1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_39 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.45 7.43 2.46 2.77 1.52 3.56 8.73 2.04 1.12 1.97 3.42 4.27 0.45 0.56 0.0 0.55
0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.16 0.17 0.35 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.31 0.0 3.63 0.62 6.43 0.05 0.0 0.0 0.52 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 2.17 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.61 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.86 1.22 0.42 1.13 5.21 0.04 0.0 0.0 0.31 1.89 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.3 0.05 0.33 0.13 0.05 0.0 0.13 0.0 0.14 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.45 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 5.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.3 1.33 0.0 0.0 0.0 0.5 0.15 0.0 0.35 1.48 0.0
0.21 3.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.18 37.35 38.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 92.14 402.6 192.64 132.8 52.27 0.11 1.89 2.0 4.67 30.59 41.74 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 157.75 2.94 4.46 6.65 195.03 0.86 2.63 48.42 6.21 6.51 5.54 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 7.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.15 4.52 0.53 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.21 0.0 0.0 0.17 0.46 0.33 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.87 3.8 1.72 0.3 1.92 0.01 0.0 0.0 0.16 0.23 0.19 0.0 0.75 0.35
0.0 7.89 0.56 2.38 1.39 2.41 2.62 0.0 0.0 0.0 0.31 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 14.97 77.94 53.8 18.89 18.89 1.07 0.77 0.37 0.14 2.52 5.48 0.09 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 2.29 4.41 4.57 6.54 0.0 0.0 0.0 1.05 0.82 1.01 0.0 0.57 0.0 0.0
1.7 15.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0
0.0 6.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.06 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0
0.0 0.04 8.17 6.47 6.26 8.38 0.0 0.05 0.12 0.34 0.99 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.3 0.1 0.0 0.39 0.25 0.06 0.0 0.0 0.0 0.66 2.69 0.19 0.0 0.0 0.0
0.14 7.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 9.52 13.66 0.76 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 119.08 55.33 57.11 112.03 207.22 57.05 45.77 1.65 0.0 35.53 69.85 0.29 1.76 1.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.34 0.39 0.32 0.0 0.0 0.09 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.83 2.64 0.1 0.0 0.0 0.0 13.28 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 2.68 2.25 1.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.0 0.17 0.13 0.38 0.32 0.35 0.13 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 0.37 0.0 0.24
0.0 1.26 0.27 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.21 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 3.17 3.67 0.74 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.08 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.0 0.0 17.83 27.37 33.11 12.63 3.08 0.44 0.92 1.67 0.24 1.25 0.0 0.4 0.0 0.0
0.0 1.46 80.53 87.24 69.64 39.77 0.0 0.07 0.25 0.26 0.54 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.14 0.0 0.44 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.46 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.69 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 3.3 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.34 0.04 0.07 17.47 69.82 13.79 83.91 3.21 9.86 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.62 0.32 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.53 0.14 1.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.09 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.53 0.0 0.14 0.26 0.32 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 2.19 83.57 107.03 109.65 63.5 0.54 0.0 0.09 0.09 2.6 4.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.08 0.07 0.06 2.35 1.37 0.0 0.0 0.0 2.57 0.0 0.65 0.45 0.63
0.0 0.0 126.16 164.43 109.18 161.8 1.3 0.16 0.0 0.0 221.73 248.82 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 3.23 5.8 2.88 0.86 0.28 0.31 0.22 1.76 0.47 0.29 0.0 0.09 0.0 0.0
0.41 0.18 8.93 2.25 0.91 3.28 0.07 1.66 5.87 5.85 1.52 3.99 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.19 37.06 35.85 50.92 19.36 81.48 1.22 0.09 0.0 9.99 17.46 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 2.19 7.92 1.91 5.28 3.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.5 0.0 0.0 2.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.9 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0
0.0 0.0 0.69 0.13 0.21 0.29 0.0 0.0 0.15 0.0 3.08 2.41 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 25.75 28.13 8.86 28.18 1.08 3.95 5.05 13.72 46.91 11.97 0.0 0.0 0.0 0.0
3.33 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
9.44 3.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 331.86 150.58 277.94 165.91 365.47 1.27 0.0 0.0 19.87 149.58 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
29.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 927.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.3 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.64 0.61 1.85
0.37 0.09 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.24 0.0 0.23 0.55 1.03 2.16 0.0
2.96 3.97 851.0 1399.14 978.99 809.67 140.02 19.23 562.95 314.79 828.46 1221.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.59 1.32 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.71 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 36.49 11.45 69.65 13.01 1.25 0.49 0.0 0.0 0.3 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.26 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 41.67 0.16 0.2 0.22 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 14.9 0.0 0.0 0.07 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 107.1 110.96 68.65 244.56 443.44 7.0 43.7 35.37 4640.47 2870.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 9.3 21.45 10.55 18.75 3.27 5.04 0.0 0.0 0.38 0.35 0.0 0.2 0.0 0.8
0.25 0.35 0.73 0.36 0.72 0.19 0.66 0.03 0.29 0.15 0.78 0.58 0.0 0.43 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.42 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 21.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 61.77 65.85 3.29 3.47 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.86 21.53 10.56 147.85 92.66 4.01 0.49 0.0 0.17 9.26 6.73 0.0 0.45 1.87 0.25
0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.11 0.1 0.15 0.0 0.03 0.16 0.1 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08
0.0 101.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 2.84 2.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 10.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.65 0.34 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 16.01 24.89 57.7 6.17 1.53 0.06 0.0 0.0 0.35 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.98 5.72 27.96 32.87 65.08 30.65 0.13 0.0 14.25 22.4 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 5.91 16.27 17.98 17.03 12.25 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.33 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.08 1.95 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 65.79 0.14 0.23 0.0 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 2.53 1.71 2.93 0.16 56.19 0.3 0.0 0.0 423.97 170.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 1.03 0.1 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
4.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.75 0.58 2.42 3.68 2.22 0.0 0.0 0.0 0.34 0.36 0.0 0.54 0.23 0.0
0.15 0.28 6.61 1.95 11.99 1.52 0.85 0.59 0.0 0.0 1.77 3.29 0.0 0.16 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)