1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_300 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - v0.2 (X-meeting 2023))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.08 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.04 0.01 0.02 0.04 0.04 0.82 1.0 0.56 0.61
0.66 0.34 0.14 0.1 0.22 0.29 0.79 0.39 0.3 0.33 0.47 0.32 0.64 0.99 1.0 0.8
0.44 0.17 0.11 0.12 0.08 0.13 0.39 0.3 0.15 0.1 0.22 0.27 0.68 0.77 0.56 1.0
0.48 0.14 0.21 0.12 0.21 0.34 0.76 0.38 0.26 0.42 0.67 0.32 0.82 1.0 0.97 0.6
0.92 0.17 0.32 0.28 0.35 0.56 1.0 0.43 0.47 0.58 0.94 0.45 0.86 0.85 0.76 0.78
1.0 0.35 0.2 0.18 0.27 0.29 0.83 0.6 0.49 0.39 0.66 0.52 0.47 0.48 0.38 0.49
0.75 0.26 0.22 0.18 0.24 0.27 0.69 0.39 0.37 0.3 0.37 0.5 0.75 0.9 1.0 0.48
0.73 0.28 0.29 0.28 0.39 0.47 1.0 0.55 0.53 0.48 0.95 0.54 0.8 0.92 0.82 0.59
0.3 0.19 0.11 0.09 0.18 0.17 0.42 0.19 0.19 0.22 0.28 0.23 1.0 0.82 0.67 0.76
1.0 0.26 0.25 0.19 0.29 0.26 0.88 0.65 0.5 0.63 0.75 0.35 0.99 0.76 0.48 0.61
0.53 0.42 0.01 0.0 0.34 0.24 0.97 0.53 0.72 0.31 0.55 0.4 1.0 0.64 0.62 0.87
0.43 0.38 0.18 0.15 0.25 0.35 0.84 0.31 0.34 0.31 0.41 0.38 0.68 0.33 0.38 1.0
0.28 0.06 0.05 0.02 0.0 0.1 0.19 0.06 0.05 0.03 0.12 0.13 0.59 0.63 0.52 1.0
0.64 0.17 0.19 0.2 0.27 0.4 0.64 0.48 0.34 0.39 0.64 0.38 1.0 0.71 0.4 0.9
0.86 0.39 0.31 0.31 0.42 0.44 0.78 0.55 0.44 0.35 0.5 0.54 0.93 1.0 0.93 0.91
0.72 0.42 0.38 0.26 0.48 0.65 0.89 0.68 0.81 0.49 0.97 0.66 0.75 0.66 1.0 0.9
0.72 0.44 0.31 0.41 0.46 0.63 0.93 0.5 0.65 0.62 1.0 0.54 0.39 0.3 0.23 0.51
0.74 0.36 0.23 0.25 0.32 0.43 0.74 0.41 0.36 0.45 0.61 0.5 0.84 0.79 0.64 1.0
1.0 0.14 0.11 0.08 0.04 0.19 0.8 0.48 0.22 0.27 0.51 0.15 0.8 0.96 0.99 0.76
0.74 0.29 0.29 0.22 0.42 0.52 0.7 0.41 0.44 0.42 0.71 0.57 0.76 0.95 1.0 0.72
0.38 0.45 0.22 0.22 0.22 0.25 1.0 0.47 0.37 0.4 0.55 0.61 0.42 0.48 0.32 0.49
0.45 0.37 0.02 0.03 0.22 0.19 1.0 0.26 0.34 0.29 0.82 0.48 0.34 0.19 0.09 0.31
0.47 0.43 0.32 0.24 0.36 0.36 1.0 0.54 0.5 0.43 0.59 0.66 0.46 0.45 0.43 0.51
