1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_66 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.04 0.0 0.78 0.56 0.76 1.0 0.4 0.16 0.0 0.0 0.65 0.93 0.04 0.07 0.03 0.07
0.03 0.0 0.69 0.41 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.07 0.06 0.04 0.22
0.35 0.68 0.1 0.13 0.12 0.19 0.26 0.29 0.41 0.43 0.44 0.4 0.56 0.5 0.25 1.0
0.03 0.04 0.79 1.0 0.67 0.81 0.07 0.03 0.19 0.29 0.36 0.48 0.0 0.01 0.0 0.01
0.03 0.03 0.42 0.63 0.66 1.0 0.04 0.0 0.03 0.07 0.13 0.17 0.01 0.0 0.01 0.03
0.04 0.06 1.0 0.81 0.55 0.81 0.08 0.04 0.16 0.24 0.55 0.3 0.03 0.04 0.05 0.09
0.01 0.0 1.0 0.58 0.47 0.35 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.16 0.19 0.2 0.26
0.05 0.13 0.5 0.46 0.6 1.0 0.07 0.03 0.04 0.06 0.36 0.4 0.22 0.34 0.47 0.52
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.47 0.27 0.0 0.0 0.22 0.25 0.51 0.36 1.0 0.12
0.39 0.38 0.45 0.75 0.74 0.86 0.53 0.4 0.37 0.39 1.0 0.87 0.34 0.26 0.22 0.73
0.13 0.04 0.52 0.67 0.47 1.0 0.08 0.02 0.02 0.02 0.3 0.31 0.02 0.03 0.03 0.06
0.19 0.12 0.7 0.61 0.51 1.0 0.23 0.16 0.13 0.16 0.44 0.36 0.19 0.18 0.19 0.33
0.14 1.0 0.13 0.17 0.07 0.25 0.0 0.16 0.44 0.36 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01
0.05 0.04 0.3 0.47 0.52 0.81 0.06 0.04 0.23 0.4 1.0 0.76 0.04 0.04 0.03 0.07
0.02 0.03 0.81 0.77 0.57 1.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.27 0.24 0.02 0.02 0.03 0.03
0.02 0.01 0.62 0.63 1.0 0.52 0.02 0.02 0.02 0.04 0.14 0.19 0.01 0.01 0.01 0.02
0.31 0.19 0.61 0.76 0.38 0.43 0.6 0.38 0.34 0.38 1.0 0.57 0.27 0.34 0.26 0.7
0.05 0.05 0.33 0.33 0.38 1.0 0.06 0.05 0.02 0.03 0.12 0.17 0.52 0.66 0.75 0.6
0.06 0.03 0.62 0.56 0.82 1.0 0.03 0.04 0.06 0.06 0.19 0.27 0.19 0.18 0.27 0.33
0.0 0.0 0.29 0.22 0.0 0.0 0.57 0.19 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.14 1.0 0.47
0.08 1.0 0.32 0.38 0.2 0.23 0.34 0.04 0.1 0.06 0.73 0.51 0.01 0.0 0.0 0.01
0.04 0.03 0.44 0.57 0.21 0.22 0.7 0.53 0.22 0.46 1.0 0.32 0.21 0.18 0.38 0.91
0.0 0.01 0.84 0.98 0.89 1.0 0.09 0.04 0.0 0.02 0.15 0.18 0.02 0.03 0.05 0.06
0.02 0.04 0.47 0.48 1.0 0.92 0.04 0.05 0.04 0.05 0.12 0.15 0.19 0.25 0.3 0.22
0.07 0.57 0.45 0.46 0.24 1.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.33 0.27 0.0 0.0 0.04 0.01
0.04 0.0 0.22 0.43 0.6 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01
0.03 0.09 0.14 0.24 0.47 1.0 0.05 0.03 0.08 0.1 0.65 0.6 0.04 0.05 0.07 0.13
0.14 0.11 1.0 0.89 0.87 0.93 0.44 0.36 0.37 0.42 0.79 0.91 0.15 0.19 0.33 0.38
0.0 0.03 0.81 0.57 0.84 1.0 0.03 0.3 0.02 0.02 0.16 0.27 0.0 0.0 0.08 0.09
0.01 0.01 1.0 0.6 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.08 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.61 0.56 0.72 1.0 0.05 0.05 0.14 0.24 0.37 0.36 0.08 0.09 0.22 0.18
