1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_166 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.69 0.27 0.22 0.22 0.27 0.29 0.41 0.57 0.0 0.0 0.12 0.13 0.97 0.77 0.54 1.0
1.0 0.61 0.12 0.17 0.2 0.32 0.35 0.34 0.79 0.53 0.72 0.63 0.43 0.36 0.22 0.53
0.89 0.62 0.5 1.0 0.42 0.53 0.78 0.56 0.45 0.45 0.52 0.56 0.88 0.73 0.6 0.89
1.0 0.33 0.51 0.68 0.59 0.82 0.73 0.56 0.68 0.81 0.8 0.54 0.74 0.67 0.52 0.79
0.46 0.33 0.39 0.55 0.31 0.35 0.72 0.44 0.94 1.0 0.97 0.62 0.73 0.55 0.46 0.89
0.26 0.15 0.66 1.0 0.64 0.98 0.53 0.51 0.4 0.42 0.65 0.46 0.45 0.37 0.26 0.4
1.0 0.23 0.18 0.25 0.3 0.37 0.53 0.21 0.26 0.45 0.6 0.35 0.53 0.36 0.35 0.66
0.13 0.12 0.14 0.15 0.25 0.25 0.6 0.37 0.37 0.58 0.44 0.28 1.0 0.74 0.54 0.93
0.51 0.41 0.64 0.71 0.5 0.46 0.53 0.37 0.75 0.51 0.96 1.0 0.48 0.4 0.31 0.48
0.23 0.19 0.05 0.05 0.1 0.11 0.2 0.41 0.91 1.0 0.25 0.19 0.34 0.23 0.2 0.35
0.26 0.34 0.08 0.04 0.29 0.13 0.4 0.31 0.34 0.23 0.36 0.22 0.93 0.82 0.63 1.0
0.75 0.32 0.94 0.92 0.93 0.82 0.76 0.33 0.4 0.35 1.0 0.79 0.56 0.37 0.22 0.53
0.62 0.36 0.22 0.27 0.32 0.35 0.87 0.49 0.74 0.67 0.83 0.46 0.9 0.79 0.64 1.0
0.04 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.05 0.57 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02
1.0 0.32 0.51 0.69 0.46 0.47 0.86 0.6 0.63 0.75 0.87 0.66 0.52 0.46 0.38 0.56
0.27 0.29 0.76 0.93 0.66 0.55 0.91 0.6 0.93 1.0 0.8 0.46 0.29 0.2 0.14 0.34
0.34 0.06 0.31 0.15 0.31 0.37 1.0 0.46 0.05 0.04 0.23 0.32 0.83 0.76 0.45 0.77
1.0 0.51 0.14 0.22 0.15 0.22 0.51 0.29 0.72 0.67 0.65 0.58 0.13 0.11 0.09 0.16
0.9 0.5 0.37 0.3 0.42 0.62 0.76 0.56 1.0 0.84 0.58 0.53 0.58 0.41 0.29 0.77
0.47 0.28 0.16 0.27 0.23 0.4 0.55 0.68 1.0 0.72 0.39 0.38 0.52 0.41 0.3 0.43
0.64 0.46 0.48 0.62 0.67 0.65 0.9 0.54 0.9 0.91 1.0 0.81 0.54 0.47 0.44 0.76
0.7 0.15 0.22 0.22 0.4 0.34 0.63 1.0 0.11 0.11 0.88 0.74 0.33 0.24 0.21 0.32
0.69 0.46 0.21 0.3 0.19 0.19 1.0 0.53 0.63 0.66 0.64 0.53 0.59 0.51 0.36 0.66
0.56 0.36 0.07 0.07 0.14 0.26 0.45 0.21 0.64 1.0 0.55 0.37 0.27 0.19 0.09 0.21
0.98 0.43 0.14 0.16 0.16 0.23 0.71 0.44 1.0 0.9 0.55 0.61 0.42 0.38 0.26 0.4
1.0 0.49 0.74 0.79 0.53 0.68 0.57 0.3 0.47 0.52 0.69 0.41 0.4 0.28 0.18 0.43
