1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_236 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.28 0.07 0.23 0.28 0.29 0.23 0.6 0.95 0.36 0.53 1.0 0.81 0.2 0.18 0.25 0.29
0.0 0.01 0.06 0.04 0.13 0.17 0.11 1.0 0.33 0.32 0.28 0.26 0.03 0.0 0.0 0.0
0.16 0.16 0.2 0.32 0.57 0.47 0.79 0.88 0.05 0.04 1.0 0.86 0.03 0.02 0.03 0.05
0.0 0.17 0.11 0.14 0.22 0.19 0.22 1.0 0.24 0.49 0.16 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.13 0.09 0.16 0.3 0.13 0.26 0.86 0.47 0.4 1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.2 0.06 0.04 0.22 0.25 0.39 0.22 0.08 0.07 1.0 0.75 0.05 0.0 0.0 0.09
0.4 0.23 0.32 0.39 0.39 0.61 0.82 0.91 0.45 0.37 1.0 0.55 0.66 0.47 0.33 0.61
0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.39 1.0 0.0 0.11 0.79 0.56 0.18 0.39 0.71 0.83
0.05 0.01 0.13 0.1 0.11 0.14 0.31 0.31 0.02 0.03 0.48 0.29 1.0 0.73 0.28 0.52
0.45 0.49 0.37 0.45 0.52 0.56 0.78 0.55 0.57 0.4 1.0 0.86 0.57 0.54 0.46 0.58
0.0 0.07 0.15 0.09 0.44 0.55 1.0 0.87 0.02 0.02 0.85 0.91 0.35 0.09 0.05 0.48
0.0 0.04 0.1 0.07 0.29 0.29 0.23 1.0 0.39 0.37 0.29 0.17 0.02 0.01 0.0 0.01
0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.28 0.33 0.02 0.04 0.29 0.1 0.7 0.53 0.01 1.0
0.03 0.05 0.02 0.01 0.05 0.11 0.04 1.0 0.24 0.26 0.33 0.2 0.03 0.01 0.01 0.03
0.0 0.0 0.01 0.01 0.13 0.14 0.42 0.64 0.02 0.01 1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.3 0.19 0.1 0.2 0.19 1.0 0.43 0.6 0.28
0.31 0.24 0.06 0.05 0.17 0.26 0.41 1.0 0.12 0.14 0.75 0.65 0.12 0.08 0.08 0.16
0.13 0.38 0.31 0.26 0.33 0.39 0.56 0.71 0.38 0.62 0.64 1.0 0.18 0.25 0.32 0.2
0.22 0.39 0.17 0.19 0.34 0.42 0.41 0.2 0.16 0.12 1.0 0.83 0.77 0.53 0.14 0.95
0.19 0.06 0.19 0.26 0.2 0.28 0.64 0.68 0.11 0.12 0.83 0.43 1.0 0.96 0.63 0.71
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.17 0.16 1.0 0.89 0.33 0.67
0.0 0.18 0.02 0.01 0.14 0.09 0.37 0.38 0.01 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24 0.02 0.02 1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.03 0.04 0.21 0.29 0.31 0.25 0.01 0.0 0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.15 0.09 1.0 0.57 0.51 0.4 0.38 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.29 0.05 0.06 0.12 0.32 0.22 1.0 0.12 0.03 0.4 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.23 0.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.2 0.0 1.0
0.0 0.05 0.02 0.01 0.08 0.05 0.11 0.48 0.2 0.15 0.96 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.23 0.03 0.01 0.33 0.25 0.44 0.82 0.03 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.07 0.01 1.0 0.23 0.25 0.34 0.03 0.03 0.01 0.0 0.03
0.28 0.11 0.18 0.15 0.19 0.27 0.34 0.47 0.18 0.1 0.84 1.0 0.39 0.27 0.34 0.4
0.11 0.27 0.11 0.18 0.21 0.29 0.66 0.68 0.4 0.6 1.0 0.78 0.22 0.19 0.15 0.23
0.04 0.0 0.05 0.0 0.14 0.0 0.13 0.17 0.0 0.0 0.29 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.07 0.11 0.03 0.02 0.16 0.13 1.0 0.99 0.22 0.55
0.0 0.0 0.03 0.06 0.23 0.21 0.77 0.5 0.02 0.04 1.0 0.21 0.25 0.05 0.02 0.27
