1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_81 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.03 0.08 0.69 2.77 0.38 0.9 1.52 0.11 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.85 0.0
1.06 0.0 5.07 0.92 4.54 3.54 0.64 0.46 0.26 0.68 1.76 2.83 0.0 0.25 1.07 0.0
8.18 0.03 0.12 0.59 0.15 0.32 0.18 0.13 0.32 0.27 0.61 0.17 0.21 0.21 0.46 0.2
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.58 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.74 0.0 6.88 1.41 6.96 1.1 0.0 10.38 1.88 0.35 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.38
0.0 0.0 6.75 12.31 15.8 14.42 0.49 0.15 0.87 0.39 3.8 6.0 0.11 0.54 0.21 0.0
1.36 3.51 1.21 1.62 1.12 4.35 6.84 2.26 0.47 0.72 1.55 1.72 0.42 0.82 0.84 0.28
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.29 50.42 69.88 50.15 46.45 1.51 0.9 0.1 0.6 1.94 4.08 0.92 0.55 0.52 0.48
13.99 16.48 0.12 0.24 0.38 0.8 6.82 2.64 9.37 8.32 14.88 12.97 0.0 0.34 0.0 0.0
0.0 0.0 7.9 65.99 328.43 564.81 8.42 0.5 0.0 3.72 7.08 3.73 0.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0
0.0 0.0 0.29 0.0 0.05 0.43 0.0 0.0 0.15 0.15 0.31 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
2.88 0.11 1.23 2.23 1.05 0.87 0.06 0.01 0.0 0.0 0.14 0.8 0.0 0.15 0.65 0.0
0.0 0.0 0.19 0.16 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.06 0.0 0.03 0.04 0.08 0.19 0.1 4.85 0.0 0.0 0.02 0.07 0.11 0.0 0.0 0.05
0.13 10.3 0.14 0.3 0.14 0.39 0.16 8.18 21.77 7.6 0.2 0.61 0.0 0.32 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.8 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.3 0.0 0.0 0.07 0.76 0.0 0.58 0.0 0.32
0.24 0.23 5.99 1.91 6.05 3.76 1.53 0.5 0.04 0.0 3.19 4.16 0.1 0.1 0.82 0.1
0.03 1.04 2.11 0.89 0.51 3.9 2.32 2.83 2.03 4.77 9.96 8.47 0.0 0.72 0.43 0.2
0.26 2.3 1.42 1.1 0.43 0.46 3.16 2.91 1.67 3.61 5.1 3.32 0.59 2.07 2.9 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.46 36.25 63.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 41.24 136.01 72.74 0.0 0.0 116.49 151.86 725.24 45.84
0.05 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.69 0.29 0.0 0.0 0.0 0.63 1.33 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
2.13 0.05 209.72 173.64 114.11 270.29 7.85 3.2 2.62 5.61 43.11 34.08 0.1 0.49 0.19 0.0
0.04 0.0 24.59 22.77 10.57 8.02 0.5 0.61 2.68 5.4 0.13 0.54 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.04 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 3.63 3.67 6.0 0.0 0.3 10.23 18.46 60.33 14.09
0.83 0.0 18.11 19.0 25.92 60.61 1.35 0.67 4.54 3.28 73.62 113.17 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 56.65 57.36 0.2 0.14 0.15 0.03 0.27 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.17 0.47 0.77 0.0 2.05 0.0
0.14 0.67 0.67 0.24 1.67 1.36 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08 0.35 0.0
0.03 0.0 0.09 0.29 0.05 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.56 0.0 0.0
0.22 0.27 0.13 0.39 0.32 0.18 0.13 0.06 0.78 0.06 0.23 0.05 0.62 0.42 0.4 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.65 0.0
5.1 0.22 19.24 19.99 28.92 22.83 7.57 3.07 1.9 4.27 11.78 11.08 0.98 0.31 0.43 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.08 0.13 7.57 0.92 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.16 0.0 0.1 1.07 0.0
0.0 0.0 1.3 1.74 0.2 2.64 0.21 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.22 0.05
21.05 0.34 15.61 21.1 20.1 23.06 16.83 6.39 0.0 0.0 1.28 3.34 0.12 0.16 0.23 0.0
169.09 41.08 0.18 0.09 0.85 0.78 3.18 1.47 0.0 0.0 4.38 3.21 0.82 2.23 2.14 0.25
0.0 0.0 0.25 0.26 0.46 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 1.01 0.0
0.0 0.96 0.34 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.24 0.0 2.31 2.72 3.86 1.93 0.95 1.56 3.0 0.41 0.36 0.45 0.29 0.07 0.0 0.0
0.01 0.28 28.43 21.31 19.1 39.39 82.83 6.2 29.38 34.25 27.49 23.63 0.09 0.04 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.3 1.62 0.4 1.59 0.44 2.16 0.0 0.41 0.0 0.0
