1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_245 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.59 0.38 0.73 0.8 0.52 0.62 0.91 0.58 0.76 0.63 0.95 1.0 0.52 0.53 0.49 0.47
0.47 0.48 0.77 1.0 0.58 0.48 0.77 0.53 0.79 0.74 0.87 0.61 0.61 0.4 0.3 0.72
0.55 0.37 0.47 0.61 0.36 0.43 0.91 0.66 0.68 0.73 1.0 0.6 0.71 0.66 0.45 0.71
0.08 0.43 0.42 0.59 0.36 0.42 1.0 0.69 0.98 0.96 0.4 0.21 0.15 0.14 0.07 0.17
0.47 0.5 0.51 0.74 0.45 0.53 0.82 0.66 0.94 1.0 0.71 0.58 0.4 0.29 0.28 0.42
0.37 0.18 0.37 0.51 0.35 0.49 1.0 0.78 0.9 0.84 0.97 0.56 0.8 0.48 0.31 0.67
0.0 0.0 0.14 0.46 0.17 0.11 0.67 0.02 1.0 0.84 0.64 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.01 0.38 0.61 0.03 0.04 0.2 0.37 0.54 1.0 0.51 0.26 0.31 0.07 0.08 0.42
0.16 0.15 0.46 0.59 0.36 0.39 0.94 0.67 0.7 0.82 1.0 0.59 0.35 0.24 0.2 0.36
0.29 0.49 0.35 0.46 0.31 0.35 1.0 0.52 0.74 0.95 0.64 0.75 0.26 0.28 0.22 0.39
0.01 0.0 0.16 0.33 0.62 0.19 0.98 0.05 0.11 0.05 0.95 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.15 0.54 0.67 0.2 0.48 0.57 0.36 0.6 0.56 1.0 0.39 0.1 0.05 0.05 0.12
0.38 0.41 0.37 0.51 0.28 0.55 1.0 0.81 0.89 0.87 0.52 0.43 0.58 0.62 0.51 0.54
0.33 0.36 0.43 0.45 0.22 0.3 1.0 0.39 0.75 0.57 0.2 0.14 0.17 0.13 0.36 0.23
0.1 0.38 0.67 0.82 0.64 0.33 0.87 0.44 0.6 0.64 0.95 1.0 0.15 0.1 0.27 0.19
0.36 0.62 1.0 0.76 0.57 0.46 0.87 0.61 0.97 0.81 0.94 0.68 0.74 0.69 0.39 0.69
0.04 0.03 0.44 0.57 0.21 0.22 0.7 0.53 0.22 0.46 1.0 0.32 0.21 0.18 0.38 0.91
0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04 0.07 0.07 0.05 0.03 0.67 0.66 0.4 1.0
0.47 0.42 0.65 0.58 0.31 0.28 1.0 0.59 0.89 0.88 0.99 0.88 0.98 0.64 0.56 0.92
0.67 0.48 0.65 1.0 0.64 0.45 0.89 0.48 0.96 0.73 0.86 0.58 0.27 0.19 0.15 0.34
0.4 0.23 0.4 0.58 0.36 0.44 1.0 0.72 0.83 0.78 0.89 0.43 0.65 0.42 0.23 0.54
0.53 0.36 0.61 0.79 0.54 0.43 0.83 0.55 0.9 1.0 0.64 0.48 0.3 0.18 0.16 0.25
0.16 0.04 0.51 0.46 0.33 0.39 0.22 0.55 0.76 1.0 0.53 0.42 0.37 0.27 0.15 0.29
0.08 0.36 0.51 0.7 0.46 0.68 0.96 0.89 0.77 1.0 0.69 0.43 0.13 0.11 0.21 0.12
