1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_188 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.09 0.55 1.0 0.64 0.86 0.51 0.03 0.34 0.1 0.19 0.18 0.2 0.16 0.15 0.24 0.17
0.08 0.44 1.0 0.89 0.67 0.69 0.08 0.22 0.21 0.26 0.32 0.26 0.01 0.01 0.1 0.02
0.37 0.29 0.53 0.42 1.0 0.3 0.05 0.19 0.14 0.07 0.04 0.03 0.08 0.08 0.01 0.14
0.04 1.0 0.19 0.16 0.27 0.18 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.11 0.0 0.0
0.24 0.94 1.0 0.82 0.46 0.66 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.07 0.09 0.18 0.74 0.69
0.0 1.0 0.26 0.46 0.59 0.2 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.12 0.17 0.0 0.0
0.22 1.0 0.5 0.63 0.44 0.31 0.17 0.11 0.1 0.08 0.33 0.26 0.07 0.07 0.07 0.09
0.03 0.8 1.0 0.42 0.72 0.53 0.33 0.22 0.01 0.01 0.05 0.08 0.01 0.01 0.04 0.01
0.2 1.0 0.33 0.48 0.41 0.2 0.04 0.02 0.07 0.08 0.19 0.48 0.15 0.01 0.02 0.24
0.39 0.91 0.97 0.97 0.95 1.0 0.21 0.14 0.08 0.04 0.14 0.13 0.79 0.93 0.27 0.81
0.64 1.0 0.5 0.68 0.44 0.4 0.35 0.16 0.37 0.27 0.3 0.26 0.28 0.22 0.1 0.4
0.62 1.0 0.41 0.62 0.52 0.23 0.03 0.05 0.02 0.0 0.01 0.03 0.3 0.26 0.21 0.26
0.01 0.86 0.71 0.26 0.49 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.04 0.0 0.15
0.04 0.94 0.91 0.78 0.55 1.0 0.02 0.16 0.25 0.25 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.9 1.0 0.67 0.96 0.6 0.57 0.43 0.32 0.49 0.5 0.56 0.69 0.2 0.27 0.41 0.37
0.23 0.66 1.0 0.81 0.58 0.74 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 0.07 0.02 0.12 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.02 1.0 0.04
0.04 0.6 0.9 1.0 0.41 0.66 0.06 0.38 0.88 0.28 0.04 0.04 0.01 0.11 0.01 0.01
0.16 0.37 0.58 0.65 0.42 1.0 0.12 0.09 0.06 0.1 0.31 0.29 0.04 0.04 0.03 0.04
0.1 0.48 0.87 0.54 1.0 0.87 0.26 0.64 0.02 0.08 0.19 0.72 0.7 0.55 0.6 0.58
0.02 0.01 1.0 0.63 0.7 0.43 0.14 0.39 0.11 0.55 0.06 0.1 0.18 0.01 0.0 0.17
0.05 0.62 1.0 0.86 0.95 0.65 0.27 0.08 0.07 0.04 0.25 0.3 0.05 0.06 0.09 0.04
0.04 0.94 0.59 0.69 1.0 0.45 0.32 0.05 0.03 0.01 0.06 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.35 0.96 0.76 1.0 0.66 0.09 0.06 0.22 0.08 0.45 0.36 0.12 0.06 0.11 0.08
0.05 0.57 1.0 0.54 0.81 0.42 0.11 0.02 0.06 0.07 0.05 0.09 0.26 0.3 0.16 0.19
0.21 0.35 1.0 0.69 0.44 0.54 0.05 0.05 0.01 0.02 0.23 0.21 0.01 0.01 0.03 0.01
0.13 1.0 0.93 0.62 0.74 0.85 0.1 0.11 0.36 0.2 0.27 0.24 0.28 0.4 0.24 0.29
0.04 0.98 0.83 1.0 0.86 0.2 0.4 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.86 1.0 0.68 0.73 0.66 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.06 0.05
0.01 0.45 1.0 0.84 0.7 0.71 0.05 0.03 0.01 0.01 0.1 0.12 0.01 0.0 0.0 0.01
0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.51 1.0 0.7 0.31
0.01 0.99 0.43 0.5 1.0 0.59 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.58 0.68 0.71 0.38 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.44 0.27 0.28 1.0 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.53 1.0 0.82 0.7 0.61 0.2 0.12 0.02 0.01 0.11 0.23 0.03 0.01 0.0 0.05
