1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
165.88 27.48 45.13 34.29 37.12 47.16 94.71 120.76 81.47 54.04 49.52 62.19 15.43 13.03 10.49 14.79
0.82 13.99 0.08 0.0 0.79 0.57 0.03 0.0 0.12 0.09 0.0 0.08 0.0 0.05 0.21 0.48
3.03 72.09 1.25 1.98 18.3 35.12 2.48 11.11 7.64 2.37 17.11 3.19 1.53 1.12 0.52 2.45
1.3 0.18 2.73 1.49 5.21 1.58 4.17 6.68 0.0 0.0 0.38 1.49 0.0 0.06 0.5 0.35
0.54 3.02 86.39 102.5 69.18 102.37 92.34 18.97 36.68 22.56 126.74 66.41 1.26 1.29 0.77 3.46
0.37 1.85 1.39 0.71 1.52 0.81 0.46 1.52 0.52 0.34 0.21 0.32 0.0 0.15 0.0 0.45
2.41 1.21 35.75 34.19 31.69 24.76 5.77 4.71 4.84 12.02 8.79 15.85 3.03 1.04 2.78 4.63
0.23 0.97 69.69 66.78 35.89 26.55 10.14 15.71 35.89 59.31 46.7 35.32 0.0 0.1 0.44 0.41
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.89 0.77 0.0 1.05
0.0 0.0 0.26 0.24 0.63 1.77 1.73 1.76 5.92 1.21 3.31 1.54 0.24 0.0 0.0 1.11
1.04 2.3 23.03 25.47 10.98 29.29 14.7 51.02 143.47 48.62 58.06 93.54 0.0 0.0 0.72 0.0
1.5 2.2 9.95 9.01 15.53 19.8 26.55 30.35 8.05 4.74 11.31 13.65 0.39 0.08 0.0 0.66
3.66 3.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.33 11.49 0.08 0.04 0.0 0.12 0.0 0.54 0.0 0.19
0.13 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.02 0.13 0.0 0.0 12.21 7.26 0.1 0.0 0.0 0.79
0.14 12.8 14.16 27.77 10.76 16.11 24.18 5.01 136.31 86.57 26.96 23.99 0.24 0.0 0.0 0.32
13.19 8.56 44.46 51.68 24.78 18.4 6.82 7.37 26.32 24.43 31.65 19.65 3.65 3.68 2.91 6.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.17 0.14 1.98 0.13 0.35 0.0 0.2 0.17 0.31 0.0 0.46
123.39 24.82 49.19 52.77 39.29 23.77 80.6 47.39 19.49 28.05 93.11 78.98 7.19 6.73 5.73 9.94
30.11 0.02 0.16 0.41 0.22 0.45 0.1 1.21 0.0 0.0 0.05 0.0 0.25 0.23 0.49 0.34
1.57 5.72 3.01 1.87 6.02 3.65 20.68 4.65 0.0 0.0 0.54 2.49 0.36 0.34 0.35 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.64 0.0 0.0 71.76
22.71 2.03 0.28 0.11 0.14 0.4 0.24 0.09 0.6 1.07 0.51 0.21 0.75 0.23 0.18 0.73
0.54 0.66 1.58 3.46 7.58 6.22 5.13 29.39 23.58 34.14 1.56 2.91 0.17 0.78 0.82 1.37
0.38 0.0 7.31 2.24 21.67 14.98 6.18 0.68 0.0 0.0 15.72 21.67 0.0 0.13 0.57 1.85
1.39 6.1 3.39 3.06 7.4 10.93 18.13 8.9 0.52 0.94 3.53 4.74 1.09 0.31 0.21 2.5
0.07 0.0 0.36 0.19 0.99 1.31 1.89 1.93 0.72 0.79 0.22 0.85 1.05 0.34 0.31 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 5.72 0.24 0.25 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.66
0.11 0.0 1.12 1.65 0.82 1.76 4.63 4.0 0.17 0.12 0.12 0.0 0.14 0.0 0.0 0.26