0.0 0.0 0.25 0.28 0.02 0.03 1.0 0.26 0.33 0.26 0.35 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.32 0.35 0.09 0.04 0.6 1.0 0.5 0.31 0.24 0.14 0.21 0.21 0.15 0.53
0.02 0.04 0.59 0.5 0.31 0.25 0.24 0.8 0.67 1.0 0.25 0.09 0.1 0.1 0.03 0.05
0.03 0.34 0.55 0.57 0.41 0.16 0.47 0.59 0.52 1.0 0.3 0.17 0.04 0.04 0.02 0.06
0.31 0.0 0.29 0.55 0.02 0.03 0.11 0.3 0.42 1.0 0.22 0.28 0.62 0.35 0.19 0.21
0.68 0.3 0.73 0.98 0.6 0.52 0.74 0.93 1.0 0.83 0.87 0.51 0.22 0.2 0.14 0.24
0.25 0.22 0.64 0.82 0.5 0.52 0.91 0.74 1.0 0.95 0.96 0.9 0.76 0.55 0.5 0.73
0.27 0.12 0.21 0.31 0.08 0.03 0.5 1.0 0.35 0.2 0.09 0.05 0.97 0.68 0.35 0.85
0.36 0.23 0.45 0.59 0.39 0.48 1.0 0.73 0.67 0.78 0.92 0.42 0.48 0.29 0.19 0.47
0.14 0.13 0.63 0.66 0.3 0.44 0.94 0.43 0.59 0.51 1.0 0.94 0.12 0.08 0.12 0.25
0.67 0.63 0.56 0.68 0.46 0.45 1.0 0.61 0.81 0.95 0.82 0.86 0.47 0.45 0.4 0.56
0.5 0.4 0.48 0.64 0.5 0.57 0.76 0.54 1.0 0.89 0.8 0.52 0.32 0.3 0.24 0.39
0.0 0.01 0.48 0.49 0.09 0.32 0.9 0.06 0.54 0.63 0.58 1.0 0.06 0.07 0.07 0.08
0.0 0.0 0.3 0.03 0.0 0.0 0.1 0.08 0.17 0.04 0.09 0.21 0.61 0.76 1.0 0.93
0.0 0.0 0.44 0.32 0.0 0.0 0.51 0.32 0.35 0.34 0.52 0.17 0.79 1.0 0.75 0.68
0.0 0.02 0.14 0.14 0.02 0.03 0.43 0.32 1.0 0.73 0.73 0.09 0.17 0.0 0.0 0.11
0.64 0.35 0.7 0.86 0.47 0.5 0.92 0.62 0.93 0.73 1.0 0.47 0.45 0.28 0.41 0.29
0.34 0.58 0.63 0.79 0.73 0.6 1.0 0.83 0.79 0.65 1.0 0.97 0.51 0.41 0.34 0.61
0.07 0.04 0.26 0.11 0.06 0.12 0.35 0.47 0.24 0.2 0.21 0.09 1.0 0.11 0.0 0.47
0.37 0.27 0.29 0.47 0.28 0.61 0.57 0.34 1.0 0.76 0.65 0.45 0.35 0.34 0.23 0.53
0.22 0.21 0.56 0.74 0.64 0.63 0.87 1.0 0.78 0.88 0.98 0.57 0.28 0.15 0.1 0.22
0.17 0.36 0.59 0.68 0.29 0.43 0.95 0.52 0.84 0.72 0.87 1.0 0.3 0.24 0.23 0.44
0.63 0.79 0.5 0.57 0.64 0.71 1.0 0.41 0.87 0.91 0.98 0.91 0.18 0.37 0.36 0.33
0.11 0.31 0.68 0.58 0.33 0.32 0.92 0.58 0.96 1.0 0.57 0.3 0.17 0.09 0.13 0.58
0.62 0.24 0.5 0.56 0.46 0.57 0.76 0.63 1.0 0.86 0.78 0.44 0.62 0.55 0.42 0.72
0.05 0.04 0.39 0.51 0.42 0.47 0.5 0.41 1.0 0.75 0.99 0.59 0.06 0.04 0.03 0.07
0.29 0.58 0.7 0.79 0.49 0.5 0.81 0.52 0.96 0.93 1.0 0.8 0.46 0.34 0.43 0.48
0.69 0.34 0.63 0.76 0.71 0.58 1.0 0.33 0.98 0.92 0.97 0.95 0.55 0.36 0.17 0.56
