1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_122 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.29 0.19 0.53 0.66 0.49 1.0 0.29 0.24 0.19 0.21 0.25 0.25 0.25 0.28 0.23 0.27
0.0 0.0 0.44 0.39 1.0 0.95 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.42 0.02
0.0 0.0 0.47 0.35 0.79 1.0 0.32 0.18 0.01 0.07 0.04 0.04 0.96 0.71 0.43 0.92
0.0 0.0 0.5 0.36 1.0 0.94 0.33 0.08 0.0 0.0 0.19 0.24 0.0 0.0 0.03 0.0
0.07 0.01 0.41 0.49 0.83 1.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.23 0.25 0.04 0.03 0.05 0.04
0.02 0.03 0.39 0.46 0.51 1.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.07 0.06 0.01 0.0 0.03 0.01
0.03 0.03 0.42 0.63 0.66 1.0 0.04 0.0 0.03 0.07 0.13 0.17 0.01 0.0 0.01 0.03
0.01 0.01 0.58 0.41 0.61 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.04 0.01 0.02 0.12 0.04
0.21 0.0 0.4 0.54 0.34 1.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.11 0.13 0.03 0.1 0.16 0.05
0.0 0.0 0.28 0.23 0.7 1.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.07 0.25 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.0 0.46 0.3 0.32 1.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.13 0.11 0.13 0.2 0.04 0.1 0.0 0.0 0.06 0.07 1.0 0.99 0.7 0.94
0.0 0.0 0.28 0.15 0.73 1.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.56 0.54 0.45 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.06 0.39 0.41 0.65 1.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.08 0.1 0.23 0.23 0.23 0.29
0.01 0.0 0.23 0.75 0.57 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02
0.0 0.05 0.5 0.42 0.83 1.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.13 0.35 0.42 0.57 1.0 0.08 0.02 0.01 0.01 0.06 0.05 0.03 0.04 0.05 0.02
0.09 0.03 0.46 0.69 1.0 0.96 0.23 0.22 0.03 0.02 0.29 0.29 0.03 0.02 0.02 0.08
0.06 0.01 0.55 0.62 0.88 1.0 0.26 0.01 0.0 0.0 0.11 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.47 0.66 0.37 1.0 0.01 0.03 0.01 0.04 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.07 0.68 0.62 0.76 1.0 0.12 0.12 0.05 0.13 0.29 0.24 0.02 0.04 0.04 0.02
0.08 0.0 0.41 0.34 0.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.07 0.8 0.24 0.4 1.0 0.07 0.11 0.03 0.02 0.04 0.04 0.28 0.05 0.01 0.23
0.02 0.07 0.53 0.43 0.42 1.0 0.06 0.09 0.09 0.06 0.15 0.13 0.03 0.03 0.13 0.04
0.02 0.04 0.47 0.48 1.0 0.92 0.04 0.05 0.04 0.05 0.12 0.15 0.19 0.25 0.3 0.22
0.0 0.0 0.22 0.52 0.47 1.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.09 0.17 0.17 0.25 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.78 0.55 0.13 1.0
0.0 0.0 0.29 0.7 0.85 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.07 0.3 0.0
0.0 0.0 0.47 0.25 0.63 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.32 0.4 0.59 0.83 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.66 1.0 0.69 0.36
0.0 0.08 0.45 0.51 0.38 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.25 0.21 0.06 0.06 0.08 0.01
0.0 0.04 0.42 0.3 0.67 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0
0.05 0.16 0.4 0.46 1.0 0.94 0.19 0.01 0.01 0.0 0.21 0.15 0.01 0.01 0.04 0.01
0.0 0.01 0.33 0.41 0.39 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.06 0.01 0.02 0.01 0.02
0.02 0.02 0.33 0.56 0.44 1.0 0.1 0.03 0.03 0.04 0.21 0.14 0.03 0.02 0.04 0.04
0.01 0.0 0.61 0.46 0.7 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.47 0.46 0.75 1.0 0.23 0.08 0.0 0.0 0.04 0.21 0.2 0.13 0.08 0.13
0.0 0.05 0.42 0.47 1.0 0.92 0.1 0.08 0.07 0.17 0.36 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.53 0.36 0.57 1.0 0.06 0.12 0.04 0.03 0.07 0.09 0.2 0.12 0.0 0.17
0.01 0.0 0.45 0.44 0.79 1.0 0.03 0.06 0.01 0.0 0.07 0.04 0.04 0.01 0.02 0.05
0.07 0.14 0.45 0.35 0.89 1.0 0.01 0.05 0.01 0.03 0.08 0.11 0.11 0.16 0.39 0.27
0.03 0.02 0.56 0.43 0.34 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.14 0.12 0.01 0.0 0.03 0.03
0.01 0.0 0.35 0.59 0.51 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.2 0.47 0.63 0.66 1.0 0.05 0.06 0.12 0.11 0.14 0.07 0.05 0.04 0.07 0.06