0.3 1.58 0.71 0.32 0.98 1.16 15.22 15.59 2.67 1.64 5.19 2.04 0.12 0.06 0.48 0.0
0.58 0.09 0.68 0.65 0.72 0.34 0.0 3.14 0.79 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.48 6.75 0.83 1.73 6.67 5.68 2.49 101.89 62.03 64.37 2.84 2.24 0.26 0.79 1.27 0.71
4.74 14.49 0.6 2.21 0.15 0.0 2.31 34.9 39.54 28.11 2.63 2.15 1.75 1.28 0.74 3.32
0.1 0.43 6.2 7.4 10.8 13.44 10.07 3.34 0.83 0.51 2.66 3.63 0.36 0.41 0.23 0.23
1.38 0.7 36.01 30.93 17.16 48.33 8.74 1.11 3.78 10.24 17.59 14.84 1.47 0.19 0.82 4.45
4.29 1.78 0.45 0.94 4.65 2.19 0.14 0.04 0.11 0.06 0.06 0.06 0.14 0.07 0.28 0.39
1.56 127.47 280.33 235.1 196.16 200.31 13.85 7.73 3.85 2.85 29.16 33.78 1.86 0.69 0.36 2.04
74.4 10.49 28.06 28.16 32.43 60.22 16.13 23.65 2.59 3.32 34.3 32.21 13.51 14.68 14.48 25.68
6.52 9.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 70.11 19.67 20.84 24.9 31.47 23.88 27.91 2.18 1.14 20.01 33.76 2.34 0.9 0.21 1.95
0.61 0.87 1.79 1.72 2.94 1.51 2.31 3.77 0.23 0.16 1.5 1.78 5.45 2.55 2.53 6.82
28.05 16.53 3.49 4.66 13.15 5.21 15.82 9.98 0.2 0.21 15.77 29.95 0.8 0.14 0.6 2.82
2.25 0.89 0.45 0.44 0.45 0.6 1.06 8.25 16.1 10.14 6.48 5.23 0.88 0.2 0.72 1.41
2.86 1.23 0.12 0.41 0.49 0.47 0.66 114.42 73.65 45.66 0.19 0.21 0.4 0.66 0.62 1.41
0.52 0.37 0.35 0.15 1.33 0.15 0.0 0.78 0.0 0.0 0.44 0.23 0.59 1.31 0.87 2.99
0.43 0.29 0.0 0.0 0.26 0.47 2.1 135.28 72.32 79.81 3.75 1.65 0.45 2.3 0.88 11.07
0.66 2.83 4.24 7.5 0.81 1.56 1.99 1.28 0.0 0.0 0.93 1.04 0.93 0.22 0.0 1.49
1.11 15.55 1.41 0.72 1.27 8.37 0.18 0.14 0.88 0.0 0.37 0.18 1.15 1.11 0.8 2.74
1.64 4.75 23.51 13.46 18.08 26.94 0.92 1.12 1.58 1.21 15.49 13.29 2.94 1.87 1.85 4.74
3.12 0.04 0.34 0.34 0.5 0.13 11.18 17.67 18.09 21.63 0.68 0.59 0.16 0.05 0.11 0.05
0.23 0.57 0.09 0.36 0.75 1.36 0.63 0.35 0.55 0.18 1.37 0.65 0.22 0.15 0.53 0.59
0.69 0.78 17.76 19.24 18.59 32.4 27.45 4.46 2.58 0.81 12.66 10.16 0.81 0.83 0.0 0.45
0.04 0.1 0.0 0.71 0.78 1.02 0.95 0.37 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.59 0.82
2.24 3.17 0.88 0.71 0.55 0.44 3.37 343.43 181.98 260.2 2.03 2.41 10.32 11.1 5.3 12.9
1.04 1.83 207.69 178.66 78.63 216.0 212.18 139.77 573.9 1312.57 2637.29 2329.58 4.47 1.74 1.47 4.79
0.02 0.04 0.03 0.0 8.25 3.21 12.59 1.31 0.0 0.0 10.16 12.98 0.41 0.1 0.0 0.96
10.38 101.63 7.96 9.64 22.17 11.66 65.75 114.22 68.37 81.41 34.64 31.87 24.24 17.63 14.73 31.15
0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.31 0.0 1.21
0.57 1.33 547.14 555.74 807.29 338.17 4.06 2.07 0.27 0.09 2.03 3.55 0.0 0.1 0.66 0.1