0.12 0.38 0.65 0.05 1.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.97 0.0
0.12 1.0 0.55 0.59 0.58 0.15 0.18 0.04 0.07 0.05 0.19 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.83 1.0 0.55 0.77 0.66 0.66 0.42 0.07 0.05 0.16 0.34 0.11 0.38 0.36 0.61
0.09 0.73 0.99 1.0 0.72 0.89 0.45 0.24 0.19 0.31 0.31 0.43 0.16 0.19 0.08 0.15
0.33 1.0 0.6 0.69 0.46 0.38 0.39 0.42 0.14 0.04 0.26 0.2 0.02 0.01 0.01 0.08
0.4 0.49 0.69 1.0 0.85 0.78 0.4 0.34 0.34 0.24 0.42 0.47 0.35 0.39 0.35 0.37
0.17 0.44 0.49 0.49 0.31 1.0 0.05 0.18 0.07 0.06 0.18 0.2 0.13 0.06 0.23 0.06
0.07 0.84 0.86 1.0 0.78 0.58 0.25 0.15 0.1 0.05 0.31 0.28 0.06 0.04 0.04 0.06
0.08 1.0 0.57 0.66 0.5 0.68 0.15 0.12 0.31 0.22 0.24 0.1 0.04 0.02 0.15 0.27
0.01 0.78 0.5 0.7 1.0 0.34 0.04 0.06 0.07 0.05 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.53 1.0 0.97 0.89 0.78 0.33 0.14 0.27 0.25 0.26 0.42 0.53 0.53 0.48 0.64
0.5 0.91 0.85 0.83 0.86 0.71 0.27 0.24 0.07 0.02 0.2 0.2 0.92 1.0 0.58 0.61
0.0 0.82 1.0 0.69 0.9 0.78 0.1 0.01 0.02 0.0 0.08 0.26 0.02 0.0 0.04 0.03
0.27 1.0 0.72 0.57 0.93 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
0.1 1.0 0.54 0.7 0.5 0.34 0.1 0.05 0.37 0.37 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.32 0.58 0.59 0.36 1.0 0.16 0.14 0.02 0.02 0.08 0.09 0.06 0.05 0.0 0.1
0.04 1.0 0.6 0.31 0.32 1.0 0.27 0.01 0.01 0.0 0.09 0.11 0.04 0.04 0.47 0.04
0.54 1.0 0.86 0.88 0.88 0.86 0.53 0.55 0.5 0.51 0.42 0.54 0.82 0.75 0.52 0.71
0.0 0.46 0.73 0.81 1.0 0.14 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.85 0.94 0.48 0.25 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.11 0.0 0.06 0.0 0.0
0.04 0.37 1.0 0.89 0.76 0.73 0.1 0.22 0.13 0.08 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.67 0.55 0.69 0.58 1.0 0.19 0.32 0.3 0.41 0.31 0.21 0.13 0.11 0.08 0.15
0.12 0.44 0.35 0.42 1.0 0.31 0.09 0.21 0.12 0.09 0.16 0.2 0.05 0.02 0.12 0.06
0.05 0.47 0.55 0.25 1.0 0.46 0.23 0.04 0.0 0.0 0.12 0.16 0.01 0.0 0.01 0.03
0.0 1.0 0.57 0.26 0.1 0.44 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 1.0 0.77 0.29 0.66 0.5 0.13 0.02 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 1.0 0.31 0.04 0.59 0.32 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.99 0.85 1.0 0.51 0.54 0.12 0.16 0.7 0.26 0.22 0.22 0.19 0.04 0.38 0.18
0.11 0.98 1.0 0.78 0.72 0.73 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.09 0.28 0.17 0.04 0.34
0.08 0.69 1.0 0.82 0.73 0.92 0.51 0.2 0.13 0.07 0.48 0.32 0.02 0.01 0.01 0.02
0.44 0.71 0.6 0.37 0.38 1.0 0.43 0.52 0.3 0.21 0.44 0.31 0.44 0.66 0.54 0.35
0.13 1.0 0.62 0.7 0.95 0.39 0.29 0.08 0.03 0.0 0.08 0.0 0.44 0.34 0.29 0.47
0.09 0.47 0.39 0.12 0.51 0.39 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.0 0.98
0.04 1.0 0.34 0.31 0.35 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.1 0.0 0.26
