1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_74 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.2 0.07 0.01 0.02 0.02 0.04 0.38 1.0 0.47 0.26 0.15 0.06 0.19 0.09 0.07 0.15
1.0 0.65 0.57 0.49 0.75 0.85 0.81 0.43 0.53 0.65 0.92 0.72 0.94 0.92 0.81 0.91
0.87 0.1 0.38 0.55 0.37 0.39 1.0 0.23 0.43 0.4 0.81 0.71 0.1 0.07 0.05 0.11
1.0 0.76 0.45 0.45 0.55 0.63 0.59 0.5 0.63 0.68 0.39 0.3 0.7 0.65 0.67 0.8
0.53 1.0 0.46 0.55 0.39 0.39 0.42 0.34 0.98 0.68 0.75 0.81 0.38 0.29 0.33 0.37
0.34 0.22 0.21 0.18 0.29 0.3 1.0 0.53 0.73 0.9 0.69 0.56 0.51 0.45 0.39 0.48
0.96 0.84 0.39 0.43 0.5 0.49 0.85 0.5 0.59 0.55 1.0 1.0 0.49 0.44 0.43 0.53
1.0 0.5 0.16 0.15 0.24 0.21 0.33 0.63 0.0 0.01 0.05 0.21 0.46 0.35 0.48 0.49
1.0 0.5 0.35 0.33 0.42 0.52 0.64 0.19 0.31 0.74 0.54 0.49 0.46 0.42 0.39 0.53
0.47 0.22 0.39 0.28 0.51 0.46 0.78 0.59 0.18 0.49 1.0 1.0 0.48 0.43 0.44 0.57
0.78 0.56 0.4 0.42 0.43 0.56 0.66 0.39 1.0 0.94 0.94 0.7 0.72 0.57 0.62 0.76
0.6 0.78 0.57 0.56 0.63 0.63 0.39 0.23 0.12 0.14 0.9 1.0 0.29 0.28 0.24 0.34
0.23 0.36 0.04 0.06 0.06 0.08 0.4 0.51 1.0 0.95 0.26 0.25 0.15 0.13 0.12 0.19
0.49 0.38 0.31 0.42 0.45 0.43 1.0 0.47 0.44 0.23 0.61 0.61 0.74 0.57 0.46 0.76
0.44 0.05 0.19 0.16 0.19 0.23 0.19 0.29 0.07 0.04 0.08 0.09 1.0 0.81 0.78 0.94
0.53 0.42 0.01 0.0 0.34 0.24 0.97 0.53 0.72 0.31 0.55 0.4 1.0 0.64 0.62 0.87
0.53 0.28 0.25 0.34 0.42 0.38 1.0 0.61 0.67 0.65 0.54 0.39 0.17 0.14 0.12 0.14
0.25 0.19 0.1 0.08 0.12 0.21 0.27 0.29 0.81 1.0 0.58 0.4 0.28 0.19 0.13 0.32
0.15 0.1 0.28 0.32 0.42 0.57 0.77 1.0 0.65 0.53 0.67 0.59 0.71 0.6 0.45 0.62
0.67 0.45 0.47 0.71 0.48 0.5 0.39 0.32 0.53 0.45 0.4 0.42 0.89 0.77 0.9 1.0
0.5 0.68 0.38 0.37 0.48 0.62 1.0 0.42 0.68 0.55 0.86 0.6 0.49 0.38 0.34 0.63
0.5 0.15 0.31 0.22 0.35 0.56 0.66 0.37 0.28 0.38 0.84 0.63 1.0 0.87 0.75 0.93
0.59 0.31 0.18 0.14 0.27 0.36 0.78 0.5 0.57 0.65 0.82 0.28 0.98 0.92 0.73 1.0
0.62 0.83 0.36 0.46 0.47 0.41 0.99 0.52 0.49 0.47 1.0 0.92 0.52 0.43 0.3 0.57
1.0 0.38 0.23 0.16 0.25 0.31 0.57 0.57 0.41 0.89 0.52 0.82 0.96 0.66 0.53 0.95
0.63 1.0 0.19 0.23 0.18 0.37 0.65 0.69 0.67 0.55 0.83 0.62 0.41 0.4 0.31 0.48
0.53 0.46 0.35 0.38 0.4 0.6 1.0 0.72 0.98 0.81 0.99 0.79 0.82 0.72 0.65 0.76
0.29 0.27 0.75 0.94 0.82 0.86 0.63 0.31 0.55 0.55 1.0 0.88 0.35 0.29 0.27 0.31
