1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0
0.52 12.64 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.62 0.0
1.09 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.59 1.54 0.0 3.02
0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.21 0.13 0.0 0.12 0.33 0.23
0.02 0.0 15.16 20.59 27.28 9.12 153.81 1.09 0.86 0.62 20.71 14.81 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
1.02 1.06 694.05 723.57 496.39 379.58 1.24 1.19 0.73 0.85 12.22 14.32 0.0 0.06 0.0 0.18
0.0 0.35 0.11 0.0 0.58 0.21 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.39 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.95 2.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.01 0.85 30.23 82.79 31.67 128.1 105.17 8.7 20.41 8.62 14.14 25.33 0.08 0.0 0.49 0.08
0.26 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.83 0.0 0.0
0.05 0.22 0.36 0.34 0.58 1.33 0.23 0.5 0.41 0.29 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.31
0.08 0.0 0.21 0.18 0.08 0.41 0.13 0.72 0.53 0.22 0.0 0.21 0.0 0.24 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.6 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.16 1.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.51 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.2 0.02 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.89 0.33 0.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.05 7.68 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.09 0.0
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.03 0.11 0.22 0.43 0.0 0.0 0.18 0.14 0.4 0.2 0.06 0.11 0.11 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0
0.05 0.22 0.0 0.0 0.22 0.18 0.3 0.32 0.0 0.0 0.29 0.27 0.28 0.39 0.27 0.57
0.0 0.0 0.55 0.51 11.64 1.03 9.06 0.07 0.0 0.0 0.16 0.3 0.38 0.0 0.0 0.0
42.4 0.18 0.7 0.2 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.0 3.67 2.61 1.83 0.0 0.0 0.0 0.79 0.24 0.0
0.0 0.02 0.18 0.11 0.68 0.49 0.12 0.09 0.15 0.0 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.12
0.09 12.42 0.11 0.43 0.13 1.53 0.0 1.45 4.66 4.38 1.03 2.2 0.14 0.07 0.28 0.13
0.0 0.11 0.57 0.72 0.12 0.17 0.0 0.89 2.64 1.95 0.0 0.08 0.43 0.1 0.0 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.52 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 31.56 18.51 34.71 26.48 6.64 0.1 0.0 0.0 0.25 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0
12.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 2.57 11.14 12.32 11.41 11.95 12.89 0.46 1.58 1.86 2.88 2.06 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 2.02
0.69 1.31 2.69 1.57 1.01 1.3 2.47 1.44 3.66 1.81 1.86 1.73 0.15 0.14 0.6 0.55
0.0 0.0 0.77 0.38 0.29 1.61 0.01 0.08 1.99 0.82 0.35 1.32 0.0 0.21 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.47 0.45 0.38 2.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.28 0.0
0.0 0.0 0.57 0.0 0.25 0.23 0.28 0.12 0.0 0.55 0.56 0.17 0.42 0.0 0.83 0.39
2.61 0.0 3.78 2.4 1.55 4.65 0.0 0.08 1.48 1.77 13.01 2.51 0.22 0.05 0.65 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.31 0.43 1.21 1.13
2.88 0.0 3.55 2.41 6.14 2.93 0.0 0.0 2.92 1.14 8.78 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.23 7.25 10.04 7.24 0.64 0.6 0.63 0.16 1.17 0.77 0.38 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.16 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.04 13.26 23.06 24.04 11.05 2.98 0.15 0.62 0.46 1.55 0.79 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 0.46 52.97 111.71 68.42 91.14 4.96 2.15 2.28 2.46 31.2 21.79 1.53 0.61 1.29 0.6
0.43 0.08 3.48 2.04 3.97 4.84 0.26 0.51 0.0 0.0 0.46 0.19 4.06 1.39 0.92 0.43
0.12 0.0 3.4 3.04 1.65 3.08 7.61 0.56 0.36 0.16 0.0 0.05 0.0 0.12 0.26 0.12
0.24 0.0 5.08 2.07 1.38 0.71 0.17 0.11 0.0 0.14 0.3 0.14 1.02 0.0 0.0 0.31
