1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_151 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.12 0.05 0.11 0.05 0.12 0.37 0.47 0.38 0.08 0.06 0.15 0.18 1.0 0.52 0.29 0.98
0.0 0.0 0.01 0.0 0.2 0.21 0.93 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.91 0.61 0.66
0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.15 0.31 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.82 0.66 0.67
0.04 0.01 0.04 0.0 0.15 0.23 0.44 0.44 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.79 0.67 0.96
0.32 0.17 0.27 0.15 0.35 0.32 0.61 0.61 0.04 0.01 0.16 0.35 0.81 1.0 0.96 1.0
0.05 0.2 0.14 0.08 0.14 0.13 0.21 0.38 0.06 0.0 0.05 0.08 1.0 0.71 0.39 0.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.62 1.0 0.3
0.0 0.0 0.03 0.0 0.45 0.3 0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.08 0.11 0.18
0.0 0.0 0.08 0.13 0.66 0.77 1.0 0.77 0.02 0.0 0.14 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.33 0.59 0.36 0.27 0.01 0.02 0.01 0.0 0.44 0.34 0.25 1.0
0.13 0.1 0.05 0.02 0.18 0.12 0.54 0.97 0.02 0.02 0.0 0.14 0.91 0.49 0.09 1.0
0.17 0.39 0.71 0.29 0.73 0.64 1.0 0.85 0.4 0.3 0.43 0.45 0.52 0.37 0.2 0.56
0.02 0.3 0.27 0.34 0.6 0.46 0.91 1.0 0.34 0.34 0.45 0.48 0.03 0.04 0.04 0.05
0.04 0.07 0.02 0.0 0.02 0.04 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 1.0 0.64 0.52
0.06 0.07 0.15 0.18 0.75 0.24 0.87 1.0 0.0 0.01 0.06 0.26 0.04 0.0 0.04 0.16
0.05 0.01 0.05 0.02 0.07 0.16 0.2 0.19 0.0 0.0 0.03 0.07 0.94 1.0 0.43 0.77
0.05 0.07 0.33 0.3 0.51 0.65 0.87 1.0 0.27 0.16 0.37 0.45 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.14 0.43 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.42 0.29 1.0
0.04 0.01 0.15 0.07 0.55 0.32 1.0 0.73 0.06 0.0 0.09 0.44 0.23 0.08 0.01 0.24
0.04 0.01 0.09 0.1 0.46 0.3 0.89 1.0 0.08 0.01 0.06 0.46 0.27 0.18 0.06 0.35
0.01 0.0 0.07 0.04 0.09 0.19 0.26 0.21 0.0 0.0 0.0 0.02 0.99 0.94 0.19 1.0
0.0 0.0 0.13 0.09 0.42 0.21 0.9 1.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.25 0.19 0.28 0.26 1.0 0.89 0.01 0.01 0.39 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.1 0.15 0.13 0.14 0.22 0.33 0.01 0.02 0.05 0.05 0.81 0.5 0.14 1.0
0.0 0.01 0.03 0.05 0.22 0.14 0.69 1.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.07 0.07 0.0
0.2 0.21 0.16 0.15 0.27 0.3 0.38 0.34 0.12 0.14 0.22 0.24 0.61 0.73 1.0 0.86
0.06 0.0 0.28 0.24 0.44 0.82 0.76 1.0 0.01 0.02 0.18 0.12 0.49 0.26 0.15 0.35
0.03 0.07 0.06 0.11 0.12 0.12 0.15 0.26 0.08 0.02 0.04 0.09 0.9 0.97 0.78 1.0
0.08 0.19 0.1 0.1 0.23 0.14 0.34 0.15 0.06 0.03 0.11 0.11 0.95 0.89 0.68 1.0
0.02 0.03 0.03 0.01 0.3 0.29 0.53 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.62 0.57 0.74
0.01 0.0 0.03 0.07 0.22 0.39 1.0 0.72 0.0 0.0 0.16 0.38 0.12 0.08 0.0 0.1
0.32 0.43 0.57 0.34 0.57 0.69 1.0 1.0 0.41 0.18 0.55 0.57 0.59 0.5 0.29 0.57
0.02 0.01 0.01 0.0 0.12 0.04 0.48 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.92 0.83 0.73 1.0
0.03 0.06 0.13 0.08 0.21 0.45 0.58 0.41 0.01 0.01 0.23 0.2 1.0 0.55 0.13 0.84
0.05 0.0 0.0 0.03 0.26 0.16 0.96 1.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.09 0.71 0.88 0.0
