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Heatmap: Cluster_195 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.52 -0.72 -1.0 -1.38 -0.68 -0.36 0.07 -0.37 -0.21 0.27 1.18 0.46 0.25 -0.03 -0.05 -0.02
-0.01 -0.88 -0.68 -0.42 -0.57 -0.29 0.1 -0.36 -0.31 -0.0 0.49 0.21 0.6 0.41 0.09 0.57
0.2 -0.51 -3.03 -2.91 -2.12 -1.77 0.57 0.16 -2.06 -2.39 0.99 0.68 1.05 0.58 -0.43 1.28
0.3 -1.05 -1.86 -2.15 -1.01 -0.81 0.39 -1.17 -1.66 -0.78 0.79 0.83 0.51 0.74 0.65 0.94
0.96 0.17 -0.97 -1.23 -0.5 -0.4 0.34 -0.65 0.22 0.18 0.82 0.97 -0.89 -0.7 -0.46 -0.44
0.95 -0.53 -1.06 -0.86 -0.73 -0.61 0.43 -0.25 0.14 0.06 0.66 0.48 0.03 -0.15 -0.25 0.03
0.6 0.11 -0.98 -0.72 -0.52 -0.7 0.3 -0.27 0.2 -0.26 0.44 0.38 0.19 -0.23 -0.01 0.36
0.06 -1.34 -0.92 -1.2 -0.75 -0.3 -0.35 -1.02 -1.26 -1.01 0.28 0.42 0.91 1.03 0.89 0.75
0.74 0.01 -5.65 -5.86 -5.93 -4.29 -3.39 -3.79 -4.27 -5.43 0.44 0.27 0.98 1.19 2.21 0.61
-3.32 -1.07 -2.01 -1.34 -1.4 -0.36 0.7 -1.94 -0.5 -1.48 2.2 1.83 -0.85 -0.71 -1.35 -0.06
0.81 0.39 -0.88 -0.75 -1.48 -1.65 -0.09 0.27 0.01 -0.25 0.79 0.98 -0.08 -0.18 -1.02 0.17
0.49 -0.23 -0.71 -0.65 -0.09 0.04 0.4 -0.68 0.44 0.07 0.82 0.5 -0.29 -1.04 -0.56 0.02
0.61 -0.61 -1.69 -1.68 -1.25 -0.61 0.49 -0.77 -0.18 0.28 0.98 0.31 0.16 0.31 0.05 0.53
0.49 -1.11 -1.03 -1.36 -1.06 -0.43 0.44 -0.66 0.16 0.19 0.78 0.46 0.33 0.34 0.17 0.05
0.26 -0.76 -2.27 -2.02 -0.95 -0.46 0.08 -0.17 -0.12 -0.11 1.08 0.81 0.44 0.07 -0.31 0.72
-1.51 - - - - -2.48 - -3.63 -1.84 - 0.25 -0.27 2.58 2.02 - 1.61
0.09 -1.65 -1.46 -1.91 -1.33 -1.02 0.34 -0.73 -0.06 0.43 0.92 -0.11 0.7 0.79 0.39 0.53
0.31 -0.07 -1.03 -0.89 -1.01 -0.55 0.12 -0.9 -0.14 -0.3 0.48 0.21 0.28 0.53 0.63 0.59
0.58 -1.85 -1.35 -1.72 -0.96 -0.52 -0.15 0.36 -1.44 -1.41 0.7 0.61 0.76 0.65 0.14 0.91
0.7 -0.71 -0.46 -0.09 -0.43 -0.33 0.38 -0.42 0.49 0.54 0.82 0.72 -0.92 -1.01 -0.79 -0.62
0.18 -1.97 -1.05 -0.89 -0.51 0.12 0.49 -0.62 -0.58 0.15 1.03 -0.21 0.53 0.37 0.07 0.36
0.5 -0.31 -1.16 -1.19 -0.6 -0.1 0.62 -0.35 -0.09 -0.27 0.8 0.68 0.13 -0.01 -0.49 0.1
0.19 -0.52 -0.6 -0.3 -0.58 -0.34 0.3 -0.22 0.0 -0.08 0.65 0.29 0.18 -0.13 -0.2 0.57
-0.13 -0.37 -1.02 -0.55 -0.73 -0.46 0.52 -0.24 -0.23 -0.69 0.91 0.93 0.26 -0.08 -0.11 0.27
