1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_10 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
2.01 0.06 37.1 13.03 25.3 9.13 8.4 5.61 0.27 3.48 16.29 10.93 2.05 2.0 0.67 5.97
0.0 0.0 1.28 0.19 1.07 0.14 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0
0.08 0.0 0.61 0.0 0.33 0.15 0.09 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 1.55 2.34 1.17 2.85 0.82 1.11 0.18 0.16 0.17 0.14 0.59 2.25 2.56 0.0 2.36
0.0 0.0 3.92 0.0 1.34 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 0.37 6.43 0.53 1.92 0.54 0.23 1.62 0.14 0.0 0.07 0.34 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.7 2.17 0.42 1.85 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.45 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 5.21 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0
0.03 0.02 5.16 1.6 1.26 0.26 0.41 0.06 0.1 0.0 0.21 0.33 0.0 0.11 0.1 0.05
0.0 0.0 0.71 0.0 0.21 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.16 0.0
0.06 0.26 11.1 2.21 2.73 0.1 5.2 2.84 0.05 0.22 0.84 0.26 0.0 0.06 0.52 0.12
0.0 0.0 1.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 725.37 1101.11 1362.42 1168.88
0.64 0.28 12.89 8.92 5.07 1.94 2.2 3.1 3.07 2.18 1.96 0.75 2.82 2.72 0.48 1.63
0.21 0.39 28.9 2.37 8.01 0.63 0.4 0.0 0.16 0.0 0.6 2.56 0.0 0.0 0.0 0.37
0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.25 0.0
0.02 0.0 0.58 0.39 0.81 0.15 0.05 0.41 0.0 0.0 0.0 0.06 2.04 0.48 1.43 1.07
0.0 0.0 2.51 0.0 0.27 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.2 2.64 0.72 0.87 0.84 0.16 0.75 0.68 0.18 0.07 0.06 0.6 0.11 0.0 0.71
0.0 63.15 46.63 54.33 107.76 13.17 16.16 0.15 0.0 0.0 0.55 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 78.69 3.73 0.75 0.27 1.2 0.0 0.0 0.0 0.55 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 16.06 3.41 0.53 0.16 1.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.52 0.26 14.74 2.79 2.85 0.97 0.24 0.2 0.22 0.18 0.75 2.55 1.0 4.66 16.97 0.31
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 1.28 0.77 0.0
0.0 0.0 1.38 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.31 0.08 0.14 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
1.41 5.26 9.88 2.97 9.3 1.74 2.74 8.24 0.73 0.97 0.36 0.59 1.67 1.49 0.0 0.15
0.0 0.0 1.64 0.0 0.25 0.47 0.28 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.34 1.51 0.0 1.58 0.0 0.89 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.99 0.28 15.34 3.56 0.73 1.63 0.2 0.37 0.07 0.28 0.26 0.56 0.13 0.2 0.49 0.0
0.0 0.0 5.24 1.04 3.03 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
1.18 0.0 59.39 6.95 8.75 0.91 0.12 0.07 0.08 0.04 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 3.53 5.14 1.39 5.09 1.42 3.2 2.22 0.06 0.03 0.19 0.69 5.27 3.65 3.65 6.85
0.0 0.0 0.21 0.0 0.15 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.75 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.97 0.52 0.36 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.73 0.0 0.39 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.42 2.35 11.6 3.58 11.4 5.82 7.73 6.79 4.23 1.95 1.5 1.09 1.19 0.46 0.69 0.58
0.0 0.0 1.3 0.22 0.06 0.0 0.07 0.28 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.76 4.47 0.0 2.06 0.0 0.53 1.07 1.36 0.0 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 7.62 2.15 3.18 2.52 0.13 0.27 0.0 0.0 0.2 0.11 0.85 0.27 0.37 0.26
5.34 10.45 87.12 23.26 24.91 15.01 60.0 10.31 1.44 2.52 12.57 11.99 11.82 7.36 3.91 9.33
0.64 0.06 24.43 4.2 2.11 1.91 1.91 2.75 0.82 1.12 1.33 1.09 3.9 1.68 0.5 1.82
2.63 4.55 170.03 63.4 143.35 24.93 16.23 47.71 8.05 8.66 50.73 65.47 1.75 2.35 8.15 1.6
0.0 0.05 0.43 0.0 0.09 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.13 20.23 5.91 7.09 1.9 6.64 1.53 0.11 0.06 0.79 1.58 1.29 0.47 1.69 2.24
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.21 1.5 0.0 1.47
1.09 5.2 23.35 8.2 10.54 9.31 11.62 0.99 0.04 0.0 6.83 9.35 0.0 0.1 0.0 0.2
0.0 0.0 0.21 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 1.94 0.33 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.44 2.13 2.39 2.69 1.12 0.08 0.0 0.0 0.18 0.5 0.0 0.0 1.24 0.0
0.0 0.0 0.32 0.1 0.26 0.0 0.05 0.01 0.25 0.0 0.13 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.04 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.13 4.25 1.0 2.82 0.04 2.28 0.17 0.0 0.0 0.28 0.03 0.0 0.0 0.16 0.0
