1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.0
0.17 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.46
0.0 0.0 0.34 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.64 0.4 0.0 0.36 1.0 0.7
0.0 0.0 0.1 0.13 0.18 0.06 1.0 0.01 0.01 0.0 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.96 1.0 0.69 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.61 0.18 0.0 1.0 0.36 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.68 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.97 1.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 0.24 0.65 0.25 1.0 0.82 0.07 0.16 0.07 0.11 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.04 0.17 0.27 0.26 0.44 1.0 0.17 0.38 0.31 0.21 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.23
0.11 0.0 0.29 0.24 0.11 0.57 0.18 1.0 0.73 0.3 0.0 0.29 0.0 0.34 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 1.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.0 0.06 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.03 0.07 0.22 0.02 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.12 0.07 0.27 0.51 1.0 0.0 0.0 0.42 0.33 0.95 0.47 0.13 0.25 0.26 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.38 0.0 0.0 0.39 0.31 0.52 0.56 0.0 0.0 0.51 0.47 0.48 0.68 0.48 1.0
0.0 0.0 0.05 0.04 1.0 0.09 0.78 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.71 0.5 0.0 0.0 0.0 0.21 0.06 0.0
0.0 0.04 0.26 0.16 1.0 0.72 0.18 0.13 0.22 0.0 0.12 0.0 0.2 0.0 0.0 0.18
0.01 1.0 0.01 0.03 0.01 0.12 0.0 0.12 0.38 0.35 0.08 0.18 0.01 0.01 0.02 0.01
0.0 0.04 0.21 0.27 0.05 0.06 0.0 0.34 1.0 0.74 0.0 0.03 0.16 0.04 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.77 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.91 0.53 1.0 0.76 0.19 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.86 0.96 0.89 0.93 1.0 0.04 0.12 0.14 0.22 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93
0.19 0.36 0.74 0.43 0.28 0.36 0.68 0.4 1.0 0.5 0.51 0.47 0.04 0.04 0.16 0.15
0.0 0.0 0.39 0.19 0.15 0.81 0.01 0.04 1.0 0.41 0.18 0.66 0.0 0.11 0.0 0.0
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.18 0.15 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0
0.0 0.0 0.68 0.0 0.29 0.27 0.34 0.15 0.0 0.65 0.67 0.21 0.51 0.0 1.0 0.47
0.2 0.0 0.29 0.18 0.12 0.36 0.0 0.01 0.11 0.14 1.0 0.19 0.02 0.0 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.25 0.36 1.0 0.93
0.33 0.0 0.4 0.27 0.7 0.33 0.0 0.0 0.33 0.13 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.72 0.72 1.0 0.72 0.06 0.06 0.06 0.02 0.12 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.55 0.96 1.0 0.46 0.12 0.01 0.03 0.02 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.47 1.0 0.61 0.82 0.04 0.02 0.02 0.02 0.28 0.2 0.01 0.01 0.01 0.01
0.09 0.02 0.72 0.42 0.82 1.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.1 0.04 0.84 0.29 0.19 0.09
0.02 0.0 0.45 0.4 0.22 0.4 1.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02
0.05 0.0 1.0 0.41 0.27 0.14 0.03 0.02 0.0 0.03 0.06 0.03 0.2 0.0 0.0 0.06
0.31 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.36 0.0 0.0 1.0 0.54 0.11 0.29 0.0 0.0 0.0 0.27 0.69 0.32 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.19 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.1 0.22 0.0
0.03 0.05 0.19 0.17 0.19 1.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.21 1.0 0.73 0.45 0.81 0.53 0.18 0.3 0.12 0.26 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.56 0.3 0.04 0.25 0.57 0.12 0.44 0.16 0.21 0.55 0.62 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.27 0.74 0.14 0.07 1.0 0.61 0.52 0.63 0.37 0.09 0.5 0.42 0.11 0.56 0.21 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.22 0.31 0.34 0.44 0.23 1.0 0.06 0.06 0.09 0.07 0.03 0.06 0.04 0.0 0.07
0.0 0.0 0.05 0.02 0.06 0.02 0.01 0.04 0.03 0.0 0.03 0.05 0.06 0.09 1.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.68 0.94 0.38 1.0 0.0 0.01 0.01 0.39 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 0.43 0.19 0.16 0.28 0.13 0.75 1.0 0.0 0.0 0.23 0.19 0.04 0.04 0.04 0.05
0.0 0.06 0.21 0.11 0.63 0.58 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.26 0.35 0.13 0.32
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.2 0.68 0.11 0.14 0.06 0.0 0.13
1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.8 1.0 0.02 0.02 0.02 0.66 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.98 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.11 0.41 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.22 0.54 1.0 0.05 0.05 0.07 0.04 0.0 0.13 0.11 0.14 0.04 0.0 0.25
1.0 0.99 0.01 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.19 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.24 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.98 1.0 0.21 0.44 0.12 0.18 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06
0.0 0.35 0.01 0.01 0.03 0.03 0.15 0.33 0.17 0.2 0.77 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.16 0.28 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0
0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.25 0.0
0.04 0.05 0.11 0.12 0.13 0.06 0.28 0.12 0.01 0.03 1.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.49 0.31 0.77 0.11 1.0 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.76 0.0
0.01 0.02 0.08 0.28 0.13 0.34 0.17 0.03 0.16 0.21 1.0 0.06 0.02 0.0 0.04 0.02
0.05 0.04 0.68 1.0 0.24 0.42 0.04 0.03 0.01 0.03 0.21 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.21 0.24 0.46 0.09 0.75 0.0 0.0 0.51 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.64 0.27 1.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.06 0.15 0.13 0.24 0.13 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.43 0.15 0.28
0.26 1.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.81 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.07 0.17 0.03
0.0 0.0 1.0 0.56 0.25 0.24 0.0 0.0 0.16 0.07 0.61 0.62 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.84 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.51 0.64 1.0 0.14 0.0 0.19 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.34 0.16
0.23 0.12 0.0 0.0 0.14 0.13 0.12 1.0 0.0 0.0 0.11 0.39 0.48 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.0 0.0 0.92
0.02 0.01 0.58 1.0 0.9 0.89 0.1 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.6 0.0
0.0 0.02 1.0 0.43 0.29 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)