0.01 0.0 0.66 0.53 0.13 0.07 0.47 0.79 0.19 0.23 1.0 0.67 0.28 0.94 0.43 0.46
0.22 0.13 0.49 0.57 0.44 0.44 0.68 0.48 1.0 0.99 0.67 0.41 0.12 0.06 0.08 0.13
0.39 0.31 0.72 1.0 0.49 0.55 0.95 0.69 0.95 0.78 0.96 0.9 0.5 0.49 0.5 0.53
0.34 0.13 0.67 0.73 0.71 0.28 0.62 0.31 0.8 0.81 0.43 0.5 0.6 0.42 0.21 1.0
0.4 0.28 0.43 0.54 0.4 0.4 0.56 0.51 0.66 0.58 0.46 0.56 1.0 0.75 0.66 0.85
0.14 0.19 0.6 0.76 0.43 0.32 0.61 1.0 0.91 0.66 0.86 0.34 0.62 0.26 0.34 0.6
0.12 0.07 0.66 0.91 0.52 0.29 0.55 0.08 0.77 1.0 0.76 0.3 0.02 0.02 0.01 0.02
0.41 0.54 0.39 0.63 0.37 0.4 1.0 0.44 0.56 0.47 0.66 0.69 0.21 0.18 0.23 0.24
0.06 0.15 0.62 0.65 0.54 0.23 1.0 0.26 0.59 0.81 0.97 0.68 0.18 0.14 0.06 0.2
0.77 0.55 0.72 0.89 0.7 0.8 0.96 0.69 0.86 0.87 1.0 0.98 0.72 0.53 0.54 0.69
0.59 0.24 0.6 0.69 0.48 0.34 0.61 0.52 0.96 1.0 0.5 0.41 0.29 0.24 0.18 0.25
0.72 0.36 0.74 0.99 0.75 0.58 0.93 0.63 0.95 1.0 0.99 0.97 0.78 0.64 0.56 0.81
0.1 0.08 0.5 0.7 0.63 0.45 0.96 1.0 0.45 0.45 0.84 0.36 0.48 0.23 0.15 0.53
0.55 0.0 0.5 0.48 0.0 0.25 0.23 0.32 0.77 1.0 0.21 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.27 0.5 0.71 0.32 0.28 0.78 0.8 0.59 0.75 0.74 1.0 0.97 0.94 0.51 0.91
0.64 0.33 0.74 1.0 0.42 0.53 0.66 0.49 0.8 0.92 0.7 0.49 0.5 0.38 0.37 0.8
0.0 0.0 0.13 0.3 0.17 0.06 0.39 0.28 0.41 0.26 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.44 0.53 0.03 0.01 0.78 0.23 1.0 0.7 0.94 0.25 0.04 0.0 0.0 0.0
0.04 0.01 0.29 0.45 0.01 0.01 0.04 0.33 0.18 1.0 0.13 0.12 0.05 0.02 0.03 0.04
0.0 0.0 0.52 0.81 0.03 0.02 0.35 0.13 0.51 0.56 0.44 0.09 1.0 0.61 0.46 0.74
0.37 0.2 0.3 0.46 0.23 0.15 0.3 0.28 0.52 0.56 0.16 0.22 0.8 0.65 0.47 1.0
0.05 0.08 0.41 0.44 0.18 0.12 0.67 0.92 1.0 0.51 0.35 0.12 0.66 0.32 0.2 0.67
0.29 0.43 0.87 1.0 0.82 0.46 0.92 0.38 0.93 0.9 0.72 0.77 0.77 0.44 0.42 0.71
0.01 0.0 0.65 0.09 0.14 0.02 0.01 0.76 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.39 0.59 0.73 0.51 0.49 0.78 0.87 0.94 1.0 0.83 0.51 0.18 0.16 0.12 0.21
0.24 0.38 0.41 0.59 0.47 0.29 0.91 0.22 0.41 0.51 0.99 1.0 0.22 0.11 0.08 0.28
0.31 0.11 0.32 0.43 0.38 0.39 0.81 0.53 0.52 0.58 0.74 0.34 1.0 0.56 0.42 0.87