0.0 0.0 0.03 0.03 0.25 1.0 0.03 0.0 0.05 0.21 0.39 0.27 0.04 0.04 0.1 0.17
0.02 0.02 0.87 1.0 0.69 0.98 0.03 0.02 0.05 0.08 0.19 0.25 0.02 0.01 0.02 0.03
0.06 0.13 1.0 0.59 0.73 0.86 0.35 0.26 0.2 0.1 0.64 0.71 0.14 0.23 0.2 0.27
0.08 0.04 0.2 0.18 0.38 0.5 0.36 0.33 1.0 0.8 0.56 0.42 0.04 0.04 0.06 0.07
0.08 0.45 1.0 0.96 0.32 0.8 0.14 0.11 0.23 0.2 0.19 0.33 0.03 0.03 0.0 0.07
0.38 0.09 0.68 0.94 0.88 1.0 0.98 0.95 0.01 0.04 0.55 0.43 0.09 0.14 0.24 0.23
0.16 0.24 1.0 0.54 0.74 0.93 0.09 0.26 0.16 0.25 0.19 0.34 0.04 0.06 0.2 0.12
0.01 0.0 0.24 0.21 0.42 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.2 0.23 0.66 1.0 0.42 0.61 0.35 0.15 0.19 0.27 0.63 0.38 0.13 0.11 0.12 0.24
0.18 0.26 0.36 0.57 0.4 0.64 0.16 0.15 0.26 0.46 1.0 1.0 0.05 0.05 0.05 0.08
0.07 0.06 0.77 1.0 0.41 0.48 0.18 0.1 0.06 0.07 0.23 0.22 0.01 0.01 0.03 0.03
0.18 0.08 0.56 0.63 0.56 0.6 0.31 0.23 0.22 0.3 1.0 0.81 0.06 0.05 0.1 0.1
0.07 0.14 0.45 0.35 0.89 1.0 0.01 0.05 0.01 0.03 0.08 0.11 0.11 0.16 0.39 0.27
0.07 0.03 1.0 0.59 0.26 0.23 0.0 0.0 0.11 0.06 0.04 0.1 0.09 0.17 0.22 0.26
0.39 0.22 0.14 0.21 0.2 0.46 0.51 0.2 0.0 0.01 0.0 0.02 0.65 0.63 0.1 1.0
0.04 0.0 0.51 0.71 0.46 0.43 0.07 0.14 0.24 0.52 0.62 1.0 0.14 0.07 0.3 0.18
0.14 0.22 0.63 0.6 0.76 0.48 0.21 0.24 1.0 0.6 0.49 0.56 0.1 0.11 0.07 0.19
0.0 0.0 0.65 0.75 0.96 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.06 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01
0.02 0.07 0.71 0.49 0.82 1.0 0.04 0.03 0.04 0.06 0.15 0.15 0.04 0.07 0.12 0.1
0.08 0.03 0.74 0.87 0.76 1.0 0.09 0.17 0.13 0.19 0.85 0.74 0.01 0.01 0.06 0.04
0.39 1.0 0.11 0.13 0.28 0.94 0.22 0.12 0.27 0.29 0.09 0.09 0.27 0.41 0.46 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.19 0.12 0.14 0.1 0.43 0.26 0.46 0.48 1.0 0.18 0.18 0.11 0.03 0.18 0.17
0.08 0.04 0.33 0.31 0.64 1.0 0.17 0.03 0.07 0.06 0.11 0.1 0.04 0.04 0.07 0.03
0.01 0.01 0.39 0.42 0.8 1.0 0.01 0.01 0.03 0.06 0.05 0.05 0.02 0.02 0.07 0.04
0.18 0.67 1.0 0.35 0.89 0.58 0.0 0.24 0.67 0.26 0.17 0.34 0.0 0.0 0.0 0.01
0.03 0.01 1.0 0.8 0.4 0.67 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.02 0.0 0.04 0.02
0.02 0.02 0.55 0.77 0.67 1.0 0.06 0.03 0.06 0.09 0.33 0.37 0.06 0.07 0.09 0.09
0.32 0.02 0.19 0.2 0.66 0.71 0.23 0.86 0.08 0.09 1.0 0.86 0.1 0.12 0.21 0.21
0.03 0.0 0.29 0.56 1.0 0.75 0.95 0.15 0.02 0.01 0.21 0.19 0.21 0.3 0.25 0.24
0.05 0.07 0.08 0.07 0.11 0.11 0.02 0.03 0.05 0.03 0.06 0.06 0.42 0.53 1.0 0.57
0.44 0.71 0.6 0.37 0.38 1.0 0.43 0.52 0.3 0.21 0.44 0.31 0.44 0.66 0.54 0.35
0.06 0.04 0.73 0.77 0.29 1.0 0.68 0.06 0.05 0.12 0.72 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 1.0 0.77 0.47 0.79 0.17 0.12 0.06 0.09 0.71 0.69 0.29 0.38 0.4 0.45
0.02 0.11 0.77 1.0 0.93 0.64 0.97 0.42 0.22 0.2 0.33 0.28 0.05 0.05 0.07 0.12