0.4 -0.11 -1.28 -1.28 -1.02 -1.08 0.33 -0.65 -0.28 -0.32 0.48 -0.2 0.96 0.61 0.01 0.77
0.57 0.3 -2.31 -1.83 -2.71 -0.85 0.85 0.22 -1.77 -5.47 1.11 0.94 0.57 0.52 -0.88 0.37
0.26 -0.29 -0.88 -0.78 -1.26 -0.71 0.37 0.15 -0.19 -0.21 0.96 0.59 0.41 0.15 -0.39 0.06
0.24 -0.99 -2.62 -3.87 -2.66 -2.66 0.58 -1.52 -0.05 0.45 1.56 -0.38 0.98 0.49 -0.09 0.64
0.38 -0.82 -1.13 -0.94 -0.75 -0.46 -0.03 -0.52 0.38 0.42 1.06 0.9 -0.13 -0.17 -0.36 -0.03
-0.23 -1.26 -2.83 -3.43 -2.01 -0.92 -0.31 0.14 -1.46 -0.34 0.68 0.61 1.14 0.88 0.4 1.12
0.1 -0.9 -0.84 -0.56 -0.31 -0.19 0.63 -0.26 -0.08 0.1 0.83 0.45 0.01 -0.04 -0.06 -0.04
0.8 -0.64 -0.93 -1.12 -0.98 -0.65 0.14 -0.67 -0.17 -0.14 0.63 0.35 0.43 0.31 0.54 0.13
- - - - - - - -0.89 - - 2.43 3.33 - - - -
0.65 0.22 -2.75 -2.26 -2.2 -3.63 -1.09 -0.41 0.12 -1.7 0.81 -0.1 1.58 1.03 -1.03 0.83
0.3 -0.97 -0.85 -1.79 -0.93 -0.44 -0.14 -0.74 -0.48 -0.45 0.76 0.12 0.78 0.77 0.82 0.3
0.28 -0.93 -1.51 -1.83 -1.32 -0.69 -0.07 -1.19 -0.42 0.44 0.9 0.45 0.67 0.65 0.01 0.77
-0.16 -1.35 -1.92 -1.93 -1.67 -0.82 -0.23 -0.82 -1.68 0.07 0.65 -0.28 1.33 0.98 0.02 1.39
-0.11 -0.18 -1.56 -0.54 -0.65 -0.05 0.37 0.22 -1.17 -1.01 1.05 0.52 0.43 0.17 -0.34 0.47
0.32 -1.84 -0.86 -1.18 -0.8 -0.17 0.64 -0.71 -0.74 0.35 1.11 0.1 0.3 0.26 0.34 0.07
0.17 -1.18 -0.99 -1.12 -0.56 -0.05 0.5 -0.43 0.21 0.07 1.15 0.21 0.36 -0.15 -0.55 0.3
0.59 -0.19 -1.02 -0.95 -0.84 -0.62 0.14 -0.76 0.09 0.47 1.59 0.88 -0.43 -1.05 -1.03 -0.53
0.13 -0.43 -2.15 -1.92 -1.6 -1.61 0.24 0.04 0.4 -0.43 1.77 1.22 -0.23 -0.84 -0.84 0.06
-0.0 -1.42 -1.7 -2.11 -1.54 -1.06 -0.07 -0.54 -0.4 -0.17 0.47 -0.32 1.09 1.16 0.84 0.72
0.66 -0.44 -1.76 -2.36 -0.9 -1.16 -0.02 -0.75 -0.31 -0.79 0.6 0.86 0.49 0.51 0.89 0.32
0.35 -0.22 -1.46 -1.45 -1.9 -1.4 0.45 0.06 -0.86 -1.17 0.87 0.32 0.7 0.55 0.12 0.87
1.03 -0.24 -2.11 -1.8 -1.03 -1.05 -0.62 -1.13 -2.76 -2.24 0.78 0.56 0.84 0.47 0.08 1.45
-0.17 -0.97 -0.03 -0.19 0.05 -0.08 0.53 0.19 0.31 0.29 1.14 1.12 -1.13 -1.6 -2.13 -1.62
0.82 -1.46 -1.84 -1.35 -1.23 -0.62 0.24 -0.66 -0.02 -0.04 0.7 0.21 0.74 0.48 -0.67 0.91
0.84 -0.15 -1.47 -2.02 -1.04 -1.16 -0.02 -0.86 -0.81 -0.62 1.01 0.03 0.71 0.66 -0.25 0.94