0.7 0.37 0.22 0.26 0.35 0.45 0.62 0.5 0.55 0.79 0.68 0.28 0.73 0.56 0.43 1.0
0.49 0.4 0.2 0.25 0.3 0.41 1.0 0.67 0.25 0.27 0.98 0.85 0.65 0.54 0.41 0.72
0.36 0.82 0.76 0.62 0.78 0.69 0.79 0.43 0.42 0.41 0.62 1.0 0.58 0.61 0.39 0.55
0.4 0.36 0.42 0.61 0.46 0.54 0.73 0.36 0.7 0.81 1.0 0.55 0.77 0.72 0.54 0.78
0.28 0.29 0.09 0.12 0.12 0.22 0.37 0.24 0.6 1.0 0.74 0.52 0.83 0.66 0.68 0.95
0.64 0.23 0.08 0.11 0.09 0.07 0.14 0.16 0.05 0.06 0.19 0.12 0.62 0.53 0.38 1.0
1.0 0.4 0.16 0.14 0.17 0.13 0.41 0.22 0.57 0.53 0.63 0.46 0.34 0.25 0.16 0.42
0.8 0.39 0.1 0.1 0.11 0.27 0.55 0.48 0.52 0.34 0.56 0.39 0.94 0.96 0.78 1.0
0.19 0.11 0.11 0.15 0.03 0.03 0.3 0.17 0.65 1.0 0.42 0.44 0.2 0.16 0.08 0.21
1.0 0.52 0.46 0.63 0.34 0.41 0.87 0.55 0.82 0.87 0.68 0.5 0.66 0.58 0.5 0.87
0.08 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.49 1.0 0.92 0.02 0.01 0.14 0.08 0.06 0.14
0.12 0.13 0.08 0.1 0.1 0.11 1.0 0.2 0.01 0.01 0.19 0.17 0.4 0.37 0.26 0.34
0.69 0.43 0.81 0.71 0.79 0.95 1.0 0.43 0.08 0.07 0.64 0.61 0.58 0.58 0.38 0.55
1.0 0.17 0.07 0.09 0.14 0.18 0.38 0.16 0.18 0.23 0.36 0.31 0.29 0.25 0.18 0.47
0.33 0.43 0.28 0.41 0.42 0.55 0.63 0.38 0.87 0.97 1.0 0.76 0.32 0.23 0.14 0.44
0.23 0.18 0.95 1.0 0.73 0.64 0.5 0.16 0.25 0.24 0.78 0.65 0.05 0.04 0.04 0.07
0.6 0.18 0.04 0.05 0.06 0.12 0.18 0.49 0.67 0.92 0.27 0.13 0.77 0.45 0.24 1.0
0.0 0.0 0.58 1.0 0.79 0.83 0.63 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.09 0.23
0.18 0.06 0.02 0.02 0.03 0.03 0.09 1.0 0.66 0.66 0.08 0.1 0.2 0.15 0.11 0.25
0.85 0.28 0.18 0.16 0.26 0.24 0.34 0.29 0.29 0.29 0.28 0.24 0.74 0.72 0.59 1.0
0.54 0.22 0.09 0.08 0.11 0.18 0.06 0.13 0.05 0.07 0.02 0.04 0.69 0.58 0.4 1.0
0.27 0.22 0.26 0.31 0.43 0.38 0.72 0.39 0.42 0.25 0.8 0.5 0.79 0.65 0.42 1.0
0.38 0.1 0.1 0.15 0.18 0.29 0.34 0.34 0.98 1.0 0.49 0.19 0.57 0.41 0.3 0.65
0.79 0.3 0.13 0.08 0.2 0.24 0.4 0.21 0.17 0.23 0.48 0.41 0.93 0.82 0.68 1.0
0.37 0.14 0.1 0.16 0.21 0.28 0.74 0.54 0.28 0.28 0.48 0.45 0.96 0.86 0.55 1.0
0.79 0.41 0.19 0.22 0.28 0.36 0.58 0.35 0.8 0.99 1.0 0.76 0.68 0.48 0.42 0.8
1.0 0.86 0.47 0.41 0.28 0.2 0.84 0.39 0.35 0.26 0.7 0.54 0.98 0.68 0.72 0.86
0.27 0.14 0.06 0.06 0.16 0.19 0.3 0.51 0.79 1.0 0.42 0.29 0.24 0.21 0.08 0.27