0.0 0.0 0.37 0.48 0.36 1.0 0.01 0.12 0.01 0.03 0.08 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.23 0.39 0.24 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.58 0.32 0.82 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0
0.11 0.07 0.4 0.49 0.47 1.0 0.2 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.06 0.07 0.14 0.09
0.0 0.02 0.53 0.4 0.4 1.0 0.07 0.04 0.03 0.03 0.14 0.13 0.05 0.06 0.05 0.06
0.08 0.04 0.33 0.31 0.64 1.0 0.17 0.03 0.07 0.06 0.11 0.1 0.04 0.04 0.07 0.03
0.0 0.0 0.44 0.46 0.33 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.01 0.34 0.3 0.85 1.0 0.06 0.01 0.01 0.04 0.14 0.14 0.04 0.07 0.04 0.07
0.01 0.01 0.39 0.42 0.8 1.0 0.01 0.01 0.03 0.06 0.05 0.05 0.02 0.02 0.07 0.04
0.0 0.0 0.48 0.37 0.64 1.0 0.35 0.06 0.0 0.0 0.02 0.14 0.03 0.01 0.0 0.01
0.0 0.01 0.53 0.47 0.93 1.0 0.16 0.05 0.01 0.01 0.05 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0
0.12 0.03 0.47 0.87 0.95 1.0 0.2 0.18 0.07 0.03 0.11 0.19 0.17 0.13 0.19 0.15
0.0 0.0 0.61 0.58 0.64 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.12 0.48 0.74 0.48 1.0 0.14 0.13 0.06 0.05 0.21 0.26 0.11 0.08 0.16 0.12
0.11 0.07 0.55 0.65 0.75 1.0 0.29 0.45 0.06 0.05 0.36 0.46 0.22 0.23 0.3 0.21
0.0 0.0 0.46 0.36 0.46 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.06 0.08 0.05 0.0 0.11
0.01 0.0 0.47 0.61 0.71 1.0 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.34 0.33 0.49 1.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.46 0.6 0.62 1.0 0.09 0.0 0.01 0.02 0.12 0.13 0.01 0.0 0.02 0.0
0.03 0.0 0.52 0.58 0.89 1.0 0.16 0.21 0.02 0.0 0.11 0.18 0.28 0.43 0.44 0.22
0.0 0.0 0.49 0.38 0.64 1.0 0.33 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.34 0.56 0.59 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.63 0.44 0.51 1.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.07 0.4 0.62 0.44 1.0 0.17 0.09 0.18 0.22 0.18 0.15 0.1 0.07 0.05 0.09
0.02 0.01 0.59 0.57 0.46 1.0 0.08 0.05 0.01 0.0 0.01 0.05 0.08 0.02 0.07 0.06
0.08 0.06 0.38 0.51 0.78 1.0 0.15 0.1 0.09 0.09 0.21 0.14 0.06 0.05 0.05 0.08
0.0 0.0 0.52 0.39 0.78 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.54 0.39 0.46 1.0 0.25 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.37 0.49 0.53 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.08 0.1 0.01 0.01 0.02 0.01
0.01 0.01 0.36 0.47 0.52 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.09 0.1 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.09 0.56 0.6 0.76 1.0 0.08 0.05 0.03 0.06 0.38 0.37 0.01 0.02 0.04 0.02
0.03 0.08 0.61 0.4 0.47 1.0 0.03 0.1 0.06 0.05 0.08 0.07 0.07 0.09 0.3 0.1
0.01 0.0 0.49 0.54 0.57 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.4 0.55 0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.34 0.57 0.36 1.0 0.01 0.0 0.14 0.02 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.39 0.51 0.43 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.24 0.59 0.48 1.0 0.81 0.1 0.08 0.12 0.05 0.11 0.15 0.15 0.09 0.12 0.2
0.02 0.0 0.47 0.46 0.34 1.0 0.28 0.09 0.02 0.03 0.07 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0
0.03 0.0 0.4 0.74 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.24 0.0
0.02 0.01 0.5 0.52 0.96 1.0 0.03 0.02 0.12 0.15 0.34 0.3 0.01 0.02 0.08 0.03
0.02 0.01 0.38 0.46 0.66 1.0 0.07 0.07 0.01 0.0 0.1 0.11 0.04 0.03 0.02 0.04
0.0 0.0 0.34 0.49 0.63 1.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.05 0.05 0.0 0.01 0.04 0.01
0.0 0.0 0.34 0.64 0.74 1.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.51 0.47 0.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.97 0.53 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.4 0.47 0.68 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.17 0.81 0.7 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.35 0.59 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.53 0.43 0.53 1.0 0.09 0.08 0.01 0.0 0.04 0.12 0.04 0.05 0.12 0.09
0.01 0.01 0.53 0.51 0.72 1.0 0.03 0.02 0.03 0.05 0.16 0.13 0.01 0.03 0.02 0.01
0.03 0.01 0.53 0.45 1.0 0.98 0.04 0.18 0.13 0.08 0.28 0.21 0.88 0.64 0.31 0.46