0.0 0.0 50.3 36.2 59.18 14.32 0.66 0.01 0.0 0.12 1.42 0.15 0.94 0.04 0.74 2.84
5.54 0.96 3.07 3.86 16.85 5.71 16.82 31.96 0.12 0.19 2.78 6.28 0.15 0.07 0.0 0.68
4.53 0.22 7.33 3.67 8.43 9.28 5.1 7.06 0.37 0.19 0.0 0.92 0.45 0.0 0.0 0.41
0.03 0.0 0.0 0.0 1.06 0.34 0.76 1.83 0.17 0.05 0.09 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.11 0.0 0.75 1.61 1.24 0.93 0.05 0.0 0.55 0.43 0.28 0.13 0.14 0.13
0.15 5.47 24.39 6.36 15.4 33.06 20.68 7.98 4.94 1.99 18.63 14.94 0.5 0.07 0.42 1.25
0.89 0.11 0.15 0.06 0.33 0.25 0.73 1.27 0.0 0.02 0.06 0.28 0.9 0.38 0.18 1.03
4.86 13.76 59.2 63.69 135.51 91.47 170.21 51.59 176.57 116.67 190.83 61.3 0.12 0.11 0.24 0.44
0.0 0.09 0.16 0.12 0.25 0.16 1.21 2.55 0.0 0.0 0.0 0.38 2.45 2.29 0.72 1.12
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.6 0.75
0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.26 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.13 0.35 0.0 0.64 0.47
0.48 0.0 0.93 0.83 1.52 1.25 0.43 0.53 0.27 0.05 0.05 0.11 0.29 0.19 0.11 0.21
0.02 0.03 23.59 29.98 18.45 11.88 61.55 4.31 0.06 0.06 18.37 15.0 0.28 0.26 0.0 0.77
0.0 1.12 0.48 0.91 1.21 2.11 1.51 0.05 0.0 0.15 0.15 0.14 0.36 0.0 0.35 0.83
0.07 2.82 2.92 1.94 3.83 3.07 4.42 7.65 0.05 0.05 1.17 1.46 1.81 0.17 0.24 1.11
0.03 0.33 0.61 0.56 0.61 0.51 0.23 0.43 0.06 0.02 0.02 0.06 0.46 0.32 0.15 0.88
1.86 0.53 0.13 0.0 0.26 0.51 1.09 0.75 0.06 0.03 0.38 0.41 0.73 0.15 0.16 0.45
117.32 0.11 1.35 0.55 1.68 2.72 0.35 1.33 2.54 0.32 0.71 0.68 0.85 0.43 0.48 0.67
0.44 0.22 3.91 7.64 66.87 4.78 0.58 0.61 0.2 0.31 1.18 0.1 1.24 0.47 0.49 0.46
23.45 72.07 14.8 8.42 9.47 7.72 46.18 22.65 94.58 107.95 53.51 22.63 8.27 11.17 5.56 12.11
0.11 0.06 0.37 0.16 0.17 2.05 0.02 1.05 14.9 3.69 3.68 3.29 0.12 0.27 0.0 0.86
0.02 0.05 2.68 2.47 4.95 6.11 2.8 1.49 1.43 1.81 3.38 3.03 0.15 0.14 0.0 0.42
20.36 27.81 0.79 0.09 21.42 23.1 40.93 14.26 7.61 7.35 23.65 22.19 26.07 13.83 19.02 20.48
0.48 0.14 1.55 1.71 2.21 2.28 2.5 2.59 0.35 0.02 0.11 0.69 0.56 0.19 0.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.75
0.01 0.02 0.03 0.03 0.06 0.0 0.0 0.1 3.8 0.36 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.44
1.72 1.46 0.77 0.06 5.88 0.97 0.0 3.55 4.06 0.28 0.07 0.13 0.0 0.08 0.0 0.0
12.58 49.96 1.0 0.4 1.09 0.49 7.08 17.23 120.91 106.01 12.5 9.46 0.8 0.75 0.26 0.74
26.98 40.3 5.15 6.09 5.06 8.98 7.47 41.46 68.09 62.77 12.94 10.18 12.12 10.99 12.78 14.92
7.27 1.09 3.88 4.49 5.21 4.16 0.75 0.28 12.76 4.77 11.88 3.13 1.6 0.6 1.05 1.96
