1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_250 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.05 0.85 0.28 0.32 0.17 0.41 1.0 0.23 0.13 0.23 0.39 0.49 0.05 0.06 0.0 0.06
0.64 0.87 0.26 0.3 0.38 0.61 1.0 0.46 0.36 0.31 0.63 0.76 0.46 0.49 0.49 0.51
0.28 1.0 0.54 0.58 0.73 0.69 0.5 0.46 0.58 0.44 0.43 0.65 0.23 0.24 0.17 0.28
0.18 1.0 0.4 0.28 0.32 0.4 0.27 0.16 0.15 0.15 0.33 0.33 0.28 0.19 0.21 0.26
0.0 0.88 0.41 0.0 0.07 0.13 0.0 0.34 0.2 0.0 0.54 0.3 0.25 0.0 1.0 0.23
0.18 1.0 0.46 0.32 0.21 0.09 0.11 0.21 0.56 0.16 0.44 0.37 0.51 0.26 0.5 0.92
0.79 0.48 0.38 0.35 0.48 1.0 0.46 0.12 0.44 0.15 0.72 0.76 0.37 0.21 0.33 0.4
0.06 1.0 0.11 0.05 0.19 0.62 0.41 0.41 0.15 0.02 0.25 0.47 0.06 0.03 0.0 0.02
0.7 0.71 0.41 0.44 0.76 0.67 0.68 0.31 0.59 0.59 0.76 0.6 0.94 0.96 0.99 1.0
0.55 1.0 0.28 0.5 0.58 0.9 0.55 0.69 0.0 0.0 0.54 0.74 0.02 0.02 0.02 0.03
0.11 1.0 0.1 0.31 0.11 0.9 0.1 0.03 0.5 0.19 0.68 0.3 0.02 0.01 0.01 0.01
0.25 0.58 0.47 0.36 0.4 0.29 0.84 0.36 0.41 0.29 0.34 0.41 0.85 0.99 0.47 1.0
0.39 0.8 0.3 0.38 0.87 0.5 0.88 0.1 0.32 0.32 0.86 1.0 0.37 0.41 0.26 0.65
0.48 0.86 0.31 0.26 0.38 0.51 0.83 0.32 0.15 0.15 0.63 0.62 0.93 0.95 0.86 1.0
0.25 0.16 0.11 0.1 0.15 0.22 0.27 0.19 0.09 0.02 0.19 0.18 1.0 0.68 0.45 0.66
0.44 0.98 0.38 0.55 0.49 0.65 1.0 0.37 0.3 0.35 0.79 0.64 0.31 0.24 0.28 0.39
1.0 0.98 0.59 0.7 0.58 0.86 0.71 0.34 0.63 0.74 0.83 0.77 0.42 0.31 0.27 0.61
0.13 0.26 0.22 0.12 0.23 0.3 0.31 0.13 0.14 0.16 0.32 0.14 1.0 0.72 0.82 0.7
0.88 0.86 0.3 0.33 0.54 0.6 0.65 0.47 0.79 0.36 1.0 0.32 0.28 0.37 0.39 0.4
1.0 0.94 0.34 0.51 0.35 0.81 0.86 0.24 0.3 0.25 0.68 0.62 0.66 0.59 0.67 0.68
0.0 1.0 0.34 0.21 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.26 0.81 0.25 0.0 0.0 0.0 0.58
0.21 1.0 0.23 0.25 0.34 0.05 0.5 0.06 0.0 0.0 0.24 0.51 0.34 0.38 0.14 0.17
0.05 1.0 0.3 0.34 0.37 0.46 0.45 0.2 0.43 0.37 0.52 0.46 0.01 0.07 0.1 0.08
0.09 0.93 0.03 0.23 0.03 0.31 0.26 0.51 0.39 0.33 0.58 0.31 0.1 0.37 0.39 1.0
0.08 0.75 0.29 0.15 0.22 0.36 1.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.47 0.0 0.08 0.35 0.0
0.77 0.37 0.55 0.26 0.68 1.0 0.3 0.05 0.21 0.0 0.11 0.0 0.0 0.48 0.51 0.0
0.34 1.0 0.11 0.14 0.21 0.65 0.42 0.2 0.41 0.2 0.48 0.45 0.56 0.63 0.35 0.43
0.03 0.53 0.21 0.3 0.22 1.0 0.84 0.07 0.06 0.07 0.4 0.28 0.07 0.06 0.04 0.06
0.83 0.86 0.61 0.72 0.8 0.72 0.82 0.62 0.93 0.79 1.0 0.74 0.33 0.28 0.31 0.3
0.53 0.52 0.0 0.0 0.39 0.67 0.49 0.37 0.0 0.08 0.26 0.32 0.58 1.0 0.38 0.89