0.45 0.57 0.23 0.29 0.23 0.34 0.38 0.78 1.0 0.69 0.34 0.29 0.3 0.25 0.16 0.43
0.46 0.26 0.36 0.39 0.51 0.49 0.81 0.44 0.58 0.51 1.0 0.75 0.77 0.64 0.46 0.68
0.24 0.2 0.08 0.05 0.11 0.13 0.26 0.35 0.82 1.0 0.28 0.24 0.33 0.31 0.26 0.34
0.61 0.19 0.05 0.04 0.08 0.24 0.59 0.33 0.33 0.29 0.79 0.63 0.67 0.54 0.46 1.0
0.54 0.33 0.17 0.18 0.25 0.23 0.62 1.0 0.66 0.83 0.41 0.36 0.66 0.46 0.35 0.86
0.4 0.24 0.29 0.23 0.33 0.33 0.51 0.3 0.15 0.15 0.38 0.3 0.78 0.67 0.49 1.0
0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.53 1.0 0.93 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03
0.31 0.04 0.09 0.05 0.12 0.16 0.31 0.61 0.1 0.16 0.18 0.2 0.81 0.43 0.49 1.0
0.22 1.0 0.23 0.26 0.18 0.17 0.5 0.74 1.0 0.81 0.34 0.5 0.26 0.2 0.12 0.31
0.18 1.0 0.09 0.1 0.1 0.17 0.49 0.25 0.28 0.21 0.18 0.21 0.27 0.23 0.18 0.3
0.6 0.33 0.21 0.23 0.33 0.42 0.62 0.54 0.72 0.76 1.0 0.88 0.76 0.58 0.44 0.64
0.65 0.4 0.11 0.12 0.22 0.22 1.0 0.72 0.78 0.57 0.68 0.55 0.67 0.46 0.37 0.78
0.29 0.47 0.51 0.76 0.92 1.0 0.48 0.21 0.33 0.18 0.46 0.33 0.19 0.13 0.1 0.2
0.71 0.09 0.08 0.06 0.1 0.22 0.22 0.41 0.66 1.0 0.19 0.08 0.87 0.58 0.41 0.87
1.0 0.39 0.16 0.22 0.21 0.32 0.26 0.27 0.23 0.26 0.53 0.41 0.89 0.72 0.64 0.96
0.54 1.0 0.86 0.88 0.88 0.86 0.53 0.55 0.5 0.51 0.42 0.54 0.82 0.75 0.52 0.71
0.16 0.04 0.4 0.93 0.57 0.91 0.75 0.15 0.26 0.36 1.0 0.46 0.35 0.23 0.26 0.43
0.45 0.19 0.17 0.07 0.32 0.23 0.27 0.43 0.17 0.11 0.15 0.15 0.91 0.47 0.48 1.0
1.0 0.61 0.57 0.71 0.58 0.47 0.68 0.48 0.72 0.83 0.91 0.93 0.7 0.69 0.62 0.71
0.61 0.2 0.2 0.19 0.18 0.26 0.52 0.28 0.29 0.29 0.53 0.28 0.93 0.73 0.64 1.0
0.49 0.48 0.43 0.44 0.58 0.5 0.68 0.39 1.0 0.94 0.8 0.97 0.39 0.32 0.23 0.4
0.17 1.0 0.03 0.03 0.01 0.03 0.05 0.28 0.15 0.07 0.14 0.07 0.06 0.04 0.03 0.05
0.4 0.28 0.43 0.54 0.4 0.4 0.56 0.51 0.66 0.58 0.46 0.56 1.0 0.75 0.66 0.85
0.56 0.54 0.11 0.14 0.16 0.18 0.52 0.33 0.41 0.24 0.33 0.23 0.8 0.53 0.35 1.0
0.53 0.51 0.61 0.81 0.73 0.56 1.0 0.68 0.42 0.43 0.76 0.8 0.87 0.77 0.46 0.81
0.64 0.18 0.27 0.31 0.24 0.23 0.5 0.48 0.26 0.26 0.35 0.19 1.0 0.85 0.69 0.84
1.0 0.58 0.11 0.16 0.26 0.29 0.67 0.35 0.3 0.34 0.34 0.25 0.56 0.38 0.28 0.78