7.75 0.07 25.29 59.35 47.96 22.23 40.88 3.47 0.4 4.57 27.51 14.92 0.0 0.11 0.0 0.21
0.04 0.0 2.03 1.2 2.35 2.43 5.09 3.32 0.04 0.02 0.59 1.21 0.62 0.61 0.44 1.24
1.4 0.0 0.44 0.36 2.42 1.63 1.87 7.53 0.19 0.04 0.5 1.04 0.1 0.14 0.0 0.36
0.04 0.88 1.86 0.65 4.69 2.33 1.13 2.42 0.19 0.0 0.72 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0
3.47 34.42 247.33 101.5 177.15 94.54 60.38 174.03 0.34 0.51 74.97 204.69 1.23 0.92 0.48 1.36
236.13 6489.61 12.29 1.96 11.84 1.65 0.07 15.72 17.61 120.51 74.47 24.4 1.12 1.36 0.44 2.05
0.53 1.48 45.87 13.25 231.92 90.61 98.42 4.03 1.33 1.21 1.32 3.13 0.0 0.09 0.39 0.36
5.57 1.11 1.86 0.57 0.73 0.42 0.36 0.44 0.0 0.05 0.1 0.04 0.69 0.0 1.8 0.42
0.0 1.5 2.62 12.88 1.93 18.04 2.9 0.37 0.0 0.57 0.2 0.55 1.33 1.04 1.74 0.81
0.4 0.06 0.2 0.51 0.44 0.17 1.05 3.63 3.6 4.96 0.46 0.51 3.37 2.49 2.57 3.19
1.78 202.6 0.66 0.24 1.03 1.22 0.51 3.2 0.0 0.0 0.04 0.08 100.77 61.65 33.73 140.9
0.07 1.25 6.86 7.49 3.96 4.0 1.61 0.6 0.13 0.0 0.07 0.5 1.43 0.89 1.87 0.58
0.0 0.12 9.68 7.3 4.35 1.65 6.45 3.6 0.25 0.11 0.92 1.42 0.13 0.0 0.25 0.47
0.13 2.48 14.37 5.7 13.29 13.74 0.02 0.4 0.0 0.06 0.96 1.73 0.28 0.13 0.28 1.95
0.19 0.2 104.31 114.52 41.09 30.51 1.74 0.51 0.0 0.0 1.24 4.96 0.28 0.09 0.0 0.08
0.35 0.23 9.83 8.7 4.13 3.69 0.38 0.5 0.12 0.21 0.87 0.98 0.67 0.21 0.73 1.43
0.94 0.0 0.13 0.17 0.36 0.39 0.0 0.86 1.09 0.0 0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.11
0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.12 0.0 0.0 0.2 0.09 0.39 0.46
0.67 2.17 63.88 48.32 72.02 36.66 18.86 2.45 0.0 0.0 4.1 15.71 0.0 0.08 0.09 0.08
0.01 0.0 0.0 0.04 0.84 2.27 0.74 0.64 1.92 0.13 0.26 0.15 0.0 0.09 0.12 0.0
0.0 59.71 0.05 0.0 0.03 0.0 0.02 0.05 0.08 0.12 0.34 0.12 0.1 0.09 0.2 0.09
0.09 0.09 2.24 2.73 2.22 3.47 2.88 2.14 0.73 1.12 3.67 3.19 0.32 0.15 0.47 0.66
3.49 0.92 2.44 2.27 4.71 6.68 15.07 33.39 0.08 0.03 9.95 37.5 0.46 0.43 0.0 1.15
3.36 12.49 43.51 27.43 34.65 17.92 31.53 223.88 73.9 92.43 8.28 4.58 0.32 1.59 0.42 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 2.68
1.16 0.1 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 8.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.14 0.19 0.0 0.0
0.26 0.17 81.13 53.38 43.87 65.04 0.72 164.53 2.68 12.97 20.77 22.87 0.15 0.0 0.0 0.14
0.03 0.14 40.14 8.9 28.32 5.62 2.6 0.18 0.0 0.0 0.0 0.48 0.4 0.09 0.4 0.93
0.01 0.09 23.12 31.74 20.46 27.27 0.99 0.93 3.96 7.65 20.97 15.81 0.0 0.07 0.16 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)