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Heatmap: Cluster_185 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
-0.13 -1.51 -0.24 -0.31 0.49 0.58 0.28 -0.29 -1.02 -1.23 1.68 1.0 -0.54 -1.22 -1.77 -0.7
-0.04 -1.5 0.15 0.56 0.49 0.68 0.59 -0.34 -0.94 -1.12 0.96 0.84 -1.02 -1.12 -0.84 -0.87
0.46 -1.42 -0.48 -0.91 0.13 -0.36 -0.72 -0.63 -0.69 -0.69 0.25 -0.43 1.21 0.62 -0.08 0.93
0.89 -0.77 0.3 -0.36 0.2 0.42 -0.25 -1.09 -0.65 -0.66 0.48 0.61 -0.27 0.1 0.14 -0.81
-0.04 -2.24 0.32 0.01 0.92 -0.04 0.74 0.31 -8.38 -8.1 0.91 1.15 -0.51 -0.09 -1.48 -0.55
0.12 -0.74 -0.64 -1.02 -0.27 0.06 -0.22 -1.58 -1.25 -1.32 -0.33 -0.46 1.03 1.29 0.8 0.64
0.16 -1.11 -0.82 -1.66 -0.39 -0.01 0.07 -1.35 -2.96 -2.21 -0.22 -0.22 0.97 1.36 1.05 0.76
-0.12 -3.96 0.14 -0.05 0.83 1.34 0.59 -7.04 - -0.74 2.1 1.14 - - - -
0.31 -0.42 -0.16 -0.07 0.35 0.32 0.16 -0.28 -0.23 -0.23 0.74 0.03 -0.0 -0.63 -0.58 -0.02
0.63 -1.92 -0.21 -0.58 0.43 -0.0 -0.36 -0.47 -4.38 -4.71 -0.62 0.26 0.85 0.86 0.46 0.92
-0.26 -0.67 0.25 0.56 0.62 0.5 -0.17 -0.61 -0.15 -0.49 0.83 0.81 -0.53 -0.98 -1.41 -0.61
-0.2 -2.08 0.01 -0.02 0.21 0.34 0.13 -0.13 -0.94 -0.38 0.56 0.13 0.6 -0.02 -0.5 0.49
0.59 -0.37 -0.28 -0.63 0.22 0.45 0.34 -0.44 -0.94 -1.52 0.23 -0.5 0.48 0.43 0.04 0.26
0.13 0.81 0.28 -0.01 0.51 -0.36 1.02 1.29 -3.8 -2.78 0.43 1.39 -5.76 -6.12 -6.05 -4.61
0.1 -0.41 -0.6 -0.59 0.04 -0.09 0.19 0.03 -1.57 -1.9 0.27 0.55 0.43 0.37 0.59 0.39
-1.32 -1.35 0.14 0.68 0.84 0.84 0.57 0.17 -3.29 -2.84 1.18 0.03 -0.25 -0.64 -1.29 -0.16
0.3 -0.71 0.01 0.2 0.26 0.41 0.31 -0.84 -0.13 -0.29 1.01 0.47 -0.61 -0.67 -0.74 -0.6
-0.98 -2.01 0.06 0.36 0.49 0.69 0.29 -0.02 -0.73 -0.6 0.98 0.57 0.08 -0.65 -1.13 -0.28
-0.77 -2.23 0.35 0.11 0.46 1.16 0.68 -0.54 -2.13 -1.32 1.15 0.35 -0.21 -0.79 -1.37 -0.01
0.37 -0.48 -0.12 -0.01 0.35 0.24 0.29 -0.46 -0.07 -0.33 0.64 0.36 -0.16 -0.77 -0.5 -0.18
0.65 -2.96 0.17 -1.11 -0.4 -0.52 0.41 -1.06 0.03 0.22 -0.01 0.41 0.21 0.26 0.25 0.48
-0.01 -0.47 -0.65 -1.11 0.09 -0.07 -0.27 -0.35 -0.87 -1.16 0.14 0.63 0.7 0.64 0.03 0.78
0.24 -1.04 -0.15 -0.71 -0.08 0.25 0.02 -1.12 -1.98 -1.23 0.36 0.23 0.88 0.72 -0.26 0.8