0.67 0.26 0.59 0.55 0.65 0.7 0.98 0.47 0.52 0.69 0.81 0.65 0.92 0.86 0.74 1.0
0.43 0.48 0.14 0.2 0.21 0.24 0.61 0.45 0.98 1.0 0.99 0.85 0.62 0.57 0.49 0.67
0.78 0.26 0.2 0.13 0.29 0.42 0.56 0.45 0.81 1.0 0.77 0.42 0.67 0.62 0.45 0.73
0.25 0.12 0.06 0.05 0.07 0.13 0.31 1.0 0.87 0.78 0.34 0.2 0.37 0.31 0.15 0.42
0.75 0.19 0.77 0.96 0.92 0.66 0.46 0.18 0.03 0.01 1.0 0.73 0.51 0.38 0.19 0.48
0.08 0.04 0.25 0.27 0.17 0.14 0.93 0.69 0.22 0.58 1.0 0.82 0.23 0.19 0.08 0.28
1.0 0.22 0.19 0.11 0.27 0.29 0.18 0.08 0.04 0.11 0.2 0.28 0.84 0.81 0.66 0.88
0.31 0.14 0.55 0.95 0.33 0.61 1.0 0.24 0.33 0.46 0.9 0.31 0.44 0.27 0.15 0.65
1.0 0.32 0.58 0.54 0.47 0.49 0.42 0.4 0.29 0.39 0.46 0.51 0.57 0.39 0.19 0.6
0.71 1.0 0.48 0.56 0.53 0.64 0.61 0.34 0.75 0.6 0.78 0.9 0.46 0.39 0.41 0.51
0.53 1.0 0.12 0.17 0.15 0.23 0.72 0.37 0.58 0.72 0.48 0.42 0.46 0.3 0.09 0.52
0.39 0.23 0.58 0.57 0.85 0.38 0.95 0.71 0.62 0.81 1.0 0.72 0.81 0.7 0.46 0.76
0.28 0.2 0.15 0.13 0.13 0.15 0.66 0.75 0.49 0.4 0.52 0.4 0.94 1.0 0.65 0.85
0.61 0.32 0.08 0.04 0.14 0.09 0.39 0.23 0.08 0.04 0.29 0.18 1.0 0.85 0.72 0.93
0.7 0.54 0.65 0.77 0.68 0.59 0.62 0.44 0.89 1.0 0.87 0.69 0.45 0.36 0.26 0.62
0.42 0.38 0.7 0.79 0.61 1.0 0.49 0.53 0.59 0.55 0.72 0.56 0.8 0.83 0.6 0.83
0.39 0.94 0.2 0.26 0.41 0.5 0.7 0.35 0.69 0.6 0.88 1.0 0.42 0.27 0.16 0.38
0.33 0.31 0.08 0.16 0.11 0.15 0.58 0.45 0.88 1.0 0.88 0.62 0.38 0.31 0.21 0.43
0.36 0.29 0.36 0.25 0.37 0.57 0.86 0.21 0.07 0.06 0.99 1.0 0.79 0.72 0.77 0.95
0.33 0.31 0.12 0.16 0.19 0.23 0.59 0.47 0.72 1.0 0.95 0.78 0.55 0.44 0.3 0.66
0.37 0.25 0.56 0.62 0.89 1.0 0.67 0.34 0.05 0.04 0.19 0.47 0.48 0.38 0.24 0.61
0.31 0.04 0.14 0.16 0.14 0.15 0.16 0.15 0.07 0.05 0.08 0.06 0.8 0.74 0.49 1.0
0.31 0.39 0.79 1.0 0.63 0.4 0.3 0.43 0.32 0.52 0.45 0.59 0.16 0.14 0.1 0.18
0.37 0.34 0.18 0.2 0.31 0.35 0.59 0.55 0.57 0.6 1.0 0.8 0.75 0.73 0.52 0.84
0.7 0.26 0.15 0.18 0.17 0.36 0.68 0.44 0.73 0.54 1.0 0.52 0.65 0.54 0.33 0.63
0.58 0.26 0.44 0.59 0.64 0.7 0.96 0.66 0.55 0.72 1.0 0.71 0.7 0.58 0.41 0.76
0.29 0.07 0.07 0.07 0.12 0.24 0.46 0.45 0.06 0.07 0.77 0.68 1.0 0.76 0.54 0.87
0.78 0.34 0.4 0.48 0.38 0.4 1.0 0.56 0.45 0.39 0.59 0.48 0.74 0.75 0.51 0.65
