68 1.0 0.43 0.49 0.36 0.81 0.73 0.66 0.51 0.55 0.7
0.17 0.1 0.24 0.37 0.34 1.0 0.31 0.32 0.73 0.5 0.52 0.29 0.26 0.2 0.09 0.28
0.01 0.06 0.03 0.01 0.92 1.0 0.48 0.66 0.44 0.19 0.16 0.07 0.23 0.12 0.12 0.29
0.19 0.09 0.09 0.09 0.11 0.54 0.04 0.24 0.63 1.0 0.21 0.14 0.2 0.21 0.16 0.17
0.25 0.28 0.26 0.45 0.57 1.0 0.44 0.15 0.4 0.87 0.98 0.73 0.21 0.17 0.1 0.28
0.01 0.0 0.08 0.05 0.58 0.61 0.21 0.08 0.63 0.67 1.0 0.27 0.24 0.06 0.05 0.16
0.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.14 0.15 0.03 0.09 0.16 0.07 0.06 0.16 0.47 0.0 1.0
0.88 0.4 0.19 0.19 0.41 0.96 0.48 0.53 0.55 0.44 0.65 0.45 0.9 1.0 0.82 0.89
0.56 0.61 0.52 0.41 0.72 0.73 0.44 0.37 0.47 0.86 0.75 0.88 0.9 0.91 0.63 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.77 0.4 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.08 0.1 0.26 1.0 0.05 0.11 0.47 0.12 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.7 0.57 0.43 0.8 1.0 0.94 0.7 0.8 0.93 0.72 0.66 0.69 0.81 0.79 0.53
0.1 0.13 0.15 0.03 0.75 1.0 0.31 0.51 0.45 0.58 0.44 0.13 0.24 0.02 0.09 0.17
0.0 0.0 0.0 0.01 0.68 0.8 0.55 0.12 0.34 0.5 0.46 0.22 1.0 0.71 0.3 0.87
0.0 0.01 0.05 0.03 0.6 0.72 1.0 0.42 0.24 0.5 0.3 0.3 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.94 0.0 0.04 0.89 0.29 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.18 0.0 0.01 0.68 0.5 0.4 0.8 0.54 0.19 0.12 0.01 0.42 0.23 0.18 1.0
0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.9 0.15 0.8 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.06 0.09 0.48 0.85 0.26 0.06 0.22 1.0 0.66 0.38 0.08 0.05 0.02 0.07
0.0 0.0 0.34 0.29 1.0 0.92 0.05 0.14 0.14 0.1 0.46 0.44 0.0 0.0 0.16 0.0
0.12 0.05 0.08 0.1 0.81 0.73 0.1 1.0 0.27 0.18 0.0 0.0 0.43 0.16 0.17 0.24
0.15 0.05 0.02 0.07 0.02 0.71 0.0 0.01 1.0 0.66 0.07 0.01 0.03 0.01 0.03 0.1
0.29 0.22 0.36 0.5 0.59 1.0 0.63 0.52 0.68 0.95 0.75 0.65 0.16 0.22 0.29 0.28
0.0 0.0 0.11 0.17 0.3 1.0 0.54 0.2 0.47 0.67 0.32 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.75 0.42 0.46 0.53 1.0 0.64 0.61 0.78 0.85 0.55 0.29 0.91 0.67 0.5 0.78
0.48 0.5 0.53 0.63 0.92 1.0 0.65 0.54 0.69 0.75 0.78 0.74 0.22 0.25 0.16 0.2
0.34 0.4 0.0 0.08 0.27 0.64 0.44 0.21 0.5 0.09 0.19 0.2 0.25 0.0 0.92 1.0
0.2 0.1 0.16 0.1 1.0 0.85 0.13 0.4 0.42 0.44 0.13 0.13 0.44 0.3 0.41 0.3
0.13 0.44 0.07 0.16 0.82 0.9 0.82 0.32 1.0 0.77 0.42 0.43 0.14 0.14 0.06 0.07
0.12 0.06 0.18 0.18 0.28 0.32 0.17 0.18 0.17 0.22 0.19 0.24 0.88 0.73 0.81 1.0
0.62 0.64 0.26 0.19 0.76 0.77 0.67 0.45 0.59 0.66 0.8 0.75 0.87 0.79 0.42 1.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.44 1.0 0.0 0.05 0.79 0.34 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.24 0.15 0.09 1.0 0.18 0.22 0.28 0.75 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.36 0.25 0.34 0.42 0.49 0.64 0.41 0.42 0.4 0.47 0.39 1.0 0.83 0.59 1.0