0.3 0.24 0.59 0.9 0.49 0.74 0.95 0.96 1.0 0.85 0.95 0.75 0.29 0.24 0.19 0.33
0.3 0.18 0.51 0.58 0.42 0.48 0.56 0.56 1.0 0.81 0.7 0.47 0.71 0.58 0.55 0.67
0.0 0.0 0.04 0.1 0.03 0.16 0.15 0.22 0.48 0.27 0.22 0.07 0.71 0.61 0.96 1.0
0.46 0.3 0.47 0.52 0.42 0.48 0.64 0.43 0.79 0.61 0.52 0.54 0.79 0.59 0.57 1.0
0.0 0.0 0.26 0.36 0.16 0.09 0.83 0.61 0.88 1.0 0.13 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0
0.46 0.29 0.8 1.0 0.66 0.48 0.76 0.57 0.84 0.81 0.81 0.77 0.51 0.42 0.39 0.54
0.1 0.07 0.23 0.16 0.13 0.14 0.21 0.17 0.31 0.2 0.26 0.33 0.67 0.92 1.0 0.93
0.04 0.17 0.6 1.0 0.19 0.32 0.42 0.47 0.64 0.59 0.81 0.56 0.15 0.14 0.04 0.18
0.19 0.22 0.59 0.69 0.35 0.45 0.95 0.49 0.63 0.55 1.0 0.67 0.24 0.15 0.15 0.29
0.38 0.17 0.33 0.45 0.31 0.36 0.74 0.65 0.68 0.72 1.0 0.5 0.48 0.26 0.17 0.42
0.0 0.0 0.19 0.14 0.05 0.05 0.21 0.56 0.2 0.2 0.1 0.05 0.67 0.74 0.48 1.0
0.0 0.0 0.96 0.72 0.24 0.23 0.36 0.49 1.0 0.85 0.76 0.33 0.96 0.26 0.2 0.41
0.0 0.04 0.25 0.24 0.05 0.16 1.0 0.46 0.77 0.78 0.75 0.2 0.17 0.08 0.22 0.05
0.03 0.16 0.33 0.43 0.37 0.33 0.68 0.5 1.0 0.72 0.83 0.51 0.05 0.02 0.02 0.06
0.55 0.43 0.54 0.87 0.33 0.49 0.79 0.95 0.42 0.43 0.98 0.81 1.0 0.89 0.53 0.98
0.34 0.65 0.56 0.78 0.54 0.57 1.0 0.52 0.72 0.68 0.96 0.98 0.17 0.14 0.19 0.23
0.53 0.66 0.68 0.74 0.65 0.64 0.95 0.39 0.75 0.81 1.0 0.97 0.32 0.26 0.27 0.46
0.08 0.11 0.06 0.05 0.0 0.01 0.08 0.13 0.17 0.17 0.14 0.06 0.97 0.51 0.18 1.0
0.37 0.62 0.78 1.0 0.59 0.63 0.84 0.77 0.68 0.81 0.84 0.73 0.55 0.67 0.31 0.66
0.2 0.2 0.13 0.24 0.04 0.04 0.34 0.22 0.29 0.33 0.18 0.39 0.72 0.53 0.48 1.0
0.38 0.44 0.53 0.66 0.29 0.31 1.0 0.47 0.51 0.52 0.75 0.6 0.36 0.38 0.19 0.57
0.01 0.01 0.25 0.39 0.09 0.33 1.0 0.35 0.76 0.74 0.34 0.76 0.06 0.04 0.03 0.08
0.05 0.06 0.8 0.61 0.14 0.12 0.46 0.91 1.0 0.66 0.4 0.24 0.69 0.77 0.37 0.6
0.06 0.05 0.17 0.14 0.05 0.06 0.1 0.29 0.22 0.18 0.13 0.18 1.0 0.21 0.15 0.96
0.04 0.05 0.25 0.47 0.19 0.47 0.49 0.4 1.0 0.73 0.57 0.49 0.09 0.06 0.04 0.09
0.46 0.35 0.53 0.78 0.47 0.52 0.96 0.69 0.76 0.85 0.83 0.72 0.94 0.72 0.62 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)