0.13 0.02 0.06 0.04 0.08 0.15 0.45 0.59 0.0 0.0 0.05 0.18 1.0 0.77 0.2 0.99
0.32 0.43 0.54 0.52 0.53 1.0 0.98 0.96 0.09 0.11 0.14 0.22 0.43 0.3 0.19 0.45
0.68 0.22 0.24 0.12 0.44 0.44 1.0 0.88 0.11 0.12 0.22 0.69 0.04 0.31 0.08 0.67
0.0 0.06 0.33 0.19 0.45 0.13 0.42 0.54 0.0 0.0 0.14 0.23 0.0 1.0 0.0 0.08
0.33 0.03 0.25 0.25 0.28 0.32 1.0 0.94 0.07 0.09 0.17 0.4 0.24 0.18 0.01 0.74
0.42 0.25 0.56 0.36 0.62 0.56 0.92 1.0 0.27 0.15 0.27 0.48 0.83 0.74 0.41 0.79
0.39 0.12 0.38 0.36 0.45 0.53 0.65 1.0 0.25 0.28 0.33 0.22 0.38 0.35 0.31 0.38
0.0 0.0 0.13 0.2 0.19 0.16 0.68 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.51 0.4 0.95
0.07 0.04 0.13 0.14 0.4 0.5 0.61 0.58 0.0 0.0 0.06 0.23 0.32 0.21 0.54 1.0
0.1 0.0 0.21 0.24 0.31 0.16 0.69 1.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.28 0.16 0.0 0.96
0.32 0.0 0.25 0.25 0.29 0.33 1.0 0.63 0.0 0.0 0.07 0.55 0.18 0.91 0.0 0.0
0.2 0.45 0.2 0.08 0.29 0.24 0.54 0.51 0.08 0.01 0.02 0.03 0.62 0.63 0.38 1.0
0.04 0.0 0.03 0.03 0.1 0.04 0.15 0.14 0.01 0.0 0.01 0.03 0.82 1.0 0.68 0.76
0.39 0.54 0.22 0.33 0.51 0.48 1.0 0.75 0.24 0.23 0.43 0.32 0.77 0.65 0.34 0.98
0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.17 0.88 1.0 0.13 0.0 0.0 0.17 0.11 0.15 0.0 0.2
0.21 0.19 0.16 0.2 0.25 0.38 0.71 0.95 0.14 0.19 0.31 0.27 0.98 0.57 0.31 1.0
0.09 0.0 0.33 0.37 0.31 0.3 0.57 0.72 0.13 0.15 0.18 0.28 1.0 0.63 0.34 0.83
0.15 0.2 0.2 0.25 0.23 0.12 0.44 0.42 0.09 0.11 0.11 0.12 0.98 0.75 1.0 0.68
0.16 0.07 0.12 0.06 0.19 0.19 0.75 0.82 0.02 0.02 0.04 0.14 0.86 0.43 0.08 1.0
0.08 0.16 0.2 0.17 0.33 0.34 0.81 1.0 0.05 0.16 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03
0.0 0.0 0.57 0.47 0.62 0.47 0.93 1.0 0.01 0.0 0.23 0.33 0.43 0.04 0.0 0.26
0.11 0.18 0.63 0.19 0.74 0.19 1.0 0.57 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0
0.19 0.29 0.24 0.35 0.34 0.36 0.91 1.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.51 0.52 0.43 0.62
0.0 0.05 0.0 0.0 0.31 0.0 0.35 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 1.0
0.29 0.41 0.38 0.41 0.48 0.51 0.64 1.0 0.07 0.02 0.38 0.51 0.08 0.05 0.07 0.14
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.87 0.46 0.75
0.09 0.05 0.14 0.17 0.15 0.42 0.75 1.0 0.2 0.15 0.25 0.15 0.01 0.06 0.04 0.06
0.03 0.02 0.33 0.34 0.91 0.33 0.76 1.0 0.14 0.12 0.04 0.05 0.04 0.02 0.02 0.02
0.45 0.14 0.16 0.11 0.61 0.32 1.0 0.75 0.06 0.06 0.17 0.29 0.46 0.32 0.38 0.42
0.29 0.07 0.31 0.3 0.54 0.26 0.89 1.0 0.07 0.09 0.24 0.25 0.75 0.57 0.39 0.63
0.08 0.37 0.01 0.03 0.65 0.17 1.0 0.49 0.0 0.05 0.14 0.01 0.04 0.23 0.07 0.03
0.01 0.0 0.07 0.07 0.62 1.0 0.77 0.33 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.32 0.02 0.04 0.62 0.54 1.0 0.93 0.02 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.4 0.17 0.36 0.43 0.75 1.0 0.0 0.0 0.16 0.41 0.17 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.73 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.45 0.54 0.21 0.24 0.49 0.53 0.61 0.6 0.45 0.61 0.34 0.37 0.78 0.71 0.58 1.0
0.33 0.69 0.62 0.72 0.74 0.3 0.99 1.0 0.42 0.36 0.37 0.49 0.43 0.44 0.51 0.35