0.94 -1.15 - -4.01 - - -6.01 -0.78 -0.14 -1.91 1.88 1.16 0.97 -2.94 -0.87 1.7
0.12 -1.08 -3.25 -3.16 -2.21 -1.73 -0.34 -0.52 -1.02 -0.14 0.43 0.44 1.24 0.91 0.42 1.34
0.71 -0.85 -0.98 -1.3 -1.91 -0.31 0.3 -0.16 0.11 0.1 0.62 0.34 0.58 -0.03 -0.49 0.64
0.25 -0.73 -1.92 -1.45 -1.15 -1.44 -0.34 -0.44 -0.62 -0.69 -0.33 0.44 1.26 1.04 -0.09 1.27
1.12 -0.69 -3.35 -3.01 -2.94 -1.79 0.11 -0.35 -1.61 -2.05 1.35 0.95 0.43 0.15 0.49 0.84
0.82 -0.08 -2.09 -1.78 -0.72 -0.46 0.51 -0.98 -0.51 0.45 1.2 0.67 -0.11 -0.28 -0.71 0.25
0.51 -0.19 -1.46 -1.17 -0.45 -0.65 -0.25 -0.14 -0.09 -0.23 0.42 0.52 0.48 0.43 0.1 0.49
0.52 -1.2 -3.18 -3.31 -2.36 -0.82 0.46 -0.36 -0.38 -0.58 0.88 0.57 0.65 0.33 0.09 1.23
1.12 0.52 -1.54 -1.75 -0.94 -0.51 -0.53 -0.95 -0.04 -0.37 0.79 1.2 0.03 -0.23 -0.68 0.06
1.04 -0.03 -2.5 -1.15 -1.6 -1.11 0.72 -0.08 -0.26 0.36 1.17 0.55 -0.22 -0.09 -2.26 0.15
0.45 0.42 -1.26 -0.97 -0.34 0.19 0.44 -1.05 0.42 0.33 1.47 1.21 -1.76 -2.15 -2.89 -1.86
0.56 -0.41 -0.5 -0.58 -0.33 -0.16 0.49 -0.31 0.11 0.14 0.57 0.71 -0.36 -0.3 -0.21 -0.43
1.98 -1.06 -3.87 - -1.73 - -4.54 -2.81 -1.3 -0.92 2.28 1.64 -0.95 -0.73 -0.98 -1.08
0.09 -0.9 -1.02 -0.42 -0.59 -0.61 0.36 -0.19 0.04 0.17 1.23 1.05 -0.09 -0.56 -0.79 -0.12
0.81 -1.21 -0.34 0.15 0.06 -0.01 0.3 -0.14 -1.34 -2.28 0.94 0.82 0.21 -0.4 -0.47 -0.29
-0.22 -1.61 -1.84 -1.56 -1.81 -1.17 0.11 -0.42 -1.41 -1.22 0.43 0.42 1.2 1.2 0.55 1.07
0.12 -0.17 -0.69 -0.33 -0.4 -0.02 0.13 -0.8 0.04 0.16 0.72 0.37 0.12 -0.36 -0.53 0.63
0.36 -2.12 -2.06 -1.55 -1.44 -1.25 -0.05 0.33 -1.15 -1.35 1.25 0.48 0.7 0.72 0.33 0.81
0.4 -0.1 -0.77 -0.84 -0.17 0.02 0.35 -0.26 0.13 -0.02 0.61 0.26 0.03 -0.23 -0.36 0.17
0.77 0.55 -1.68 -1.18 -1.22 -0.14 0.34 -0.23 0.05 -0.25 1.21 0.53 -0.51 -0.5 -0.41 -0.25
0.45 0.06 -0.49 -0.24 -0.34 -0.18 0.37 -0.49 -0.46 -0.34 1.02 0.61 -0.23 -0.45 -0.63 0.07
1.01 -0.03 -1.03 -1.17 -0.75 -0.85 0.73 -0.86 -0.39 -0.1 1.47 0.9 -0.38 -0.85 -1.72 -0.4
0.64 0.05 -1.31 -1.03 -0.83 -0.73 0.05 -0.45 -0.36 -0.22 0.69 0.61 0.5 0.06 -0.23 0.59
0.74 0.21 -1.66 -1.34 -1.26 -1.05 -1.4 -0.27 -0.35 0.18 1.58 1.61 -0.56 -1.09 -1.37 -0.23
0.65 -0.86 -0.65 -0.85 -0.38 -0.65 -0.3 -0.28 -3.39 -3.63 0.76 0.75 0.79 0.58 0.58 0.45
- - - - - - - - - - 3.05 2.94 - - - -
