1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_73 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.81 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.59 1.0 0.43 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.24 0.14 0.15 0.08 0.06 0.17 0.0 0.01 0.07 0.07 0.25 1.0 0.14 0.08 0.56 0.08
0.0 0.01 0.34 0.39 0.33 0.88 0.45 0.06 1.0 0.44 0.31 0.23 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.52 0.25 0.09 0.01 0.02 0.0 0.04 1.0 0.26 0.24 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.05 0.08 0.14 0.14 0.01 0.12 0.44 1.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.09 0.82 0.51 1.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.74 0.0 0.0 0.02 0.0
0.07 0.05 0.58 0.52 0.77 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.13 0.53 0.29 1.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.28 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 1.0 0.06
0.06 0.11 0.22 0.25 0.18 0.14 0.04 0.03 1.0 0.33 0.18 0.12 0.04 0.03 0.85 0.05
0.03 0.04 0.29 0.3 0.34 0.75 0.25 0.05 0.25 0.26 0.27 0.15 0.02 0.05 1.0 0.08
0.08 0.75 0.29 0.15 0.22 0.36 1.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.47 0.0 0.08 0.35 0.0
0.04 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.1 0.15 1.0 0.95 0.09 0.06 0.15 0.15 0.19 0.1 0.02 0.03 0.19 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 1.0 0.92 0.36 0.68 0.07 0.07 0.09 0.0 0.39 0.1 0.04 0.02 0.22 0.1
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.15 0.59 0.4 0.34 1.0 0.01 0.02 0.0 0.14 0.04 0.0 0.01 0.09 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 1.0 0.03 0.02 0.05 0.1 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.24 0.0
0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.95 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01
0.02 0.02 0.07 0.08 0.08 0.22 0.04 0.07 0.98 1.0 0.52 0.19 0.16 0.1 0.35 0.2
0.1 0.0 0.12 0.1 1.0 0.4 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.31 0.0
0.0 0.0 0.14 0.7 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.1 0.0
0.0 0.02 0.04 0.04 0.01 0.02 0.01 0.07 0.56 0.21 0.12 0.18 0.0 0.01 1.0 0.0
0.04 0.08 0.45 0.52 0.34 0.39 0.26 0.21 0.53 1.0 0.5 0.31 0.27 0.22 0.94 0.25
0.01 0.0 0.13 0.19 0.16 0.36 0.94 0.07 0.66 1.0 0.2 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0
0.03 0.01 0.48 0.54 0.09 0.16 1.0 0.05 0.03 0.02 0.1 0.04 0.05 0.05 0.57 0.06
0.0 0.0 0.15 0.19 0.3 1.0 0.14 0.08 0.08 0.18 0.95 0.79 0.02 0.01 0.08 0.03
0.02 0.53 0.52 0.42 0.44 1.0 0.44 0.11 0.02 0.0 0.78 0.65 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.24 0.17 0.2 0.25 0.01 0.01 0.29 0.43 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.62 0.21 0.33 0.11 0.02 0.1 0.17 0.13 0.0 0.15 0.27 0.51 0.05
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.41 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.43 0.72 0.98 1.0 0.15 0.05 0.02 0.0 0.1 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.11 0.04 0.08 0.01 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01 1.0 0.04
0.53 0.01 0.51 0.51 0.44 0.5 0.04 0.07 0.03 0.03 0.12 0.05 0.04 0.1 1.0 0.04
0.16 0.3 0.01 0.04 0.02 0.03 0.01 0.01 1.0 0.52 0.58 0.54 0.0 0.04 0.35 0.06
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.1 1.0 0.96 0.54 0.64 0.13 0.04 0.04 0.04 0.11 0.07 0.01 0.0 0.06 0.01
0.0 0.02 0.53 1.0 0.46 0.36 0.55 0.03 0.24 0.12 0.65 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.18 1.0 0.92 0.74 0.19 0.1 0.25 0.2 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.46 0.26 0.16 0.48 0.47 0.12 0.06 0.01 0.01 0.06 0.05 0.41 0.19 1.0 0.19
0.0 0.0 0.51 1.0 0.6 0.56 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.08 0.22 0.17 0.48 0.28 0.39 0.49 0.09 0.03 0.0 0.13 0.0 0.16 0.14 1.0 0.0