0.04 0.06 0.14 0.18 0.21 0.42 0.37 0.48 0.01 0.01 0.08 0.05 1.0 0.7 0.68 0.66
0.19 0.2 0.0 0.0 0.19 0.22 0.78 1.0 0.06 0.03 0.02 0.02 0.9 0.88 0.6 0.9
0.03 0.0 0.06 0.03 0.2 0.09 0.61 1.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.14 0.16 0.05 0.2
0.0 0.01 0.0 0.0 0.2 0.24 0.71 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.65 0.63 1.0
0.0 0.0 0.11 0.06 0.15 0.15 0.99 1.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.12 0.19 0.27 0.24 1.0 0.61 0.02 0.03 0.25 0.46 0.07 0.01 0.0 0.05
0.03 0.0 0.01 0.04 0.05 0.06 0.16 0.23 0.02 0.0 0.06 0.04 1.0 0.77 0.49 0.72
0.13 0.12 0.15 0.26 0.76 0.19 0.54 1.0 0.11 0.36 0.1 0.12 0.02 0.0 0.0 0.01
0.13 0.04 0.07 0.07 0.03 0.69 1.0 0.75 0.05 0.0 0.15 0.17 0.07 0.07 0.0 0.17
0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.08 0.11 0.14 0.0 0.0 0.01 0.05 0.88 1.0 0.15 0.57
0.04 0.02 0.04 0.01 0.09 0.09 0.15 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.94 0.14 0.97
0.0 0.01 0.0 0.01 0.55 0.78 0.76 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.86 0.74 0.79
0.0 0.07 0.01 0.01 0.46 0.59 0.67 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.88 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.85 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0
0.35 0.16 0.24 0.27 0.23 0.4 0.59 0.46 0.31 0.25 0.33 0.3 1.0 0.88 0.85 0.61
0.38 0.73 0.33 0.36 0.62 0.44 1.0 0.73 0.29 0.58 0.44 0.41 0.61 0.42 0.24 0.53
0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.08 0.2 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.51 0.72 1.0 0.35
0.0 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.8 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.04
0.0 0.0 0.07 0.09 0.41 0.52 1.0 0.89 0.01 0.0 0.33 0.52 0.09 0.01 0.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.07 0.22 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.7 0.74
0.05 0.0 0.12 0.1 0.73 1.0 0.87 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.16 0.0 0.16
0.01 0.0 0.21 0.16 0.47 0.48 1.0 0.62 0.03 0.05 0.23 0.2 0.01 0.04 0.02 0.02
0.05 0.09 0.06 0.15 0.59 0.17 1.0 0.76 0.01 0.0 0.13 0.29 0.06 0.01 0.24 0.11
0.0 0.16 0.0 0.0 0.19 0.04 0.25 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.46
0.01 0.37 0.38 0.25 0.5 0.4 0.58 1.0 0.01 0.01 0.15 0.19 0.24 0.02 0.03 0.15
0.0 0.0 0.25 0.33 0.58 0.21 1.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.28 0.09 0.48
0.18 0.09 0.14 0.08 0.31 0.23 0.55 0.55 0.0 0.0 0.03 0.05 0.89 0.82 0.29 1.0
0.03 0.0 0.18 0.11 0.05 0.26 0.59 0.72 0.0 0.0 0.0 0.07 0.51 0.24 1.0 0.62
0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.67 1.0 0.1 0.31
0.04 0.01 0.06 0.06 0.07 0.09 0.23 0.34 0.04 0.04 0.1 0.07 1.0 0.36 0.08 0.78
0.02 0.02 0.03 0.04 0.03 0.05 0.09 0.1 0.04 0.02 0.01 0.03 0.8 0.58 0.09 1.0
0.05 0.35 0.08 0.07 0.81 0.59 0.78 1.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.1 0.0 0.2 0.09
0.0 0.01 0.12 0.18 0.13 0.15 0.72 1.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.81 0.19 0.18 0.43
0.0 0.0 0.13 0.13 0.23 0.16 0.69 1.0 0.08 0.06 0.06 0.2 0.0 0.0 0.05 0.0