0.23 0.48 0.93 0.23 0.46 0.2 0.1 0.17 0.27 0.04 0.15 0.03 1.46 0.41 0.17 0.96
0.0 0.0 2.09 0.0 0.87 0.0 0.23 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.87 0.67 1.48 0.71 0.39 0.02 0.0 0.0 0.23 0.29 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.04 2.89 0.0 1.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 0.42 6.77 2.37 2.25 3.99 3.87 1.48 0.04 0.04 0.38 1.23 2.38 0.09 0.18 1.21
0.24 0.0 5.08 2.07 1.38 0.71 0.17 0.11 0.0 0.14 0.3 0.14 1.02 0.0 0.0 0.31
0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0
0.13 0.2 25.73 13.12 8.7 4.2 9.9 0.5 0.0 0.0 5.91 9.36 0.0 0.39 0.54 0.0
6.5 5.48 40.44 14.23 22.79 4.77 10.69 9.06 7.97 6.54 10.27 3.33 17.58 8.95 5.48 13.28
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.58 0.0 0.31 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.24 2.02 1.21 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.07 0.2 0.06 0.38 0.05 0.34 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 76.2 48.46 26.24 55.24
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.18 15.11 1.56 3.38 1.08 0.15 0.14 0.02 0.16 0.72 1.81 0.32 0.65 9.6 0.07
0.25 0.0 1.39 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.48 0.0 0.14 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.88 0.51 0.17 0.0 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.11 0.7 0.33
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.37 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 3.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.94 0.19 0.05 0.0 0.09 0.17 0.07 0.23 0.47 0.0 0.37 0.26 0.36 0.68
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
6.98 0.0 33.05 6.94 26.48 3.53 11.22 15.47 0.08 0.25 3.54 2.24 4.52 1.93 0.2 4.52
0.78 0.42 13.31 1.67 1.92 3.04 0.54 0.44 0.0 0.06 0.12 0.35 42.63 43.53 85.82 15.6
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.12 0.35 0.74 1.72
0.35 0.0 0.33 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.38 3.07 0.0 2.01
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.19 0.0
0.0 0.24 0.3 0.0 0.24 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.12 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.36 15.57 4.03 6.3 0.48 8.13 2.46 1.31 0.39 0.6 0.0 2.72 1.48 12.47 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.14 15.86 4.29 4.31 3.35 0.28 0.14 0.43 0.03 0.95 2.46 0.0 0.59 4.76 0.19
0.11 0.0 11.87 2.34 4.35 1.11 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.0 0.0 0.74 0.64 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.8 5.02 76.04 9.88 23.77 4.7 20.84 9.75 2.36 3.17 14.0 21.11 0.33 0.54 0.65 0.53
0.0 0.0 11.32 0.0 9.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 11.01 2.18 3.2 3.97 3.49 1.91 0.71 0.08 0.5 1.72 2.56 0.37 0.39 0.9
0.0 0.04 6.18 3.04 0.15 0.0 1.94 2.08 0.93 0.86 1.44 0.1 40.25 53.63 49.11 32.1
0.07 0.0 7.97 0.86 1.61 0.68 0.0 0.02 0.02 0.04 0.1 0.11 0.0 0.11 1.75 0.02
0.0 0.0 6.22 0.0 3.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.16 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.24 0.15 0.13 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.82 0.52 0.22 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 1.05 1.47 2.05
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.87 2.93 110.64 82.24 73.3 15.37 27.48 50.07 7.45 13.42 29.31 16.94 11.21 6.77 1.21 7.7
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.76 0.17 0.0 0.0 0.09 0.0 0.21 0.0 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 0.46 11.0 5.16 3.35 1.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21.93 21.81 10.78 55.37
0.64 0.0 50.01 13.13 8.76 1.45 4.95 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 4.37 0.34 0.77 0.69 0.49 0.11 0.0 0.0 0.4 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.34 0.45 0.31 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.29 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
30.72 26.72 411.51 182.45 178.7 32.41 155.52 116.91 19.16 72.08 52.77 55.16 7.76 9.09 13.65 8.14
0.0 0.0 1.72 0.26 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 3.05 1.32 0.87 0.55 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)