0.51 -0.43 0.03 0.13 0.06 0.19 0.33 -0.55 -0.03 -0.32 0.29 0.41 -0.37 -0.37 -0.07 -0.42
-0.26 -0.58 -1.15 -1.1 -0.3 0.26 0.22 0.13 -5.62 -4.82 0.23 0.67 0.98 0.82 -0.07 0.86
0.04 -1.47 -0.51 -0.27 -0.27 -0.2 0.22 -0.46 -0.07 -0.19 0.02 0.03 0.62 0.43 0.3 0.59
1.78 - - - 1.72 - - - - - 2.26 2.16 - - - -
0.13 -1.19 -0.56 -0.61 0.2 0.08 0.3 -0.33 -0.19 -0.38 0.38 0.13 0.7 -0.07 -0.09 0.43
0.14 -2.44 -0.66 -0.72 -0.02 0.55 0.4 0.05 -2.06 -1.54 1.17 0.59 0.65 -0.01 -0.83 0.26
0.35 -0.36 -0.73 -1.19 0.43 -0.66 0.39 -0.27 -0.52 -1.2 0.38 0.65 0.35 0.14 0.12 0.4
0.47 -0.32 0.27 0.47 0.33 0.18 0.59 -0.54 -1.32 -1.59 0.39 0.55 -0.15 -0.24 -0.97 -0.19
1.04 -0.36 - - 0.67 - -2.14 0.13 - - 0.89 - 0.46 1.69 - 1.93
-0.21 -1.52 -0.06 0.09 0.33 0.21 0.38 -0.31 -0.81 -0.62 0.74 0.3 0.3 0.0 -0.5 0.24
-0.16 -1.34 0.4 0.44 0.71 0.73 -0.17 -0.65 -1.09 -1.08 0.65 0.52 0.28 -0.53 -1.01 -0.21
-0.23 -2.23 0.2 0.57 0.49 1.18 0.61 0.43 -2.51 -2.92 0.86 0.49 -0.42 -1.23 -2.45 -0.17
0.05 -0.98 0.32 0.55 0.49 0.05 -0.17 -0.59 -1.4 -2.16 0.79 -0.16 0.58 -0.03 -0.12 0.18
0.46 -1.83 -0.63 -1.21 -0.46 -0.52 -1.07 -1.37 -1.32 -0.93 0.16 0.67 1.08 0.85 0.81 0.74
-0.1 -1.28 0.05 -0.48 0.74 1.3 -0.04 -0.36 -4.72 -5.09 0.39 0.13 0.46 -0.05 0.09 0.2
-0.77 0.15 -0.54 -0.83 -0.15 0.05 0.3 -0.14 -4.47 -5.16 0.06 0.6 0.76 0.6 0.72 0.56
0.57 -1.9 -0.46 -1.15 -0.23 0.22 -0.95 -2.38 -0.7 -0.27 0.73 -0.08 0.88 0.38 0.33 0.92
0.88 -2.8 -0.93 -0.39 -0.97 0.18 -1.47 -1.68 0.32 0.6 1.37 1.29 -0.9 -0.61 -0.85 -0.17
0.49 -2.29 -0.16 -0.04 0.51 0.35 0.74 -0.5 -0.83 -0.93 0.79 0.88 -0.61 -0.35 -0.64 -0.51
0.81 -1.19 -0.74 -1.45 1.03 -0.28 -0.13 0.17 -1.0 -0.22 0.38 0.01 0.49 -0.2 -0.9 0.55
0.27 -0.59 0.28 0.17 0.5 1.12 0.82 -0.61 -0.87 -1.63 1.17 0.66 -1.55 -2.4 -2.32 -1.45
0.51 -3.19 -0.32 -0.33 0.31 0.22 -0.2 -0.04 -4.96 -5.19 -0.21 0.5 0.61 0.87 -0.2 1.04
0.04 -0.93 -0.11 -0.56 -0.57 -0.35 0.06 -0.74 -1.24 -1.79 -0.24 0.02 0.68 0.89 1.12 0.62
-0.3 -0.97 -1.28 -2.2 -0.17 -0.3 -0.31 -0.51 -3.05 -2.18 0.06 -0.65 1.35 1.45 0.82 0.83
-0.02 -2.72 -0.29 -0.53 0.01 0.24 -0.03 -0.83 -1.65 -0.53 0.81 0.11 0.8 -0.07 -0.09 1.1
-0.53 -1.88 -0.16 -0.6 -0.07 0.47 0.31 -0.93 -1.56 -0.75 0.08 -0.41 0.72 0.78 0.65 0.76