0.59 0.53 0.2 0.23 0.54 0.42 1.0 0.44 0.22 0.29 0.66 0.83 0.97 0.84 0.66 0.86
0.36 0.17 0.72 1.0 0.48 0.27 0.49 0.47 0.35 0.24 0.8 0.62 0.17 0.17 0.16 0.19
0.85 0.6 0.83 0.83 0.6 0.55 0.53 0.36 0.59 0.65 0.87 1.0 0.35 0.29 0.37 0.41
0.86 0.77 0.53 0.52 0.68 0.75 0.93 0.6 0.81 0.59 0.98 1.0 0.36 0.3 0.37 0.38
0.45 0.18 0.12 0.07 0.2 0.17 0.49 0.43 0.01 0.02 0.16 0.29 0.98 0.83 0.7 1.0
1.0 0.47 0.42 0.5 0.55 0.56 0.5 0.24 0.33 0.29 0.4 0.44 0.4 0.37 0.49 0.43
0.05 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.05 0.36 0.8 1.0 0.08 0.05 0.04 0.03 0.03 0.04
0.59 0.47 0.36 0.47 0.33 0.37 1.0 0.52 0.49 0.44 0.84 0.71 0.51 0.41 0.29 0.58
0.46 0.23 0.29 0.23 0.33 0.39 0.37 0.43 0.31 0.47 0.47 0.38 0.99 0.86 0.73 1.0
0.96 0.46 0.21 0.24 0.21 0.24 0.41 0.27 0.96 1.0 0.59 0.69 0.13 0.13 0.12 0.13
1.0 0.5 0.59 0.38 0.58 0.7 0.75 0.61 0.76 0.63 0.78 0.69 0.87 0.85 0.81 0.79
0.32 0.43 0.54 0.52 0.53 1.0 0.98 0.96 0.09 0.11 0.14 0.22 0.43 0.3 0.19 0.45
1.0 0.42 0.31 0.27 0.43 0.67 0.37 0.29 0.81 0.76 0.74 0.59 0.53 0.5 0.45 0.64
0.68 0.34 0.12 0.15 0.24 0.35 0.55 0.35 0.7 1.0 0.47 0.45 0.84 0.68 0.72 0.96
0.36 0.32 0.37 0.3 0.55 0.39 0.8 0.67 0.6 1.0 0.57 0.55 0.43 0.39 0.3 0.35
1.0 0.37 0.27 0.2 0.33 0.31 0.23 0.18 0.02 0.03 0.33 0.42 0.48 0.47 0.41 0.62
1.0 0.6 0.37 0.31 0.23 0.29 0.7 0.4 0.43 0.36 0.45 0.52 0.59 0.43 0.53 0.64
0.2 0.15 0.14 0.2 0.16 0.44 0.59 0.52 0.38 0.34 0.55 0.37 0.91 0.63 0.5 1.0
0.05 0.07 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.46 0.95 1.0 0.04 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03
0.87 0.38 0.27 0.28 0.39 0.47 0.96 0.61 0.64 0.6 1.0 0.71 0.68 0.58 0.61 0.68
0.93 0.77 0.23 0.38 0.35 0.32 0.82 0.55 0.86 0.92 1.0 0.74 0.42 0.4 0.36 0.56
0.82 0.54 0.5 0.46 0.53 0.6 1.0 0.56 0.59 0.62 0.86 0.44 0.91 0.66 0.81 0.99
0.56 0.29 0.12 0.09 0.15 0.16 0.32 0.52 0.82 1.0 0.43 0.37 0.39 0.31 0.31 0.4
0.55 0.3 0.17 0.19 0.29 0.37 0.73 0.42 0.79 0.73 1.0 0.6 0.53 0.49 0.52 0.58
0.93 0.48 0.69 0.66 0.78 0.8 0.98 0.53 0.8 0.92 0.98 1.0 0.78 0.73 0.88 0.73
1.0 0.25 0.36 0.52 0.29 0.43 0.42 0.2 0.21 0.19 0.58 0.46 0.22 0.18 0.19 0.26
0.7 0.22 0.18 0.15 0.2 0.14 0.26 0.28 0.5 0.43 0.31 0.26 0.9 0.67 0.7 1.0
0.64 0.63 0.38 0.58 0.46 0.53 0.69 0.37 0.65 0.59 1.0 0.98 0.45 0.44 0.49 0.51
0.41 0.34 0.75 1.0 0.7 0.58 0.55 0.36 0.35 0.41 0.64 0.64 0.29 0.21 0.23 0.28