0.38 0.29 0.43 0.29 0.66 1.0 0.57 0.3 0.31 0.0 0.0 0.07 0.68 0.28 0.5 0.24
0.1 0.72 0.3 0.36 0.28 0.61 1.0 0.1 0.0 0.0 0.41 0.51 0.02 0.01 0.0 0.04
0.02 0.76 0.13 0.02 0.14 1.0 0.67 0.22 0.09 0.02 0.17 0.14 0.06 0.17 0.59 0.0
0.01 0.46 0.37 0.18 0.15 0.87 1.0 0.34 0.18 0.23 0.34 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.47 0.35 0.33 0.43 0.46 0.65 0.38 0.31 0.18 0.7 0.4 1.0 0.72 0.82 0.96
0.02 0.41 0.05 0.04 0.06 0.45 0.03 0.04 0.12 0.3 0.3 0.32 0.5 0.85 1.0 0.34
0.54 0.78 0.19 0.26 0.59 0.35 1.0 0.1 0.02 0.02 0.56 0.54 0.1 0.07 0.09 0.13
1.0 0.87 0.42 0.58 0.68 0.66 0.76 0.53 0.64 0.67 0.81 0.37 0.46 0.34 0.35 0.55
0.01 1.0 0.28 0.3 0.36 0.45 0.34 0.4 0.03 0.02 0.29 0.48 0.03 0.01 0.0 0.03
0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.95 0.34 0.55
0.25 0.4 0.07 0.15 0.25 0.37 0.43 0.19 0.15 0.1 0.14 0.13 0.88 1.0 0.68 0.64
0.44 1.0 0.35 0.33 0.35 0.82 0.71 0.32 0.22 0.23 0.51 0.48 0.88 0.97 0.9 0.85
0.75 0.86 0.55 0.65 0.89 0.83 1.0 0.47 0.51 0.48 0.93 0.87 0.42 0.33 0.35 0.38
0.61 0.76 0.53 0.57 0.54 0.42 1.0 0.33 0.38 0.29 0.54 0.74 0.61 0.5 0.45 0.71
0.4 1.0 0.33 0.34 0.61 0.9 0.73 0.52 0.25 0.4 0.91 0.48 0.51 0.33 0.32 0.39
0.06 0.28 0.25 0.21 0.14 1.0 0.72 0.14 0.04 0.05 0.22 0.12 0.05 0.07 0.0 0.08
0.41 0.45 0.28 0.25 0.41 0.4 0.53 0.28 0.22 0.1 0.44 0.44 1.0 0.9 0.67 0.77
0.73 0.59 0.36 0.41 0.64 0.53 0.64 0.3 0.43 0.38 0.76 0.6 0.98 0.9 0.51 1.0
0.66 0.86 0.36 0.62 0.66 0.95 0.92 0.28 0.66 0.53 0.56 0.87 1.0 0.6 0.28 1.0
0.22 0.26 0.15 0.16 0.22 0.27 0.28 0.13 0.12 0.02 0.22 0.23 0.93 1.0 0.63 0.64
0.06 1.0 0.15 0.3 0.45 0.47 0.07 0.35 0.01 0.01 0.63 0.56 0.0 0.01 0.06 0.06
0.27 0.31 0.11 0.08 0.12 0.31 0.26 0.2 0.04 0.02 0.08 0.08 0.82 0.82 1.0 0.83
0.01 1.0 0.17 0.32 0.42 0.92 0.97 0.12 0.14 0.34 0.15 0.26 0.01 0.01 0.11 0.01
0.46 0.64 0.2 0.31 0.17 0.62 0.63 0.32 0.13 0.03 0.32 0.32 0.86 1.0 0.22 0.97
0.28 1.0 0.74 0.49 0.52 0.56 0.67 0.77 0.23 0.19 0.44 0.5 0.4 0.57 0.39 0.7
0.07 1.0 0.27 0.34 0.36 0.21 0.39 0.32 0.02 0.02 0.27 0.68 0.11 0.06 0.04 0.14
0.0 0.79 0.17 0.0 0.0 1.0 0.53 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 1.0 0.11 0.15 0.16 0.59 0.5 0.24 0.39 0.39 0.73 0.55 0.8 0.51 0.58 0.87
0.18 1.0 0.53 0.37 0.29 0.67 0.28 0.77 0.14 0.01 0.62 0.49 0.19 0.26 0.42 0.24
0.16 1.0 0.36 0.44 0.38 0.54 0.32 0.23 0.01 0.13 0.47 0.57 0.44 0.18 0.18 0.78
0.66 0.94 0.25 0.26 0.4 1.0 0.88 0.28 0.23 0.16 0.39 0.19 0.47 0.25 0.08 0.51
0.05 1.0 0.3 0.29 0.12 0.69 0.38 0.05 0.43 0.04 0.32 0.33 0.05 0.08 0.0 0.0