-0.07 0.23 -1.06 -1.1 0.14 0.05 0.34 0.44 -3.87 -5.09 0.8 0.75 0.31 -0.02 0.25 0.3
0.45 -3.05 -0.31 -0.43 0.03 0.84 0.12 -0.71 -2.43 -1.11 0.41 -0.52 1.01 0.38 -0.14 0.63
-0.19 -0.61 -0.07 0.38 0.64 0.33 -0.19 -0.96 -0.88 -0.12 0.78 0.6 0.02 -0.79 -0.79 0.17
1.03 -0.25 0.04 -0.32 0.57 0.51 0.05 -0.92 -1.5 -2.86 0.89 0.53 -0.17 -0.35 -0.56 -0.57
0.02 -0.58 -0.39 -0.35 0.13 0.26 0.28 -0.17 -0.65 -0.44 0.83 0.34 0.08 -0.1 -0.21 0.14
-1.31 -1.23 0.4 0.67 0.89 1.56 0.17 -0.38 -4.54 -5.26 1.68 0.73 -2.38 -3.27 -2.87 -2.2
0.31 -0.54 0.38 0.53 0.25 0.44 0.43 -0.65 -0.53 -0.67 1.04 0.66 -1.12 -1.27 -1.22 -0.92
0.26 -1.27 0.14 0.56 0.4 -0.18 0.19 -0.33 -0.5 -0.6 0.6 0.17 -0.07 -0.4 -0.47 0.3
0.1 -1.5 0.14 0.4 0.52 0.51 0.41 -0.38 -0.56 -0.54 0.79 0.23 -0.03 -0.62 -1.07 -0.28
-0.06 -1.55 0.46 0.28 0.32 -0.05 0.48 0.15 -3.96 -3.05 0.43 0.08 0.06 0.73 0.12 0.02
0.22 -0.63 -0.51 0.16 0.11 0.77 -0.14 -1.27 -2.1 -1.5 0.02 0.26 1.0 0.28 -0.92 0.79
0.75 -0.89 -0.16 -1.14 -0.13 0.25 -0.12 -0.98 -1.14 -0.89 0.21 -0.31 0.37 0.76 0.72 0.39
-0.06 -1.43 0.26 -0.1 0.49 -0.07 0.25 0.17 -2.73 -3.95 0.57 1.23 0.21 -0.13 -0.47 0.06
0.05 -0.48 -0.11 0.19 0.39 -0.13 0.2 0.09 -2.78 -3.79 0.49 0.85 0.25 -0.16 -0.24 0.48
-0.36 -1.01 -0.51 -1.44 0.16 -0.06 0.98 -0.72 -1.23 -1.14 -0.18 0.05 0.65 0.67 0.58 0.63
0.48 -0.15 0.11 0.11 0.09 -0.04 0.53 -0.64 -0.05 0.32 0.76 0.7 -0.82 -1.2 -1.84 -0.71
0.21 -1.27 -0.26 0.08 0.35 0.72 0.64 -0.32 -0.81 -0.47 0.38 -0.37 0.41 -0.38 -0.42 0.04
0.24 -0.72 -0.19 -0.27 -0.02 0.01 0.3 -0.58 0.01 0.21 0.31 0.34 -0.01 -0.12 0.16 -0.11
0.05 -1.08 -0.2 -0.02 0.7 0.25 0.25 -0.55 -2.05 -1.53 -0.27 -0.29 0.72 0.27 0.03 0.89
-2.85 -6.11 -2.52 -3.84 -1.29 -2.26 -2.18 -2.68 -8.0 - -4.2 -3.68 2.41 1.81 0.66 2.03
-0.15 -1.23 0.08 0.1 0.56 0.64 -0.15 -0.78 -0.78 -0.58 0.89 0.93 -0.23 -0.46 -0.72 -0.28
0.36 -0.38 -0.39 -0.38 -0.16 0.42 0.29 -1.13 -0.9 -0.65 0.13 -0.44 0.28 0.53 0.67 0.33
-0.32 -2.27 -0.73 -0.53 -0.03 0.37 -0.71 -1.4 -5.51 -5.24 -0.15 0.32 0.6 0.71 1.33 1.37
0.17 -0.62 0.13 0.51 0.35 0.41 0.5 -0.21 -1.34 -1.25 0.59 0.09 0.1 -0.37 -0.76 0.01
0.13 -0.74 0.19 0.31 0.31 0.35 0.14 -0.53 -0.37 -0.7 0.85 0.75 -0.31 -0.72 -0.89 -0.36