0.24 0.15 1.0 0.89 0.42 0.22 0.54 0.3 0.28 0.29 0.92 0.99 0.15 0.11 0.08 0.21
0.65 0.4 0.23 0.29 0.27 0.23 0.31 1.0 0.42 0.46 0.29 0.27 0.35 0.26 0.29 0.36
0.68 0.65 0.17 0.15 0.22 0.23 0.83 0.39 0.59 0.65 0.5 0.53 0.71 0.6 0.77 1.0
0.55 0.39 0.79 1.0 0.41 0.32 0.31 0.45 0.18 0.19 0.33 0.28 0.52 0.45 0.39 0.57
0.76 0.84 0.22 0.15 0.22 0.29 0.65 0.25 0.2 0.26 0.55 0.54 1.0 0.75 0.93 1.0
0.91 0.68 0.19 0.22 0.25 0.3 0.4 0.36 1.0 0.82 0.48 0.42 0.49 0.4 0.44 0.5
0.17 0.09 0.33 0.34 0.25 0.7 0.25 0.18 0.45 0.25 1.0 0.69 0.11 0.11 0.05 0.12
0.9 0.45 0.31 0.4 0.48 0.54 0.65 0.55 0.87 0.88 0.94 0.79 0.88 0.65 0.81 1.0
1.0 0.37 0.34 0.3 0.38 0.6 0.63 0.33 0.83 0.97 0.87 0.64 0.83 0.76 0.61 0.75
0.82 0.63 0.52 0.57 0.63 0.65 1.0 0.53 0.58 0.44 0.94 0.84 0.51 0.42 0.44 0.45
1.0 0.47 0.08 0.07 0.12 0.17 0.13 0.19 0.18 0.2 0.09 0.07 0.44 0.45 0.42 0.5
1.0 0.47 0.37 0.42 0.4 0.41 0.73 0.37 0.72 0.67 0.79 0.65 0.25 0.24 0.26 0.34
0.29 0.58 0.7 0.79 0.49 0.5 0.81 0.52 0.96 0.93 1.0 0.8 0.46 0.34 0.43 0.48
1.0 0.5 0.58 0.8 0.53 0.4 0.85 0.64 0.68 0.68 0.78 0.53 0.57 0.38 0.35 0.56
0.66 0.54 0.38 0.48 0.46 0.6 0.66 0.35 0.62 0.68 1.0 0.79 0.66 0.47 0.42 0.94
0.56 0.25 0.63 0.8 0.62 0.47 1.0 0.43 0.35 0.68 0.89 0.8 0.51 0.35 0.28 0.58
1.0 0.29 0.2 0.18 0.28 0.35 0.45 0.22 0.26 0.32 0.75 0.57 0.38 0.35 0.32 0.35
0.57 0.4 0.37 0.32 0.41 0.51 0.75 0.43 0.44 0.42 0.57 0.48 0.94 0.77 0.77 1.0
0.72 0.41 0.6 0.59 0.74 0.84 0.75 0.42 0.56 0.61 1.0 0.85 0.62 0.58 0.59 0.64
0.92 0.42 0.52 0.51 0.66 0.87 0.58 0.42 0.6 0.69 1.0 0.7 0.87 0.72 0.59 0.83
0.74 0.73 0.38 0.36 0.43 0.42 1.0 0.59 0.64 0.6 1.0 0.9 0.55 0.45 0.44 0.64
0.82 0.37 0.08 0.08 0.07 0.09 0.49 0.49 0.36 0.45 0.3 0.21 1.0 0.69 0.82 1.0
0.86 0.62 0.4 0.54 0.48 0.54 0.93 0.49 0.63 0.63 1.0 0.92 0.69 0.57 0.49 0.66
0.74 0.33 0.66 0.73 0.72 1.0 0.92 0.51 0.57 0.97 0.76 0.77 0.93 0.92 0.77 0.83
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.52 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 0.37 0.41 0.58 0.5 0.5 0.71 0.56 0.94 0.91 1.0 0.89 0.72 0.58 0.63 0.81
1.0 0.73 0.31 0.24 0.31 0.41 0.69 0.45 0.68 0.7 0.59 0.48 0.48 0.43 0.37 0.53
0.36 0.25 0.04 0.08 0.09 0.21 0.67 0.91 0.07 0.01 0.75 1.0 0.59 0.43 0.25 0.65
0.61 0.56 0.48 0.47 0.6 0.39 1.0 0.38 0.34 0.35 0.59 0.73 0.42 0.33 0.33 0.36