0.23 0.35 0.15 0.27 0.31 0.47 0.27 0.24 0.1 0.13 0.25 0.17 0.77 0.76 1.0 0.56
0.41 0.89 0.32 0.35 0.58 0.84 1.0 0.13 0.27 0.15 0.65 0.55 0.04 0.05 0.05 0.04
0.48 1.0 0.05 0.02 0.12 0.71 0.89 0.29 0.21 0.0 0.7 0.54 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.59 0.04 0.03 0.07 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.08 0.0 0.09 0.62 0.1 0.17 0.0 0.25 0.63 0.71 0.0 0.0 0.0 0.54
0.06 0.09 0.16 0.26 0.35 1.0 0.76 0.08 0.06 0.03 0.23 0.17 0.0 0.0 0.01 0.0
0.12 0.53 0.04 0.09 0.03 0.28 0.43 0.14 0.04 0.06 0.3 0.43 0.97 0.81 0.16 1.0
0.0 0.28 0.17 0.09 0.13 0.21 0.06 0.42 0.0 0.06 0.2 0.06 1.0 0.23 0.15 0.53
0.26 1.0 0.14 0.36 0.23 0.66 0.37 0.1 0.04 0.02 0.33 0.18 0.19 0.12 0.04 0.19
0.07 1.0 0.26 0.19 0.17 0.13 0.61 0.08 0.06 0.09 0.46 0.84 0.14 0.42 0.34 0.24
0.04 0.47 0.08 0.09 0.18 0.32 0.13 0.08 0.05 0.01 0.19 0.33 0.21 0.54 1.0 0.1
0.63 0.41 0.27 0.2 0.49 0.73 0.66 0.31 0.34 0.11 0.48 0.51 0.53 0.75 0.89 1.0
0.09 0.62 0.19 0.14 0.14 0.72 1.0 0.34 0.13 0.35 0.4 0.43 0.04 0.0 0.0 0.02
0.53 0.28 0.04 0.07 0.26 1.0 0.52 0.2 0.1 0.12 0.64 0.65 0.94 0.74 0.34 0.61
0.01 1.0 0.4 0.34 0.48 0.47 0.34 0.6 0.02 0.02 0.04 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.55 0.15 0.17 0.4 0.0 0.07 0.0 0.13 0.31 0.18 0.0 0.0 0.3 0.0
0.52 0.4 0.1 0.0 0.57 1.0 0.58 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.38 0.39 0.47
0.64 0.94 0.63 0.77 0.92 1.0 0.88 0.58 0.69 0.63 0.88 0.45 0.39 0.22 0.14 0.37
0.72 0.94 0.43 0.64 0.7 0.48 0.77 0.62 1.0 0.76 0.82 0.59 0.9 0.59 0.54 0.95
0.99 0.94 0.47 0.72 0.68 0.71 0.78 0.32 0.65 1.0 0.79 0.9 0.41 0.3 0.23 0.56
0.14 1.0 0.54 0.44 0.28 0.44 0.28 0.07 0.0 0.0 0.42 0.43 0.38 0.21 0.23 0.46
0.1 0.29 0.12 0.13 0.16 0.22 0.22 0.13 0.08 0.09 0.03 0.07 0.58 1.0 0.42 0.42
1.0 0.82 0.71 0.76 0.7 0.89 0.92 0.55 0.58 0.62 0.95 0.82 0.76 0.63 0.63 0.73
0.6 0.45 0.4 0.4 0.45 0.56 0.53 0.31 0.36 0.31 0.76 0.59 0.79 0.77 0.46 1.0
0.45 0.19 0.15 0.17 0.25 0.23 0.24 0.12 0.18 0.18 0.45 0.3 0.65 0.75 0.65 1.0
0.48 0.79 0.34 0.58 0.51 0.61 0.85 0.22 0.38 0.3 0.72 0.79 0.72 0.68 0.61 1.0
0.74 1.0 0.54 0.76 0.63 0.75 0.75 0.51 0.59 0.57 0.91 0.71 0.8 0.61 0.6 0.72
0.15 1.0 0.47 0.7 0.56 0.69 0.97 0.65 0.22 0.18 0.74 0.81 0.13 0.14 0.06 0.12
0.75 1.0 0.54 0.38 0.7 0.54 0.99 0.36 0.27 0.42 0.44 0.79 0.5 0.43 0.54 0.62
0.53 0.75 0.3 0.21 0.42 0.61 0.72 0.42 0.28 0.2 0.41 0.35 0.89 1.0 0.84 0.96
0.5 0.45 0.29 0.19 0.31 0.52 0.38 0.23 0.33 0.25 0.22 0.27 0.59 0.61 1.0 0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)