0.84 0.31 0.23 0.14 0.37 0.37 0.75 0.37 0.28 0.29 0.44 0.31 0.92 0.83 1.0 0.67
0.43 0.16 0.13 0.13 0.21 0.25 0.72 0.43 0.48 0.2 0.43 0.14 0.9 0.46 0.23 1.0
0.89 0.16 0.15 0.13 0.15 0.21 0.56 0.36 0.26 0.16 0.58 0.26 0.9 1.0 0.52 0.97
0.47 0.08 0.11 0.14 0.12 0.4 0.8 0.38 0.63 0.47 0.71 0.17 0.52 0.51 0.0 1.0
0.73 0.42 0.14 0.16 0.21 0.12 1.0 0.43 0.3 0.38 0.53 0.46 0.5 0.69 0.7 0.57
0.44 0.13 0.14 0.15 0.14 0.17 0.86 0.42 0.53 0.3 0.5 0.52 0.82 0.9 0.66 1.0
0.95 0.49 0.44 0.48 0.53 0.68 1.0 0.58 0.69 0.59 0.94 0.71 0.86 0.91 0.91 0.75
0.75 0.18 0.14 0.1 0.19 0.23 0.51 0.35 0.19 0.29 0.46 0.23 0.81 0.56 0.37 1.0
0.34 0.1 0.04 0.04 0.03 0.05 0.37 0.05 0.07 0.18 0.25 0.12 1.0 0.94 0.11 0.92
0.73 0.4 0.29 0.22 0.44 0.59 1.0 0.56 0.66 0.62 0.84 0.56 0.95 0.87 0.71 0.87
0.82 0.27 0.17 0.12 0.15 0.27 0.87 0.34 0.38 0.59 0.93 0.53 0.99 1.0 0.86 0.75
0.49 0.41 0.08 0.1 0.18 0.17 0.94 0.44 0.28 0.46 1.0 0.54 0.67 0.6 0.55 0.76
0.82 0.54 0.5 0.46 0.53 0.6 1.0 0.56 0.59 0.62 0.86 0.44 0.91 0.66 0.81 0.99
0.69 0.37 0.17 0.08 0.17 0.24 0.93 0.54 0.22 0.12 1.0 0.42 0.57 0.6 0.93 0.29
1.0 0.36 0.45 0.45 0.57 0.52 0.84 0.65 0.61 0.54 0.89 0.8 0.73 0.52 0.55 0.64
0.76 0.28 0.14 0.09 0.24 0.32 1.0 0.52 0.42 0.43 0.87 0.49 0.7 0.65 0.72 0.94
0.61 0.32 0.32 0.33 0.38 0.54 1.0 0.46 0.55 0.57 0.82 0.46 0.71 0.68 0.32 0.68
0.46 0.19 0.01 0.0 0.3 0.28 1.0 0.47 0.54 0.54 0.56 0.23 0.56 0.37 0.19 0.62
0.64 0.33 0.36 0.4 0.53 0.66 1.0 0.56 0.65 0.71 0.73 0.63 0.64 0.44 0.24 0.6
0.63 0.2 0.15 0.17 0.19 0.19 0.99 0.44 0.24 0.18 1.0 0.27 0.68 0.4 0.14 0.51
0.48 0.08 0.1 0.05 0.11 0.14 0.19 0.15 0.03 0.17 0.33 0.27 1.0 0.7 0.66 0.91
1.0 0.26 0.17 0.15 0.32 0.27 0.88 0.67 0.33 0.38 0.7 0.57 0.59 0.59 0.38 0.6
0.91 0.37 0.25 0.23 0.3 0.32 0.99 0.61 0.37 0.38 1.0 0.76 0.56 0.73 0.66 0.63
0.89 0.63 0.34 0.31 0.38 0.29 1.0 0.48 0.47 0.48 0.55 0.62 0.46 0.37 0.33 0.58
0.62 0.4 0.19 0.25 0.48 0.48 1.0 0.62 0.58 0.44 0.74 0.39 0.95 0.61 0.38 0.78
0.63 0.24 0.1 0.09 0.16 0.15 0.55 0.34 0.29 0.31 0.47 0.22 0.72 0.87 1.0 0.6