0.08 0.11 0.53 0.75 0.55 0.58 1.0 0.31 0.08 0.12 0.57 0.38 0.53 0.39 0.45 0.57
0.75 0.36 0.29 0.27 0.32 0.44 0.77 0.35 0.46 0.54 1.0 0.78 0.47 0.44 0.44 0.56
1.0 0.63 0.25 0.19 0.31 0.31 0.43 0.24 0.31 0.27 0.21 0.33 0.51 0.44 0.54 0.51
1.0 0.73 0.39 0.56 0.51 0.51 1.0 0.57 0.85 0.87 0.92 0.84 0.31 0.27 0.3 0.45
0.66 0.39 0.24 0.18 0.36 0.32 0.51 0.92 0.92 1.0 0.75 0.66 0.6 0.5 0.46 0.52
1.0 0.08 0.25 0.31 0.29 0.63 0.38 0.34 0.1 0.12 0.25 0.21 0.38 0.3 0.3 0.38
0.66 0.27 0.3 0.39 0.33 0.41 0.53 0.36 0.67 0.58 1.0 0.75 0.34 0.29 0.25 0.33
1.0 0.16 0.23 0.27 0.17 0.26 0.35 0.12 0.09 0.19 0.32 0.37 0.27 0.25 0.25 0.27
1.0 0.58 0.35 0.39 0.45 0.48 0.71 0.38 0.48 0.72 0.61 0.48 0.66 0.67 0.89 0.85
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.32 0.38 0.69
0.85 0.34 0.49 0.45 0.51 0.75 0.91 0.57 0.58 0.59 0.93 0.65 0.96 1.0 0.96 0.9
0.38 0.33 0.15 0.22 0.25 0.37 0.47 0.39 0.74 1.0 0.79 0.28 0.66 0.56 0.46 0.74
0.58 0.43 0.26 0.23 0.29 0.34 1.0 0.54 0.48 0.45 0.8 0.66 0.86 0.64 0.66 0.85
0.89 0.7 0.29 0.4 0.46 0.69 0.7 0.32 0.68 0.69 1.0 0.83 0.31 0.29 0.29 0.38
0.54 0.22 0.49 0.48 0.47 0.48 1.0 0.45 0.68 0.72 0.9 0.79 0.36 0.29 0.33 0.53
0.58 0.41 0.24 0.29 0.24 0.45 0.58 0.44 1.0 0.83 0.71 0.47 0.47 0.35 0.42 0.53
0.7 1.0 0.41 0.5 0.46 0.59 0.81 0.52 0.97 0.89 0.83 0.69 0.29 0.23 0.18 0.31
0.65 0.45 0.56 0.23 0.69 1.0 0.8 0.52 0.03 0.06 0.33 0.47 0.65 0.56 0.52 0.69
0.99 0.6 0.33 0.25 0.32 0.45 0.46 0.25 0.37 0.42 0.48 0.44 1.0 0.83 0.93 0.89
0.68 0.26 0.32 0.24 0.33 0.35 0.53 0.32 0.16 0.16 0.37 0.36 1.0 0.93 0.88 0.98
0.9 1.0 0.3 0.39 0.36 0.44 0.6 0.37 0.83 0.6 0.91 0.91 0.43 0.36 0.32 0.45
0.17 0.09 0.04 0.06 0.05 0.09 0.46 0.31 0.0 0.0 0.04 0.22 1.0 0.71 0.6 1.0
0.76 0.6 0.18 0.23 0.34 0.36 0.8 0.53 0.76 0.64 0.85 0.5 0.98 0.7 0.79 1.0
0.24 0.21 0.17 0.17 0.4 0.38 0.81 0.47 0.56 0.56 0.83 0.69 1.0 0.51 0.57 0.93
0.56 0.3 0.47 0.36 0.55 0.58 1.0 0.52 0.52 0.53 0.92 0.87 0.5 0.56 0.46 0.59
0.58 0.34 0.1 0.08 0.11 0.09 0.18 0.14 0.11 0.07 0.2 0.19 0.71 0.68 0.6 1.0
0.82 0.34 0.36 0.42 0.4 0.29 1.0 0.48 0.16 0.11 0.61 0.47 0.5 0.34 0.43 0.52
0.96 1.0 0.16 0.1 0.35 0.34 0.71 0.51 0.76 0.65 0.65 0.71 0.65 0.66 0.85 0.65
0.44 0.31 0.61 0.59 0.64 0.51 1.0 0.53 0.28 0.19 0.55 0.67 0.38 0.31 0.37 0.42
