1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_65 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.28 7.18 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.7 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 5.71 3.4 0.35 0.31 0.0 0.0 0.06 0.0 0.96 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.24 1.4 2.44 1.05 5.7 0.54 19.37 2.3 23.25 15.89 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 19.27 19.76 58.77 48.42 0.6 3.97 62.53 25.34 20.99 14.72 0.0 0.0 0.0 0.0
1.53 6.14 12.3 7.95 23.91 11.49 0.18 0.11 0.0 0.0 0.83 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.29 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 3.07 6.06 4.3 1.75 3.15 0.1 0.0 0.0 0.79 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.25 1060.76 639.14 794.61 319.02 26.67 1.64 15.48 3.49 234.79 799.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 6.16 0.06 0.15 0.2 0.3 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.81 29.63 2.03 2.1 1.56 1.33 0.05 0.0 0.34 0.12 1.95 3.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 22.5 5.26 39.76 14.36 130.43 0.71 0.0 0.0 5.49 4.3 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.03 0.4 0.28 0.12 0.65 0.07 0.0 0.71 0.63 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.57 7.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.0 7.06 7.54 4.9 3.43 5.7 2.28 4.71 4.24 19.6 22.7 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.14 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.21 1.61 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 2.63 7.15 22.25 29.21 0.2 0.11 5.18 0.58 3.11 8.88 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 1.26 8.67 5.0 0.0 0.16 7.38 0.12 0.63 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.25
1.15 3.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.7 0.45 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.15 2.75 4.63 7.18 3.37 0.0 0.19 0.0 0.0 0.77 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 31.16 30.36 27.72 46.27 6.23 0.32 0.0 0.52 1.62 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.16 0.16 23.64 20.59 16.63 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.49 0.13 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.01 10.61 3.88 32.72 13.57 89.65 0.38 0.05 0.0 2.06 1.33 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.36 0.76 0.13 0.24 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.16 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.37 0.13 0.05 0.56 0.67 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.45 0.8 0.45 2.59 0.11 0.0 0.95 0.0 2.9 0.4 0.0 0.16 0.0 0.0
3.67 4.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.87 5.42 2.42 8.51 0.06 0.06 0.55 0.11 16.11 12.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.5 32.19 65.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.0 0.0 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 3.41 19.16 34.64 0.94 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 8.64 1.65 92.35 13.9 36.71 0.1 0.0 0.0 2.78 2.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 17.35 6.07 20.46 76.76 29.28 47.86 557.78 1741.54 348.23 161.54 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 2.05 1.91 0.78 0.79 0.31 0.38 1.94 3.65 2.93 1.41 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.09 0.0 2.1 0.14 0.07 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 2.47 0.05 0.14 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.84 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.6 0.29 0.31 0.0 0.48 0.46 1.19 4.81 1.36 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 361.68 246.26 176.31 592.58 24.85 1.15 0.28 1.0 131.3 119.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 1.08 0.0 0.06 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.57 2.9 3.46 1.41 0.88 1.69 1.09 0.03 0.07 0.17 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.33 0.07 0.07 0.32 0.0 0.01 0.35 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.54 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 1.51 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 6.46 4.85 1.57 2.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
30.39 0.29 34.84 29.11 23.29 46.53 0.64 2.31 18.41 8.06 4.9 4.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 23.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.47 0.62 0.69 1.48 0.14 0.0 0.07 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.05 0.56 0.0 0.0 0.16 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.0 0.52 1.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.11 0.0 0.06 1.48 0.03 0.39 7.56 0.0 0.43 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.36 0.37 0.08 0.43 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.21 0.27 0.24 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 817.52 1.91 4.63 2.24 22.03 2.04 0.13 1.74 0.29 0.22 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)