-0.61 -1.89 0.34 0.08 0.25 -0.21 0.3 -0.49 -3.29 -2.56 0.2 -1.03 1.31 0.41 0.21 0.92
-0.4 -0.25 -0.11 0.27 0.31 -0.04 0.62 -0.09 -0.8 -0.35 0.61 0.6 -0.25 -1.21 -1.11 0.53
0.22 -1.09 0.29 0.26 0.84 0.63 0.11 -0.23 -0.91 -1.13 0.64 0.3 0.01 -0.58 -1.07 -0.42
-0.23 -1.08 -0.41 -0.46 -0.45 -0.38 0.28 -0.85 -0.82 -0.96 0.04 0.07 0.65 0.94 0.52 0.89
1.09 -0.48 -0.42 -1.96 -0.1 0.21 -0.12 -1.11 -0.56 -0.66 0.71 0.65 0.18 -0.13 0.32 -0.18
-0.19 -1.17 -0.43 -0.55 0.28 -0.2 0.14 -0.79 -2.69 -2.43 0.53 0.45 1.02 0.54 -0.03 0.9
-0.3 -2.97 -0.47 -0.5 -0.1 0.24 -0.48 -0.66 -4.41 -3.48 0.4 0.4 1.12 0.54 0.56 1.19
0.44 -0.85 -0.26 -0.56 0.69 0.23 -0.27 -1.37 -0.68 0.04 0.74 1.06 -0.48 -0.23 -0.07 -0.65
0.16 -0.88 -0.11 0.27 0.49 0.45 0.4 -0.08 -0.37 -0.39 0.91 0.22 -0.26 -1.0 -1.09 -0.34
0.43 -0.91 0.15 0.21 1.03 1.08 0.63 -1.19 -1.25 -2.15 0.38 0.55 -0.45 -1.06 -1.35 -0.5
1.0 -1.62 -0.69 -1.12 0.12 0.31 -0.99 -2.29 -1.38 -2.21 0.3 0.09 1.15 0.71 0.49 0.5
-0.21 -1.3 -0.68 -0.8 -0.1 0.03 0.24 -0.56 -0.53 -0.64 0.09 -0.05 0.39 0.96 0.97 0.17
0.23 -0.42 -0.37 -1.18 0.06 -0.48 0.51 0.37 -7.54 -5.55 0.21 1.4 -0.03 0.29 0.42 0.02
-0.02 -0.31 -0.13 0.27 0.35 0.63 0.21 -0.6 -0.53 -0.8 0.3 0.2 0.0 -0.06 -0.29 0.02
-0.05 -2.22 -0.25 0.36 0.34 0.89 0.39 -0.1 -1.57 -0.88 0.82 0.42 0.2 -0.52 -1.46 0.2
0.59 -0.54 -0.15 0.27 0.44 0.35 0.06 -0.69 -0.79 -1.62 0.86 0.84 -0.21 -0.46 -0.93 -0.36
-0.18 -1.53 -0.16 -0.79 0.95 -0.31 0.2 -1.64 -3.96 -3.36 -1.49 1.15 -1.02 -0.4 1.56 1.11
-0.08 -1.93 -0.15 -0.84 0.68 0.59 -0.19 -0.81 -0.96 -1.51 0.13 -0.04 1.09 0.31 0.36 0.26
-0.22 0.85 0.01 -0.98 0.31 -0.37 0.54 0.52 -2.54 -1.42 0.38 1.11 -0.71 -0.67 0.13 -0.76
0.65 -0.31 0.23 0.1 0.38 0.09 0.38 -0.43 -0.37 -0.2 0.46 0.58 -0.74 -0.88 -0.58 -0.64
0.23 -2.35 0.5 0.17 0.84 1.14 0.49 0.57 -6.51 -6.71 0.35 0.47 -0.73 -0.69 -0.58 -0.68
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-0.89 -1.92 -1.16 0.12 -0.4 0.21 0.31 -2.22 -2.42 -2.6 0.53 0.25 0.93 1.08 0.81 0.62
0.78 -0.84 0.1 -1.06 0.04 -0.27 0.62 -1.08 -0.98 -0.83 0.16 0.49 -0.29 0.26 0.72 0.06
0.13 -1.32 -0.09 -0.51 0.25 -0.27 0.73 -1.02 -4.57 -3.66 0.01 0.04 0.83 0.69 0.5 0.8

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.