0.17 0.08 0.22 0.16 0.27 0.27 0.8 0.62 0.06 0.03 0.41 0.41 1.0 0.73 0.47 0.79
0.02 0.0 0.09 0.1 0.29 0.24 0.89 1.0 0.17 0.16 0.48 0.29 0.1 0.08 0.01 0.16
0.0 0.03 0.17 0.03 0.31 0.1 0.98 1.0 0.11 0.03 0.28 0.46 0.01 0.02 0.0 0.0
0.04 0.17 0.13 0.07 0.17 0.17 0.41 0.31 0.04 0.01 0.02 0.09 0.93 0.72 1.0 0.64
0.14 0.0 0.14 0.12 0.33 0.27 1.0 0.82 0.01 0.0 0.32 0.34 0.06 0.09 0.05 0.05
0.15 0.98 0.12 0.02 0.53 0.52 1.0 0.99 0.0 0.0 0.05 0.03 0.33 0.31 0.0 0.66
0.23 0.23 0.12 0.11 0.39 0.23 0.64 0.59 0.0 0.0 0.2 0.33 0.88 1.0 0.6 0.9
0.17 0.22 0.12 0.15 0.31 0.18 0.58 0.34 0.18 0.11 0.25 0.08 0.83 0.66 0.34 1.0
0.16 0.45 0.06 0.05 0.17 0.18 0.55 0.4 0.05 0.02 0.15 0.06 0.85 1.0 0.76 1.0
0.0 0.0 0.03 0.06 0.08 0.12 0.25 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.25 0.97
0.01 0.09 0.2 0.11 0.27 0.09 1.0 0.89 0.01 0.01 0.19 0.34 0.72 0.35 0.08 0.93
0.03 0.0 0.12 0.0 0.44 0.57 0.51 1.0 0.0 0.0 0.28 0.09 0.22 0.0 0.43 0.2
0.18 0.34 0.36 0.2 0.4 0.48 0.75 1.0 0.24 0.24 0.14 0.26 0.38 0.34 0.48 0.31
0.0 0.0 0.06 0.03 0.13 0.12 0.41 0.44 0.06 0.07 0.09 0.06 1.0 0.7 0.58 0.92
0.22 0.12 0.23 0.13 0.23 0.28 0.65 0.62 0.01 0.02 0.17 0.18 0.95 0.67 0.45 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.48 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.41 0.53 0.91
0.17 0.19 0.11 0.17 0.3 0.49 0.67 0.78 0.01 0.04 0.04 0.1 0.95 0.71 0.15 1.0
0.02 0.0 0.02 0.03 0.01 0.06 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.76 0.28 0.01 1.0
0.11 0.01 0.07 0.05 0.1 0.27 0.61 0.79 0.0 0.0 0.1 0.16 1.0 0.72 0.2 0.67
0.0 0.05 0.25 0.31 0.58 0.24 1.0 0.98 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.06 0.26 0.0
0.0 0.0 0.12 0.1 0.25 0.1 1.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0
0.03 0.01 0.03 0.02 0.09 0.04 0.19 0.17 0.0 0.01 0.08 0.03 1.0 0.53 0.48 0.86
0.19 0.46 0.4 0.28 0.56 0.58 0.91 1.0 0.38 0.31 0.34 0.28 0.68 0.88 0.5 0.49
0.01 0.01 0.28 0.11 0.51 0.51 0.88 1.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.21 0.16 0.13 0.39 0.44 0.08 0.03 0.03 0.0 0.19 1.0 0.0 0.06
0.01 0.0 0.12 0.04 0.17 0.09 0.65 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.11 0.1 0.1 0.09 0.24 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0 0.83 0.72
0.0 0.0 0.08 0.09 0.67 0.13 0.12 1.0 0.2 0.33 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.15 0.29 0.26 0.43 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.81 0.94 1.0
0.03 0.0 0.21 0.12 0.57 0.2 0.52 1.0 0.22 0.44 0.08 0.12 0.04 0.02 0.07 0.02
0.0 0.01 0.24 0.24 0.74 0.38 0.53 1.0 0.15 0.23 0.18 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.05 0.05 0.06 0.14 0.19 0.27 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.92 0.78 0.65
0.1 0.08 0.24 0.3 0.14 0.24 0.9 1.0 0.06 0.09 0.13 0.3 0.22 0.17 0.1 0.16
0.01 0.02 0.14 0.08 0.35 0.83 0.54 1.0 0.02 0.0 0.05 0.09 0.34 0.53 0.53 0.15
0.17 0.01 0.14 0.15 0.41 0.17 0.76 1.0 0.02 0.08 0.35 0.33 0.18 0.09 0.06 0.23
0.25 0.76 0.21 0.28 0.45 0.55 1.0 0.83 0.2 0.85 0.32 0.33 0.05 0.03 0.01 0.04
0.15 0.06 0.08 0.05 0.26 0.18 0.48 0.53 0.0 0.0 0.02 0.17 0.22 0.28 1.0 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)