0.0 0.0 0.23 0.72 0.48 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.02 0.39 0.3 0.53 1.0 0.24 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0
0.01 0.0 0.62 0.03 0.44 1.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.25 0.35 0.41
0.01 0.0 0.44 0.54 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01
0.16 0.21 0.54 0.63 0.81 1.0 0.08 0.23 0.0 0.02 0.07 0.08 0.64 0.38 0.11 0.15
0.03 0.05 0.15 0.2 0.46 0.48 0.13 0.07 0.04 0.01 0.1 0.12 0.55 0.65 0.56 1.0
0.0 0.0 0.51 0.43 0.2 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.52 0.39 0.35 1.0 0.03 0.02 0.05 0.01 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.46 0.46 0.96 1.0 0.31 0.23 0.01 0.07 0.17 0.1 0.64 0.36 0.0 0.33
0.02 0.03 0.52 0.48 0.54 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.09 0.16 0.36 0.33 0.42
0.0 0.0 0.55 0.29 0.22 1.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.45 0.47 0.61 1.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.11 0.18 0.14 0.23
0.02 0.0 0.46 0.65 0.64 1.0 0.18 0.1 0.04 0.02 0.07 0.08 0.22 0.11 0.09 0.19
0.01 0.0 0.35 0.52 0.25 1.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.12 0.12 0.02 0.01 0.24 0.01
0.14 0.13 0.61 0.72 0.97 1.0 0.26 0.16 0.04 0.05 0.21 0.24 0.59 0.54 0.39 0.66
0.0 0.0 0.46 0.46 0.59 1.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.09 0.4 0.44 0.69 1.0 0.07 0.04 0.1 0.05 0.08 0.0 0.12 0.26 0.24 0.11
0.0 0.0 0.6 0.48 0.33 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0
0.02 0.0 0.29 0.19 0.72 1.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.08 0.05 0.0 0.03 0.48 0.0
0.02 0.07 0.52 0.42 0.34 1.0 0.1 0.04 0.04 0.0 0.08 0.06 0.09 0.04 0.02 0.11
0.08 0.07 0.28 0.54 0.71 1.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.31 0.12 0.42 0.55 0.29 1.0 0.13 0.04 0.04 0.09 0.17 0.13 0.05 0.05 0.06 0.07
0.0 0.0 0.59 0.66 0.48 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0
0.04 0.15 0.49 0.4 0.7 1.0 0.12 0.07 0.0 0.01 0.28 0.26 0.01 0.04 0.02 0.01
0.0 0.07 0.43 0.33 0.34 1.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.17 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.22 0.66 0.48 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.49 0.39 0.77 1.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.19 0.18 0.04 0.04 0.1 0.1
0.07 0.14 0.5 0.59 0.36 1.0 0.07 0.07 0.11 0.05 0.3 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.69 0.52 0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.28 0.43 0.7 1.0 0.18 0.15 0.0 0.0 0.19 0.19 0.03 0.04 0.02 0.06
0.0 0.0 0.58 0.69 0.29 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.48 0.54 0.64 1.0 0.15 0.05 0.03 0.02 0.15 0.12 0.03 0.04 0.14 0.03
0.0 0.0 0.49 0.27 0.53 1.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.05 0.44 0.34 0.85 1.0 0.23 0.13 0.0 0.0 0.03 0.09 0.06 0.07 0.05 0.04
0.01 0.02 0.6 0.47 0.6 1.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.13 0.13 0.02 0.01 0.05 0.03
0.44 0.2 0.55 0.72 0.81 1.0 0.43 0.32 0.45 0.41 0.47 0.3 0.23 0.16 0.23 0.2
0.0 0.0 0.26 0.27 0.91 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.05 0.03 0.38 0.41 0.31 1.0 0.03 0.02 0.03 0.04 0.16 0.12 0.01 0.01 0.02 0.02
0.1 0.0 0.46 0.35 0.86 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.45 0.33 0.67 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.05 0.48 0.65 1.0 0.91 0.19 0.12 0.06 0.09 0.32 0.27 0.07 0.06 0.17 0.09
0.18 0.01 0.72 0.79 0.65 1.0 0.18 0.39 0.03 0.05 0.37 0.44 0.64 0.39 0.6 0.56
0.03 0.11 0.44 0.56 1.0 0.93 0.23 0.13 0.01 0.01 0.37 0.48 0.22 0.25 0.38 0.21
0.01 0.02 0.53 0.55 1.0 0.93 0.09 0.04 0.11 0.11 0.27 0.28 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.11 0.08 0.22 0.26 0.04 0.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 1.0 0.0
0.09 0.0 0.35 0.41 0.83 1.0 0.16 0.19 0.0 0.0 0.04 0.18 0.28 0.22 0.31 0.27
0.09 0.03 0.55 0.63 0.47 1.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.12 0.22 0.19 0.09 0.55 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)