0.82 0.26 0.21 0.23 0.42 0.47 1.0 0.34 0.22 0.19 0.39 0.3 0.26 0.22 0.26 0.3
0.95 0.55 0.79 0.72 1.0 0.91 0.95 0.54 0.6 0.56 0.9 0.98 0.72 0.67 0.71 0.69
0.96 1.0 0.26 0.45 0.28 0.36 0.38 0.3 0.68 0.71 0.44 0.45 0.21 0.16 0.16 0.22
1.0 0.96 0.33 0.37 0.41 0.44 0.62 0.28 0.44 0.39 0.5 0.58 0.36 0.33 0.39 0.47
0.06 0.01 1.0 0.8 0.43 0.32 0.07 0.05 0.0 0.0 0.07 0.04 0.09 0.08 0.07 0.1
0.0 0.0 0.74 1.0 0.02 0.0 0.72 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.21 0.2 0.29
0.22 0.35 0.4 0.27 0.48 0.31 1.0 0.33 0.09 0.1 0.5 0.53 0.59 0.5 0.51 0.68
0.84 0.81 0.68 0.9 0.71 0.87 0.68 0.52 0.97 1.0 0.7 0.54 0.6 0.53 0.33 0.83
0.31 0.37 0.18 0.09 0.19 0.23 0.3 1.0 0.5 0.57 0.12 0.22 0.49 0.39 0.52 0.57
1.0 0.18 0.55 0.39 0.67 0.74 0.8 0.31 0.25 0.3 0.6 0.58 0.53 0.52 0.49 0.56
0.5 0.31 0.27 0.34 0.39 0.29 0.58 0.31 1.0 0.73 0.86 0.56 0.38 0.32 0.24 0.52
0.37 0.05 0.09 0.08 0.15 0.15 0.11 0.17 0.06 0.06 0.07 0.09 0.83 0.73 0.65 1.0
0.46 0.3 0.65 0.72 0.82 0.51 1.0 0.25 0.38 0.48 0.72 0.69 0.42 0.28 0.25 0.44
0.66 0.39 0.25 0.34 0.32 0.41 0.65 0.38 0.91 1.0 0.75 0.55 0.48 0.42 0.38 0.6
0.8 0.66 0.38 0.41 0.49 0.68 0.99 0.43 0.84 1.0 0.89 0.68 0.71 0.57 0.77 0.67
1.0 0.37 0.14 0.13 0.23 0.18 0.23 0.17 0.15 0.17 0.19 0.22 0.19 0.17 0.18 0.22
0.86 0.74 0.21 0.39 0.41 0.35 1.0 0.44 0.98 0.94 0.84 0.57 0.47 0.34 0.34 0.56
0.47 0.24 0.22 0.32 0.46 0.51 0.85 1.0 0.65 0.55 0.67 0.6 0.71 0.41 0.35 0.69
0.71 0.34 0.31 0.3 0.44 0.5 0.62 0.44 0.5 0.56 0.74 0.69 0.75 0.58 0.62 1.0
1.0 0.36 0.45 0.47 0.54 0.67 0.89 0.46 0.67 0.63 0.87 0.58 0.61 0.51 0.52 0.58
0.08 0.12 0.51 0.69 0.44 0.97 0.13 0.26 1.0 0.57 0.78 0.58 0.11 0.09 0.14 0.14
0.28 0.01 0.45 0.21 0.38 0.46 0.22 0.24 0.0 0.0 0.02 0.07 1.0 0.91 0.85 0.89
0.62 0.73 0.46 0.54 0.32 0.42 0.75 0.42 1.0 0.78 0.83 0.87 0.34 0.28 0.31 0.36
0.54 0.58 0.85 1.0 0.98 0.79 0.81 0.45 0.56 0.55 0.78 0.84 0.44 0.39 0.46 0.46
0.05 0.01 0.56 0.6 1.0 0.71 0.15 0.22 0.07 0.11 0.16 0.28 0.14 0.08 0.11 0.13
0.44 0.2 0.35 0.32 0.45 0.33 0.32 0.17 0.01 0.0 0.14 0.23 0.88 0.76 0.84 1.0
0.6 0.44 0.12 0.06 0.13 0.16 0.18 0.18 0.0 0.0 0.06 0.15 1.0 0.93 0.77 0.86
1.0 0.51 0.34 0.28 0.41 0.54 0.8 0.4 0.59 0.66 0.8 0.55 0.55 0.47 0.43 0.54
0.61 0.22 0.53 0.39 0.67 0.46 0.93 0.28 0.02 0.04 0.57 0.58 1.0 0.91 0.79 0.97

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)