0.09 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.11 0.0 0.0 0.29 0.16 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 1.03 0.0 0.0 0.84 0.0 4.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 13.9 9.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.63 1.3 0.0 0.17 0.36 0.0
9.11 15.71 53.47 47.86 54.58 285.8 2.03 0.75 0.84 4.93 30.99 40.26 0.08 0.15 0.47 0.7
0.74 0.47 2.28 1.66 1.03 1.85 1.21 0.42 0.68 0.28 0.59 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.5 2.5 1.35 0.19 1.13 2.55 0.56 1.98 0.7 0.97 2.5 2.78 0.0 0.26 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.82
0.18 0.5 0.1 0.05 0.68 0.42 0.35 0.43 0.25 0.06 0.34 0.29 0.07 0.38 0.14 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.35 2.35 3.18 3.57 4.64 2.38 10.43 0.59 0.66 0.96 0.71 0.33 0.67 0.39 0.0 0.76
0.0 0.0 0.21 0.09 0.22 0.07 0.04 0.16 0.1 0.0 0.11 0.21 0.26 0.36 4.04 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 36.87 56.25 78.16 31.19 82.91 0.39 0.62 0.5 32.1 14.51 0.0 0.0 0.0 0.0
1.32 0.72 0.32 0.27 0.47 0.22 1.24 1.66 0.0 0.0 0.38 0.32 0.06 0.06 0.06 0.09
0.0 0.39 1.29 0.68 3.95 3.62 6.25 0.12 0.0 0.0 0.0 0.33 1.6 2.2 0.79 2.02
0.12 3.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.73 0.79 2.65 0.43 0.53 0.25 0.0 0.49
1.59 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.77 3.47 0.07 0.08 0.07 2.3 0.13 0.57 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.47 0.0 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.35 1.02 4.27 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.21 24.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.66 1.35 5.06 0.1 12.37 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.07 0.46 1.13 2.1 0.1 0.1 0.15 0.08 0.0 0.28 0.23 0.29 0.09 0.0 0.53
26.63 26.43 0.25 0.44 0.72 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.06 0.0 0.08 0.55 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.06 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 4.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.27 2.31 0.48 1.01 0.28 0.41 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14
0.08 22.97 0.63 0.76 1.7 2.21 9.77 21.53 10.96 13.17 50.73 65.84 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.21 0.0 1.6 2.83 0.67 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.9 0.0
1.85 2.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 44.64 44.64 1.33 0.0 0.0 2.63 11.04 0.0
0.81 0.92 2.13 2.32 2.46 1.14 5.22 2.23 0.1 0.52 18.77 12.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.18 0.11 0.29 0.04 0.37 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.28 0.0
0.03 0.04 0.15 0.51 0.24 0.62 0.3 0.06 0.3 0.39 1.83 0.1 0.03 0.0 0.07 0.03
2.34 1.84 29.19 42.97 10.31 18.13 1.74 1.42 0.36 1.08 9.12 9.82 0.11 0.21 0.0 0.11
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 5.59 5.47 6.41 12.21 2.31 20.06 0.04 0.0 13.51 26.6 0.11 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.27 0.12 0.42 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.09 0.23 0.2 0.36 0.19 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 1.49 0.64 0.22 0.42
3.93 14.98 0.1 0.0 0.21 0.47 0.06 12.07 0.0 0.0 0.08 0.22 1.09 1.11 2.5 0.5
0.0 0.0 6.22 3.47 1.53 1.47 0.02 0.03 0.99 0.43 3.77 3.87 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.14 0.8 1.01 1.57 0.21 0.0 0.31 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.53 0.25
0.43 0.22 0.0 0.0 0.26 0.24 0.22 1.86 0.0 0.0 0.2 0.73 0.89 0.21 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.54 0.0 0.0 0.49
0.66 0.32 23.09 39.58 35.55 35.37 4.1 0.17 0.25 0.15 1.05 0.98 0.0 0.26 0.55 0.0
0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 1.85 1.11 0.0
0.0 0.05 3.05 1.32 0.87 0.55 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)