0.12 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.22 2.37 0.94 7.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.87 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 16.63 15.52 0.82 1.51 0.0 1.05 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.45 1.88 0.13
0.0 7.45 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.29 0.0 0.0 0.35 0.65 0.68 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 3.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.0 7.8 4.13 7.15 2.59 0.51 0.0 0.0 0.0 0.14 1.13 0.0 0.08 0.33 0.0
0.29 0.0 3.4 1.66 1.45 0.61 0.8 0.03 0.0 0.0 0.06 0.16 0.28 0.71 0.27 0.13
0.0 0.0 0.25 0.32 0.06 0.22 0.0 0.08 0.13 0.3 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 7.96 8.99 11.38 20.72 28.13 0.38 0.04 0.0 5.03 7.99 0.1 0.0 0.38 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.18 0.21 0.57 0.15 0.01 0.0 0.0 0.16 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.0 0.33 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 4.66 8.41 3.96 8.07 0.49 0.01 0.55 1.33 1.56 3.07 0.23 0.32 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.44 0.41
0.0 0.24 0.3 0.0 0.24 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.12 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.2 0.0 0.43 0.39 0.48 0.22 0.94 0.44
1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.16
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.59 0.05
0.0 0.34 15.13 24.33 0.0 0.05 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.06 0.83 2.53 3.67 3.39 0.0 0.0 0.0 0.06 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.33 0.0 0.0
0.0 0.0 10.44 3.58 5.35 7.8 0.04 0.0 0.0 0.0 0.33 0.5 0.0 0.47 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.29 0.08 0.08 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.85 0.0
0.05 0.1 0.06 0.14 0.02 0.03 0.75 0.08 0.12 0.23 0.15 0.03 0.32 0.11 0.34 0.12
0.0 0.0 16.26 16.47 10.04 31.42 0.57 0.02 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.32 9.31 4.11 161.21 25.13 86.27 33.46 79.96 374.22 141.0 185.76 0.0 0.0 0.0 0.09
0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.11 0.31 0.0 0.0 0.52 0.0
0.04 2.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0
0.0 0.27 0.16 0.0 0.33 0.0 3.77 0.35 0.0 0.0 0.26 0.72 1.15 0.54 0.0 1.59
0.03 0.07 1.33 1.24 3.94 5.4 18.44 0.32 0.0 0.0 0.52 1.84 0.16 0.93 0.0 0.15
0.0 0.0 0.79 0.15 0.56 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 1.33 0.59 0.0 0.0 0.29 0.0
0.0 351.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.5 17.55 19.97 183.16 1119.49 256.36 0.11 0.0 0.43 0.0
0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.2 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.33 0.08
19.37 5.22 0.72 0.9 3.92 5.3 2.36 3.61 9.7 6.9 0.37 0.44 0.7 1.14 1.54 1.2
0.0 0.03 0.25 0.06 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.08 0.62 0.27 2.22 13.91 26.78 21.08 4.68 1.91 0.05 0.05 0.1 0.0
0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.49 0.18 0.32 0.67 0.46 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 1.46 4.32 0.17
0.0 0.12 0.09 0.29 0.05 0.04 0.49 0.03 0.0 0.0 0.37 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.06 33.37 0.04 0.32 0.12 0.25 0.0 1.04 7.17 3.4 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.16 3.88 5.19 1.67 7.08 8.83 16.85 28.53 28.3 23.35 23.97 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 5.8 6.11 0.98 1.13 0.04 0.09 1.91 1.99 0.19 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0
23.18 17.72 2.15 2.61 2.6 2.08 4.27 13.75 0.65 3.93 0.81 0.83 0.14 0.1 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.59 0.03 0.12 0.07 0.3 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0 0.23 0.27 0.45 0.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)