0.0 0.0 0.24 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 1.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.15 0.29 0.35 0.09 0.13 0.18 0.23 0.46 0.35 0.38 0.13 0.25 0.23 1.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.27 0.43 0.47 0.04 0.16 0.15 0.31 0.15 0.08 0.57 0.39 0.09 0.09 1.0 0.02
0.0 0.01 0.14 0.23 0.01 0.01 0.04 0.02 0.25 0.3 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.04 0.44 0.31 0.3 0.51 0.57 0.47 0.26 0.15 0.26 0.09 0.43 0.28 1.0 0.56
0.0 0.0 1.0 0.84 0.79 0.59 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02
0.12 0.23 0.07 0.13 0.05 0.08 0.2 0.19 0.0 0.02 0.02 0.01 0.44 0.32 1.0 0.46
0.0 0.87 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.81 1.0 0.8 0.46 0.09 0.14 0.0 0.58 0.27 0.0 0.0 0.68 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 1.0 0.47
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 1.0 0.03 0.04 0.0 0.02 0.02 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.33 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.23 0.0 0.17 1.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.29 0.36 1.0 0.41 0.14 0.04 0.03 0.07 0.04 0.01 0.06 0.03 0.45 0.02
0.01 0.0 0.75 1.0 0.15 0.28 0.07 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.1 0.04 0.77 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.03 0.07 0.02 0.07 0.02 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.05 0.48 0.08
0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 0.44 0.22 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0
0.15 0.02 0.92 0.37 0.79 0.37 0.0 0.22 0.0 0.0 0.81 0.49 0.0 0.08 1.0 0.16
1.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.22 0.02 1.0 0.01 0.03 0.06 0.2 0.76 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.58 1.0 0.36 0.15 0.21 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 1.0 0.96 0.14 0.18 0.82 0.06 0.02 0.04 0.11 0.06 0.03 0.02 0.3 0.03
0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 1.0 0.01
0.07 0.16 0.31 0.4 0.14 0.22 0.18 1.0 0.45 0.52 0.32 0.19 0.26 0.18 0.62 0.5
0.05 0.02 0.16 0.23 0.37 0.42 0.09 1.0 0.11 0.08 0.17 0.08 0.03 0.03 0.72 0.08
0.0 0.02 0.14 0.09 0.19 0.62 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35
0.1 0.11 0.23 0.26 0.31 0.4 0.24 0.25 0.23 0.17 0.09 0.0 0.24 0.13 1.0 0.09
0.0 0.01 0.21 0.2 0.03 0.05 0.04 0.03 0.66 0.3 0.87 0.24 0.01 0.04 1.0 0.03
0.0 1.0 0.55 0.15 0.17 0.4 0.0 0.07 0.0 0.13 0.31 0.18 0.0 0.0 0.3 0.0
0.0 0.01 0.39 0.46 0.06 0.14 0.06 0.01 0.08 0.09 0.55 0.32 0.02 0.04 1.0 0.03
0.69 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.15 0.25 0.27 1.0 0.0
0.23 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0
1.0 0.02 0.13 0.15 0.03 0.07 0.01 0.05 0.14 0.17 0.04 0.02 0.0 0.01 0.14 0.02
0.07 0.65 0.1 0.1 0.17 0.08 0.19 1.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.05 0.19 0.0
0.04 0.03 0.66 1.0 0.65 0.89 0.05 0.07 0.16 0.01 0.12 0.07 0.1 0.08 0.87 0.11
0.0 0.0 0.05 0.14 0.42 0.25 1.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.05 0.0 1.0 0.5 0.38 0.23 0.86 0.08 0.18 0.26 0.94 0.32 0.01 0.02 0.23 0.03
0.01 0.08 0.1 0.34 0.3 0.17 0.6 0.09 0.46 0.27 0.43 0.69 0.3 0.28 1.0 0.1
0.02 0.14 0.53 0.76 0.64 0.49 0.04 0.1 0.17 0.07 0.39 0.3 0.21 0.12 1.0 0.0
0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0
0.0 0.01 0.07 0.15 0.29 0.11 0.01 0.0 0.13 0.08 0.78 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.52 0.53 0.31 1.0 0.11 0.04 0.05 0.11 0.08 0.1 0.0 0.01 0.06 0.0
0.0 0.0 0.3 0.59 0.23 0.27 0.01 0.02 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.06
0.0 0.0 0.05 0.02 1.0 0.55 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.13 0.0
0.01 1.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.36 0.01
1.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.47 0.0
0.0 0.0 0.82 1.0 0.97 0.83 0.0 0.01 0.01 0.03 0.04 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)