1.0 0.36 0.41 0.25 0.33 0.41 0.81 0.46 0.59 0.54 0.77 0.47 0.64 0.73 0.83 0.79
0.43 0.24 0.27 0.38 0.27 0.24 0.75 0.39 0.32 0.23 1.0 0.36 0.73 0.5 0.18 0.81
0.84 0.0 0.13 0.13 0.18 0.15 0.57 0.46 0.17 0.14 0.38 0.21 0.98 0.5 0.55 1.0
0.73 0.21 0.18 0.17 0.26 0.42 0.87 0.61 0.42 0.5 0.65 0.41 1.0 0.75 0.56 1.0
0.86 0.37 0.32 0.27 0.34 0.46 0.78 0.43 0.41 0.4 0.59 0.44 0.87 0.97 1.0 0.82
0.6 0.38 0.25 0.3 0.35 0.35 0.95 0.57 0.49 0.42 1.0 0.68 0.53 0.41 0.36 0.49
0.61 0.2 0.2 0.19 0.18 0.26 0.52 0.28 0.29 0.29 0.53 0.28 0.93 0.73 0.64 1.0
0.89 0.49 0.41 0.57 0.63 0.6 1.0 0.6 0.68 0.55 0.86 0.62 0.48 0.41 0.31 0.6
0.58 0.43 0.2 0.1 0.22 0.23 1.0 0.33 0.39 0.39 0.54 0.46 0.56 0.78 0.88 0.57
0.47 0.47 0.15 0.34 0.44 0.39 1.0 0.67 0.51 0.44 0.72 0.52 0.7 0.85 0.74 0.6
0.54 0.33 0.28 0.19 0.28 0.33 0.86 0.59 0.5 0.55 0.65 0.48 0.66 0.66 1.0 0.62
0.88 0.5 0.38 0.41 0.5 0.51 1.0 0.57 0.69 0.64 0.81 0.8 0.63 0.75 0.72 0.58
1.0 0.43 0.28 0.21 0.33 0.5 0.88 0.51 0.49 0.59 0.63 0.36 0.8 0.62 0.66 0.71
0.63 0.19 0.28 0.21 0.26 0.31 0.8 0.55 0.43 0.47 0.68 0.49 0.84 0.83 1.0 0.76
0.76 0.39 0.26 0.33 0.46 0.41 1.0 0.59 0.68 0.61 0.75 0.52 0.61 0.58 0.41 0.72
0.63 0.05 0.24 0.21 0.41 0.35 0.92 0.57 1.0 0.75 0.72 0.37 0.71 0.59 0.42 0.9
0.58 0.21 0.13 0.17 0.13 0.21 0.75 0.58 0.27 0.26 0.86 0.67 0.95 1.0 0.73 0.84
0.43 0.12 0.14 0.1 0.16 0.19 0.38 0.2 0.23 0.3 0.48 0.33 0.88 0.81 0.61 1.0
0.59 0.16 0.25 0.28 0.3 0.48 1.0 0.59 0.48 0.45 0.92 0.5 0.99 0.61 0.38 0.79
0.49 0.01 0.09 0.03 0.08 0.12 0.33 0.27 0.04 0.02 0.27 0.17 1.0 0.9 0.92 0.64
0.63 0.23 0.25 0.28 0.34 0.37 0.66 0.49 0.48 0.45 0.58 0.37 1.0 0.88 0.77 0.84
0.12 0.19 0.02 0.04 0.06 0.07 0.31 0.24 0.15 0.15 0.14 0.23 0.94 0.94 0.64 1.0
0.53 0.07 0.15 0.15 0.25 0.16 0.76 0.24 0.27 0.48 0.63 0.38 0.79 0.55 0.39 1.0
0.61 0.29 0.08 0.08 0.28 0.32 0.96 0.31 0.25 0.31 0.84 0.27 1.0 0.42 0.32 0.86
0.79 0.38 0.28 0.22 0.38 0.44 1.0 0.58 0.66 0.53 0.75 0.54 0.87 0.73 0.92 0.82
0.96 0.27 0.33 0.23 0.35 0.51 0.89 0.46 0.52 0.42 0.9 0.76 0.93 1.0 0.93 0.79