0.55 0.22 0.28 0.36 0.36 0.52 0.74 0.39 0.57 0.83 1.0 0.44 0.73 0.46 0.48 0.79
0.45 0.19 0.08 0.07 0.18 0.21 0.46 0.26 0.29 0.64 0.7 0.41 0.94 0.81 0.64 1.0
1.0 0.6 0.34 0.49 0.48 0.47 0.67 0.46 0.47 0.35 0.74 0.59 0.44 0.36 0.29 0.48
1.0 0.53 0.16 0.2 0.27 0.28 0.5 0.3 0.49 0.47 0.6 0.4 0.69 0.54 0.42 0.63
0.48 0.15 0.22 0.17 0.18 0.21 0.72 0.54 0.92 0.62 1.0 0.32 0.88 0.77 0.4 0.84
0.0 0.0 0.03 0.06 0.08 0.12 0.25 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.25 0.97
0.38 0.69 0.41 0.55 0.4 0.51 0.97 0.29 0.25 0.35 1.0 0.96 0.35 0.28 0.22 0.37
0.79 0.56 0.25 0.29 0.45 0.41 0.89 0.57 0.31 0.31 0.64 0.68 1.0 0.77 0.65 0.99
0.17 0.17 0.69 1.0 0.59 0.32 0.18 0.15 0.13 0.14 0.41 0.25 0.2 0.18 0.11 0.24
0.06 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.4 0.86 1.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03
0.18 0.03 0.03 0.03 0.05 0.06 0.11 0.13 0.0 0.0 0.05 0.06 0.97 0.92 0.64 1.0
0.14 0.13 0.26 0.35 0.3 0.35 0.59 0.21 0.33 0.5 1.0 0.68 0.18 0.13 0.09 0.17
0.43 0.32 0.54 0.55 0.52 0.39 0.39 0.26 0.02 0.01 0.17 0.19 0.52 0.56 0.46 1.0
0.48 0.11 0.09 0.07 0.15 0.17 0.2 0.21 0.07 0.27 0.24 0.27 0.68 0.62 0.53 1.0
0.54 0.33 0.04 0.06 0.08 0.16 0.09 0.43 0.18 0.36 0.43 0.26 0.99 0.8 0.54 1.0
0.61 0.74 0.54 0.69 0.7 0.59 0.75 0.49 0.7 0.83 1.0 0.99 0.44 0.31 0.31 0.69
0.1 0.13 0.04 0.06 0.06 0.1 0.14 0.33 0.51 1.0 0.21 0.15 0.42 0.37 0.21 0.51
0.59 0.14 0.04 0.03 0.07 0.05 0.18 0.26 0.05 0.04 0.02 0.06 0.95 0.8 0.53 1.0
0.71 0.36 0.01 0.01 0.17 0.22 0.79 0.51 0.03 0.04 0.03 0.03 1.0 0.95 0.87 0.92
0.35 0.53 0.23 0.38 0.29 0.41 0.98 0.59 0.69 0.93 1.0 0.81 0.43 0.4 0.18 0.51
0.74 1.0 0.54 0.76 0.63 0.75 0.75 0.51 0.59 0.57 0.91 0.71 0.8 0.61 0.6 0.72
0.7 0.39 0.53 0.6 0.73 0.8 0.66 0.61 0.63 0.63 0.87 0.56 1.0 0.67 0.63 0.81
0.54 0.17 0.1 0.12 0.09 0.13 0.66 0.52 0.72 0.85 0.78 0.69 1.0 0.86 0.66 0.82
0.81 0.4 0.22 0.18 0.23 0.29 0.55 0.31 0.38 0.33 1.0 0.98 0.57 0.48 0.46 0.67
0.25 0.27 0.7 1.0 0.42 0.58 0.53 0.26 0.31 0.24 0.73 0.6 0.2 0.19 0.12 0.19
0.47 0.08 0.16 0.11 0.24 0.34 0.7 0.38 0.47 0.38 0.51 0.29 0.89 0.6 0.65 1.0
1.0 0.39 0.04 0.06 0.05 0.08 0.32 0.12 0.14 0.15 0.38 0.42 0.32 0.29 0.28 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)