0.31 0.63 0.4 0.25 0.63 0.98 0.85 0.76 0.47 0.45 0.62 0.63 1.0 0.88 0.55 0.91
0.0 0.0 0.12 0.11 1.0 0.52 0.03 0.7 0.65 0.41 0.07 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.56 0.38 0.23 0.06 0.15 0.28 0.03 1.0 0.43 0.0 0.66
0.02 0.06 0.27 0.12 0.49 1.0 0.13 0.1 0.62 0.67 0.45 0.78 0.0 0.0 0.08 0.0
0.3 0.52 0.14 0.31 0.82 0.81 0.26 0.12 0.61 1.0 0.37 0.36 0.06 0.61 0.9 0.18
0.46 0.37 0.19 0.21 0.9 1.0 0.41 0.51 0.95 0.71 0.91 0.76 0.25 0.28 0.35 0.35
0.03 0.01 0.02 0.01 1.0 0.43 0.01 0.94 0.35 0.31 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.0 0.11 0.2 0.82 1.0 0.25 0.39 0.31 0.17 0.18 0.12 0.04 0.05 0.08 0.04
0.16 0.01 0.1 0.06 0.25 0.2 0.07 0.17 0.29 0.25 0.21 0.13 1.0 0.61 0.66 0.81
0.0 0.17 0.0 0.06 0.07 0.58 0.15 0.31 1.0 1.0 0.01 0.01 0.3 0.04 0.03 0.61
0.06 0.21 0.09 0.12 0.24 1.0 0.17 0.14 0.4 0.54 0.56 0.31 0.14 0.09 0.04 0.25
0.11 0.49 0.01 0.05 1.0 0.53 0.04 0.26 1.0 0.47 0.72 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.09 0.08 0.23 1.0 0.23 0.37 0.4 0.69 0.79 0.79 0.4 0.34 0.06 0.36
0.01 0.03 0.04 0.04 0.1 0.86 0.16 0.05 1.0 0.44 0.05 0.05 0.34 0.48 0.08 0.07
0.61 0.37 0.19 0.12 0.2 0.68 0.65 0.64 0.73 0.29 0.52 0.27 0.72 0.86 0.56 1.0
0.0 0.16 0.29 0.04 0.16 1.0 0.13 0.0 0.74 0.54 0.28 0.3 0.0 0.0 0.22 0.2
0.08 0.09 0.12 0.38 1.0 0.29 0.28 0.08 0.07 0.42 0.29 0.29 0.0 0.0 0.01 0.0
0.71 0.46 0.38 0.43 0.51 1.0 0.35 0.28 0.81 0.33 0.46 0.42 0.8 0.74 0.67 0.97
0.35 0.21 0.03 0.03 0.62 1.0 0.04 0.05 0.45 0.34 0.8 0.49 0.07 0.03 0.0 0.12
0.04 0.04 0.04 0.04 1.0 0.86 0.21 0.09 0.32 0.69 0.59 0.39 0.3 0.2 0.08 0.29
0.0 0.0 0.15 0.14 0.25 1.0 0.13 0.13 0.12 0.46 0.11 0.27 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.74 0.26 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.16 0.19 0.23 0.26 1.0 0.98 0.24 0.62 0.72 0.52 0.86 0.38 0.41 0.43 0.3 0.63
0.93 0.61 0.58 0.46 0.91 1.0 0.26 0.4 0.76 0.27 0.57 0.47 0.5 0.44 0.33 0.57
0.2 0.1 0.04 0.09 0.15 0.3 0.2 0.26 0.21 0.22 0.26 0.17 1.0 0.45 0.46 0.91
0.01 0.0 0.04 0.08 0.29 0.28 0.26 0.09 0.12 0.17 0.22 0.09 1.0 0.68 0.22 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.84 0.0 0.0 0.75 0.58 1.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.24 0.37 0.28 0.63 0.86 0.11 0.25 0.75 0.2 0.13 0.12 1.0 0.53 0.47 0.51
0.13 0.16 0.27 0.18 1.0 0.52 0.35 0.22 0.52 0.78 0.5 0.8 0.19 0.4 0.32 0.37
0.0 0.02 0.27 0.05 0.91 1.0 0.03 0.1 0.5 0.77 0.66 0.59 0.0 0.0 0.0 0.02
0.17 0.14 0.05 0.05 0.37 0.67 0.41 0.28 0.34 0.26 0.35 0.16 1.0 0.78 0.49 0.52
0.04 0.17 0.07 0.27 0.0 1.0 0.11 0.18 0.58 0.49 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.09 0.13 1.0 0.07 0.06 0.43 0.73 0.43 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.01 0.03 0.0 0.68 1.0 0.04 0.28 0.57 0.21 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)