0.55 0.4 0.19 0.14 0.29 0.3 1.0 0.56 0.49 0.33 0.57 0.72 0.32 0.3 0.35 0.28
1.0 0.17 0.2 0.24 0.19 0.29 0.64 0.38 0.21 0.32 0.59 0.58 0.7 0.72 0.57 0.75
0.71 0.52 0.31 0.22 0.38 0.35 0.86 0.5 0.44 0.66 0.89 0.65 0.88 0.98 1.0 0.93
0.65 0.36 0.14 0.19 0.29 0.43 1.0 0.5 0.46 0.53 0.68 0.43 0.8 0.58 0.33 0.93
1.0 0.16 0.07 0.09 0.27 0.34 0.78 0.34 0.42 0.33 0.52 0.32 0.74 0.61 0.68 0.92
0.59 0.14 0.17 0.34 0.29 0.4 1.0 0.52 0.4 0.33 0.89 0.47 0.17 0.12 0.08 0.26
0.91 0.31 0.37 0.27 0.4 0.55 0.96 0.56 0.43 0.59 0.9 0.43 0.92 0.95 0.85 1.0
0.59 0.24 0.06 0.05 0.14 0.11 0.59 0.44 0.24 0.23 0.35 0.42 0.96 0.7 0.37 1.0
0.72 0.2 0.2 0.12 0.27 0.33 0.59 0.34 0.25 0.27 0.47 0.32 0.59 0.8 1.0 0.64
0.6 0.25 0.14 0.17 0.17 0.27 0.93 0.41 0.51 0.35 1.0 0.64 0.53 0.42 0.34 0.59
0.34 0.37 0.18 0.18 0.31 0.33 0.81 0.36 0.46 0.35 0.47 0.38 1.0 0.45 0.5 0.76
1.0 0.26 0.27 0.27 0.36 0.4 0.93 0.56 0.5 0.47 0.68 0.48 0.59 0.46 0.49 0.6
1.0 0.05 0.06 0.1 0.11 0.09 0.71 0.42 0.18 0.16 0.59 0.36 0.92 0.79 0.29 0.85
0.84 0.44 0.31 0.36 0.27 0.31 0.97 0.47 0.59 0.48 1.0 0.85 0.66 0.57 0.27 0.78
0.55 0.15 0.1 0.07 0.09 0.13 0.56 0.31 0.21 0.18 0.31 0.33 0.82 0.92 1.0 0.66
0.78 0.27 0.27 0.19 0.29 0.5 0.95 0.31 0.49 0.64 0.88 0.55 0.72 0.81 1.0 0.84
1.0 0.39 0.17 0.18 0.25 0.35 0.65 0.49 0.3 0.24 0.6 0.38 0.86 0.62 0.4 0.92
0.89 0.14 0.16 0.26 0.18 0.13 0.84 0.39 0.34 0.33 0.6 0.49 1.0 0.91 0.54 0.75
0.84 0.39 0.3 0.28 0.43 0.42 1.0 0.53 0.64 0.66 0.94 0.43 0.88 0.83 0.73 0.81
0.9 0.27 0.34 0.21 0.32 0.38 1.0 0.54 0.3 0.43 0.81 0.37 0.67 0.6 0.72 0.68
0.68 0.28 0.3 0.26 0.26 0.33 0.46 0.37 0.39 0.26 0.65 0.42 0.95 1.0 0.91 0.95
0.62 0.35 0.17 0.11 0.23 0.3 0.63 0.33 0.28 0.28 0.32 0.32 0.65 0.85 1.0 0.67
0.46 0.26 0.19 0.17 0.34 0.24 1.0 0.35 0.65 0.55 0.63 0.69 0.21 0.26 0.35 0.24
0.73 0.76 0.29 0.42 0.37 0.4 1.0 0.56 0.57 0.7 0.99 0.68 0.97 0.72 0.48 0.83
0.66 0.2 0.2 0.18 0.23 0.28 0.88 0.37 0.22 0.47 0.71 0.25 1.0 0.93 0.71 0.77
0.42 0.36 0.18 0.14 0.32 0.23 0.65 0.54 0.73 0.43 0.47 0.49 1.0 1.0 0.58 0.55