0.0 0.17 0.09 0.05 0.59 0.78 0.33 0.83 0.0 0.0 1.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.17 0.1 0.02 0.24 0.19 0.42 1.0 0.75 0.64 0.34 0.53 0.02 0.06 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.0 0.0 0.23 0.0 1.0 0.16 0.33 0.32
0.0 0.0 0.05 0.03 0.29 0.15 0.29 0.22 0.0 0.0 0.99 1.0 0.03 0.05 0.02 0.03
0.01 0.0 0.1 0.29 0.26 0.38 0.72 0.56 0.0 0.0 1.0 0.98 0.02 0.03 0.02 0.04
0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.12 0.01 0.0 0.38 0.45 0.68 0.58 1.0 0.65
0.02 0.02 0.07 0.07 0.28 0.2 0.88 0.76 0.0 0.0 0.68 1.0 0.02 0.0 0.08 0.12
0.01 0.4 0.08 0.1 0.15 0.21 1.0 0.84 0.11 0.03 0.93 0.81 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.02 0.08 0.04 0.35 0.28 0.4 0.26 0.0 0.0 1.0 0.93 0.01 0.0 0.0 0.01
0.23 0.51 0.24 0.16 0.61 0.47 0.43 0.67 0.5 0.74 0.63 1.0 0.89 0.66 0.57 0.76
0.05 0.18 0.33 0.25 0.35 0.31 0.7 0.57 0.04 0.06 0.82 0.77 0.59 0.46 1.0 0.54
0.04 0.02 0.08 0.08 0.18 0.19 0.4 0.33 0.02 0.04 0.68 1.0 0.21 0.08 0.03 0.27
0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.04 0.4 1.0 0.46 0.62 0.79 0.6 0.02 0.03 0.02 0.03
0.0 0.01 0.04 0.0 0.16 0.6 0.01 0.67 0.95 0.66 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.1 0.07 0.2 0.18 0.37 0.36 0.59 0.47 0.17 0.19 0.77 1.0 0.59 0.52 0.43 0.58
0.0 0.11 0.02 0.05 0.06 0.31 0.42 0.7 0.19 0.47 0.83 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.28 0.07 0.14 0.11 0.17 0.21 0.49 1.0 0.36 0.55 0.53 0.46 0.61 0.36 0.22 0.55
0.02 0.1 0.03 0.0 0.03 0.01 0.33 0.46 0.18 0.26 0.99 1.0 0.08 0.06 0.03 0.08
0.27 0.19 0.26 0.33 0.53 0.66 0.9 0.82 0.15 0.18 1.0 0.68 0.5 0.49 0.38 0.36
0.02 0.02 0.18 0.1 0.4 0.45 0.14 0.77 0.01 0.02 1.0 0.72 0.01 0.0 0.02 0.0
0.25 0.91 0.49 0.32 0.27 0.38 0.66 0.62 0.35 0.74 0.98 1.0 0.19 0.21 0.22 0.25
0.36 0.25 0.04 0.08 0.09 0.21 0.67 0.91 0.07 0.01 0.75 1.0 0.59 0.43 0.25 0.65
0.2 0.02 0.1 0.08 0.16 0.3 0.59 0.46 0.08 0.09 0.44 0.53 0.68 0.31 0.05 1.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.29 0.0 0.3 0.52 1.0 0.63 0.21 0.5 0.25 0.0 0.5 0.47
0.23 0.11 0.07 0.12 0.14 0.17 0.37 0.24 0.09 0.1 0.87 1.0 0.07 0.05 0.06 0.08
0.05 0.3 0.03 0.07 0.08 0.1 0.06 0.43 0.0 0.0 0.24 0.32 0.57 1.0 0.43 0.24
0.22 0.13 0.14 0.12 0.18 0.27 0.39 0.37 0.13 0.12 0.4 0.28 1.0 0.48 0.21 0.86
0.0 0.0 0.01 0.0 0.32 0.07 0.27 0.18 0.0 0.0 1.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.05 0.08 0.17 0.08 0.35 0.41 0.05 0.2 0.78 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.42 0.0 0.08 0.06 0.29 0.3 1.0 0.82 0.74 0.83 0.8 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.05 0.03 0.05 0.39 0.3 0.61 0.46 0.38 0.11 1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.78 0.0 0.0 1.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.01 0.01 0.0 0.22 0.26 0.39 0.32 0.02 0.04 0.77 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.02 0.01 0.14 0.11 0.36 0.99 0.01 0.0 1.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.04 0.06 0.27 0.36 0.72 0.57 0.01 0.02 0.8 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.01 0.01 0.03 0.03 0.3 0.03 0.17 0.64 0.76 0.67 0.26 0.44 0.47 0.51 1.0 0.32