0.06 -2.74 -1.93 -2.72 -2.36 -0.54 0.09 -1.09 -1.31 0.38 1.36 0.16 1.18 0.39 -0.34 1.14
0.72 -0.96 -4.48 -4.45 -2.25 -1.42 0.09 -1.13 -0.96 0.1 1.27 0.1 0.94 0.35 0.06 1.23
-0.28 -0.33 -1.8 -2.21 -1.27 -0.65 -0.35 -1.27 -0.48 -1.06 -0.1 0.2 1.11 1.24 0.74 1.11
0.46 -1.57 -3.64 -3.74 -2.4 -4.2 -0.2 0.03 -1.23 -0.75 0.62 1.02 1.2 1.16 0.56 0.49
0.18 0.22 -0.68 -0.94 -0.71 -1.3 0.91 -1.41 -3.17 -3.24 0.85 1.49 0.14 -0.05 0.17 0.36
0.38 -0.52 -0.75 -1.57 -0.87 -0.54 0.36 -0.7 -0.46 0.17 0.48 0.53 0.26 0.24 0.26 0.75
0.13 -0.16 -0.72 -0.22 -0.28 -0.15 0.31 -0.1 -0.05 -0.34 0.48 0.41 0.23 -0.13 -0.32 0.35
0.75 0.26 -0.69 -1.03 -0.76 -0.26 0.54 -0.48 0.19 0.0 0.8 0.6 -0.32 -0.77 -0.54 -0.08
-0.08 -1.09 -1.1 -0.79 -0.32 0.09 0.76 -0.21 0.03 0.06 1.14 0.34 -0.04 -0.19 -0.64 0.14
0.4 - - - - - 1.63 - - - 2.02 2.91 - - - -
0.89 0.1 -0.85 -1.55 -0.88 -0.92 0.18 -0.88 -1.18 -0.24 0.97 0.96 0.29 -0.05 -0.75 0.54
0.65 0.06 -2.45 -2.14 -1.56 -0.96 -0.13 -1.5 -0.62 -0.12 1.05 0.92 0.36 0.41 0.29 0.57
0.09 -0.16 -1.37 -1.29 -0.33 -1.31 0.5 -1.16 -0.51 -0.71 1.21 1.45 -0.07 0.03 -0.09 -0.12
0.66 -1.23 -0.43 -0.93 -0.17 -0.01 0.16 -0.39 -0.75 -1.01 0.88 0.61 0.27 -0.09 -0.12 0.53
0.07 -0.32 -1.33 -1.63 -1.56 -0.64 0.03 0.2 -1.24 -1.46 1.29 1.08 0.66 0.02 -0.75 0.81
0.48 -1.82 -2.78 -3.82 -3.08 -2.53 0.21 -0.95 -1.71 -0.77 0.44 0.09 0.93 1.21 1.33 1.07
0.18 -1.08 -1.74 -2.14 -0.58 -0.6 0.18 -0.27 -0.04 0.39 0.87 -0.03 0.65 0.3 -0.09 0.81
0.14 -1.2 -1.2 -2.08 -0.95 -1.12 -0.57 -0.13 -1.38 -1.38 0.65 0.79 0.77 0.71 0.67 1.16
0.06 -0.35 -2.19 -1.57 -0.65 -0.97 0.72 -0.22 -0.77 -0.95 0.99 0.08 1.02 0.39 -0.59 0.86
-0.45 -0.86 -1.63 -2.38 -1.41 -1.14 -0.3 -1.26 -2.12 -1.46 0.31 -0.12 1.31 1.55 1.32 0.56
0.81 -0.2 -0.95 -1.1 -0.88 -0.73 0.37 -0.67 -0.14 0.12 0.59 0.63 0.01 0.07 0.18 0.13
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-0.04 0.38 -1.97 -2.18 -0.87 -0.63 0.05 -0.78 -1.18 -0.97 1.1 1.33 0.28 0.29 0.07 0.43
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0.13 -0.82 -0.64 -0.46 -0.68 -0.13 0.72 -0.33 0.4 0.17 1.0 0.77 -0.1 -0.62 -1.42 -0.17

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Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.