1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_19 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 4.32 4.78 0.0 1.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
44.1 0.21 15.7 8.94 17.45 33.29 35.23 63.1 4.82 0.42 11.34 21.28 51.09 56.94 27.11 48.68
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0
25.15 8.15 9.11 5.36 14.41 10.1 20.72 17.02 3.62 2.11 8.8 10.91 17.22 15.98 14.54 12.22
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.89 0.77 0.0 1.05
0.25 0.17 0.01 0.01 0.39 0.83 0.67 2.31 0.0 0.01 0.57 0.15 0.29 0.14 0.1 0.52
1.44 0.0 0.14 0.0 0.1 0.31 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.16
9.35 13.1 16.51 8.18 35.2 22.13 7.72 171.13 60.14 60.06 1.51 1.75 10.94 8.91 15.25 10.34
24.59 0.86 0.23 0.32 0.19 0.47 0.07 23.05 0.0 0.0 0.09 0.54 71.97 61.3 16.37 54.5
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
15.39 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 74.34 69.06 18.41 62.25
50.55 1.08 0.0 0.42 0.0 0.0 0.03 42.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.75 0.13 0.1 0.06 0.18 0.03 2.08 0.0 0.0 0.16 0.19 0.1 0.18 0.0 0.09
0.0 0.0 0.02 0.02 0.06 0.0 0.06 0.39 0.0 0.0 0.0 0.05 1.74 0.59 1.51 1.41
1429.56 1.22 0.25 0.85 0.09 0.91 0.32 0.16 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0
3.59 0.15 0.08 0.14 0.06 0.54 0.05 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.92 0.2 0.67
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21 0.44 0.0
37.65 0.58 1.67 1.37 3.56 3.18 1.99 1.85 0.2 0.0 0.36 0.81 2.72 1.43 1.0 2.65
0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 3.22 0.27 1.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.41 0.66 2.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.85 0.23 0.2 0.25 0.35 0.48 0.56 1.83 0.58 0.23 0.07 0.24 10.07 5.19 2.91 7.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57
3792.61 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.99 1.65 3.13 3.27 4.66 9.13 9.5 15.98 1.81 2.88 11.46 7.13 55.17 26.66 16.58 55.42
0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 1.59 1.67 3.9
19.1 3.36 3.47 3.09 2.44 2.34 3.36 4.99 5.68 10.23 3.13 1.43 15.43 28.88 0.0 49.57
10.74 11.77 0.03 0.0 0.0 0.0 0.18 53.77 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.04 0.01 0.08 0.02 0.01 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.68 0.4 1.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
1.54 1.18 0.18 0.0 0.03 0.0 0.11 26.88 8.51 2.62 0.0 0.04 3.98 2.13 0.67 3.13
46.62 6.48 6.04 6.32 6.92 7.53 9.76 12.94 1.57 1.97 9.44 12.52 28.47 18.86 15.44 22.58
59.82 20.98 4.58 3.57 4.68 4.61 19.26 15.84 12.27 10.14 15.35 13.27 28.89 22.55 17.66 29.98
219.16 135.93 76.06 97.57 92.6 77.73 106.15 337.36 142.46 156.34 99.1 92.32 117.01 86.29 96.7 122.91
25.16 1.11 0.2 0.31 1.36 0.89 0.93 8.19 2.95 5.57 1.33 1.07 2.76 2.62 2.14 2.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
1.22 0.05 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.31 0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.09 0.18 0.51
34.34 1.7 3.08 1.1 5.54 5.17 7.87 23.58 4.44 8.29 5.83 12.42 14.77 10.65 5.23 24.81
12.06 5.28 4.1 4.42 6.88 7.94 16.82 22.45 16.2 13.43 13.48 7.79 13.16 10.33 11.54 12.08
10.61 7.64 1.92 1.18 4.09 3.49 7.02 19.13 0.79 0.82 5.99 8.15 11.73 11.07 5.93 13.78