0.11 0.02 0.06 0.05 0.08 0.14 0.25 0.26 0.03 0.04 0.31 0.22 0.93 0.9 0.54 1.0
0.12 0.22 0.13 0.07 0.4 0.13 0.87 0.68 0.0 0.04 1.0 0.31 0.1 0.0 0.39 0.54
0.29 0.2 0.41 0.35 0.47 0.67 0.67 0.8 0.09 0.19 1.0 0.66 0.39 0.3 0.28 0.44
0.01 0.1 0.04 0.06 0.01 0.05 0.08 1.0 0.51 0.22 0.38 0.17 0.01 0.0 0.03 0.03
0.01 0.37 0.0 0.0 0.03 0.17 0.03 1.0 0.01 0.0 0.6 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.06 0.15 0.12 0.27 0.35 0.81 0.76 0.09 0.08 1.0 0.72 0.29 0.23 0.13 0.33
0.0 0.4 0.02 0.05 0.11 0.2 0.68 1.0 0.01 0.02 0.78 0.92 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.1 0.1 0.45 0.0 0.0 0.95 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.06 0.13 0.08 0.14 0.4 0.06 0.2 0.84 0.4 0.66 0.86 1.0 0.27 0.15 0.3 0.17
0.08 0.03 0.03 0.03 0.22 0.07 0.21 1.0 0.55 0.76 0.8 0.53 0.1 0.07 0.07 0.2
0.19 0.18 0.19 0.15 0.45 0.73 0.41 1.0 0.02 0.01 1.0 0.75 0.03 0.02 0.0 0.03
0.52 0.22 0.23 0.27 0.28 0.52 0.78 0.74 0.35 0.43 1.0 0.46 0.94 0.62 0.44 0.95
0.01 0.0 0.06 0.04 0.29 0.21 0.38 0.42 0.0 0.0 1.0 0.53 0.01 0.01 0.0 0.02
0.1 0.07 0.09 0.1 0.18 0.28 0.65 0.6 0.04 0.04 1.0 0.92 0.13 0.1 0.08 0.13
0.46 0.31 0.19 0.11 0.34 0.25 0.43 0.7 0.39 0.65 0.8 0.59 0.75 0.51 0.29 1.0
0.12 0.01 0.09 0.05 0.07 0.13 0.28 0.14 0.02 0.15 0.37 0.13 1.0 0.56 0.3 0.31
0.29 0.05 0.22 0.12 0.26 0.27 0.54 0.79 0.3 0.49 0.48 0.47 0.82 0.75 0.67 1.0
0.0 0.02 0.04 0.04 0.09 0.01 0.03 0.45 0.08 0.08 1.0 0.77 0.01 0.0 0.0 0.0
0.18 0.2 0.05 0.07 0.21 0.2 0.36 0.32 0.0 0.0 1.0 0.91 0.16 0.02 0.01 0.23
0.22 0.09 0.04 0.04 0.08 0.06 0.07 1.0 0.2 0.13 0.26 0.14 0.03 0.01 0.02 0.02
0.11 0.59 0.1 0.06 0.14 0.13 0.39 0.65 0.32 0.44 0.52 0.74 0.77 0.82 1.0 0.79
0.03 0.0 0.01 0.01 0.04 0.06 0.22 0.17 0.04 0.06 0.93 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.25 0.22 0.1 0.08 0.16 0.23 0.56 1.0 0.49 0.58 0.49 0.57 0.93 0.88 0.55 0.74
0.01 0.0 0.11 0.21 0.07 0.12 1.0 0.98 0.01 0.01 0.99 0.78 0.01 0.04 0.0 0.07
0.0 0.34 0.03 0.01 0.06 0.1 0.24 1.0 0.28 0.59 0.25 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.32 0.27 0.21 0.29 0.34 0.51 0.44 0.42 0.35 0.59 0.56 1.0 0.84 0.7 0.97
0.0 0.0 0.07 0.06 0.25 0.25 0.15 0.33 0.01 0.0 0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.11 0.04 0.0 0.01 0.07 0.46 1.0 0.09 0.76 0.61 0.44 0.4 0.36 0.22 0.57
0.08 0.02 0.05 0.03 0.08 0.11 0.2 0.23 0.04 0.04 0.17 0.25 1.0 1.0 0.97 0.72
0.01 0.06 0.32 0.15 0.32 0.18 0.56 0.46 0.29 0.02 1.0 0.33 0.1 0.01 0.02 0.14
0.19 0.12 0.08 0.06 0.25 0.33 0.49 0.43 0.02 0.01 1.0 0.82 0.34 0.31 0.26 0.3
0.48 0.18 0.21 0.25 0.47 0.18 0.39 0.68 0.61 0.55 0.6 1.0 0.44 0.36 0.64 0.96
0.0 0.34 0.05 0.05 0.07 0.1 0.24 1.0 0.26 0.61 0.43 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01
0.21 0.16 0.31 0.35 0.45 0.34 0.86 1.0 0.37 0.65 0.68 0.47 0.26 0.18 0.1 0.2
0.29 0.45 0.41 0.52 0.4 0.29 1.0 0.76 0.14 0.3 0.93 0.61 0.86 0.37 0.2 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)