0.17 0.56 0.42 0.26 0.28 0.46 0.1 0.08 0.04 0.0 0.04 0.04 0.29 1.0 0.76 0.27
0.23 0.57 0.7 0.48 1.0 0.3 0.05 0.18 0.13 0.09 0.03 0.05 0.24 0.16 0.15 0.16
0.56 0.56 0.98 0.97 1.0 0.81 0.75 0.47 0.25 0.21 0.47 0.58 0.52 0.61 0.54 0.45
0.17 0.95 1.0 0.89 0.57 0.69 0.1 0.06 0.13 0.14 0.08 0.12 0.11 0.14 0.01 0.14
0.31 0.76 0.49 0.63 0.42 0.42 0.08 0.12 0.04 0.03 0.01 0.01 1.0 0.81 0.24 0.9
0.01 1.0 0.79 0.74 0.46 0.59 0.03 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.03 0.08 0.02
0.41 0.84 0.49 0.7 1.0 0.48 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.24
0.16 0.37 1.0 0.83 1.0 0.35 0.04 0.39 0.1 0.12 0.19 0.45 0.07 0.07 0.1 0.06
0.0 1.0 0.82 0.92 0.6 0.15 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.11 0.22 0.0
0.0 0.41 0.05 1.0 0.58 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.6 0.38 1.0 0.36 0.38 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.1 0.11 0.15 0.17 0.08 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.85 1.0 0.3 0.31
0.66 0.92 0.76 1.0 0.75 0.43 0.3 0.13 0.41 0.29 0.32 0.39 0.22 0.19 0.18 0.28
0.05 1.0 0.71 0.74 0.37 0.42 0.16 0.04 0.02 0.02 0.19 0.06 0.28 0.1 0.55 0.1
0.19 0.53 0.68 0.76 0.7 0.19 0.33 0.53 0.22 0.22 0.17 0.21 0.92 0.73 0.58 1.0
0.13 0.53 1.0 1.0 0.61 0.59 0.08 0.17 0.01 0.01 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.44 0.86 1.0 0.82 0.81 0.2 0.14 0.25 0.26 0.41 0.47 0.22 0.19 0.19 0.24
0.6 1.0 0.57 0.75 0.89 0.5 0.17 0.12 0.19 0.3 0.17 0.22 0.5 0.27 0.36 0.72
0.23 0.73 1.0 0.75 0.87 1.0 0.17 0.25 0.3 0.61 0.24 0.17 0.66 0.99 0.31 0.71
0.23 1.0 0.67 0.79 0.78 0.68 0.28 0.32 0.19 0.21 0.31 0.22 0.12 0.12 0.14 0.13
0.12 1.0 0.94 0.52 0.43 0.7 0.1 0.14 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.48 0.04
0.0 1.0 0.33 0.57 0.04 0.34 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.14 1.0 0.56 0.51 0.48 0.43 0.13 0.05 0.0 0.0 0.02 0.06 0.25 0.23 0.79 0.31
0.42 0.53 0.97 1.0 0.87 0.85 0.55 0.38 0.14 0.16 0.44 0.49 0.43 0.34 0.3 0.4
0.24 0.41 1.0 0.72 1.0 0.56 0.22 0.58 0.35 0.51 0.37 0.52 0.28 0.15 0.19 0.31
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.41 1.0 0.08 0.17
0.25 0.79 1.0 0.89 0.73 0.69 0.26 0.41 0.11 0.1 0.28 0.51 0.4 0.27 0.46 0.51
0.0 1.0 0.88 0.59 0.6 0.9 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.05 0.0 0.02 0.2 0.0
0.1 1.0 0.42 0.53 0.15 0.34 0.13 0.04 0.05 0.08 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.76 0.46 0.52 1.0 0.51 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.0 0.78 0.64 0.64 0.69 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 0.54 0.47 1.0 0.65
0.12 0.46 0.24 0.21 0.79 0.23 0.09 0.09 0.1 0.1 0.1 0.16 0.39 0.31 1.0 0.24
0.49 0.81 0.77 0.92 1.0 0.75 0.6 0.31 0.31 0.22 0.37 0.36 0.28 0.37 0.64 0.25
0.0 1.0 0.36 0.39 0.39 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0
0.11 0.52 0.85 0.94 1.0 0.8 0.29 0.26 0.19 0.17 0.52 0.34 0.17 0.12 0.07 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)