0.5 0.23 0.23 0.26 0.23 0.24 0.45 0.28 0.23 0.29 0.4 0.3 0.95 1.0 0.74 0.9
0.73 0.22 0.1 0.04 0.13 0.15 0.7 0.27 0.23 0.35 0.54 0.36 0.64 0.87 1.0 0.56
0.68 0.45 0.17 0.2 0.22 0.31 1.0 0.4 0.43 0.47 0.77 0.55 0.25 0.28 0.25 0.42
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.35 0.98 0.23
1.0 0.35 0.36 0.33 0.43 0.45 0.85 0.39 0.52 0.6 0.99 0.74 0.58 0.59 0.64 0.56
0.7 0.33 0.18 0.14 0.28 0.39 0.79 0.36 0.36 0.43 0.56 0.44 0.97 1.0 0.77 0.95
0.33 0.07 0.04 0.06 0.08 0.1 0.26 0.13 0.14 0.11 0.25 0.08 0.59 0.47 0.24 1.0
0.31 0.34 0.11 0.09 0.12 0.11 0.73 0.44 0.23 0.2 0.3 0.43 0.84 0.91 1.0 0.78
0.68 0.65 0.28 0.22 0.36 0.36 1.0 0.47 0.45 0.54 0.89 0.71 0.53 0.58 0.49 0.58
0.61 0.58 0.25 0.29 0.35 0.39 1.0 0.55 0.39 0.35 0.84 0.52 0.66 0.59 0.57 0.63
0.56 0.26 0.2 0.14 0.28 0.32 0.74 0.38 0.35 0.33 0.76 0.54 1.0 0.8 0.76 0.82
0.16 0.06 0.05 0.04 0.09 0.09 0.26 0.16 0.18 0.09 0.17 0.19 0.78 0.58 0.38 1.0
0.28 0.08 0.05 0.05 0.07 0.1 0.21 0.13 0.12 0.11 0.19 0.18 1.0 0.8 0.73 0.74
0.85 0.39 0.18 0.17 0.32 0.34 0.64 0.51 0.34 0.33 0.43 0.42 0.92 0.76 0.76 1.0
0.53 0.36 0.28 0.35 0.41 0.51 1.0 0.42 0.49 0.51 0.79 0.55 0.45 0.29 0.18 0.49
0.84 0.26 0.27 0.29 0.33 0.3 0.89 0.54 0.46 0.54 0.67 0.62 0.92 1.0 0.92 0.91
0.12 0.17 0.09 0.1 0.07 0.09 0.32 0.2 0.17 0.13 0.17 0.23 1.0 0.79 0.61 0.8
0.78 0.25 0.41 0.4 0.45 0.62 1.0 0.59 0.61 0.51 0.89 0.61 0.88 0.83 0.69 0.57
0.97 0.12 0.22 0.12 0.24 0.26 0.59 0.39 0.25 0.35 0.58 0.44 0.89 1.0 0.92 0.88
0.97 0.33 0.24 0.17 0.33 0.45 1.0 0.73 0.42 0.35 0.79 0.72 0.68 0.61 0.59 0.68
0.89 0.66 0.45 0.38 0.51 0.45 0.97 0.35 0.52 0.52 0.55 0.53 0.75 0.78 1.0 0.89
0.75 0.2 0.16 0.11 0.3 0.34 0.61 0.37 0.28 0.43 0.74 0.37 1.0 0.99 0.88 0.83
0.59 0.42 0.26 0.23 0.42 0.54 0.88 0.68 0.69 0.5 0.72 0.47 1.0 0.75 0.69 0.91
0.91 0.35 0.27 0.22 0.24 0.4 0.79 0.44 0.34 0.45 0.63 0.37 0.69 0.96 0.86 1.0
0.47 0.08 0.16 0.11 0.24 0.34 0.7 0.38 0.47 0.38 0.51 0.29 0.89 0.6 0.65 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)