1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 160.5 0.0 0.0 36.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.26 0.0 4.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.61 4.54 2.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.48 0.95 0.0 0.0 0.32 0.28 0.48 0.56 0.0 0.0 0.08 0.04 0.45 0.51 1.43 0.42
66.02 29.97 0.07 0.0 0.0 0.0 0.09 49.1 9.75 6.32 0.04 0.17 68.89 70.98 17.08 50.05
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.67 2.68 0.0 0.0
3.75 0.0 0.39 0.28 0.12 0.54 0.03 3.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
16.21 2.34 0.05 0.06 0.05 0.01 0.13 20.53 0.0 0.04 0.0 0.0 26.18 22.42 8.47 19.62
60.29 0.0 6.85 3.1 7.12 3.69 4.79 22.99 0.03 0.06 1.06 3.87 12.27 10.6 8.7 13.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 8.22 1.77 1.24 4.64
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0
9.29 3.24 2.08 5.1 2.53 2.3 9.38 9.48 0.5 0.48 4.15 3.69 12.2 10.67 2.5 7.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
435.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
237.06 86.15 102.27 69.09 148.93 112.66 124.71 177.89 104.97 139.69 88.98 136.37 132.52 128.01 99.7 122.14
2.21 0.21 0.02 0.03 0.08 0.05 0.05 0.99 0.07 0.08 0.0 0.04 7.16 4.45 1.73 4.55
84.6 21.55 70.53 55.36 82.13 100.14 80.38 134.1 63.66 80.04 95.39 63.36 60.6 36.29 25.93 38.7
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 1.19 0.0 2.34
0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.05 0.07 0.68 0.06 0.09 0.35 0.06 0.1 0.04 0.05 0.0
605.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
298.96 42.33 6.06 9.82 15.05 16.07 26.52 10.2 24.24 19.71 26.52 24.11 1.84 0.75 0.68 2.32
1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
41.66 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 10.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
48.1 0.85 0.11 0.33 0.0 0.33 0.09 0.42 0.06 0.06 0.0 0.06 1.14 2.26 1.95 0.13
1.32 0.72 0.32 0.27 0.47 0.22 1.24 1.66 0.0 0.0 0.38 0.32 0.06 0.06 0.06 0.09
15.56 2.58 0.03 0.0 0.41 0.33 0.46 14.31 0.0 0.12 6.02 3.5 44.43 52.44 12.34 32.74
5294.89 0.45 0.26 0.33 0.4 0.21 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23.93 1.12 0.58 0.37 0.32 0.71 0.41 1.44 2.09 2.06 0.59 0.44 0.54 0.76 0.0 0.75
8.6 3.32 3.24 3.25 4.77 7.73 11.9 19.94 9.99 10.59 8.99 4.48 29.12 26.38 10.88 25.45
30.38 4.7 2.56 2.83 2.82 4.85 10.48 7.34 2.75 5.39 3.47 2.45 25.53 14.06 10.77 37.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.98 0.59 5.18 5.31 4.73 5.63 6.93 17.07 0.0 0.0 0.84 1.84 47.04 30.65 19.34 43.47
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.84 1.64 6.81 5.3 1.43 2.56 1.96 66.37 38.59 19.74 0.64 1.1 0.43 2.19 1.68 0.59
22.18 8.53 2.17 1.05 3.32 3.56 9.28 4.75 2.85 4.77 5.51 4.65 28.28 21.37 18.44 28.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.95 0.0
16.4 4.09 4.29 4.14 6.76 8.57 18.33 28.59 0.85 0.33 7.42 9.86 114.47 110.22 84.29 105.07
0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0
1.42 0.42 0.21 0.0 0.0 0.0 1.14 7.56 0.05 0.0 0.0 0.0 6.99 5.81 8.52 11.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0
5.11 0.41 0.04 0.19 0.52 0.86 0.77 3.1 0.26 0.2 0.96 0.83 1.29 1.57 0.32 2.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0
2.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.03 4.31 3.11 0.29 3.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
176.3 0.48 1.44 2.06 3.31 5.61 3.67 0.04 0.0 0.0 3.86 2.46 0.0 0.03 0.14 0.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)