0.06 0.08 1.0 0.94 0.87 0.88 0.49 0.3 0.12 0.15 0.72 0.37 0.05 0.11 0.16 0.68
0.29 0.22 0.36 0.5 0.59 1.0 0.63 0.52 0.68 0.95 0.75 0.65 0.16 0.22 0.29 0.28
0.07 0.1 0.52 0.59 0.65 1.0 0.41 0.26 0.06 0.1 0.83 0.78 0.08 0.12 0.12 0.13
0.03 0.17 0.86 1.0 0.52 0.81 0.04 0.03 0.07 0.14 0.24 0.36 0.05 0.13 0.23 0.23
0.04 0.03 0.15 0.21 0.15 0.43 0.1 0.06 0.17 0.32 1.0 0.91 0.08 0.07 0.07 0.12
0.02 0.01 0.53 0.43 0.53 1.0 0.09 0.08 0.01 0.0 0.04 0.12 0.04 0.05 0.12 0.09
0.09 0.01 0.02 0.05 0.12 0.14 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.04 1.0 0.22
0.49 1.0 0.91 0.67 0.77 0.37 0.72 0.79 0.23 0.3 0.53 0.66 0.23 0.34 0.3 0.5
0.09 0.07 0.77 0.76 0.58 1.0 0.09 0.05 0.08 0.08 0.33 0.35 0.05 0.04 0.04 0.1
0.09 0.18 0.35 0.5 0.42 0.54 0.31 0.16 0.07 0.14 0.26 0.27 0.74 0.86 0.76 1.0
0.05 0.15 0.32 0.58 0.34 0.74 0.21 0.07 0.55 0.77 1.0 0.43 0.04 0.02 0.01 0.09
0.07 0.09 0.64 0.73 0.38 1.0 0.27 0.19 0.21 0.18 0.51 0.36 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.03 0.52 0.48 0.54 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.09 0.16 0.36 0.33 0.42
0.0 0.0 0.38 0.26 0.39 1.0 0.01 0.04 0.02 0.05 0.28 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.14 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.05 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.07 0.54 0.67 0.47 1.0 0.24 0.03 0.13 0.2 0.77 0.63 0.0 0.01 0.02 0.02
0.03 0.06 0.92 0.88 0.91 1.0 0.13 0.05 0.16 0.22 0.28 0.31 0.22 0.26 0.35 0.34
0.29 0.74 0.93 0.91 0.83 0.79 0.51 0.52 0.57 0.54 0.96 1.0 0.12 0.09 0.14 0.22
0.02 0.05 0.74 0.5 0.59 1.0 0.17 0.1 0.21 0.21 0.44 0.35 0.14 0.17 0.2 0.27
0.1 0.15 0.5 0.36 0.99 0.29 0.08 0.04 0.22 0.24 0.87 1.0 0.0 0.0 0.03 0.02
0.02 0.08 0.95 1.0 0.78 0.49 0.01 0.0 0.05 0.08 0.38 0.41 0.0 0.0 0.01 0.0
0.04 0.08 0.9 0.64 0.52 1.0 0.02 0.05 0.38 0.54 0.83 0.89 0.17 0.18 0.31 0.37
0.58 0.43 0.33 0.41 0.5 0.5 0.96 0.5 0.14 0.23 0.73 1.0 0.27 0.26 0.52 0.45
0.05 0.06 0.81 0.65 1.0 0.7 0.06 0.05 0.1 0.11 0.23 0.26 0.01 0.01 0.03 0.03
0.0 0.06 0.43 0.34 0.23 1.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.09 0.17 0.0 0.0 0.05 0.01
0.06 0.47 0.6 0.77 0.53 1.0 0.48 0.07 0.03 0.06 0.36 0.37 0.01 0.01 0.08 0.04
0.15 0.01 0.21 0.23 0.11 0.5 0.02 1.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.45 0.43 0.71 0.66
0.01 0.01 0.15 0.1 0.14 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.1 1.0 0.3
0.02 0.02 0.77 0.6 0.83 1.0 0.05 0.03 0.01 0.05 0.15 0.12 0.0 0.01 0.05 0.01
0.32 0.88 0.79 1.0 0.64 0.7 0.4 0.19 0.32 0.57 0.7 0.81 0.17 0.21 0.25 0.32
0.2 0.0 0.06 0.04 0.01 0.01 0.16 0.21 0.01 0.01 0.0 0.02 0.51 1.0 0.38 0.79
0.08 0.07 0.92 0.8 0.61 1.0 0.05 0.02 0.1 0.17 0.33 0.31 0.08 0.09 0.24 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)